MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014172	GCAAA	2	10	386	395	60 %	0 %	20 %	20 %	296506383
2	NC_014172	TTCTT	2	10	1504	1513	0 %	80 %	0 %	20 %	296506384
3	NC_014172	TAATG	2	10	11082	11091	40 %	40 %	20 %	0 %	296506394
4	NC_014172	GAATC	2	10	12682	12691	40 %	20 %	20 %	20 %	296506397
5	NC_014172	ATTCC	2	10	15528	15537	20 %	40 %	0 %	40 %	296506399
6	NC_014172	TTTGT	2	10	18290	18299	0 %	80 %	20 %	0 %	296506402
7	NC_014172	AAACC	2	10	19763	19772	60 %	0 %	0 %	40 %	296506403
8	NC_014172	ATATT	2	10	19937	19946	40 %	60 %	0 %	0 %	296506403
9	NC_014172	TTGTT	2	10	20409	20418	0 %	80 %	20 %	0 %	296506403
10	NC_014172	AAAGG	2	10	21363	21372	60 %	0 %	40 %	0 %	296506404
11	NC_014172	CTGTT	2	10	25035	25044	0 %	60 %	20 %	20 %	296506407
12	NC_014172	CAACC	2	10	25720	25729	40 %	0 %	0 %	60 %	296506408
13	NC_014172	TTGCA	2	10	25745	25754	20 %	40 %	20 %	20 %	296506408
14	NC_014172	ATAAA	2	10	27229	27238	80 %	20 %	0 %	0 %	296506411
15	NC_014172	ATAAA	2	10	27670	27679	80 %	20 %	0 %	0 %	296506411
16	NC_014172	AAAAG	2	10	31497	31506	80 %	0 %	20 %	0 %	296506414
17	NC_014172	AGATG	2	10	31861	31870	40 %	20 %	40 %	0 %	296506414
18	NC_014172	CTGGA	2	10	32680	32689	20 %	20 %	40 %	20 %	296506414
19	NC_014172	TAAAT	2	10	35415	35424	60 %	40 %	0 %	0 %	296506415
20	NC_014172	ATCAC	2	10	35524	35533	40 %	20 %	0 %	40 %	296506415
21	NC_014172	ATTTC	2	10	39440	39449	20 %	60 %	0 %	20 %	296506423
22	NC_014172	GAAAA	2	10	40084	40093	80 %	0 %	20 %	0 %	296506424
23	NC_014172	AATTA	2	10	41532	41541	60 %	40 %	0 %	0 %	296506427
24	NC_014172	TAATT	2	10	42072	42081	40 %	60 %	0 %	0 %	296506427
25	NC_014172	CAAAT	2	10	47614	47623	60 %	20 %	0 %	20 %	296506436
26	NC_014172	TTTCT	2	10	48044	48053	0 %	80 %	0 %	20 %	296506436
27	NC_014172	ATTTA	2	10	50045	50054	40 %	60 %	0 %	0 %	296506439
28	NC_014172	AAATT	2	10	50983	50992	60 %	40 %	0 %	0 %	296506441
29	NC_014172	TGTTA	2	10	51176	51185	20 %	60 %	20 %	0 %	296506441
30	NC_014172	TTAAA	2	10	55601	55610	60 %	40 %	0 %	0 %	296506445
31	NC_014172	TAATA	2	10	55827	55836	60 %	40 %	0 %	0 %	296506445
32	NC_014172	TTAGA	2	10	56084	56093	40 %	40 %	20 %	0 %	296506445
33	NC_014172	AAATA	2	10	56585	56594	80 %	20 %	0 %	0 %	296506446
34	NC_014172	TTCTG	2	10	59717	59726	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
35	NC_014172	TTCTG	2	10	59741	59750	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
36	NC_014172	TTCTG	2	10	59765	59774	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
37	NC_014172	TTCTG	2	10	59789	59798	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
38	NC_014172	TTCTG	2	10	59813	59822	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
39	NC_014172	TTCTG	2	10	59837	59846	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
40	NC_014172	CTTCT	2	10	60121	60130	0 %	60 %	0 %	40 %	296506452
