MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli 95/1000 chromosome

Total Repeats: 40290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014330	AGA	2	6	1222	1227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
2	NC_014330	AGA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
3	NC_014330	GAA	2	6	1418	1423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
4	NC_014330	AGA	2	6	1459	1464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
5	NC_014330	ATA	2	6	1529	1534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
6	NC_014330	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
7	NC_014330	ATT	3	9	1611	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
8	NC_014330	TAG	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
9	NC_014330	ATA	2	6	1940	1945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
10	NC_014330	ATT	2	6	2038	2043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
11	NC_014330	AGA	2	6	2058	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
12	NC_014330	ATG	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
13	NC_014330	TAA	2	6	2157	2162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
14	NC_014330	TGA	2	6	2194	2199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
15	NC_014330	ATT	2	6	2201	2206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
16	NC_014330	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869641
17	NC_014330	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
18	NC_014330	TGA	2	6	2299	2304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869641
19	NC_014330	ATA	2	6	2315	2320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
20	NC_014330	TAA	2	6	2365	2370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
21	NC_014330	TGG	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869641
22	NC_014330	AAG	2	6	2393	2398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869641
23	NC_014330	TAA	2	6	2482	2487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869641
24	NC_014330	ATA	2	6	2632	2637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
25	NC_014330	TGG	2	6	2650	2655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300869642
26	NC_014330	AGA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
27	NC_014330	TAA	2	6	2781	2786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
28	NC_014330	ATT	3	9	2990	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
29	NC_014330	AGA	2	6	3009	3014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
30	NC_014330	ATT	3	9	3053	3061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
31	NC_014330	TAA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
32	NC_014330	AAT	2	6	3163	3168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
33	NC_014330	TAA	2	6	3273	3278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
34	NC_014330	ATT	2	6	3302	3307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
35	NC_014330	TAA	2	6	3309	3314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
36	NC_014330	GTA	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869642
37	NC_014330	AGA	3	9	3465	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869642
38	NC_014330	TAA	2	6	3495	3500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
39	NC_014330	ATA	2	6	3508	3513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
40	NC_014330	ATT	2	6	3543	3548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869642
41	NC_014330	TAA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869642
42	NC_014330	AGT	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869642
43	NC_014330	GGA	2	6	3646	3651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869642
44	NC_014330	TCA	2	6	4140	4145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869643
45	NC_014330	TAT	2	6	4150	4155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
46	NC_014330	TCT	2	6	4208	4213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869643
47	NC_014330	ATA	2	6	4290	4295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869643
48	NC_014330	AAG	2	6	4302	4307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869643
49	NC_014330	AGG	2	6	4366	4371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869643
50	NC_014330	TGC	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869643
51	NC_014330	ATT	2	6	4461	4466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
52	NC_014330	TAG	2	6	4500	4505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869643
53	NC_014330	TAT	2	6	4544	4549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
54	NC_014330	AGA	2	6	4603	4608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869643
55	NC_014330	TAT	2	6	4639	4644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
56	NC_014330	GAT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869643
57	NC_014330	AGA	2	6	4826	4831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869643
58	NC_014330	TTA	2	6	5015	5020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869643
59	NC_014330	ATA	2	6	5079	5084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869643
60	NC_014330	TGC	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869644
61	NC_014330	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869644
62	NC_014330	TAT	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869644
63	NC_014330	CTA	2	6	5608	5613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869644
64	NC_014330	AGA	2	6	5642	5647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869644
65	NC_014330	GAA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869644
66	NC_014330	TAC	2	6	5669	5674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869644
67	NC_014330	TAA	2	6	5675	5680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869644
68	NC_014330	TAA	2	6	5717	5722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869644
69	NC_014330	ACT	2	6	5724	5729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869644
70	NC_014330	AAT	2	6	5743	5748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869644
71	NC_014330	ATT	2	6	5901	5906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
72	NC_014330	AAG	2	6	5944	5949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869645
73	NC_014330	TAA	2	6	5989	5994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869645
74	NC_014330	AGA	3	9	6034	6042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869645
75	NC_014330	ATA	2	6	6134	6139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869645
76	NC_014330	ACT	2	6	6281	6286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869645
77	NC_014330	TAT	2	6	6307	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
78	NC_014330	ATT	2	6	6334	6339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
79	NC_014330	AAG	2	6	6366	6371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869645
80	NC_014330	AGA	2	6	6508	6513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869645
81	NC_014330	TAT	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
82	NC_014330	CTA	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869645
83	NC_014330	AAG	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869645
84	NC_014330	TAT	2	6	6683	6688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
85	NC_014330	TAT	2	6	6710	6715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
86	NC_014330	CTT	2	6	6752	6757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869645
87	NC_014330	ATA	2	6	6765	6770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869645
88	NC_014330	ATA	2	6	6810	6815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869645
89	NC_014330	TAA	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869645
90	NC_014330	AGA	2	6	7036	7041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869645
91	NC_014330	AGC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869645
92	NC_014330	TAA	2	6	7108	7113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869645
93	NC_014330	ATT	2	6	7115	7120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869645
94	NC_014330	ATC	2	6	7442	7447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869646
95	NC_014330	TAA	2	6	7502	7507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
96	NC_014330	TTG	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869646
