MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014638	GAA	2	6	28580	28585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063480
502	NC_014638	CTG	2	6	28649	28654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
503	NC_014638	CGAG	2	8	28663	28670	25 %	0 %	50 %	25 %	311063480
504	NC_014638	GCT	2	6	28679	28684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
505	NC_014638	GC	3	6	28789	28794	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
506	NC_014638	TGA	2	6	28822	28827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063480
507	NC_014638	TGCC	2	8	28837	28844	0 %	25 %	25 %	50 %	311063480
508	NC_014638	CGCC	2	8	28879	28886	0 %	0 %	25 %	75 %	311063480
509	NC_014638	CTT	2	6	28895	28900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063480
510	NC_014638	CGT	3	9	28906	28914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
511	NC_014638	CGT	2	6	28972	28977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
512	NC_014638	TGA	2	6	29011	29016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063480
513	NC_014638	CCGT	2	8	29064	29071	0 %	25 %	25 %	50 %	311063480
514	NC_014638	GGT	2	6	29099	29104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063480
515	NC_014638	CTG	2	6	29168	29173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
516	NC_014638	GC	3	6	29218	29223	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
517	NC_014638	CGG	2	6	29263	29268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063480
518	NC_014638	GTC	2	6	29276	29281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
519	NC_014638	GTTC	2	8	29296	29303	0 %	50 %	25 %	25 %	311063480
520	NC_014638	ACGCTG	2	12	29325	29336	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063480
521	NC_014638	TTG	2	6	29340	29345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063480
522	NC_014638	ACGA	2	8	29352	29359	50 %	0 %	25 %	25 %	311063480
523	NC_014638	GTC	2	6	29363	29368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
524	NC_014638	TCG	2	6	29382	29387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
525	NC_014638	TCC	2	6	29475	29480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063480
526	NC_014638	GCC	2	6	29516	29521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
527	NC_014638	GCC	2	6	29543	29548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
528	NC_014638	GGT	2	6	29558	29563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063480
529	NC_014638	GC	3	6	29670	29675	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
530	NC_014638	GCC	2	6	29693	29698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
531	NC_014638	CCG	2	6	29743	29748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
532	NC_014638	GCC	2	6	29852	29857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
533	NC_014638	GTT	2	6	29867	29872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063480
534	NC_014638	GC	3	6	29904	29909	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
535	NC_014638	TGG	2	6	29917	29922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063480
536	NC_014638	GTC	2	6	30005	30010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
537	NC_014638	GAT	2	6	30064	30069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063480
538	NC_014638	CG	3	6	30207	30212	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
539	NC_014638	GTT	2	6	30230	30235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063480
540	NC_014638	TGCGCC	2	12	30276	30287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311063480
541	NC_014638	CAG	2	6	30314	30319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063480
542	NC_014638	GTT	2	6	30349	30354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063480
543	NC_014638	GTC	2	6	30401	30406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
544	NC_014638	CAT	2	6	30418	30423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063480
545	NC_014638	GTC	2	6	30434	30439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
546	NC_014638	CAG	2	6	30497	30502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063480
547	NC_014638	GC	3	6	30553	30558	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
548	NC_014638	TGC	2	6	30612	30617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
549	NC_014638	CCG	2	6	30621	30626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
550	NC_014638	TTG	2	6	30639	30644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063480
551	NC_014638	GTCG	2	8	30653	30660	0 %	25 %	50 %	25 %	311063480
552	NC_014638	CGGC	2	8	30711	30718	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
553	NC_014638	CTG	2	6	30725	30730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
554	NC_014638	CGT	2	6	30767	30772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
555	NC_014638	CGCGCC	2	12	30851	30862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
556	NC_014638	CGG	2	6	30889	30894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063480
557	NC_014638	GAT	2	6	30902	30907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063480
558	NC_014638	GTC	2	6	30914	30919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
559	NC_014638	GCT	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
560	NC_014638	GCC	2	6	30950	30955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
561	NC_014638	GTT	2	6	30956	30961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063480
562	NC_014638	GCCG	2	8	30977	30984	0 %	0 %	50 %	50 %	311063480
563	NC_014638	GGT	2	6	31028	31033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063480
564	NC_014638	GGCGTC	2	12	31046	31057	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	311063480
565	NC_014638	GCT	2	6	31095	31100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063480
566	NC_014638	GCC	2	6	31110	31115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063480
567	NC_014638	GTGAT	2	10	31150	31159	20 %	40 %	40 %	0 %	311063480
568	NC_014638	GAT	2	6	31984	31989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063481
569	NC_014638	GAT	2	6	32089	32094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063481
570	NC_014638	GCG	2	6	32101	32106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063481
571	NC_014638	TGG	2	6	32141	32146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063481
572	NC_014638	CGT	2	6	32292	32297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063481
573	NC_014638	CGG	2	6	32298	32303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063481
574	NC_014638	ATC	2	6	32347	32352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063481
575	NC_014638	CTA	2	6	32418	32423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063481
576	NC_014638	CG	3	6	32435	32440	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
577	NC_014638	GTACAA	2	12	32493	32504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	311063481
578	NC_014638	CGA	2	6	32541	32546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063481
579	NC_014638	CAT	2	6	32592	32597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063481
580	NC_014638	CGA	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063481
