MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 1565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	TTGGGG	2	12	1510	1521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869641
2	NC_014330	ATTTTA	2	12	3320	3331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
3	NC_014330	AGATAA	2	12	7979	7990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300869646
4	NC_014330	CTTTTG	2	12	12039	12050	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	300869651
5	NC_014330	AATTAT	2	12	15632	15643	50 %	50 %	0 %	0 %	300869654
6	NC_014330	TATTTT	2	12	16775	16786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300869655
7	NC_014330	ATGTTC	2	12	18519	18530	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300869656
8	NC_014330	TGAAGA	2	12	19166	19177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300869657
9	NC_014330	TTAGGA	2	12	20388	20399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869659
10	NC_014330	TAAAAA	2	12	21414	21425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869660
11	NC_014330	CTATAT	2	12	22285	22296	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869661
12	NC_014330	AATATA	2	12	22629	22640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869661
13	NC_014330	CTTTAT	2	12	24972	24983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869662
14	NC_014330	AAATAC	2	12	25381	25392	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	300869662
15	NC_014330	CTTTTT	2	12	28826	28837	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869666
16	NC_014330	AAAATA	2	12	29933	29944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869668
17	NC_014330	TGAAGC	2	12	31466	31477	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300869669
18	NC_014330	TAAAAA	2	12	33359	33370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869670
19	NC_014330	TCTTTT	2	12	33953	33964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869671
20	NC_014330	TTCTAT	2	12	35185	35196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869671
21	NC_014330	ATAAAA	2	12	36971	36982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869673
22	NC_014330	CTTTTT	2	12	37522	37533	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869674
23	NC_014330	ATATTC	2	12	39331	39342	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869675
24	NC_014330	CTTTTA	2	12	39357	39368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869675
25	NC_014330	CACCAA	2	12	47088	47099	50 %	0 %	0 %	50 %	300869682
26	NC_014330	TGAATA	2	12	47100	47111	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300869682
27	NC_014330	TAGCAA	2	12	49499	49510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300869684
28	NC_014330	TATCAT	2	12	51145	51156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869687
29	NC_014330	CATTTA	2	12	53506	53517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869689
30	NC_014330	GATAAA	2	12	53822	53833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300869689
31	NC_014330	TGCGTA	2	12	56280	56291	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300869692
32	NC_014330	TACTTT	2	12	62610	62621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869697
33	NC_014330	TCAATA	2	12	63854	63865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300869698
34	NC_014330	AGATAA	2	12	66972	66983	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300869700
35	NC_014330	TATGTT	2	12	66991	67002	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	300869700
36	NC_014330	CTATAT	2	12	67533	67544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869701
37	NC_014330	AAGTAT	2	12	67951	67962	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300869701
38	NC_014330	ATATTA	2	12	69144	69155	50 %	50 %	0 %	0 %	300869702
39	NC_014330	TTTCTC	2	12	70738	70749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869704
40	NC_014330	TATAGC	2	12	71039	71050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869704
41	NC_014330	AGCTGG	2	12	74901	74912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300869707
42	NC_014330	ATTTCT	2	12	75472	75483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869707
43	NC_014330	AATAAA	2	12	78573	78584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869710
44	NC_014330	TAAAAT	2	12	79300	79311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869712
45	NC_014330	CTCCAA	2	12	79576	79587	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	300869712
46	NC_014330	AAAATA	2	12	79930	79941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869712
47	NC_014330	AGATAA	2	12	80320	80331	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300869713
48	NC_014330	AATATC	2	12	80805	80816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300869714
49	NC_014330	CTAATG	2	12	81712	81723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869715
50	NC_014330	AAATAT	2	12	83400	83411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869717
51	NC_014330	ATTTAT	2	12	86976	86987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869721
52	NC_014330	AAATTA	2	12	87625	87636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869723
53	NC_014330	TGAAGA	2	12	90035	90046	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300869725
54	NC_014330	AAAGAA	2	12	91029	91040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	300869725
55	NC_014330	TAATCT	2	12	93410	93421	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869725
56	NC_014330	CAAGAA	2	12	93919	93930	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	300869726
