MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44501	NC_014616	CTG	2	6	2148324	2148329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288281
44502	NC_014616	TCAT	2	8	2148343	2148350	25 %	50 %	0 %	25 %	310288281
44503	NC_014616	TTG	2	6	2148367	2148372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288281
44504	NC_014616	GTG	2	6	2148385	2148390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288281
44505	NC_014616	AGC	2	6	2148420	2148425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288281
44506	NC_014616	TTGAAG	2	12	2148487	2148498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288281
44507	NC_014616	TGG	2	6	2148530	2148535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288281
44508	NC_014616	CTT	2	6	2148609	2148614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288281
44509	NC_014616	GTA	2	6	2148732	2148737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288281
44510	NC_014616	TGT	2	6	2148821	2148826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288281
44511	NC_014616	GAA	2	6	2148969	2148974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310288281
44512	NC_014616	GTCA	2	8	2148987	2148994	25 %	25 %	25 %	25 %	310288281
44513	NC_014616	AGT	2	6	2149083	2149088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288281
44514	NC_014616	GTC	2	6	2149135	2149140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288281
44515	NC_014616	CGC	2	6	2149167	2149172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288281
44516	NC_014616	GGC	2	6	2149173	2149178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288281
44517	NC_014616	TCA	2	6	2149193	2149198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288281
44518	NC_014616	GTC	2	6	2149269	2149274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44519	NC_014616	AGC	2	6	2149379	2149384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44520	NC_014616	CGC	2	6	2149438	2149443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288282
44521	NC_014616	TGG	2	6	2149524	2149529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288282
44522	NC_014616	CGG	2	6	2149551	2149556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288282
44523	NC_014616	TTC	2	6	2149558	2149563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288282
44524	NC_014616	GTA	2	6	2149576	2149581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288282
44525	NC_014616	TCCA	2	8	2149612	2149619	25 %	25 %	0 %	50 %	310288282
44526	NC_014616	GGA	2	6	2149681	2149686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310288282
44527	NC_014616	TTC	2	6	2149709	2149714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288282
44528	NC_014616	GCG	2	6	2149758	2149763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288282
44529	NC_014616	GCG	2	6	2149796	2149801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288282
44530	NC_014616	CGAC	2	8	2149812	2149819	25 %	0 %	25 %	50 %	310288282
44531	NC_014616	GGTCA	2	10	2149861	2149870	20 %	20 %	40 %	20 %	310288282
44532	NC_014616	CGT	2	6	2149908	2149913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44533	NC_014616	CCG	2	6	2149931	2149936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288282
44534	NC_014616	TTG	2	6	2149937	2149942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288282
44535	NC_014616	TGC	3	9	2150007	2150015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44536	NC_014616	TTC	2	6	2150174	2150179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288282
44537	NC_014616	TTG	2	6	2150192	2150197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310288282
44538	NC_014616	GCC	2	6	2150275	2150280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288282
44539	NC_014616	GTC	2	6	2150410	2150415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44540	NC_014616	TCG	2	6	2150429	2150434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44541	NC_014616	CCGC	2	8	2150450	2150457	0 %	0 %	25 %	75 %	310288282
44542	NC_014616	CAC	2	6	2150505	2150510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288282
44543	NC_014616	TGA	2	6	2150577	2150582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288282
44544	NC_014616	TGC	2	6	2150598	2150603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44545	NC_014616	TGC	2	6	2150631	2150636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44546	NC_014616	TGA	2	6	2150646	2150651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288282
44547	NC_014616	CTG	3	9	2150686	2150694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44548	NC_014616	TCA	3	9	2150699	2150707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288282
44549	NC_014616	CAC	2	6	2150884	2150889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288282
44550	NC_014616	GCA	3	9	2150892	2150900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44551	NC_014616	CGA	2	6	2150958	2150963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288282
44552	NC_014616	CCG	2	6	2150966	2150971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288282
44553	NC_014616	CTT	2	6	2150992	2150997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288282
44554	NC_014616	CAA	2	6	2151045	2151050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310288282
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44556	NC_014616	CG	3	6	2151153	2151158	0 %	0 %	50 %	50 %	310288282
44557	NC_014616	GCCG	2	8	2151193	2151200	0 %	0 %	50 %	50 %	310288282
44558	NC_014616	CGG	2	6	2151246	2151251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288282
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44561	NC_014616	TGG	2	6	2151420	2151425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288282
44562	NC_014616	TGACC	2	10	2151465	2151474	20 %	20 %	20 %	40 %	310288282
44563	NC_014616	AGC	2	6	2151536	2151541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288282
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44566	NC_014616	AAG	2	6	2151614	2151619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310288282
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44568	NC_014616	CCG	2	6	2151764	2151769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288282
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44574	NC_014616	CGTG	2	8	2152179	2152186	0 %	25 %	50 %	25 %	310288282
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44577	NC_014616	CATC	2	8	2152410	2152417	25 %	25 %	0 %	50 %	310288282
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44603	NC_014616	GAC	3	9	2153404	2153412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288282
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44614	NC_014616	GCC	2	6	2153902	2153907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288282
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44725	NC_014616	GCA	2	6	2160319	2160324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288286
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44727	NC_014616	GC	3	6	2160451	2160456	0 %	0 %	50 %	50 %	310288286
44728	NC_014616	CCA	2	6	2160460	2160465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288286
44729	NC_014616	ATAC	2	8	2160501	2160508	50 %	25 %	0 %	25 %	310288286
44730	NC_014616	TGC	2	6	2160587	2160592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288286
44731	NC_014616	TCC	2	6	2160633	2160638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310288286
44732	NC_014616	GGT	2	6	2160676	2160681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288286
44733	NC_014616	CGAC	2	8	2160683	2160690	25 %	0 %	25 %	50 %	310288286
44734	NC_014616	CCG	2	6	2160772	2160777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288286