581	NC_014638	GC	3	6	32615	32620	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
582	NC_014638	CG	3	6	32684	32689	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
583	NC_014638	CAC	2	6	32758	32763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063481
584	NC_014638	GCG	2	6	32858	32863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063481
585	NC_014638	CGC	2	6	32911	32916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063481
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589	NC_014638	GCT	2	6	33162	33167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063481
590	NC_014638	CGA	2	6	33177	33182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063481
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592	NC_014638	CG	3	6	33207	33212	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
593	NC_014638	GC	3	6	33314	33319	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
594	NC_014638	GCG	2	6	33365	33370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063481
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596	NC_014638	CTG	2	6	33386	33391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063481
597	NC_014638	ATGCCG	2	12	33398	33409	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063481
598	NC_014638	CCG	3	9	33407	33415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063481
599	NC_014638	CCGT	2	8	33419	33426	0 %	25 %	25 %	50 %	311063481
600	NC_014638	GCC	2	6	33436	33441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063481
601	NC_014638	CGA	2	6	33486	33491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063481
602	NC_014638	GC	3	6	33524	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
603	NC_014638	CGGC	2	8	33530	33537	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
604	NC_014638	GGC	2	6	33601	33606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063481
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606	NC_014638	GACG	2	8	33691	33698	25 %	0 %	50 %	25 %	311063481
607	NC_014638	CGGG	2	8	33759	33766	0 %	0 %	75 %	25 %	311063481
608	NC_014638	CTG	2	6	33781	33786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063481
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611	NC_014638	CGC	2	6	33836	33841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063481
612	NC_014638	CG	3	6	33850	33855	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
613	NC_014638	GCT	2	6	33873	33878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063481
614	NC_014638	GCC	3	9	33901	33909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063481
615	NC_014638	GCC	2	6	33961	33966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063481
616	NC_014638	GCG	2	6	34011	34016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063481
617	NC_014638	TCA	2	6	34025	34030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063481
618	NC_014638	CG	3	6	34054	34059	0 %	0 %	50 %	50 %	311063481
619	NC_014638	CGGAAT	2	12	34193	34204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	311063481
620	NC_014638	TCG	3	9	34738	34746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063482
621	NC_014638	GCG	2	6	34808	34813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
622	NC_014638	TGC	2	6	34844	34849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063482
623	NC_014638	TGA	2	6	34862	34867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063482
624	NC_014638	CGG	2	6	34899	34904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
625	NC_014638	CGA	2	6	34911	34916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063482
626	NC_014638	GCG	2	6	34919	34924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
627	NC_014638	GCC	2	6	34936	34941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063482
628	NC_014638	TGACCT	2	12	34964	34975	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	311063482
629	NC_014638	TCG	2	6	35032	35037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063482
630	NC_014638	CGT	2	6	35093	35098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063482
631	NC_014638	TCA	2	6	35150	35155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063482
632	NC_014638	CGG	2	6	35198	35203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
633	NC_014638	TCG	2	6	35296	35301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063482
634	NC_014638	GCG	2	6	35405	35410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
635	NC_014638	ACC	2	6	35416	35421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063482
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641	NC_014638	TGT	2	6	35681	35686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311063482
642	NC_014638	GCG	2	6	35697	35702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
643	NC_014638	CG	3	6	35738	35743	0 %	0 %	50 %	50 %	311063482
644	NC_014638	GCG	2	6	35749	35754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063482
645	NC_014638	TGG	2	6	36213	36218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063483
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647	NC_014638	GAT	2	6	36253	36258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063483
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650	NC_014638	CAA	2	6	36391	36396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063483
651	NC_014638	AAG	2	6	36497	36502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063483
652	NC_014638	ATGTCA	2	12	36777	36788	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	311063484
653	NC_014638	CCG	2	6	36849	36854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063484
654	NC_014638	CAC	3	9	36877	36885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063484
655	NC_014638	TCA	2	6	36897	36902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063484
656	NC_014638	CGA	2	6	36919	36924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063484
657	NC_014638	TCA	2	6	37052	37057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063485
658	NC_014638	CAT	2	6	37095	37100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063485
659	NC_014638	AGCGC	2	10	37127	37136	20 %	0 %	40 %	40 %	311063485
660	NC_014638	GGC	2	6	37164	37169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063485
661	NC_014638	CGT	2	6	37203	37208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063485
662	NC_014638	GC	3	6	37256	37261	0 %	0 %	50 %	50 %	311063485
663	NC_014638	CGT	2	6	37266	37271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063485
664	NC_014638	CCA	2	6	37274	37279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063485
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667	NC_014638	CCT	2	6	37319	37324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311063485
668	NC_014638	CAT	2	6	37332	37337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063485
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671	NC_014638	CCA	2	6	37407	37412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063485
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751	NC_014638	CGC	2	6	41299	41304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063488
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