MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum S17 chromosome

Total Repeats: 45248

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014616	GCG	2	6	50241	50246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286560
1002	NC_014616	CGA	2	6	50254	50259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286560
1003	NC_014616	GGC	2	6	50281	50286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286560
1004	NC_014616	CG	3	6	50315	50320	0 %	0 %	50 %	50 %	310286560
1005	NC_014616	GACG	2	8	50350	50357	25 %	0 %	50 %	25 %	310286560
1006	NC_014616	GCC	2	6	50381	50386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286560
1007	NC_014616	GCT	2	6	50410	50415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286560
1008	NC_014616	GCA	2	6	50431	50436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286560
1009	NC_014616	GCC	2	6	50483	50488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286560
1010	NC_014616	GCG	3	9	50489	50497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286560
1011	NC_014616	CGG	2	6	50565	50570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286560
1012	NC_014616	GCT	2	6	50575	50580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286560
1013	NC_014616	CGG	3	9	50803	50811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286560
1014	NC_014616	TCG	2	6	50835	50840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286560
1015	NC_014616	CGCC	2	8	50878	50885	0 %	0 %	25 %	75 %	310286560
1016	NC_014616	TTC	2	6	50897	50902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286560
1017	NC_014616	GGC	2	6	51050	51055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286560
1018	NC_014616	CAT	2	6	51115	51120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286560
1019	NC_014616	CGC	2	6	51276	51281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286560
1020	NC_014616	CGC	2	6	51298	51303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286560
1021	NC_014616	GCCG	2	8	51358	51365	0 %	0 %	50 %	50 %	310286560
1022	NC_014616	GC	3	6	51384	51389	0 %	0 %	50 %	50 %	310286560
1023	NC_014616	CCG	2	6	51423	51428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286560
1024	NC_014616	CTG	2	6	51440	51445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286560
1025	NC_014616	CCG	2	6	51446	51451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286560
1026	NC_014616	TCA	2	6	51495	51500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286560
1027	NC_014616	CTGC	2	8	51601	51608	0 %	25 %	25 %	50 %	310286560
1028	NC_014616	CGC	2	6	51788	51793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286561
1029	NC_014616	TCC	2	6	51813	51818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286561
1030	NC_014616	GCC	2	6	51909	51914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286561
1031	NC_014616	GC	3	6	51923	51928	0 %	0 %	50 %	50 %	310286561
1032	NC_014616	GCG	2	6	52015	52020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286561
1033	NC_014616	TGA	2	6	52117	52122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286561
1034	NC_014616	CCG	2	6	52195	52200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286561
1035	NC_014616	GT	3	6	52238	52243	0 %	50 %	50 %	0 %	310286561
1036	NC_014616	CGC	3	9	52247	52255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286561
1037	NC_014616	ATGGC	2	10	52287	52296	20 %	20 %	40 %	20 %	310286561
1038	NC_014616	AT	3	6	52387	52392	50 %	50 %	0 %	0 %	310286561
1039	NC_014616	ATC	2	6	52446	52451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286561
1040	NC_014616	TCC	2	6	52527	52532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286561
1041	NC_014616	CGCC	2	8	52549	52556	0 %	0 %	25 %	75 %	310286561
1042	NC_014616	CG	3	6	52633	52638	0 %	0 %	50 %	50 %	310286561
1043	NC_014616	CGC	2	6	52649	52654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286561
1044	NC_014616	CGG	2	6	52662	52667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286561
1045	NC_014616	TCC	2	6	52767	52772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	310286561
1046	NC_014616	GCAGC	2	10	53482	53491	20 %	0 %	40 %	40 %	310286562
1047	NC_014616	GCC	2	6	53500	53505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286562
1048	NC_014616	GTC	2	6	53594	53599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1049	NC_014616	TCG	2	6	53625	53630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1050	NC_014616	GTC	2	6	53666	53671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1051	NC_014616	ATG	2	6	53768	53773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286562
1052	NC_014616	GAC	2	6	53797	53802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1053	NC_014616	GAG	2	6	53807	53812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286562
1054	NC_014616	GCC	2	6	53871	53876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286562
1055	NC_014616	GCGT	2	8	53911	53918	0 %	25 %	50 %	25 %	310286562
1056	NC_014616	AGG	2	6	53931	53936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286562
1057	NC_014616	TCG	2	6	53945	53950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1058	NC_014616	CGG	2	6	54134	54139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286562
1059	NC_014616	TGA	2	6	54196	54201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286562
1060	NC_014616	AGG	2	6	54246	54251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286562
1061	NC_014616	TGC	2	6	54360	54365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286562
1062	NC_014616	GCG	2	6	55025	55030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1063	NC_014616	TACG	2	8	55070	55077	25 %	25 %	25 %	25 %	310286563
1064	NC_014616	GC	3	6	55084	55089	0 %	0 %	50 %	50 %	310286563
1065	NC_014616	CGG	2	6	55111	55116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1066	NC_014616	CGG	2	6	55150	55155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1067	NC_014616	CAG	2	6	55160	55165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286563
1068	NC_014616	GCGG	2	8	55177	55184	0 %	0 %	75 %	25 %	310286563
1069	NC_014616	TCGG	2	8	55218	55225	0 %	25 %	50 %	25 %	310286563
1070	NC_014616	CTT	2	6	55229	55234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286563
1071	NC_014616	CGG	2	6	55255	55260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1072	NC_014616	ATG	2	6	55272	55277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286563