97	NC_014330	AAT	2	6	7536	7541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
98	NC_014330	ATT	2	6	7572	7577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
99	NC_014330	TTC	2	6	7582	7587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869646
100	NC_014330	ATG	2	6	7597	7602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869646
101	NC_014330	TAT	2	6	7673	7678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
102	NC_014330	CAG	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869646
103	NC_014330	TTC	2	6	7709	7714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869646
104	NC_014330	TTA	2	6	7725	7730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
105	NC_014330	ATG	2	6	7753	7758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869646
106	NC_014330	GGA	2	6	7794	7799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300869646
107	NC_014330	AGC	2	6	7803	7808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869646
108	NC_014330	AAT	2	6	7820	7825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
109	NC_014330	TTG	2	6	7921	7926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869646
110	NC_014330	TTA	2	6	7933	7938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
111	NC_014330	TTA	2	6	7972	7977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
112	NC_014330	TCC	2	6	8042	8047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300869646
113	NC_014330	TAA	2	6	8059	8064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
114	NC_014330	ATA	2	6	8125	8130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
115	NC_014330	TAT	2	6	8150	8155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
116	NC_014330	TTG	2	6	8227	8232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869646
117	NC_014330	GAT	2	6	8349	8354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869646
118	NC_014330	TAA	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
119	NC_014330	ATA	2	6	8430	8435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
120	NC_014330	GAT	3	9	8618	8626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869646
121	NC_014330	TAA	2	6	8708	8713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
122	NC_014330	AGA	2	6	8738	8743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869646
123	NC_014330	GCA	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869646
124	NC_014330	TAA	2	6	8876	8881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
125	NC_014330	TTA	2	6	8893	8898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
126	NC_014330	CTA	2	6	8926	8931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869646
127	NC_014330	ATT	2	6	8954	8959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
128	NC_014330	AGA	2	6	9002	9007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869646
129	NC_014330	TAC	2	6	9017	9022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869646
130	NC_014330	TAA	2	6	9044	9049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
131	NC_014330	AAT	2	6	9054	9059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
132	NC_014330	ATC	2	6	9122	9127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869646
133	NC_014330	TAA	2	6	9272	9277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869646
134	NC_014330	CAT	2	6	9282	9287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869646
135	NC_014330	ACA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300869646
136	NC_014330	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869646
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138	NC_014330	TTA	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
139	NC_014330	GAA	2	6	9459	9464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869646
140	NC_014330	CTG	2	6	9580	9585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300869646
141	NC_014330	ATT	2	6	9595	9600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
142	NC_014330	ATT	2	6	9602	9607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869646
143	NC_014330	TCA	2	6	9687	9692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869647
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145	NC_014330	TCA	2	6	9903	9908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869647
146	NC_014330	CTA	2	6	9925	9930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869647
147	NC_014330	TCT	2	6	9981	9986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869647
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149	NC_014330	ATA	2	6	10001	10006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869647
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151	NC_014330	ATT	2	6	10058	10063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869647
152	NC_014330	TTA	2	6	10083	10088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869647
153	NC_014330	ATG	2	6	10119	10124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300869647
154	NC_014330	AAT	2	6	10255	10260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869648
155	NC_014330	TAT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869648
156	NC_014330	TAT	2	6	10292	10297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869648
157	NC_014330	TTA	2	6	10298	10303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869648
158	NC_014330	AAG	2	6	10315	10320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300869648
159	NC_014330	AAT	2	6	10387	10392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869648
160	NC_014330	ATT	3	9	10397	10405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869648
161	NC_014330	TTA	2	6	10451	10456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869648
162	NC_014330	ATA	2	6	10900	10905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869649
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164	NC_014330	AAT	2	6	11040	11045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300869649
165	NC_014330	TGT	2	6	11063	11068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869649
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169	NC_014330	ATT	2	6	11288	11293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869650
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171	NC_014330	CTT	2	6	11359	11364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869650
172	NC_014330	TTA	2	6	11389	11394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869650
173	NC_014330	ATT	2	6	11486	11491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869650
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182	NC_014330	TAT	2	6	12119	12124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869651
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200	NC_014330	CAG	2	6	13128	13133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300869651
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245	NC_014330	TAT	13	39	15254	15292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
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248	NC_014330	TAT	2	6	15350	15355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
249	NC_014330	TAT	2	6	15383	15388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
250	NC_014330	ATT	3	9	15393	15401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
251	NC_014330	TAT	3	9	15413	15421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
252	NC_014330	TAT	2	6	15447	15452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
253	NC_014330	TGT	2	6	15468	15473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
254	NC_014330	TTC	2	6	15474	15479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
255	NC_014330	TAT	4	12	15506	15517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
256	NC_014330	TAT	2	6	15557	15562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300869654
257	NC_014330	CAT	2	6	15599	15604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300869654
258	NC_014330	TGT	2	6	15609	15614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300869654
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261	NC_014330	TCT	2	6	15658	15663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
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282	NC_014330	TTC	2	6	16529	16534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300869654
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