MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014616	TCC	2	6	175863	175868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286683
3502	NC_014616	TCG	2	6	175935	175940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3503	NC_014616	TCG	2	6	176014	176019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3504	NC_014616	CGG	2	6	176116	176121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286683
3505	NC_014616	CGT	2	6	176209	176214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3506	NC_014616	CCTC	2	8	176277	176284	0 %	25 %	0 %	75 %	310286683
3507	NC_014616	TTG	2	6	176298	176303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286683
3508	NC_014616	TTC	2	6	176382	176387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286683
3509	NC_014616	AGA	2	6	176491	176496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286683
3510	NC_014616	CTC	2	6	176531	176536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286683
3511	NC_014616	GA	3	6	176548	176553	50 %	0 %	50 %	0 %	310286683
3512	NC_014616	TTGC	2	8	176609	176616	0 %	50 %	25 %	25 %	310286683
3513	NC_014616	GTC	2	6	176642	176647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3514	NC_014616	ATCGG	2	10	176683	176692	20 %	20 %	40 %	20 %	310286683
3515	NC_014616	TCG	2	6	176697	176702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3516	NC_014616	CAG	2	6	176708	176713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3517	NC_014616	TCG	2	6	176745	176750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3518	NC_014616	GTC	2	6	176753	176758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3519	NC_014616	TCGG	2	8	176858	176865	0 %	25 %	50 %	25 %	310286683
3520	NC_014616	CTG	2	6	176882	176887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3521	NC_014616	GAA	2	6	176915	176920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286683
3522	NC_014616	GGA	2	6	176924	176929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286683
3523	NC_014616	GTCT	2	8	176931	176938	0 %	50 %	25 %	25 %	310286683
3524	NC_014616	GC	3	6	176989	176994	0 %	0 %	50 %	50 %	310286683
3525	NC_014616	GGT	2	6	177056	177061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286683
3526	NC_014616	GCT	2	6	177067	177072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286683
3527	NC_014616	GAAC	2	8	177085	177092	50 %	0 %	25 %	25 %	310286683
3528	NC_014616	ATC	2	6	177107	177112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286683
3529	NC_014616	TCA	2	6	177183	177188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286683
3530	NC_014616	CGC	2	6	177223	177228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286683
3531	NC_014616	AGT	2	6	177271	177276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286683
3532	NC_014616	TCC	2	6	177347	177352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286684
3533	NC_014616	GAT	2	6	177373	177378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286684
3534	NC_014616	GTA	2	6	177451	177456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286684
3535	NC_014616	GTG	2	6	177494	177499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286684
3536	NC_014616	GAT	2	6	177514	177519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286684
3537	NC_014616	GCTT	2	8	177567	177574	0 %	50 %	25 %	25 %	310286684
3538	NC_014616	TCG	2	6	177653	177658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3539	NC_014616	GAA	2	6	177778	177783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286684
3540	NC_014616	CT	3	6	177794	177799	0 %	50 %	0 %	50 %	310286684
3541	NC_014616	CCT	2	6	177834	177839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286684
3542	NC_014616	CCG	2	6	177858	177863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286684
3543	NC_014616	CAG	2	6	177952	177957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286684
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3548	NC_014616	CGT	2	6	178419	178424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3549	NC_014616	TCG	2	6	178493	178498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3550	NC_014616	AGC	2	6	178502	178507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3551	NC_014616	TGG	2	6	178718	178723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286684
3552	NC_014616	AAT	2	6	178824	178829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310286684
3553	NC_014616	GCC	2	6	178831	178836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286684
3554	NC_014616	AGC	3	9	178868	178876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3555	NC_014616	TGT	2	6	178889	178894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286684
3556	NC_014616	ACG	2	6	178934	178939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3557	NC_014616	AGT	2	6	178953	178958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286684
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3559	NC_014616	GAA	2	6	178981	178986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286684
3560	NC_014616	GTC	2	6	178996	179001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286684
3561	NC_014616	CCT	2	6	179016	179021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286684
3562	NC_014616	GAA	2	6	179059	179064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286684
3563	NC_014616	TTG	2	6	179075	179080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286684
3564	NC_014616	GATT	2	8	179110	179117	25 %	50 %	25 %	0 %	310286684
3565	NC_014616	ATGGAT	2	12	179120	179131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286684
3566	NC_014616	CTG	3	9	179360	179368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286685
3567	NC_014616	CGT	2	6	179396	179401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286685
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3569	NC_014616	CGGCG	2	10	179897	179906	0 %	0 %	60 %	40 %	310286686
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3573	NC_014616	CAAA	2	8	180592	180599	75 %	0 %	0 %	25 %	310286687
3574	NC_014616	GGC	3	9	180603	180611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286687
