MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014638	GCC	2	6	84125	84130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063520
1502	NC_014638	ATC	2	6	84134	84139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063520
1503	NC_014638	CCA	2	6	84151	84156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063520
1504	NC_014638	GAT	2	6	84163	84168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063520
1505	NC_014638	AACAA	2	10	84216	84225	80 %	0 %	0 %	20 %	311063520
1506	NC_014638	GGT	2	6	84845	84850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063521
1507	NC_014638	GTC	2	6	84870	84875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063521
1508	NC_014638	ATC	2	6	84966	84971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063521
1509	NC_014638	GCC	2	6	85080	85085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063521
1510	NC_014638	TTC	2	6	85092	85097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063521
1511	NC_014638	TTC	2	6	85116	85121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063521
1512	NC_014638	CGGG	2	8	85124	85131	0 %	0 %	75 %	25 %	311063521
1513	NC_014638	GAG	2	6	85152	85157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063521
1514	NC_014638	AAG	2	6	85209	85214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063521
1515	NC_014638	ACTGG	2	10	85217	85226	20 %	20 %	40 %	20 %	311063521
1516	NC_014638	GCC	2	6	85263	85268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063521
1517	NC_014638	CGT	2	6	85474	85479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063522
1518	NC_014638	TGA	2	6	85552	85557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063522
1519	NC_014638	TGT	2	6	85590	85595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063522
1520	NC_014638	GGT	2	6	85625	85630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063522
1521	NC_014638	CGA	2	6	85648	85653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063522
1522	NC_014638	GTA	2	6	85658	85663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063522
1523	NC_014638	GAAGCT	2	12	85739	85750	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311063522
1524	NC_014638	GCCA	2	8	85844	85851	25 %	0 %	25 %	50 %	311063522
1525	NC_014638	GAATC	2	10	85883	85892	40 %	20 %	20 %	20 %	311063522
1526	NC_014638	GCG	2	6	86016	86021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063522
1527	NC_014638	GCA	2	6	86161	86166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063522
1528	NC_014638	GTC	2	6	86195	86200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063522
1529	NC_014638	GCG	2	6	86232	86237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063522
1530	NC_014638	GCC	2	6	86267	86272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063522
1531	NC_014638	TGA	2	6	86280	86285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063522
1532	NC_014638	CCA	2	6	86359	86364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063522
1533	NC_014638	CTG	2	6	86390	86395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063522
1534	NC_014638	GAATC	2	10	86398	86407	40 %	20 %	20 %	20 %	311063522
1535	NC_014638	GAT	2	6	86450	86455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063522
1536	NC_014638	TCG	2	6	86622	86627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063523
1537	NC_014638	GTG	2	6	86628	86633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063523
1538	NC_014638	AGG	2	6	86743	86748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063523
1539	NC_014638	CGGTGA	2	12	86752	86763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	311063523
1540	NC_014638	AGT	2	6	86884	86889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063523
1541	NC_014638	GTC	2	6	86924	86929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063523
1542	NC_014638	GC	3	6	86992	86997	0 %	0 %	50 %	50 %	311063523
1543	NC_014638	TGC	2	6	87049	87054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063523
1544	NC_014638	GTG	2	6	87117	87122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063523
1545	NC_014638	CCAT	2	8	87168	87175	25 %	25 %	0 %	50 %	311063523
1546	NC_014638	GGC	2	6	87447	87452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063524
1547	NC_014638	CCG	2	6	87549	87554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063524
1548	NC_014638	GCC	2	6	87599	87604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063524
1549	NC_014638	CGG	2	6	87632	87637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063524
1550	NC_014638	GCC	2	6	87663	87668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063524
1551	NC_014638	GCA	2	6	87686	87691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063524
1552	NC_014638	GGC	2	6	87711	87716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063524
1553	NC_014638	GGCG	2	8	87755	87762	0 %	0 %	75 %	25 %	311063524
1554	NC_014638	CGC	2	6	87776	87781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063524
1555	NC_014638	CTC	2	6	87828	87833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063524
1556	NC_014638	TGG	3	9	87842	87850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063524
1557	NC_014638	GCCTCG	2	12	87967	87978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311063524
1558	NC_014638	CCA	2	6	87989	87994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063524
1559	NC_014638	GCC	2	6	88005	88010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063524
1560	NC_014638	TGG	2	6	88028	88033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063524