41	NC_014172	CTTTT	2	10	61183	61192	0 %	80 %	0 %	20 %	296506452
42	NC_014172	CTTCT	2	10	61520	61529	0 %	60 %	0 %	40 %	296506453
43	NC_014172	TTATT	2	10	62144	62153	20 %	80 %	0 %	0 %	296506453
44	NC_014172	TTTAG	2	10	66973	66982	20 %	60 %	20 %	0 %	296506457
45	NC_014172	GTTTC	2	10	67025	67034	0 %	60 %	20 %	20 %	296506457
46	NC_014172	TTCTT	2	10	69563	69572	0 %	80 %	0 %	20 %	296506458
47	NC_014172	AAATT	2	10	70284	70293	60 %	40 %	0 %	0 %	296506459
48	NC_014172	ATTTG	2	10	74438	74447	20 %	60 %	20 %	0 %	296506461
49	NC_014172	GTATT	2	10	75827	75836	20 %	60 %	20 %	0 %	296506462
50	NC_014172	AGTTT	2	10	75942	75951	20 %	60 %	20 %	0 %	296506462
51	NC_014172	TGTGT	2	10	76219	76228	0 %	60 %	40 %	0 %	296506462
52	NC_014172	AAATT	2	10	77233	77242	60 %	40 %	0 %	0 %	296506463
53	NC_014172	GAAAA	2	10	78953	78962	80 %	0 %	20 %	0 %	296506465
54	NC_014172	TCAAA	2	10	79181	79190	60 %	20 %	0 %	20 %	296506465
55	NC_014172	TAGTA	2	10	79807	79816	40 %	40 %	20 %	0 %	296506465
56	NC_014172	ATATT	2	10	83687	83696	40 %	60 %	0 %	0 %	296506469
57	NC_014172	ATACT	2	10	86839	86848	40 %	40 %	0 %	20 %	296506471
58	NC_014172	ATGTT	2	10	87498	87507	20 %	60 %	20 %	0 %	296506471
59	NC_014172	CAATG	2	10	89206	89215	40 %	20 %	20 %	20 %	296506471
60	NC_014172	TATTT	2	10	90026	90035	20 %	80 %	0 %	0 %	296506472
61	NC_014172	ATTAA	2	10	90447	90456	60 %	40 %	0 %	0 %	296506472
62	NC_014172	CTTCT	2	10	90548	90557	0 %	60 %	0 %	40 %	296506472
63	NC_014172	TTATT	2	10	92057	92066	20 %	80 %	0 %	0 %	296506473
64	NC_014172	TTATC	2	10	95067	95076	20 %	60 %	0 %	20 %	296506474
65	NC_014172	TCAAC	2	10	95905	95914	40 %	20 %	0 %	40 %	296506475
66	NC_014172	TAGTC	2	10	96242	96251	20 %	40 %	20 %	20 %	296506475
67	NC_014172	TATCT	2	10	98590	98599	20 %	60 %	0 %	20 %	296506476
68	NC_014172	ATTGT	2	10	98715	98724	20 %	60 %	20 %	0 %	296506476
69	NC_014172	AAAGC	2	10	100922	100931	60 %	0 %	20 %	20 %	296506477
70	NC_014172	ACTCA	2	10	101430	101439	40 %	20 %	0 %	40 %	296506477
71	NC_014172	AAATC	2	10	102238	102247	60 %	20 %	0 %	20 %	296506477
72	NC_014172	AAAGA	2	10	103537	103546	80 %	0 %	20 %	0 %	296506478
73	NC_014172	GATTA	2	10	106080	106089	40 %	40 %	20 %	0 %	296506481
74	NC_014172	CTAAA	2	10	106239	106248	60 %	20 %	0 %	20 %	296506481
75	NC_014172	ACTAA	2	10	107595	107604	60 %	20 %	0 %	20 %	296506482
76	NC_014172	ATTAG	2	10	107715	107724	40 %	40 %	20 %	0 %	296506482
77	NC_014172	ACTAA	2	10	110598	110607	60 %	20 %	0 %	20 %	296506484
78	NC_014172	AAAAT	2	10	110800	110809	80 %	20 %	0 %	0 %	296506484
79	NC_014172	GAAAT	2	10	111010	111019	60 %	20 %	20 %	0 %	296506484
80	NC_014172	ATTTA	2	10	111154	111163	40 %	60 %	0 %	0 %	296506485
81	NC_014172	CTGGA	2	10	112162	112171	20 %	20 %	40 %	20 %	296506485
82	NC_014172	AGAAA	2	10	112565	112574	80 %	0 %	20 %	0 %	296506485