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3578	NC_014616	TCG	2	6	180744	180749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286687
3579	NC_014616	AGG	2	6	180764	180769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286687
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3587	NC_014616	TGG	2	6	181490	181495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286688
3588	NC_014616	GC	3	6	181545	181550	0 %	0 %	50 %	50 %	310286688
3589	NC_014616	TGCTT	2	10	181671	181680	0 %	60 %	20 %	20 %	310286688
3590	NC_014616	ACCA	2	8	181747	181754	50 %	0 %	0 %	50 %	310286688
3591	NC_014616	GAC	2	6	181764	181769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286688
3592	NC_014616	CTGC	2	8	181777	181784	0 %	25 %	25 %	50 %	310286688
3593	NC_014616	GC	3	6	181806	181811	0 %	0 %	50 %	50 %	310286688
3594	NC_014616	TTC	3	9	181825	181833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286688
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3596	NC_014616	GGA	2	6	181905	181910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286688
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3602	NC_014616	AT	3	6	182462	182467	50 %	50 %	0 %	0 %	310286689
3603	NC_014616	CGC	2	6	182468	182473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286689
3604	NC_014616	CGG	2	6	182518	182523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286689
3605	NC_014616	CTC	2	6	182566	182571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286689
3606	NC_014616	GTT	2	6	182633	182638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286689
3607	NC_014616	TCG	2	6	182643	182648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286689
3608	NC_014616	CGTCG	2	10	182766	182775	0 %	20 %	40 %	40 %	310286690
3609	NC_014616	TGG	2	6	182876	182881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286690
3610	NC_014616	TTG	2	6	182890	182895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286690
3611	NC_014616	GTC	2	6	182916	182921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286690
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3614	NC_014616	AATCGA	2	12	183156	183167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	310286691
3615	NC_014616	GTCCA	2	10	183269	183278	20 %	20 %	20 %	40 %	310286691
3616	NC_014616	GGC	2	6	183316	183321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286691
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3740	NC_014616	GATG	2	8	190936	190943	25 %	25 %	50 %	0 %	310286697
3741	NC_014616	TGG	2	6	190946	190951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286697
3742	NC_014616	GCAA	2	8	190953	190960	50 %	0 %	25 %	25 %	310286697
3743	NC_014616	TACC	3	12	190989	191000	25 %	25 %	0 %	50 %	310286697
3744	NC_014616	GAT	2	6	191090	191095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286697
3745	NC_014616	GTG	2	6	191180	191185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286697
3746	NC_014616	GCG	2	6	191216	191221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286697
3747	NC_014616	TGAT	2	8	191247	191254	25 %	50 %	25 %	0 %	310286697
3748	NC_014616	GTG	2	6	191267	191272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286697
3749	NC_014616	TGA	2	6	191334	191339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286697
3750	NC_014616	CAC	2	6	191368	191373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286697
3751	NC_014616	TCC	2	6	191393	191398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286697
3752	NC_014616	TCA	2	6	191421	191426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286697
3753	NC_014616	GCA	2	6	191487	191492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286697
3754	NC_014616	GATG	2	8	191578	191585	25 %	25 %	50 %	0 %	310286697
3755	NC_014616	TCT	2	6	191682	191687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286697
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3757	NC_014616	CT	3	6	191811	191816	0 %	50 %	0 %	50 %	310286698
3758	NC_014616	TCA	2	6	191973	191978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286698
3759	NC_014616	GAC	2	6	192005	192010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286698
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3761	NC_014616	CT	3	6	192069	192074	0 %	50 %	0 %	50 %	310286698
3762	NC_014616	AGG	2	6	192167	192172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286698
3763	NC_014616	AGC	2	6	192181	192186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286698
3764	NC_014616	AGG	2	6	192244	192249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286698
3765	NC_014616	GAT	2	6	192322	192327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286698
3766	NC_014616	AGA	2	6	192366	192371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286698
3767	NC_014616	A	7	7	192410	192416	100 %	0 %	0 %	0 %	310286698
3768	NC_014616	GA	3	6	192451	192456	50 %	0 %	50 %	0 %	310286698
3769	NC_014616	CAA	2	6	192469	192474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286698
3770	NC_014616	CGA	2	6	192665	192670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286699
3771	NC_014616	AGGCAA	2	12	192671	192682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	310286699
3772	NC_014616	CGG	2	6	192731	192736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286699
3773	NC_014616	CAA	2	6	192737	192742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286699
3774	NC_014616	CTG	2	6	192789	192794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286699
3775	NC_014616	CAT	2	6	192803	192808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286699
3776	NC_014616	CGT	3	9	192842	192850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286699
3777	NC_014616	GAG	2	6	192870	192875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286699
3778	NC_014616	CTG	2	6	192915	192920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286699
3779	NC_014616	CAC	2	6	193007	193012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286699
3780	NC_014616	CGGCC	2	10	193025	193034	0 %	0 %	40 %	60 %	310286699
