MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum PRL2010 chromosome

Total Repeats: 44897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014638	TGC	2	6	237240	237245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063634
4502	NC_014638	GTG	2	6	237263	237268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063634
4503	NC_014638	CGC	2	6	237275	237280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063634
4504	NC_014638	CGA	2	6	237503	237508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063635
4505	NC_014638	GCC	2	6	237519	237524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063635
4506	NC_014638	CGA	2	6	237578	237583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063635
4507	NC_014638	GATC	2	8	237584	237591	25 %	25 %	25 %	25 %	311063635
4508	NC_014638	CCG	2	6	237592	237597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063635
4509	NC_014638	CCG	2	6	237735	237740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063635
4510	NC_014638	GCA	2	6	237817	237822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063635
4511	NC_014638	GCC	2	6	237860	237865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063635
4512	NC_014638	TCA	2	6	238003	238008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063635
4513	NC_014638	CAC	2	6	238155	238160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063636
4514	NC_014638	CAT	2	6	238200	238205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063636
4515	NC_014638	TCG	3	9	238253	238261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4516	NC_014638	CG	3	6	238280	238285	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4517	NC_014638	TCA	2	6	238298	238303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063636
4518	NC_014638	CGA	2	6	238326	238331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4519	NC_014638	GAAG	2	8	238368	238375	50 %	0 %	50 %	0 %	311063636
4520	NC_014638	ACC	2	6	238438	238443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063636
4521	NC_014638	GGC	2	6	238485	238490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063636
4522	NC_014638	GCCG	2	8	238521	238528	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4523	NC_014638	CGG	2	6	238533	238538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063636
4524	NC_014638	GAG	2	6	238546	238551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063636
4525	NC_014638	TGC	2	6	238568	238573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4526	NC_014638	CAC	2	6	238581	238586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063636
4527	NC_014638	CG	3	6	238587	238592	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4528	NC_014638	CTT	2	6	238618	238623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063636
4529	NC_014638	CGA	2	6	238671	238676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4530	NC_014638	TGG	2	6	238681	238686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063636
4531	NC_014638	CGA	2	6	238731	238736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4532	NC_014638	CGA	2	6	238770	238775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4533	NC_014638	ACA	2	6	238937	238942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063636
4534	NC_014638	CGC	2	6	238943	238948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063636
4535	NC_014638	GC	3	6	238947	238952	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4536	NC_014638	ACG	2	6	238982	238987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4537	NC_014638	ACC	2	6	239012	239017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063636
4538	NC_014638	CGA	2	6	239028	239033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4539	NC_014638	CA	3	6	239149	239154	50 %	0 %	0 %	50 %	311063636
4540	NC_014638	CG	3	6	239239	239244	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4541	NC_014638	CG	3	6	239342	239347	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4542	NC_014638	CAT	2	6	239379	239384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063636
4543	NC_014638	CGC	2	6	239475	239480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063636
4544	NC_014638	CGA	2	6	239484	239489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4545	NC_014638	CG	3	6	239496	239501	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4546	NC_014638	CGA	2	6	239514	239519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4547	NC_014638	GGCCGC	2	12	239520	239531	0 %	0 %	50 %	50 %	311063636
4548	NC_014638	GGC	2	6	239553	239558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063636
4549	NC_014638	CAT	2	6	239598	239603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063636
4550	NC_014638	ACG	2	6	239618	239623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4551	NC_014638	GCC	2	6	239644	239649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063636
4552	NC_014638	AGACCG	2	12	239675	239686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4553	NC_014638	GCT	2	6	239691	239696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063636
4554	NC_014638	ATGAAG	2	12	239722	239733	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	311063636
4555	NC_014638	TGA	2	6	239851	239856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063637
4556	NC_014638	CTA	2	6	239857	239862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063637
4557	NC_014638	GAG	2	6	239865	239870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311063637
4558	NC_014638	CCAG	2	8	239875	239882	25 %	0 %	25 %	50 %	311063637
4559	NC_014638	AAG	2	6	239895	239900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063637
4560	NC_014638	CGCGC	2	10	239945	239954	0 %	0 %	40 %	60 %	311063637
4561	NC_014638	CCG	2	6	239980	239985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4562	NC_014638	CGC	2	6	239989	239994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4563	NC_014638	CG	3	6	240004	240009	0 %	0 %	50 %	50 %	311063637
4564	NC_014638	ACG	3	9	240024	240032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4565	NC_014638	CCG	2	6	240076	240081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4566	NC_014638	TGC	2	6	240082	240087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4567	NC_014638	CCG	3	9	240109	240117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4568	NC_014638	GCG	2	6	240139	240144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063637
4569	NC_014638	ACCC	2	8	240159	240166	25 %	0 %	0 %	75 %	311063637