57	NC_014330	CATTTC	2	12	94943	94954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	300869727
58	NC_014330	CTAGCA	2	12	95082	95093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300869727
59	NC_014330	TTTGGT	2	12	95335	95346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869727
60	NC_014330	CTTTCT	2	12	95685	95696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869727
61	NC_014330	TATAGA	2	12	99189	99200	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300869729
62	NC_014330	TCTTTT	2	12	100086	100097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869730
63	NC_014330	AGCACC	2	12	101759	101770	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	300869732
64	NC_014330	TCATAA	2	12	102253	102264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300869734
65	NC_014330	TCATAT	2	12	102941	102952	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869734
66	NC_014330	AAATAT	2	12	104784	104795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869735
67	NC_014330	TAATAT	2	12	107009	107020	50 %	50 %	0 %	0 %	300869736
68	NC_014330	AAAAAT	2	12	110259	110270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869738
69	NC_014330	ATTTTT	2	12	113835	113846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300869742
70	NC_014330	GTTGGT	2	12	117257	117268	0 %	50 %	50 %	0 %	300869746
71	NC_014330	GGCACT	2	12	118055	118066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300869747
72	NC_014330	ATTTAT	2	12	121602	121613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869751
73	NC_014330	TTGCTG	2	12	124592	124603	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	300869754
74	NC_014330	ATAAAA	2	12	125344	125355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869755
75	NC_014330	ATTCTT	2	12	125771	125782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869756
76	NC_014330	TTATCA	2	12	125989	126000	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869756
77	NC_014330	ATGAAT	2	12	126236	126247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300869756
78	NC_014330	ATAATG	2	12	126457	126468	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300869756
79	NC_014330	GGAGCT	2	12	127408	127419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	300869756
80	NC_014330	AATGAA	2	12	132866	132877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300869761
81	NC_014330	CTCATA	2	12	134367	134378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869763
82	NC_014330	TATTAG	2	12	135229	135240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300869763
83	NC_014330	AAATGG	2	12	135807	135818	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	300869764
84	NC_014330	TAGCAT	2	12	139648	139659	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869767
85	NC_014330	TCACTA	2	12	140809	140820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869768
86	NC_014330	ATTGTA	2	12	143994	144005	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300869769
87	NC_014330	CTTTTT	2	12	146121	146132	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869771
88	NC_014330	AGAGAA	2	12	148923	148934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869773
89	NC_014330	CATAAG	2	12	152542	152553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300869776
90	NC_014330	CGCTAT	2	12	154771	154782	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300869778
91	NC_014330	ATTAAA	2	12	156712	156723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869779
92	NC_014330	AATATT	2	12	157664	157675	50 %	50 %	0 %	0 %	300869779
93	NC_014330	TATAGA	2	12	157822	157833	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300869779
94	NC_014330	TTTATT	2	12	158837	158848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300869780
95	NC_014330	GCATAT	2	12	159972	159983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869781
96	NC_014330	ATCAAA	2	12	162794	162805	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	300869785
97	NC_014330	CTATAT	2	12	162847	162858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869785
98	NC_014330	AGAAAA	2	12	164564	164575	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	300869787
99	NC_014330	AAAAGA	2	12	167733	167744	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	300869790
100	NC_014330	AAAATA	2	12	169020	169031	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300869791
101	NC_014330	TTAATA	2	12	173155	173166	50 %	50 %	0 %	0 %	300869796
102	NC_014330	TAAATC	2	12	173319	173330	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300869796
103	NC_014330	ACCAAG	2	12	174434	174445	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	300869798
104	NC_014330	ATTAAT	2	12	176315	176326	50 %	50 %	0 %	0 %	300869801
105	NC_014330	CTTTAT	2	12	178362	178373	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869803
106	NC_014330	TTTAAT	2	12	179663	179674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869805
107	NC_014330	CATTAT	2	12	181486	181497	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869806
108	NC_014330	CATAAA	2	12	181579	181590	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	300869806
109	NC_014330	ATATTC	2	12	183845	183856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869807
110	NC_014330	ATTTTT	2	12	184106	184117	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300869807
111	NC_014330	TTACAT	2	12	184217	184228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869808
112	NC_014330	TTTCTT	2	12	184972	184983	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300869809
113	NC_014330	TCTTTC	2	12	185016	185027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869809
