MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_014616	ACG	2	6	104640	104645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2003	NC_014616	ACG	2	6	104655	104660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2004	NC_014616	GCG	2	6	104686	104691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286616
2005	NC_014616	CGA	2	6	104695	104700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2006	NC_014616	CAAGGC	2	12	104707	104718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2007	NC_014616	TCG	2	6	104805	104810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286616
2008	NC_014616	ATC	2	6	104834	104839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286616
2009	NC_014616	GC	3	6	104859	104864	0 %	0 %	50 %	50 %	310286616
2010	NC_014616	CGCGC	2	10	104866	104875	0 %	0 %	40 %	60 %	310286616
2011	NC_014616	GGC	2	6	104891	104896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286616
2012	NC_014616	CAT	2	6	104969	104974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286617
2013	NC_014616	CG	4	8	105020	105027	0 %	0 %	50 %	50 %	310286617
2014	NC_014616	ACGCGT	2	12	105097	105108	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	310286617
2015	NC_014616	GAG	2	6	105114	105119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286617
2016	NC_014616	CGG	2	6	105215	105220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286617
2017	NC_014616	CAG	2	6	105246	105251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286617
2018	NC_014616	GCA	2	6	105256	105261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286617
2019	NC_014616	GC	3	6	105275	105280	0 %	0 %	50 %	50 %	310286617
2020	NC_014616	TTC	2	6	105333	105338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286617
2021	NC_014616	CCG	2	6	105349	105354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
2022	NC_014616	AAG	2	6	105381	105386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286617
2023	NC_014616	GC	3	6	105397	105402	0 %	0 %	50 %	50 %	310286617
2024	NC_014616	CGG	2	6	105413	105418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286617
2025	NC_014616	CGA	2	6	105482	105487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286617
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2030	NC_014616	CCG	2	6	105670	105675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
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2032	NC_014616	CGC	2	6	105692	105697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286617
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2101	NC_014616	CGA	2	6	109660	109665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2104	NC_014616	AGGA	2	8	109800	109807	50 %	0 %	50 %	0 %	310286626
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2117	NC_014616	GAA	2	6	110467	110472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286626
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2120	NC_014616	CGG	2	6	110578	110583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286626
2121	NC_014616	CGT	2	6	110593	110598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2122	NC_014616	CGG	2	6	110632	110637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286626
2123	NC_014616	CTT	2	6	110650	110655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286626
2124	NC_014616	TCA	2	6	110670	110675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
2125	NC_014616	CTC	2	6	110678	110683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286626
2126	NC_014616	CAT	2	6	110695	110700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
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2128	NC_014616	GC	3	6	110778	110783	0 %	0 %	50 %	50 %	310286626
2129	NC_014616	TGC	2	6	110796	110801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2130	NC_014616	CGC	2	6	110821	110826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286626
2131	NC_014616	GAT	2	6	110839	110844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286626
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2133	NC_014616	GCT	2	6	110923	110928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2143	NC_014616	GTC	2	6	111257	111262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2144	NC_014616	GCT	2	6	111280	111285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
2145	NC_014616	GCT	2	6	111322	111327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2149	NC_014616	ATC	3	9	111455	111463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286626
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2154	NC_014616	TCG	2	6	111627	111632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286626
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2168	NC_014616	CTG	2	6	112307	112312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286627
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2183	NC_014616	TGG	2	6	113056	113061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286628
2184	NC_014616	TCG	2	6	113087	113092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286628
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2190	NC_014616	CGCAG	2	10	113391	113400	20 %	0 %	40 %	40 %	310286628
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2193	NC_014616	CTCGC	2	10	113482	113491	0 %	20 %	20 %	60 %	310286628
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2195	NC_014616	TCG	2	6	113543	113548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286628
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2202	NC_014616	ATC	2	6	113812	113817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286628
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2221	NC_014616	GGAA	2	8	114494	114501	50 %	0 %	50 %	0 %	310286628
2222	NC_014616	CAT	2	6	114510	114515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286628
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2224	NC_014616	CAT	2	6	114553	114558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286629
2225	NC_014616	AC	3	6	114664	114669	50 %	0 %	0 %	50 %	310286629
2226	NC_014616	CGGA	2	8	114675	114682	25 %	0 %	50 %	25 %	310286629
2227	NC_014616	AGG	2	6	114690	114695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286629
2228	NC_014616	CAG	2	6	114716	114721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286629
2229	NC_014616	CGC	2	6	114736	114741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286629
2230	NC_014616	ACC	2	6	114795	114800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286630
2231	NC_014616	TCA	2	6	114805	114810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286630
2232	NC_014616	GGC	2	6	114819	114824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286630
2233	NC_014616	GCG	2	6	114841	114846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286630
2234	NC_014616	CTG	2	6	114891	114896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286630
2235	NC_014616	CG	4	8	114989	114996	0 %	0 %	50 %	50 %	310286630
2236	NC_014616	AC	3	6	115072	115077	50 %	0 %	0 %	50 %	310286630
2237	NC_014616	AAC	2	6	115080	115085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286630
2238	NC_014616	CCG	2	6	115099	115104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286630
2239	NC_014616	GCC	2	6	115143	115148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286630
2240	NC_014616	CCGTC	2	10	115156	115165	0 %	20 %	20 %	60 %	310286630
2241	NC_014616	GCA	2	6	115168	115173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286630
2242	NC_014616	TCA	2	6	115255	115260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286630
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2244	NC_014616	TCG	2	6	115366	115371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286630
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2359	NC_014616	TCG	2	6	121957	121962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286641
2360	NC_014616	CCG	2	6	121970	121975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286641
2361	NC_014616	GAT	2	6	122019	122024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286641
2362	NC_014616	TGG	2	6	122530	122535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286642
