MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014616	GCT	2	6	80090	80095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286583
1502	NC_014616	AAG	2	6	80157	80162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286583
1503	NC_014616	CGC	3	9	80311	80319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286583
1504	NC_014616	CTG	2	6	80391	80396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286583
1505	NC_014616	TA	3	6	80749	80754	50 %	50 %	0 %	0 %	310286583
1506	NC_014616	GAA	2	6	80912	80917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286583
1507	NC_014616	CGC	2	6	80918	80923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286583
1508	NC_014616	CGTT	2	8	80942	80949	0 %	50 %	25 %	25 %	310286583
1509	NC_014616	TA	3	6	81065	81070	50 %	50 %	0 %	0 %	310286584
1510	NC_014616	T	6	6	81090	81095	0 %	100 %	0 %	0 %	310286584
1511	NC_014616	AAG	2	6	81139	81144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286584
1512	NC_014616	CTTT	2	8	81150	81157	0 %	75 %	0 %	25 %	310286584
1513	NC_014616	GTA	2	6	81244	81249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286584
1514	NC_014616	GCC	2	6	81305	81310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286584
1515	NC_014616	TG	3	6	81345	81350	0 %	50 %	50 %	0 %	310286584
1516	NC_014616	AAT	2	6	81375	81380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	310286584
1517	NC_014616	ACA	2	6	81381	81386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286584
1518	NC_014616	CAAT	2	8	81389	81396	50 %	25 %	0 %	25 %	310286584
1519	NC_014616	CG	3	6	81416	81421	0 %	0 %	50 %	50 %	310286584
1520	NC_014616	GAC	2	6	81504	81509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286584
1521	NC_014616	TAT	2	6	81543	81548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310286584
1522	NC_014616	AAGC	2	8	81600	81607	50 %	0 %	25 %	25 %	310286584
1523	NC_014616	TGC	2	6	81698	81703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286584
1524	NC_014616	TTGCT	2	10	81708	81717	0 %	60 %	20 %	20 %	310286584
1525	NC_014616	AGTA	2	8	81749	81756	50 %	25 %	25 %	0 %	310286584
1526	NC_014616	TGG	2	6	81866	81871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286584
1527	NC_014616	TGA	2	6	81919	81924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286584
1528	NC_014616	CAT	2	6	81939	81944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286584
1529	NC_014616	ATT	2	6	81953	81958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310286584
1530	NC_014616	GAT	2	6	82036	82041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286584
1531	NC_014616	AGATCG	2	12	82286	82297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310286585
1532	NC_014616	GAT	2	6	82329	82334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286585
1533	NC_014616	CGA	2	6	82392	82397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286585
1534	NC_014616	GGC	2	6	82427	82432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286585
1535	NC_014616	TTA	2	6	82458	82463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	310286585
1536	NC_014616	GCCGG	2	10	82468	82477	0 %	0 %	60 %	40 %	310286585
1537	NC_014616	GCC	2	6	82489	82494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286585
1538	NC_014616	GC	3	6	82510	82515	0 %	0 %	50 %	50 %	310286585
1539	NC_014616	GTGG	2	8	82551	82558	0 %	25 %	75 %	0 %	310286585
1540	NC_014616	GA	3	6	82561	82566	50 %	0 %	50 %	0 %	310286585
1541	NC_014616	CGC	3	9	82583	82591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286585
1542	NC_014616	CGA	2	6	82626	82631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286585
1543	NC_014616	GCCGC	2	10	82683	82692	0 %	0 %	40 %	60 %	310286585
1544	NC_014616	TGCC	2	8	82708	82715	0 %	25 %	25 %	50 %	310286585
1545	NC_014616	CGG	3	9	82726	82734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286585
1546	NC_014616	GTC	2	6	82796	82801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286585
1547	NC_014616	AGG	2	6	82891	82896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286585
1548	NC_014616	CCG	2	6	82934	82939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286585
1549	NC_014616	CGG	2	6	82982	82987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286585
1550	NC_014616	CACG	2	8	83004	83011	25 %	0 %	25 %	50 %	310286585
1551	NC_014616	CGCC	2	8	83028	83035	0 %	0 %	25 %	75 %	310286585
1552	NC_014616	CG	3	6	83037	83042	0 %	0 %	50 %	50 %	310286585
1553	NC_014616	CGA	2	6	83049	83054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286585
1554	NC_014616	GGC	2	6	83104	83109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286585
1555	NC_014616	CCG	2	6	83133	83138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286585
1556	NC_014616	ATC	2	6	83158	83163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286585
1557	NC_014616	TCG	2	6	83195	83200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286585
1558	NC_014616	CCG	2	6	83246	83251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286585
1559	NC_014616	CGA	2	6	83262	83267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286585
1560	NC_014616	CAG	2	6	83379	83384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1561	NC_014616	GCA	2	6	83444	83449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1562	NC_014616	CTT	2	6	83466	83471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286586
1563	NC_014616	CGA	2	6	83579	83584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1564	NC_014616	GTC	2	6	83616	83621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1565	NC_014616	AGA	2	6	83639	83644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286586
1566	NC_014616	ACG	2	6	83680	83685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1567	NC_014616	AGG	2	6	83725	83730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286586
1568	NC_014616	CGG	2	6	83801	83806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286586
1569	NC_014616	AGA	2	6	83906	83911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286586
1570	NC_014616	TC	3	6	83942	83947	0 %	50 %	0 %	50 %	310286586
1571	NC_014616	GATGT	2	10	83953	83962	20 %	40 %	40 %	0 %	310286586
1572	NC_014616	CTT	2	6	83967	83972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286586