114	NC_014330	TTCATT	2	12	185856	185867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869809
115	NC_014330	TCATTT	2	12	187719	187730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869809
116	NC_014330	TAGTTC	2	12	187810	187821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300869809
117	NC_014330	ATTTTT	2	12	188089	188100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	300869810
118	NC_014330	TAATTC	2	12	188580	188591	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	300869810
119	NC_014330	TTTATC	2	12	189042	189053	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869810
120	NC_014330	TGTAAT	2	12	190068	190079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300869811
121	NC_014330	AGATAA	2	12	191441	191452	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300869812
122	NC_014330	TGATAT	2	12	191961	191972	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300869813
123	NC_014330	GTTGAT	2	12	193195	193206	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	300869813
124	NC_014330	TTCAAA	2	12	194719	194730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300869814
125	NC_014330	TTACTT	2	12	195092	195103	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300869815
126	NC_014330	ATTATA	2	12	195913	195924	50 %	50 %	0 %	0 %	300869816
127	NC_014330	ATTTAG	2	12	196126	196137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	300869816
128	NC_014330	TAATAT	2	12	196886	196897	50 %	50 %	0 %	0 %	300869816
129	NC_014330	CGCATT	2	12	197370	197381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300869817
130	NC_014330	TTTCCT	2	12	203065	203076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869824
131	NC_014330	CTATAG	2	12	203864	203875	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869824
132	NC_014330	TCAGTT	2	12	204994	205005	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	300869825
133	NC_014330	TGAGCA	2	12	205465	205476	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300869825
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236	NC_014330	ATTTAA	2	12	399106	399117	50 %	50 %	0 %	0 %	300869992
237	NC_014330	TATGAC	2	12	399673	399684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300869992
238	NC_014330	GGATTT	2	12	400927	400938	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	300869993
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337	NC_014330	CCTGCT	2	12	558595	558606	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	300870132
338	NC_014330	GCTAAA	2	12	559039	559050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300870132
339	NC_014330	CTAATG	2	12	561478	561489	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	300870133
340	NC_014330	CAGATG	2	12	561579	561590	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300870133
341	NC_014330	AAATTA	3	18	561864	561881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300870133
342	NC_014330	TACAAA	2	12	565297	565308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	300870137
343	NC_014330	CCTATA	2	12	567123	567134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300870138
344	NC_014330	CATTTT	2	12	571726	571737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300870141
345	NC_014330	TTTTCA	2	12	575444	575455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300870145
346	NC_014330	GCTAAA	2	12	575845	575856	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300870145
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348	NC_014330	TTCTTT	2	12	584796	584807	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300870153
349	NC_014330	TTCTTT	2	12	587096	587107	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	300870157
350	NC_014330	CAAAAG	2	12	589567	589578	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	300870160
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352	NC_014330	CAAGTA	2	12	592168	592179	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300870163
353	NC_014330	TATCAA	2	12	596376	596387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	300870168
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456	NC_014330	CTAAAG	2	12	781870	781881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300870336
457	NC_014330	ATCAGC	2	12	782360	782371	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300870336
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460	NC_014330	ATAAAA	2	12	792814	792825	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	300870345
461	NC_014330	ATAGAT	2	12	793527	793538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300870345
462	NC_014330	TATAGG	2	12	794735	794746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300870346
463	NC_014330	TATTTC	2	12	796856	796867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300870349
464	NC_014330	TTTAAT	2	12	797115	797126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300870349
465	NC_014330	TAGCCT	2	12	799171	799182	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	300870350
466	NC_014330	TGAGCT	2	12	801067	801078	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300870352
467	NC_014330	TGCTTT	2	12	802260	802271	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	300870352
468	NC_014330	TAGAAT	2	12	802425	802436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	300870353
469	NC_014330	CTTTTA	2	12	803349	803360	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	300870353
470	NC_014330	CCTAAA	2	12	803366	803377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	300870353
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