2363	NC_014616	CCA	2	6	122550	122555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286642
2364	NC_014616	GCC	2	6	122612	122617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286642
2365	NC_014616	TCAAT	2	10	122783	122792	40 %	40 %	0 %	20 %	310286643
2366	NC_014616	GC	3	6	122863	122868	0 %	0 %	50 %	50 %	310286643
2367	NC_014616	TTC	2	6	122882	122887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286643
2368	NC_014616	GCT	2	6	122899	122904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286643
2369	NC_014616	CG	3	6	122918	122923	0 %	0 %	50 %	50 %	310286643
2370	NC_014616	GGC	2	6	122931	122936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286643
2371	NC_014616	CGA	2	6	122983	122988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286643
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2373	NC_014616	CGG	2	6	123591	123596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286644
2374	NC_014616	TCC	2	6	123613	123618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286644
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2378	NC_014616	GCT	2	6	123707	123712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286644
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2381	NC_014616	CGGA	2	8	123900	123907	25 %	0 %	50 %	25 %	310286645
2382	NC_014616	GCG	2	6	123960	123965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286645
2383	NC_014616	AGA	2	6	123972	123977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286645
2384	NC_014616	CGA	2	6	124024	124029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286645
2385	NC_014616	CCG	2	6	124035	124040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286645
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2390	NC_014616	GTC	2	6	124336	124341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286646
2391	NC_014616	CGG	2	6	124353	124358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286646
2392	NC_014616	CGG	2	6	124401	124406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286646
2393	NC_014616	GCCGGG	2	12	124528	124539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286646
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2396	NC_014616	CGCTG	2	10	124646	124655	0 %	20 %	40 %	40 %	310286646
2397	NC_014616	CGT	2	6	124656	124661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286646
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2400	NC_014616	CCG	2	6	125093	125098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286647
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2409	NC_014616	ACT	2	6	125564	125569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286647
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2419	NC_014616	ACG	2	6	125939	125944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286647
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2422	NC_014616	CGA	2	6	126069	126074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286647
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2426	NC_014616	CTG	2	6	126190	126195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286647
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2430	NC_014616	CGA	2	6	126300	126305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286647
2431	NC_014616	CCG	2	6	126341	126346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286647
2432	NC_014616	C	6	6	126464	126469	0 %	0 %	0 %	100 %	310286647
2433	NC_014616	TCA	2	6	126509	126514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286647
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2444	NC_014616	CGT	2	6	126897	126902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286647
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2449	NC_014616	CCGGCA	2	12	127034	127045	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310286647
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2451	NC_014616	CGA	2	6	127158	127163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286647
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2455	NC_014616	TCG	2	6	127295	127300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286647
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2459	NC_014616	CTC	2	6	128414	128419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286648
2460	NC_014616	CTG	2	6	128441	128446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286648
2461	NC_014616	ACCA	2	8	128462	128469	50 %	0 %	0 %	50 %	310286648
2462	NC_014616	CGG	2	6	128470	128475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286648
2463	NC_014616	CAG	2	6	128477	128482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286648
2464	NC_014616	AAC	2	6	128493	128498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286648
2465	NC_014616	GTTT	2	8	128742	128749	0 %	75 %	25 %	0 %	310286649
2466	NC_014616	ATC	3	9	128837	128845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286649
2467	NC_014616	GCGT	2	8	128846	128853	0 %	25 %	50 %	25 %	310286649
2468	NC_014616	CGG	2	6	128943	128948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286649
2469	NC_014616	TGC	2	6	129003	129008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286649
2470	NC_014616	GAT	2	6	129061	129066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286649
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2472	NC_014616	TGG	2	6	129169	129174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286649
2473	NC_014616	GTT	2	6	129196	129201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	310286649
2474	NC_014616	TGG	2	6	129300	129305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286649
2475	NC_014616	TCG	2	6	129342	129347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286649
2476	NC_014616	GCG	2	6	129348	129353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286649
2477	NC_014616	GCT	2	6	129364	129369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286649
2478	NC_014616	GGT	2	6	129433	129438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286649
2479	NC_014616	CAT	2	6	129499	129504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286649
2480	NC_014616	GCG	2	6	129542	129547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286650
2481	NC_014616	CAG	2	6	129558	129563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286650
2482	NC_014616	CGT	3	9	129612	129620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286650
2483	NC_014616	CTC	2	6	129693	129698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286650
2484	NC_014616	TTC	2	6	129853	129858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286650
2485	NC_014616	TTC	2	6	129877	129882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286650
2486	NC_014616	CGA	2	6	129924	129929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286650
2487	NC_014616	CGA	2	6	129934	129939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286650
2488	NC_014616	ACATG	2	10	129942	129951	40 %	20 %	20 %	20 %	310286650
2489	NC_014616	CGA	2	6	129958	129963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286650
2490	NC_014616	CAT	2	6	129991	129996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286650
2491	NC_014616	TCG	2	6	130020	130025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286650
2492	NC_014616	CAA	2	6	130075	130080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286650
2493	NC_014616	ATG	2	6	130196	130201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286650
2494	NC_014616	GCG	2	6	130523	130528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2495	NC_014616	CCG	2	6	130676	130681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286651
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2497	NC_014616	CGG	2	6	130759	130764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2498	NC_014616	CGG	2	6	130783	130788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286651
2499	NC_014616	CG	3	6	130813	130818	0 %	0 %	50 %	50 %	310286651
2500	NC_014616	GGA	2	6	130930	130935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286651

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