4570	NC_014638	GCC	2	6	240201	240206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4571	NC_014638	CGC	3	9	240209	240217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4572	NC_014638	CG	3	6	240286	240291	0 %	0 %	50 %	50 %	311063637
4573	NC_014638	CGCT	2	8	240309	240316	0 %	25 %	25 %	50 %	311063637
4574	NC_014638	AAC	2	6	240345	240350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311063637
4575	NC_014638	TCG	2	6	240397	240402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4576	NC_014638	GATG	2	8	240416	240423	25 %	25 %	50 %	0 %	311063637
4577	NC_014638	GAT	2	6	240446	240451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063637
4578	NC_014638	GGC	2	6	240585	240590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063637
4579	NC_014638	TCG	2	6	240667	240672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4580	NC_014638	GC	3	6	240736	240741	0 %	0 %	50 %	50 %	311063637
4581	NC_014638	CGG	2	6	240754	240759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063637
4582	NC_014638	TCG	2	6	240760	240765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4583	NC_014638	TGA	2	6	240788	240793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063637
4584	NC_014638	TGGCG	2	10	240802	240811	0 %	20 %	60 %	20 %	311063637
4585	NC_014638	CAT	2	6	240944	240949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063637
4586	NC_014638	CGG	2	6	240968	240973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063637
4587	NC_014638	TCG	2	6	241003	241008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4588	NC_014638	CTG	2	6	241065	241070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4589	NC_014638	GGC	2	6	241085	241090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063637
4590	NC_014638	TGC	2	6	241123	241128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4591	NC_014638	TGC	2	6	241157	241162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063637
4592	NC_014638	GAT	2	6	241164	241169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063637
4593	NC_014638	GCC	2	6	241179	241184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063637
4594	NC_014638	GAA	2	6	241283	241288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063637
4595	NC_014638	CAC	2	6	241331	241336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063637
4596	NC_014638	ACC	2	6	241344	241349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063637
4597	NC_014638	CCG	2	6	241776	241781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063638
4598	NC_014638	GGT	2	6	241796	241801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063638
4599	NC_014638	TCG	2	6	241947	241952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063638
4600	NC_014638	GCC	2	6	241955	241960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063638
4601	NC_014638	ATC	2	6	241976	241981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063638
4602	NC_014638	CAGC	2	8	241997	242004	25 %	0 %	25 %	50 %	311063638
4603	NC_014638	GGC	2	6	242045	242050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063638
4604	NC_014638	GCT	2	6	242065	242070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063638
4605	NC_014638	TGA	2	6	242272	242277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063639
4606	NC_014638	TCA	2	6	242305	242310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063639
4607	NC_014638	TGA	2	6	242323	242328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063639
4608	NC_014638	CTG	2	6	242334	242339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063639
4609	NC_014638	TTC	2	6	242379	242384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063639
4610	NC_014638	CCGG	2	8	242435	242442	0 %	0 %	50 %	50 %	311063639
4611	NC_014638	GC	3	6	242448	242453	0 %	0 %	50 %	50 %	311063639
4612	NC_014638	TGGA	2	8	242454	242461	25 %	25 %	50 %	0 %	311063639
4613	NC_014638	GGC	2	6	242480	242485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063639
4614	NC_014638	CGT	2	6	242530	242535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063639
4615	NC_014638	GTG	2	6	242616	242621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063639
4616	NC_014638	GCT	2	6	242651	242656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063639
4617	NC_014638	CGAAG	2	10	242726	242735	40 %	0 %	40 %	20 %	311063639
4618	NC_014638	TCGC	2	8	242772	242779	0 %	25 %	25 %	50 %	311063639
4619	NC_014638	CGA	2	6	242957	242962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063640
4620	NC_014638	CCACG	2	10	243093	243102	20 %	0 %	20 %	60 %	311063640
4621	NC_014638	GCA	2	6	243134	243139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063640
4622	NC_014638	CAG	2	6	243186	243191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063640
4623	NC_014638	GAT	2	6	243195	243200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063640
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4626	NC_014638	GAT	2	6	243402	243407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063640
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4639	NC_014638	GAT	2	6	243810	243815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063640
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4641	NC_014638	CGGT	2	8	243856	243863	0 %	25 %	50 %	25 %	311063640
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4709	NC_014638	GCCGAT	2	12	247404	247415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063643
4710	NC_014638	CGAT	2	8	247508	247515	25 %	25 %	25 %	25 %	311063643
4711	NC_014638	GCG	2	6	247516	247521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063643
4712	NC_014638	CTGG	2	8	247524	247531	0 %	25 %	50 %	25 %	311063643
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4724	NC_014638	CTT	2	6	248212	248217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063644
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4726	NC_014638	CTT	2	6	248233	248238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063644
4727	NC_014638	CGA	2	6	248331	248336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063644
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4729	NC_014638	GCCG	2	8	248443	248450	0 %	0 %	50 %	50 %	311063644
4730	NC_014638	GCC	2	6	248473	248478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063644
4731	NC_014638	ATC	2	6	248489	248494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063644