1073	NC_014616	CGG	2	6	55348	55353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1074	NC_014616	TTC	2	6	55371	55376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286563
1075	NC_014616	GCG	2	6	55397	55402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1076	NC_014616	AGA	2	6	55471	55476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286563
1077	NC_014616	AGC	2	6	55509	55514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286563
1078	NC_014616	GCA	3	9	55606	55614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286563
1079	NC_014616	CGGC	2	8	55624	55631	0 %	0 %	50 %	50 %	310286563
1080	NC_014616	CGG	2	6	55633	55638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1081	NC_014616	CAT	2	6	55649	55654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286563
1082	NC_014616	CGG	2	6	55675	55680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1083	NC_014616	GTG	2	6	55728	55733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286563
1084	NC_014616	CGGT	2	8	55737	55744	0 %	25 %	50 %	25 %	310286563
1085	NC_014616	GAT	3	9	55763	55771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286563
1086	NC_014616	CGC	2	6	55783	55788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286563
1087	NC_014616	AGT	2	6	55825	55830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286563
1088	NC_014616	GGC	2	6	55843	55848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286563
1089	NC_014616	CGGCT	2	10	55886	55895	0 %	20 %	40 %	40 %	310286563
1090	NC_014616	CTT	2	6	55925	55930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286563
1091	NC_014616	TGC	2	6	55977	55982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286563
1092	NC_014616	CAG	2	6	56167	56172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286564
1093	NC_014616	ACC	2	6	56200	56205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286564
1094	NC_014616	ATG	2	6	56303	56308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286564
1095	NC_014616	CGC	2	6	56313	56318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286564
1096	NC_014616	GCG	2	6	56389	56394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286564
1097	NC_014616	GCCG	2	8	56415	56422	0 %	0 %	50 %	50 %	310286564
1098	NC_014616	CCCATG	2	12	56479	56490	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	310286564
1099	NC_014616	AAG	2	6	56509	56514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	310286564
1100	NC_014616	GGCGT	2	10	56784	56793	0 %	20 %	60 %	20 %	310286565
1101	NC_014616	GGCG	2	8	56813	56820	0 %	0 %	75 %	25 %	310286565
1102	NC_014616	ACG	2	6	56875	56880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286565
1103	NC_014616	TGA	2	6	56899	56904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286565
1104	NC_014616	CG	3	6	56951	56956	0 %	0 %	50 %	50 %	310286565
1105	NC_014616	CG	3	6	57147	57152	0 %	0 %	50 %	50 %	310286565
1106	NC_014616	GCG	2	6	57167	57172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286565
1107	NC_014616	GTC	2	6	57191	57196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286565
1108	NC_014616	GAC	2	6	57215	57220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286565
1109	NC_014616	CGGC	2	8	57300	57307	0 %	0 %	50 %	50 %	310286565
1110	NC_014616	AGG	2	6	57352	57357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	310286565
1111	NC_014616	GGC	2	6	57476	57481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286565
1112	NC_014616	AGC	2	6	57565	57570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286566
1113	NC_014616	CCCATA	2	12	57617	57628	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	310286566
1114	NC_014616	TGC	2	6	57664	57669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286566
1115	NC_014616	ACG	2	6	57707	57712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286566
1116	NC_014616	AGC	2	6	57806	57811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286566
1117	NC_014616	CAC	2	6	57834	57839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286566
1118	NC_014616	ATC	2	6	57886	57891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286566
1119	NC_014616	GCGG	2	8	57898	57905	0 %	0 %	75 %	25 %	310286566
1120	NC_014616	CCA	2	6	57938	57943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286566
1121	NC_014616	CTG	2	6	57952	57957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286566
1122	NC_014616	TGA	2	6	57967	57972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	310286566
1123	NC_014616	GCG	2	6	58167	58172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286567
1124	NC_014616	CGG	2	6	58201	58206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	310286567
1125	NC_014616	GCC	2	6	58324	58329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286567
1126	NC_014616	ACG	2	6	58398	58403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286567
1127	NC_014616	GCC	2	6	58505	58510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	310286567
1128	NC_014616	ACG	2	6	58518	58523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	310286567
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1130	NC_014616	CGT	2	6	58641	58646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286567
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1133	NC_014616	CAA	2	6	58711	58716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	310286567
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1232	NC_014616	GCT	2	6	64373	64378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286571
1233	NC_014616	TGCGG	2	10	64380	64389	0 %	20 %	60 %	20 %	310286571
1234	NC_014616	TTC	2	6	64459	64464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	310286571
1235	NC_014616	TCA	2	6	64471	64476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	310286571
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1493	NC_014616	GCCA	2	8	79711	79718	25 %	0 %	25 %	50 %	310286583
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1497	NC_014616	CTG	2	6	79920	79925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	310286583
1498	NC_014616	GACC	2	8	79964	79971	25 %	0 %	25 %	50 %	310286583
1499	NC_014616	ACC	2	6	79983	79988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	310286583
1500	NC_014616	GTG	2	6	80061	80066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	310286583

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