3781	NC_014616	AGA	2	6	193126	193131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286699
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3783	NC_014616	GCT	2	6	193193	193198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286699
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3810	NC_014616	TGG	2	6	194316	194321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286700
3811	NC_014616	TCG	2	6	194325	194330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286700
3812	NC_014616	TTC	2	6	194336	194341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286700
3813	NC_014616	CGATA	2	10	194349	194358	40 %	20 %	20 %	20 %	310286700
3814	NC_014616	GCT	2	6	194368	194373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286700
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3820	NC_014616	GAT	3	9	194575	194583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286700
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3822	NC_014616	GCT	2	6	194638	194643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286700
3823	NC_014616	ATC	2	6	194663	194668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286700
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3828	NC_014616	CGA	2	6	194845	194850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286700
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3833	NC_014616	TCA	3	9	195043	195051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286701
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3844	NC_014616	GT	4	8	195261	195268	0 %	50 %	50 %	0 %	310286701
3845	NC_014616	TGG	2	6	195522	195527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286702
3846	NC_014616	CCA	2	6	195663	195668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286702
3847	NC_014616	TTC	2	6	195680	195685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286702
3848	NC_014616	GGC	2	6	195694	195699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286702
3849	NC_014616	CCG	2	6	195796	195801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286702
3850	NC_014616	ATG	2	6	195806	195811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286702
3851	NC_014616	GGC	2	6	195826	195831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286702
3852	NC_014616	TCGG	2	8	195867	195874	0 %	25 %	50 %	25 %	310286702
3853	NC_014616	TCGG	2	8	195917	195924	0 %	25 %	50 %	25 %	310286702
3854	NC_014616	GGGC	2	8	195940	195947	0 %	0 %	75 %	25 %	310286702
3855	NC_014616	GGC	2	6	196001	196006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286702
3856	NC_014616	GCAG	2	8	196011	196018	25 %	0 %	50 %	25 %	310286702
3857	NC_014616	GCC	2	6	196259	196264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286702
3858	NC_014616	TGC	2	6	196265	196270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286702
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3860	NC_014616	CGC	2	6	196286	196291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286702
3861	NC_014616	GTC	2	6	196319	196324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286702
3862	NC_014616	ATG	2	6	196329	196334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286702
3863	NC_014616	CCG	2	6	196371	196376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286702
3864	NC_014616	CCG	2	6	196455	196460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286702
3865	NC_014616	TGC	2	6	196594	196599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286703
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3873	NC_014616	ACGCG	2	10	196962	196971	20 %	0 %	40 %	40 %	310286703
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3907	NC_014616	GC	3	6	198166	198171	0 %	0 %	50 %	50 %	310286704
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3934	NC_014616	CTG	2	6	199759	199764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286705
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3975	NC_014616	GAC	2	6	201512	201517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286706
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3977	NC_014616	GGC	2	6	201570	201575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286706
3978	NC_014616	ACC	2	6	201580	201585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286706
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3980	NC_014616	TCA	2	6	201760	201765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286706
3981	NC_014616	CGA	2	6	201767	201772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286706
3982	NC_014616	AAG	2	6	201777	201782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286706
3983	NC_014616	GC	3	6	201926	201931	0 %	0 %	50 %	50 %	310286706
3984	NC_014616	AAC	2	6	201945	201950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286706
3985	NC_014616	ACG	2	6	202463	202468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286707
3986	NC_014616	AAG	2	6	202492	202497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286707
3987	NC_014616	ATC	2	6	202504	202509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286707
3988	NC_014616	GTC	2	6	202570	202575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286707
3989	NC_014616	GTCG	2	8	202596	202603	0 %	25 %	50 %	25 %	310286707
3990	NC_014616	AAGTC	2	10	202628	202637	40 %	20 %	20 %	20 %	310286707
3991	NC_014616	GCC	3	9	202648	202656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286707
3992	NC_014616	CGT	2	6	202852	202857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286707
3993	NC_014616	CGC	2	6	202863	202868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286707
3994	NC_014616	GTC	2	6	202885	202890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286707
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3997	NC_014616	GCG	2	6	203042	203047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286707
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3999	NC_014616	TCG	2	6	203144	203149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286707
4000	NC_014616	CGA	2	6	203235	203240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286707

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