1561	NC_014638	ATG	2	6	88081	88086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063524
1562	NC_014638	TGA	2	6	88133	88138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063524
1563	NC_014638	CGG	2	6	88169	88174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063524
1564	NC_014638	CCG	2	6	88180	88185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063524
1565	NC_014638	GC	3	6	88224	88229	0 %	0 %	50 %	50 %	311063524
1566	NC_014638	CG	3	6	88271	88276	0 %	0 %	50 %	50 %	311063524
1567	NC_014638	CGGCC	2	10	88323	88332	0 %	0 %	40 %	60 %	311063524
1568	NC_014638	TCG	2	6	88351	88356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063524
1569	NC_014638	CGT	2	6	88415	88420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063525
1570	NC_014638	TCGT	2	8	88428	88435	0 %	50 %	25 %	25 %	311063525
1571	NC_014638	CCGC	2	8	88456	88463	0 %	0 %	25 %	75 %	311063525
1572	NC_014638	CCT	2	6	88486	88491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063525
1573	NC_014638	CGG	2	6	88513	88518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063525
1574	NC_014638	CGA	2	6	88607	88612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063525
1575	NC_014638	ACG	2	6	88615	88620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063525
1576	NC_014638	CAT	2	6	88696	88701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063525
1577	NC_014638	A	6	6	88731	88736	100 %	0 %	0 %	0 %	311063525
1578	NC_014638	TCG	2	6	89539	89544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063526
1579	NC_014638	GCC	2	6	89569	89574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063526
1580	NC_014638	CAA	2	6	89630	89635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063526
1581	NC_014638	CCG	2	6	89672	89677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063526
1582	NC_014638	TGT	2	6	89814	89819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063527
1583	NC_014638	ATC	2	6	89822	89827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063527
1584	NC_014638	TGA	2	6	89839	89844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063527
1585	NC_014638	TCT	2	6	89850	89855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063527
1586	NC_014638	CGG	2	6	89902	89907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063527
1587	NC_014638	CCAG	2	8	90046	90053	25 %	0 %	25 %	50 %	311063527
1588	NC_014638	ATC	2	6	90089	90094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063527
1589	NC_014638	CCA	2	6	90274	90279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063527
1590	NC_014638	GTA	2	6	90305	90310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063527
1591	NC_014638	AGA	2	6	90379	90384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063527
1592	NC_014638	TAT	2	6	90385	90390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311063527
1593	NC_014638	GAT	2	6	90437	90442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063527
1594	NC_014638	ATG	2	6	90558	90563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063527
1595	NC_014638	CAT	2	6	90584	90589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063527
1596	NC_014638	ATC	2	6	90612	90617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063527
1597	NC_014638	GTA	2	6	90657	90662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063527
1598	NC_014638	CCA	2	6	90687	90692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063527
1599	NC_014638	ATA	2	6	90699	90704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311063527
1600	NC_014638	GCT	2	6	90714	90719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063528
1601	NC_014638	GA	3	6	90745	90750	50 %	0 %	50 %	0 %	311063528
1602	NC_014638	GCA	2	6	90827	90832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063528
1603	NC_014638	TGT	2	6	90954	90959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063528
1604	NC_014638	AGG	2	6	90969	90974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063528
1605	NC_014638	TCA	2	6	91013	91018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063528
1606	NC_014638	TTC	2	6	91349	91354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063528
1607	NC_014638	CGT	2	6	91363	91368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063528
1608	NC_014638	TGC	2	6	91393	91398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063528
1609	NC_014638	TGA	2	6	91404	91409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063528
1610	NC_014638	CAAT	2	8	91427	91434	50 %	25 %	0 %	25 %	311063528
1611	NC_014638	GCG	2	6	91519	91524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063528
1612	NC_014638	GAT	2	6	91605	91610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063528
1613	NC_014638	TCC	2	6	91637	91642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063528
1614	NC_014638	TCT	3	9	91701	91709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063528
1615	NC_014638	CG	3	6	91788	91793	0 %	0 %	50 %	50 %	311063528
1616	NC_014638	AT	3	6	91798	91803	50 %	50 %	0 %	0 %	311063528
1617	NC_014638	GTG	2	6	91826	91831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063528
1618	NC_014638	T	6	6	91948	91953	0 %	100 %	0 %	0 %	311063528
1619	NC_014638	CAG	2	6	92080	92085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063528
1620	NC_014638	GTG	2	6	92102	92107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063528
1621	NC_014638	CTG	2	6	92205	92210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063529
1622	NC_014638	CCA	2	6	92247	92252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063529
1623	NC_014638	GT	3	6	92281	92286	0 %	50 %	50 %	0 %	311063529
