MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Butyrivibrio proteoclasticus B316 plasmid pCY186

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014390	AGGGG	2	10	1813	1822	20 %	0 %	80 %	0 %	302668501
2	NC_014390	AGATA	2	10	2841	2850	60 %	20 %	20 %	0 %	302668502
3	NC_014390	ATGGT	2	10	4540	4549	20 %	40 %	40 %	0 %	302668504
4	NC_014390	TAGGA	2	10	4692	4701	40 %	20 %	40 %	0 %	302668504
5	NC_014390	AATGG	2	10	5266	5275	40 %	20 %	40 %	0 %	302668504
6	NC_014390	ATGCA	2	10	5313	5322	40 %	20 %	20 %	20 %	302668504
7	NC_014390	CAGGA	2	10	6500	6509	40 %	0 %	40 %	20 %	302668504
8	NC_014390	TGATA	2	10	9311	9320	40 %	40 %	20 %	0 %	302668505
9	NC_014390	TATCA	2	10	9636	9645	40 %	40 %	0 %	20 %	302668505
10	NC_014390	GTGGC	2	10	9748	9757	0 %	20 %	60 %	20 %	302668506
11	NC_014390	CAAAG	2	10	10952	10961	60 %	0 %	20 %	20 %	302668507
12	NC_014390	AAGAT	2	10	13436	13445	60 %	20 %	20 %	0 %	302668508
13	NC_014390	GATAA	2	10	15641	15650	60 %	20 %	20 %	0 %	302668510
14	NC_014390	AAAGT	2	10	17254	17263	60 %	20 %	20 %	0 %	302668511
15	NC_014390	ACAGA	2	10	17503	17512	60 %	0 %	20 %	20 %	302668512
16	NC_014390	GAAGA	2	10	18379	18388	60 %	0 %	40 %	0 %	302668513
17	NC_014390	AAGAG	2	10	19848	19857	60 %	0 %	40 %	0 %	302668513
18	NC_014390	GAAAG	2	10	20628	20637	60 %	0 %	40 %	0 %	302668514
19	NC_014390	GGAAT	2	10	21978	21987	40 %	20 %	40 %	0 %	302668515
20	NC_014390	AAGAA	2	10	23892	23901	80 %	0 %	20 %	0 %	302668518
21	NC_014390	ATCTG	2	10	26143	26152	20 %	40 %	20 %	20 %	302668521
22	NC_014390	GAAAA	2	10	27507	27516	80 %	0 %	20 %	0 %	302668523
23	NC_014390	AAAGA	2	10	29436	29445	80 %	0 %	20 %	0 %	302668524
24	NC_014390	AGCAT	2	10	31314	31323	40 %	20 %	20 %	20 %	302668526
25	NC_014390	GAGAT	2	10	31923	31932	40 %	20 %	40 %	0 %	302668526
26	NC_014390	GTTCA	2	10	32687	32696	20 %	40 %	20 %	20 %	302668526
27	NC_014390	TTCCT	2	10	34179	34188	0 %	60 %	0 %	40 %	302668527
28	NC_014390	TATAA	2	10	35130	35139	60 %	40 %	0 %	0 %	302668528
29	NC_014390	TATAC	2	10	35167	35176	40 %	40 %	0 %	20 %	302668528
30	NC_014390	AAAGA	2	10	35827	35836	80 %	0 %	20 %	0 %	302668529
31	NC_014390	GTCAC	2	10	37302	37311	20 %	20 %	20 %	40 %	302668530
32	NC_014390	CACAT	2	10	39159	39168	40 %	20 %	0 %	40 %	302668532
33	NC_014390	CTTTG	2	10	45195	45204	0 %	60 %	20 %	20 %	302668538
34	NC_014390	AGGGT	2	10	45424	45433	20 %	20 %	60 %	0 %	302668538
35	NC_014390	AGATG	2	10	45434	45443	40 %	20 %	40 %	0 %	302668538
36	NC_014390	CTGTA	2	10	47881	47890	20 %	40 %	20 %	20 %	302668541
