MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014616	GCG	2	6	130944	130949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2502	NC_014616	CGC	2	6	130963	130968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286651
2503	NC_014616	CG	3	6	131035	131040	0 %	0 %	50 %	50 %	310286651
2504	NC_014616	GGC	2	6	131054	131059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2505	NC_014616	CTG	2	6	131114	131119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286651
2506	NC_014616	CGC	2	6	131127	131132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286651
2507	NC_014616	TCGG	2	8	131195	131202	0 %	25 %	50 %	25 %	310286651
2508	NC_014616	CTG	3	9	131243	131251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286651
2509	NC_014616	CG	3	6	131268	131273	0 %	0 %	50 %	50 %	310286651
2510	NC_014616	CATGA	2	10	131324	131333	40 %	20 %	20 %	20 %	310286651
2511	NC_014616	CGC	3	9	131365	131373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286651
2512	NC_014616	CGC	2	6	131416	131421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286651
2513	NC_014616	TGA	2	6	131463	131468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286651
2514	NC_014616	GGC	2	6	131471	131476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2515	NC_014616	GCT	2	6	131485	131490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286651
2516	NC_014616	GGA	2	6	131491	131496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286651
2517	NC_014616	CTG	2	6	131534	131539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286651
2518	NC_014616	CCGG	2	8	131568	131575	0 %	0 %	50 %	50 %	310286651
2519	NC_014616	A	6	6	131609	131614	100 %	0 %	0 %	0 %	310286651
2520	NC_014616	CGG	2	6	131716	131721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2521	NC_014616	ACG	2	6	131741	131746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286651
2522	NC_014616	GTCAT	2	10	131760	131769	20 %	40 %	20 %	20 %	310286651
2523	NC_014616	CCA	2	6	131923	131928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286652
2524	NC_014616	ATG	2	6	131936	131941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286652
2525	NC_014616	GTA	2	6	132025	132030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286652
2526	NC_014616	GAT	2	6	132052	132057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286652
2527	NC_014616	GC	3	6	132063	132068	0 %	0 %	50 %	50 %	310286652
2528	NC_014616	CAT	2	6	132154	132159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286652
2529	NC_014616	CGG	2	6	132192	132197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286652
2530	NC_014616	TCG	2	6	132254	132259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286652
2531	NC_014616	GTGTCC	2	12	132284	132295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286652
2532	NC_014616	CGTCGG	2	12	132300	132311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310286652
2533	NC_014616	AC	3	6	132458	132463	50 %	0 %	0 %	50 %	310286653
2534	NC_014616	CAG	2	6	132464	132469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286653
2535	NC_014616	CGC	2	6	132473	132478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286653
2536	NC_014616	CGG	2	6	132494	132499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286653
2537	NC_014616	CTG	2	6	132537	132542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286653
2538	NC_014616	CGG	2	6	132589	132594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286653
2539	NC_014616	TGG	2	6	132598	132603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286653
2540	NC_014616	AGC	2	6	132604	132609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286653
2541	NC_014616	GC	3	6	132655	132660	0 %	0 %	50 %	50 %	310286653
2542	NC_014616	CAA	2	6	132686	132691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286653
2543	NC_014616	CTC	2	6	132698	132703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286653
2544	NC_014616	AGC	2	6	132706	132711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286653
2545	NC_014616	CGG	2	6	132775	132780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286653
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2547	NC_014616	GCTCGG	2	12	132844	132855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	310286653
2548	NC_014616	CGT	2	6	132875	132880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286653
2549	NC_014616	AGG	2	6	132886	132891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286653
2550	NC_014616	TGT	2	6	132902	132907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286653
2551	NC_014616	GGGC	2	8	132919	132926	0 %	0 %	75 %	25 %	310286653
2552	NC_014616	GAT	3	9	132938	132946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286653
2553	NC_014616	GTT	2	6	132962	132967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286653
2554	NC_014616	CGC	2	6	133024	133029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286653
2555	NC_014616	GAC	2	6	133080	133085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286653
2556	NC_014616	A	7	7	133147	133153	100 %	0 %	0 %	0 %	310286653
2557	NC_014616	GCG	2	6	133179	133184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286653
2558	NC_014616	CTG	2	6	133299	133304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2559	NC_014616	CGG	2	6	133389	133394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286654
2560	NC_014616	TGA	2	6	133443	133448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286654
2561	NC_014616	GGC	2	6	133453	133458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286654
2562	NC_014616	GC	3	6	133464	133469	0 %	0 %	50 %	50 %	310286654
2563	NC_014616	TGG	2	6	133490	133495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286654
2564	NC_014616	CCGG	2	8	133556	133563	0 %	0 %	50 %	50 %	310286654
2565	NC_014616	GCG	2	6	133596	133601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286654
2566	NC_014616	CGA	2	6	133617	133622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2567	NC_014616	GGGT	2	8	133676	133683	0 %	25 %	75 %	0 %	310286654
2568	NC_014616	CTG	2	6	133832	133837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2569	NC_014616	AGG	2	6	133839	133844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286654
2570	NC_014616	ATC	2	6	133853	133858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286654