1624	NC_014638	TGG	2	6	92345	92350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063529
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1749	NC_014638	GCC	2	6	100104	100109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063535
1750	NC_014638	GGT	2	6	100134	100139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063535
1751	NC_014638	GAT	2	6	100220	100225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063535
1752	NC_014638	GAA	2	6	100247	100252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063535
1753	NC_014638	GATGG	2	10	100334	100343	20 %	20 %	60 %	0 %	311063535
1754	NC_014638	GTC	2	6	100353	100358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063535
1755	NC_014638	TCG	2	6	100369	100374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063535
1756	NC_014638	TCG	2	6	100390	100395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063535
1757	NC_014638	CAAG	2	8	100406	100413	50 %	0 %	25 %	25 %	311063535
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1761	NC_014638	TGC	2	6	100585	100590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063535
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1767	NC_014638	TCT	2	6	100703	100708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063535
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1773	NC_014638	CCG	2	6	101101	101106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063535
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1777	NC_014638	GCT	2	6	101242	101247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063535
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1779	NC_014638	TCG	2	6	101335	101340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063535
1780	NC_014638	CACCGG	2	12	101402	101413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	311063535
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1845	NC_014638	CGA	2	6	105468	105473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063540
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1849	NC_014638	CTG	2	6	105589	105594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063540
1850	NC_014638	ATC	2	6	105610	105615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063540
1851	NC_014638	CAAGAC	2	12	105648	105659	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	311063540
1852	NC_014638	GCGCAT	2	12	105681	105692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063540
1853	NC_014638	CGA	2	6	105699	105704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063540
1854	NC_014638	CCG	2	6	105740	105745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063540
1855	NC_014638	C	6	6	105863	105868	0 %	0 %	0 %	100 %	311063540
1856	NC_014638	TCA	2	6	105908	105913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063540
1857	NC_014638	GAC	2	6	105985	105990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063540
1858	NC_014638	AAG	2	6	106000	106005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063540
1859	NC_014638	CGC	2	6	106008	106013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063540
1860	NC_014638	CAA	2	6	106026	106031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063540
1861	NC_014638	TCGACC	2	12	106070	106081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311063540
1862	NC_014638	CCG	2	6	106193	106198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063540
1863	NC_014638	ACG	2	6	106199	106204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063540
1864	NC_014638	CTA	2	6	106248	106253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063540
1865	NC_014638	TCA	2	6	106277	106282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063540
1866	NC_014638	CGT	2	6	106296	106301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063540
1867	NC_014638	CAA	2	6	106302	106307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063540
1868	NC_014638	TCT	2	6	106337	106342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063540
1869	NC_014638	CGA	2	6	106398	106403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063540
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1983	NC_014638	GC	3	6	112775	112780	0 %	0 %	50 %	50 %	311063547
1984	NC_014638	TGG	2	6	112801	112806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063547
1985	NC_014638	CCGG	2	8	112867	112874	0 %	0 %	50 %	50 %	311063547
1986	NC_014638	GCG	2	6	112907	112912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063547
1987	NC_014638	CGA	2	6	112928	112933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063547
1988	NC_014638	GGGT	2	8	112987	112994	0 %	25 %	75 %	0 %	311063547
1989	NC_014638	CTG	2	6	113143	113148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063547
1990	NC_014638	AGG	2	6	113150	113155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063547
1991	NC_014638	ATC	2	6	113164	113169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063547
1992	NC_014638	ACT	2	6	113183	113188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063547
1993	NC_014638	CGC	2	6	113247	113252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063547
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1995	NC_014638	GAGCT	2	10	113356	113365	20 %	20 %	40 %	20 %	311063547
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1998	NC_014638	TCGT	2	8	113458	113465	0 %	50 %	25 %	25 %	311063547
1999	NC_014638	TGG	2	6	113507	113512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063547
2000	NC_014638	TGG	2	6	113540	113545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063547

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