37	NC_014390	AAAGG	2	10	49726	49735	60 %	0 %	40 %	0 %	302668542
38	NC_014390	ATGGT	2	10	51108	51117	20 %	40 %	40 %	0 %	302668542
39	NC_014390	GAAAA	2	10	51859	51868	80 %	0 %	20 %	0 %	302668544
40	NC_014390	AGTTA	2	10	52080	52089	40 %	40 %	20 %	0 %	302668545
41	NC_014390	AAAAG	2	10	54385	54394	80 %	0 %	20 %	0 %	302668547
42	NC_014390	ATTGG	2	10	54930	54939	20 %	40 %	40 %	0 %	302668548
43	NC_014390	GAGCA	2	10	55906	55915	40 %	0 %	40 %	20 %	302668549
44	NC_014390	TGTCG	2	10	57935	57944	0 %	40 %	40 %	20 %	302668554
45	NC_014390	AGGTG	2	10	64531	64540	20 %	20 %	60 %	0 %	302668563
46	NC_014390	AAAAT	2	10	64679	64688	80 %	20 %	0 %	0 %	302668564
47	NC_014390	TTTTC	2	10	70626	70635	0 %	80 %	0 %	20 %	302668570
48	NC_014390	TATAT	2	10	74045	74054	40 %	60 %	0 %	0 %	302668575
49	NC_014390	AAAAT	2	10	81964	81973	80 %	20 %	0 %	0 %	302668585
50	NC_014390	TATCG	2	10	82225	82234	20 %	40 %	20 %	20 %	302668586
51	NC_014390	ACTTT	2	10	82377	82386	20 %	60 %	0 %	20 %	302668586
52	NC_014390	AGGAA	2	10	85631	85640	60 %	0 %	40 %	0 %	302668593
53	NC_014390	AGAAC	2	10	86120	86129	60 %	0 %	20 %	20 %	302668594
54	NC_014390	TTCAC	2	10	89785	89794	20 %	40 %	0 %	40 %	302668597
55	NC_014390	AGAAA	2	10	90793	90802	80 %	0 %	20 %	0 %	302668597
56	NC_014390	TTTTC	2	10	91514	91523	0 %	80 %	0 %	20 %	302668598
57	NC_014390	TGAAC	2	10	93081	93090	40 %	20 %	20 %	20 %	302668599
58	NC_014390	ATATT	2	10	93164	93173	40 %	60 %	0 %	0 %	302668599
59	NC_014390	GAATT	2	10	94307	94316	40 %	40 %	20 %	0 %	302668600
60	NC_014390	AAGAA	3	15	96198	96212	80 %	0 %	20 %	0 %	302668601
61	NC_014390	GGGAA	2	10	96467	96476	40 %	0 %	60 %	0 %	302668601
62	NC_014390	AATCA	2	10	97075	97084	60 %	20 %	0 %	20 %	302668601
63	NC_014390	ATGGT	2	10	98378	98387	20 %	40 %	40 %	0 %	302668602
64	NC_014390	AAAAG	2	10	98622	98631	80 %	0 %	20 %	0 %	302668602
65	NC_014390	TTTTC	2	10	102884	102893	0 %	80 %	0 %	20 %	302668605
66	NC_014390	TATTG	2	10	103189	103198	20 %	60 %	20 %	0 %	302668605
67	NC_014390	CAGGG	2	10	105294	105303	20 %	0 %	60 %	20 %	302668608
68	NC_014390	CAAAA	2	10	112380	112389	80 %	0 %	0 %	20 %	302668615
69	NC_014390	CAACT	2	10	113650	113659	40 %	20 %	0 %	40 %	302668616
70	NC_014390	CTTTA	2	10	115341	115350	20 %	60 %	0 %	20 %	302668618
71	NC_014390	TATTG	2	10	117309	117318	20 %	60 %	20 %	0 %	302668619
72	NC_014390	TTTTC	2	10	119708	119717	0 %	80 %	0 %	20 %	302668622
73	NC_014390	CCTTT	2	10	119727	119736	0 %	60 %	0 %	40 %	302668622