2571	NC_014616	ACT	2	6	133872	133877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286654
2572	NC_014616	CGC	2	6	133936	133941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286654
2573	NC_014616	GGA	2	6	133948	133953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286654
2574	NC_014616	GAGCT	2	10	134045	134054	20 %	20 %	40 %	20 %	310286654
2575	NC_014616	CGT	2	6	134097	134102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2576	NC_014616	CAG	2	6	134128	134133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2577	NC_014616	TCGT	2	8	134147	134154	0 %	50 %	25 %	25 %	310286654
2578	NC_014616	TGG	2	6	134196	134201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286654
2579	NC_014616	TGG	2	6	134229	134234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286654
2580	NC_014616	TGC	2	6	134250	134255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2581	NC_014616	GCC	2	6	134277	134282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286654
2582	NC_014616	GCT	2	6	134308	134313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2583	NC_014616	GCT	2	6	134350	134355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2584	NC_014616	CTG	3	9	134360	134368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286654
2585	NC_014616	GCAA	2	8	134414	134421	50 %	0 %	25 %	25 %	310286654
2586	NC_014616	TGG	3	9	134582	134590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286655
2587	NC_014616	TTCG	2	8	134601	134608	0 %	50 %	25 %	25 %	310286655
2588	NC_014616	ACG	2	6	134666	134671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286655
2589	NC_014616	CGG	2	6	134744	134749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286655
2590	NC_014616	GT	3	6	134810	134815	0 %	50 %	50 %	0 %	310286655
2591	NC_014616	CAT	2	6	134874	134879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286655
2592	NC_014616	TCG	2	6	134897	134902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286655
2593	NC_014616	GAT	2	6	134911	134916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286655
2594	NC_014616	TGA	2	6	134994	134999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286655
2595	NC_014616	TGA	2	6	135098	135103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286655
2596	NC_014616	GCT	2	6	135120	135125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286655
2597	NC_014616	GTC	2	6	135443	135448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286656
2598	NC_014616	GCC	2	6	135451	135456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286656
2599	NC_014616	GTT	2	6	135463	135468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286656
2600	NC_014616	GGT	2	6	135481	135486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286656
2601	NC_014616	CTT	2	6	135490	135495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286656
2602	NC_014616	TGC	2	6	135513	135518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286656
2603	NC_014616	GCCG	2	8	135535	135542	0 %	0 %	50 %	50 %	310286656
2604	NC_014616	CAT	2	6	135567	135572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286656
2605	NC_014616	GTCGC	2	10	135575	135584	0 %	20 %	40 %	40 %	310286656
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2607	NC_014616	GCA	2	6	135711	135716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286656
2608	NC_014616	CCT	2	6	135777	135782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286656
2609	NC_014616	CGA	2	6	135786	135791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286656
2610	NC_014616	GAG	2	6	135878	135883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286656
2611	NC_014616	TCG	2	6	135897	135902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286656
2612	NC_014616	TGG	2	6	135963	135968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286656
2613	NC_014616	CGG	2	6	135975	135980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286656
2614	NC_014616	GACG	2	8	135988	135995	25 %	0 %	50 %	25 %	310286656
2615	NC_014616	GC	3	6	136027	136032	0 %	0 %	50 %	50 %	310286656
2616	NC_014616	TCC	2	6	136034	136039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286656
2617	NC_014616	CGG	2	6	136161	136166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286656
2618	NC_014616	TCG	2	6	136248	136253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286656
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2620	NC_014616	GAT	2	6	136321	136326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286656
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2861	NC_014616	CGCC	2	8	145897	145904	0 %	0 %	25 %	75 %	310286663
2862	NC_014616	GGCGA	2	10	146014	146023	20 %	0 %	60 %	20 %	310286663
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2978	NC_014616	GCTCG	2	10	150867	150876	0 %	20 %	40 %	40 %	310286665
2979	NC_014616	AAAG	2	8	150900	150907	75 %	0 %	25 %	0 %	310286665
2980	NC_014616	CGGC	2	8	150923	150930	0 %	0 %	50 %	50 %	310286665
2981	NC_014616	CGA	2	6	150965	150970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286665
2982	NC_014616	TCG	2	6	150979	150984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286665
2983	NC_014616	CGC	2	6	150993	150998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286665
2984	NC_014616	AGCA	2	8	151018	151025	50 %	0 %	25 %	25 %	310286665
2985	NC_014616	TCC	2	6	151060	151065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286665
2986	NC_014616	CAC	2	6	151083	151088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286665
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2988	NC_014616	GCGCT	2	10	151141	151150	0 %	20 %	40 %	40 %	310286665
2989	NC_014616	CGC	2	6	151161	151166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286665
2990	NC_014616	CAA	2	6	151194	151199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286665
2991	NC_014616	CAG	2	6	151207	151212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286665
2992	NC_014616	GAC	2	6	151300	151305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286665
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2997	NC_014616	GCC	2	6	151462	151467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286665
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3000	NC_014616	ACTCG	2	10	151575	151584	20 %	20 %	20 %	40 %	310286665

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