1573	NC_014616	CTT	2	6	83976	83981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286586
1574	NC_014616	CCA	2	6	83993	83998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286586
1575	NC_014616	GCC	2	6	84036	84041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286586
1576	NC_014616	CCTG	2	8	84056	84063	0 %	25 %	25 %	50 %	310286586
1577	NC_014616	GGA	2	6	84071	84076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286586
1578	NC_014616	CTT	2	6	84219	84224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286586
1579	NC_014616	CTC	3	9	84312	84320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286586
1580	NC_014616	CGAG	2	8	84362	84369	25 %	0 %	50 %	25 %	310286586
1581	NC_014616	CGTC	2	8	84391	84398	0 %	25 %	25 %	50 %	310286586
1582	NC_014616	CCA	2	6	84401	84406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286586
1583	NC_014616	GCT	2	6	84407	84412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1584	NC_014616	TCG	2	6	84448	84453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286586
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1586	NC_014616	CCT	2	6	84471	84476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286586
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1588	NC_014616	CGA	2	6	84542	84547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1589	NC_014616	CGA	2	6	84584	84589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1590	NC_014616	ACG	2	6	84596	84601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1591	NC_014616	CGT	2	6	84610	84615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286586
1592	NC_014616	TCC	2	6	84622	84627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286586
1593	NC_014616	GAA	2	6	84688	84693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286586
1594	NC_014616	TTCG	2	8	84725	84732	0 %	50 %	25 %	25 %	310286586
1595	NC_014616	CAT	2	6	85341	85346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286587
1596	NC_014616	GAC	2	6	85358	85363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286587
1597	NC_014616	CCG	2	6	85416	85421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1598	NC_014616	ACT	2	6	85574	85579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286587
1599	NC_014616	TGGC	2	8	85588	85595	0 %	25 %	50 %	25 %	310286587
1600	NC_014616	CG	3	6	85607	85612	0 %	0 %	50 %	50 %	310286587
1601	NC_014616	TGC	2	6	85657	85662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286587
1602	NC_014616	CCG	2	6	85697	85702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1603	NC_014616	GCACGC	2	12	85718	85729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	310286587
1604	NC_014616	AGG	2	6	85834	85839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286587
1605	NC_014616	CG	3	6	85850	85855	0 %	0 %	50 %	50 %	310286587
1606	NC_014616	GCC	2	6	85912	85917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1607	NC_014616	CAGGC	2	10	85930	85939	20 %	0 %	40 %	40 %	310286587
1608	NC_014616	CTG	2	6	85981	85986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286587
1609	NC_014616	GAACTG	2	12	86047	86058	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	310286587
1610	NC_014616	CAG	2	6	86089	86094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286587
1611	NC_014616	GTG	2	6	86122	86127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286587
1612	NC_014616	CTGG	2	8	86136	86143	0 %	25 %	50 %	25 %	310286587
1613	NC_014616	GCC	2	6	86194	86199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1614	NC_014616	AAC	2	6	86260	86265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286587
1615	NC_014616	CCGC	2	8	86294	86301	0 %	0 %	25 %	75 %	310286587
1616	NC_014616	GCC	2	6	86413	86418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1617	NC_014616	CG	3	6	86419	86424	0 %	0 %	50 %	50 %	310286587
1618	NC_014616	CGA	2	6	86433	86438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286587
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1620	NC_014616	CGC	2	6	86502	86507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1621	NC_014616	CTCG	2	8	86508	86515	0 %	25 %	25 %	50 %	310286587
1622	NC_014616	GCC	3	9	86527	86535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286587
1623	NC_014616	GGC	2	6	86551	86556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286587
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1625	NC_014616	CGA	2	6	86694	86699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286588
1626	NC_014616	CTT	2	6	86874	86879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286588
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1873	NC_014616	GCA	2	6	98883	98888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286609
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1886	NC_014616	CG	3	6	99343	99348	0 %	0 %	50 %	50 %	310286610
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1981	NC_014616	CAGA	2	8	103527	103534	50 %	0 %	25 %	25 %	310286614
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1985	NC_014616	A	6	6	103828	103833	100 %	0 %	0 %	0 %	310286614
1986	NC_014616	CGA	2	6	103874	103879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286614
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1991	NC_014616	CGA	2	6	104105	104110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286615
1992	NC_014616	GAA	2	6	104121	104126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286615
1993	NC_014616	CAT	2	6	104353	104358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286616
1994	NC_014616	GCAACC	2	12	104370	104381	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	310286616
1995	NC_014616	CCG	2	6	104454	104459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286616
1996	NC_014616	CGG	2	6	104464	104469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286616
1997	NC_014616	AGCCTC	2	12	104499	104510	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310286616
1998	NC_014616	ACC	2	6	104515	104520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286616
1999	NC_014616	GGA	2	6	104521	104526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286616
2000	NC_014616	GAG	2	6	104612	104617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286616

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