74	NC_014390	GATAA	2	10	119788	119797	60 %	20 %	20 %	0 %	302668622
75	NC_014390	GATTG	2	10	120434	120443	20 %	40 %	40 %	0 %	302668622
76	NC_014390	CTGTT	2	10	123594	123603	0 %	60 %	20 %	20 %	302668623
77	NC_014390	TAAAT	2	10	124029	124038	60 %	40 %	0 %	0 %	302668624
78	NC_014390	CATCC	2	10	125936	125945	20 %	20 %	0 %	60 %	302668626
79	NC_014390	CACTT	2	10	126142	126151	20 %	40 %	0 %	40 %	302668626
80	NC_014390	TCCTT	2	10	128070	128079	0 %	60 %	0 %	40 %	302668627
81	NC_014390	CAAAG	2	10	130150	130159	60 %	0 %	20 %	20 %	302668629
82	NC_014390	CATGT	2	10	130822	130831	20 %	40 %	20 %	20 %	302668629
83	NC_014390	ATCTT	2	10	134831	134840	20 %	60 %	0 %	20 %	302668634
84	NC_014390	AGATA	2	10	139474	139483	60 %	20 %	20 %	0 %	302668643
85	NC_014390	TATAT	2	10	145042	145051	40 %	60 %	0 %	0 %	302668647
86	NC_014390	TTTTA	2	10	145339	145348	20 %	80 %	0 %	0 %	302668647
87	NC_014390	CAGAT	2	10	147074	147083	40 %	20 %	20 %	20 %	302668649
88	NC_014390	CTTTC	2	10	149417	149426	0 %	60 %	0 %	40 %	302668650
89	NC_014390	CTCTT	2	10	153627	153636	0 %	60 %	0 %	40 %	302668656
90	NC_014390	AATAT	2	10	155524	155533	60 %	40 %	0 %	0 %	302668658
91	NC_014390	CATAT	2	10	156137	156146	40 %	40 %	0 %	20 %	302668660
92	NC_014390	CAATC	2	10	156753	156762	40 %	20 %	0 %	40 %	302668661
93	NC_014390	CTTTT	2	10	158274	158283	0 %	80 %	0 %	20 %	302668664
94	NC_014390	ATTTC	2	10	158671	158680	20 %	60 %	0 %	20 %	302668664
95	NC_014390	CTCTT	2	10	159508	159517	0 %	60 %	0 %	40 %	302668665
96	NC_014390	AAACT	2	10	160320	160329	60 %	20 %	0 %	20 %	302668666
97	NC_014390	CATAA	2	10	164309	164318	60 %	20 %	0 %	20 %	302668675
98	NC_014390	GATAA	2	10	164809	164818	60 %	20 %	20 %	0 %	302668676
99	NC_014390	GCTCC	2	10	166001	166010	0 %	20 %	20 %	60 %	302668679
100	NC_014390	CTTCT	2	10	166039	166048	0 %	60 %	0 %	40 %	302668679
101	NC_014390	TTTTC	2	10	166472	166481	0 %	80 %	0 %	20 %	302668679
102	NC_014390	AGAAA	2	10	167715	167724	80 %	0 %	20 %	0 %	302668682
103	NC_014390	TTGCT	2	10	167834	167843	0 %	60 %	20 %	20 %	302668682
104	NC_014390	GGACA	2	10	168785	168794	40 %	0 %	40 %	20 %	302668683
105	NC_014390	AAAAG	2	10	171954	171963	80 %	0 %	20 %	0 %	302668686
106	NC_014390	ATCTT	2	10	175696	175705	20 %	60 %	0 %	20 %	302668690
107	NC_014390	GACTG	2	10	176996	177005	20 %	20 %	40 %	20 %	302668690
108	NC_014390	GAAAA	2	10	181640	181649	80 %	0 %	20 %	0 %	302668694
109	NC_014390	AAAGA	2	10	184242	184251	80 %	0 %	20 %	0 %	302668696

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.