44735	NC_014616	CGG	2	6	2161406	2161411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288287
44736	NC_014616	ATG	2	6	2161468	2161473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288287
44737	NC_014616	TCGC	2	8	2161512	2161519	0 %	25 %	25 %	50 %	310288287
44738	NC_014616	CG	4	8	2161541	2161548	0 %	0 %	50 %	50 %	310288287
44739	NC_014616	GAA	2	6	2161595	2161600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310288287
44740	NC_014616	ATC	2	6	2161606	2161611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288287
44741	NC_014616	GAT	2	6	2161644	2161649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288287
44742	NC_014616	CGA	2	6	2161697	2161702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288287
44743	NC_014616	CGC	2	6	2161706	2161711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288287
44744	NC_014616	GCG	2	6	2161785	2161790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288287
44745	NC_014616	TGG	2	6	2161852	2161857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288287
44746	NC_014616	GGCGAA	2	12	2161875	2161886	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	310288287
44747	NC_014616	TGG	2	6	2161980	2161985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288287
44748	NC_014616	GTC	2	6	2161991	2161996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288287
44749	NC_014616	ATG	2	6	2162046	2162051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288287
44750	NC_014616	CAC	2	6	2162105	2162110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288287
44751	NC_014616	GCG	2	6	2162127	2162132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288287
44752	NC_014616	GCA	2	6	2162146	2162151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288287
44753	NC_014616	CTG	2	6	2162172	2162177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288287
44754	NC_014616	GCA	2	6	2162216	2162221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288287
44755	NC_014616	ACG	2	6	2162224	2162229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288287
44756	NC_014616	CGC	2	6	2162234	2162239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288287
44757	NC_014616	GCCG	2	8	2162321	2162328	0 %	0 %	50 %	50 %	310288287
44758	NC_014616	ATC	2	6	2162418	2162423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288287
44759	NC_014616	CCG	2	6	2162457	2162462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288287
44760	NC_014616	GCCA	2	8	2162481	2162488	25 %	0 %	25 %	50 %	310288287
44761	NC_014616	CGGA	2	8	2162560	2162567	25 %	0 %	50 %	25 %	310288287
44762	NC_014616	TCT	2	6	2162610	2162615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310288287
44763	NC_014616	GCC	2	6	2162669	2162674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288287
44764	NC_014616	CCA	2	6	2162743	2162748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288287
44765	NC_014616	CCATGC	2	12	2162782	2162793	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310288287
44766	NC_014616	CGA	2	6	2162803	2162808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288287
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44770	NC_014616	ACCATG	2	12	2162937	2162948	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	310288287
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44782	NC_014616	CGG	2	6	2163302	2163307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288287
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44785	NC_014616	CGCTGG	2	12	2163412	2163423	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310288287
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44802	NC_014616	CGC	2	6	2164040	2164045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288288
44803	NC_014616	GGC	2	6	2164055	2164060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288288
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44805	NC_014616	CAT	2	6	2164106	2164111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288288
44806	NC_014616	GGT	2	6	2164118	2164123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288288
44807	NC_014616	CAT	2	6	2164130	2164135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288288
44808	NC_014616	CGT	2	6	2164136	2164141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288288
44809	NC_014616	TGG	2	6	2164144	2164149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288288
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44816	NC_014616	GGC	2	6	2164275	2164280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288288
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44827	NC_014616	GAAG	2	8	2164880	2164887	50 %	0 %	50 %	0 %	310288288
44828	NC_014616	GAC	2	6	2164949	2164954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288288
44829	NC_014616	ACG	2	6	2165600	2165605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288289
44830	NC_014616	CGC	2	6	2165684	2165689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288289
44831	NC_014616	CAC	2	6	2165735	2165740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288289
44832	NC_014616	CCA	2	6	2165812	2165817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310288289
44833	NC_014616	GCG	2	6	2165818	2165823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288289
44834	NC_014616	GAC	2	6	2165870	2165875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288289
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44836	NC_014616	CAG	2	6	2165949	2165954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288289
44837	NC_014616	AACGAG	2	12	2165955	2165966	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310288289
44838	NC_014616	ACA	2	6	2165992	2165997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310288289
44839	NC_014616	CAGC	2	8	2166002	2166009	25 %	0 %	25 %	50 %	310288289
44840	NC_014616	CGG	2	6	2166014	2166019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310288289
44841	NC_014616	TCA	2	6	2166025	2166030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288289
44842	NC_014616	GTCG	2	8	2166071	2166078	0 %	25 %	50 %	25 %	310288289
44843	NC_014616	CGC	2	6	2166098	2166103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288289
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44845	NC_014616	TGC	2	6	2166181	2166186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310288289
44846	NC_014616	GAC	3	9	2166215	2166223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310288289
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44954	NC_014616	GGT	2	6	2171602	2171607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288294
44955	NC_014616	CGGC	2	8	2171619	2171626	0 %	0 %	50 %	50 %	310288294
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44958	NC_014616	CG	3	6	2171665	2171670	0 %	0 %	50 %	50 %	310288294
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44962	NC_014616	GGT	2	6	2171788	2171793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310288294
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44989	NC_014616	ATC	2	6	2172897	2172902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310288295
44990	NC_014616	CG	3	6	2172914	2172919	0 %	0 %	50 %	50 %	310288295
44991	NC_014616	ATG	2	6	2172923	2172928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310288295
44992	NC_014616	CGC	2	6	2172933	2172938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310288295
44993	NC_014616	GCCG	2	8	2173038	2173045	0 %	0 %	50 %	50 %	310288295
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45000	NC_014616	GAGC	2	8	2173341	2173348	25 %	0 %	50 %	25 %	310288295

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