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4734	NC_014638	GC	3	6	248589	248594	0 %	0 %	50 %	50 %	311063644
4735	NC_014638	GTG	2	6	248681	248686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063644
4736	NC_014638	TCT	2	6	248985	248990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063644
4737	NC_014638	GAT	2	6	249412	249417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311063645
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4739	NC_014638	GGACG	2	10	249439	249448	20 %	0 %	60 %	20 %	311063645
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4850	NC_014638	GAATC	2	10	256934	256943	40 %	20 %	20 %	20 %	311063650
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4852	NC_014638	CCGGT	2	10	257023	257032	0 %	20 %	40 %	40 %	311063650
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4858	NC_014638	TC	3	6	257303	257308	0 %	50 %	0 %	50 %	311063650
4859	NC_014638	CGT	2	6	257360	257365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063650
4860	NC_014638	CATG	2	8	257808	257815	25 %	25 %	25 %	25 %	311063651
4861	NC_014638	GCG	2	6	258092	258097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063651
4862	NC_014638	CACG	2	8	258111	258118	25 %	0 %	25 %	50 %	311063651
4863	NC_014638	GC	3	6	258128	258133	0 %	0 %	50 %	50 %	311063651
4864	NC_014638	TCGGCA	2	12	258140	258151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	311063651
4865	NC_014638	CGG	2	6	258239	258244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063651
4866	NC_014638	ATT	2	6	258262	258267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311063651
4867	NC_014638	ATC	2	6	258274	258279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063651
4868	NC_014638	CGG	3	9	258294	258302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063651
4869	NC_014638	GGCGA	2	10	258328	258337	20 %	0 %	60 %	20 %	311063651
4870	NC_014638	GGCG	2	8	258390	258397	0 %	0 %	75 %	25 %	311063651
4871	NC_014638	GAC	2	6	258520	258525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063651
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4874	NC_014638	GC	3	6	258660	258665	0 %	0 %	50 %	50 %	311063651
4875	NC_014638	CGC	3	9	258663	258671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063651
4876	NC_014638	CGA	2	6	258771	258776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063651
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4879	NC_014638	CG	3	6	258857	258862	0 %	0 %	50 %	50 %	311063651
4880	NC_014638	GAAG	2	8	258879	258886	50 %	0 %	50 %	0 %	311063651
4881	NC_014638	GCT	2	6	258935	258940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063651
4882	NC_014638	CGCA	2	8	259039	259046	25 %	0 %	25 %	50 %	311063651
4883	NC_014638	CGCC	2	8	259055	259062	0 %	0 %	25 %	75 %	311063651
4884	NC_014638	CGC	3	9	259065	259073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063651
4885	NC_014638	TCG	2	6	259096	259101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063651
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4888	NC_014638	CAC	2	6	259272	259277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311063652
4889	NC_014638	GGCGTG	2	12	259285	259296	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	311063652
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4892	NC_014638	CG	3	6	259490	259495	0 %	0 %	50 %	50 %	311063652
4893	NC_014638	GTG	2	6	259534	259539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063652
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4898	NC_014638	GTC	2	6	259658	259663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311063652
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4931	NC_014638	CG	3	6	261093	261098	0 %	0 %	50 %	50 %	311063653
4932	NC_014638	TCA	2	6	261115	261120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063653
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4936	NC_014638	TACG	2	8	261215	261222	25 %	25 %	25 %	25 %	311063653
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4969	NC_014638	CGA	2	6	262628	262633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
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4973	NC_014638	GC	3	6	262841	262846	0 %	0 %	50 %	50 %	311063653
4974	NC_014638	CAG	2	6	262851	262856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
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4976	NC_014638	CGGCCG	2	12	262900	262911	0 %	0 %	50 %	50 %	311063653
4977	NC_014638	CGA	2	6	262916	262921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
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4979	NC_014638	CGA	2	6	262970	262975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
4980	NC_014638	CGA	2	6	263009	263014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
4981	NC_014638	CGC	2	6	263033	263038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063653
4982	NC_014638	GAGC	2	8	263120	263127	25 %	0 %	50 %	25 %	311063653
4983	NC_014638	GCTCG	2	10	263162	263171	0 %	20 %	40 %	40 %	311063653
4984	NC_014638	GCG	2	6	263212	263217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311063653
4985	NC_014638	AGA	2	6	263230	263235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063653
4986	NC_014638	TCGT	2	8	263244	263251	0 %	50 %	25 %	25 %	311063653
4987	NC_014638	TCA	2	6	263320	263325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063653
4988	NC_014638	AGC	2	6	263344	263349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
4989	NC_014638	AGC	3	9	263371	263379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
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4991	NC_014638	CCG	2	6	263539	263544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311063653
4992	NC_014638	CAG	2	6	263556	263561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311063653
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4994	NC_014638	CAT	2	6	263627	263632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311063653
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4996	NC_014638	GCCG	2	8	263658	263665	0 %	0 %	50 %	50 %	311063653
4997	NC_014638	TCT	2	6	263677	263682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311063653
4998	NC_014638	GAA	2	6	263768	263773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311063653
4999	NC_014638	TGG	2	6	263788	263793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311063653
5000	NC_014638	CGACG	2	10	263807	263816	20 %	0 %	40 %	40 %	311063653

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