83	NC_014172	TGAAA	2	10	114815	114824	60 %	20 %	20 %	0 %	296506487
84	NC_014172	AATTT	2	10	115332	115341	40 %	60 %	0 %	0 %	296506487
85	NC_014172	AACTA	2	10	117296	117305	60 %	20 %	0 %	20 %	296506489
86	NC_014172	AGAAA	2	10	120320	120329	80 %	0 %	20 %	0 %	296506492
87	NC_014172	ATTTT	3	15	121053	121067	20 %	80 %	0 %	0 %	296506493
88	NC_014172	CAAGC	2	10	121400	121409	40 %	0 %	20 %	40 %	296506493
89	NC_014172	ATAAA	2	10	121559	121568	80 %	20 %	0 %	0 %	296506493
90	NC_014172	ATTCC	2	10	124308	124317	20 %	40 %	0 %	40 %	296506497
91	NC_014172	AAATT	2	10	124966	124975	60 %	40 %	0 %	0 %	296506498
92	NC_014172	ATGAG	2	10	127028	127037	40 %	20 %	40 %	0 %	296506501
93	NC_014172	GGAAA	2	10	127976	127985	60 %	0 %	40 %	0 %	296506502
94	NC_014172	ATTTC	2	10	128445	128454	20 %	60 %	0 %	20 %	296506502
95	NC_014172	ATGAA	2	10	128796	128805	60 %	20 %	20 %	0 %	296506502
96	NC_014172	GATTG	2	10	135925	135934	20 %	40 %	40 %	0 %	296506508
97	NC_014172	TGGTT	2	10	135940	135949	0 %	60 %	40 %	0 %	296506508
98	NC_014172	CTAAG	2	10	138077	138086	40 %	20 %	20 %	20 %	296506511
99	NC_014172	CAAGG	2	10	138241	138250	40 %	0 %	40 %	20 %	296506511
100	NC_014172	TGGGA	2	10	138441	138450	20 %	20 %	60 %	0 %	296506511
101	NC_014172	AATAT	2	10	138774	138783	60 %	40 %	0 %	0 %	296506512
102	NC_014172	GAAAT	2	10	138831	138840	60 %	20 %	20 %	0 %	296506512
103	NC_014172	AGAAA	2	10	140405	140414	80 %	0 %	20 %	0 %	296506514
104	NC_014172	TAGGT	2	10	140623	140632	20 %	40 %	40 %	0 %	296506515
105	NC_014172	AATAT	2	10	141432	141441	60 %	40 %	0 %	0 %	296506517
106	NC_014172	AAATT	2	10	143693	143702	60 %	40 %	0 %	0 %	296506518
107	NC_014172	TAAAT	2	10	151608	151617	60 %	40 %	0 %	0 %	296506524
108	NC_014172	GAAGA	2	10	152350	152359	60 %	0 %	40 %	0 %	296506524
109	NC_014172	CTGCA	2	10	152421	152430	20 %	20 %	20 %	40 %	296506524
110	NC_014172	AATGT	2	10	153309	153318	40 %	40 %	20 %	0 %	296506525
111	NC_014172	CCTGT	2	10	154730	154739	0 %	40 %	20 %	40 %	296506527
112	NC_014172	GTTTA	2	10	155817	155826	20 %	60 %	20 %	0 %	296506528
113	NC_014172	GATAT	2	10	161379	161388	40 %	40 %	20 %	0 %	296506535
114	NC_014172	ATATT	2	10	161588	161597	40 %	60 %	0 %	0 %	296506535
115	NC_014172	TTTTC	2	10	162070	162079	0 %	80 %	0 %	20 %	296506536
116	NC_014172	GGAGT	2	10	166779	166788	20 %	20 %	60 %	0 %	296506541
117	NC_014172	TCCTA	2	10	171304	171313	20 %	40 %	0 %	40 %	296506544
118	NC_014172	GAATG	2	10	175007	175016	40 %	20 %	40 %	0 %	296506547
119	NC_014172	AAATA	2	10	175311	175320	80 %	20 %	0 %	0 %	296506548
120	NC_014172	GATTG	2	10	175653	175662	20 %	40 %	40 %	0 %	296506549
121	NC_014172	TTTAT	2	10	175695	175704	20 %	80 %	0 %	0 %	296506549
122	NC_014172	CAGAG	2	10	178924	178933	40 %	0 %	40 %	20 %	296506550
123	NC_014172	CAAAT	2	10	180034	180043	60 %	20 %	0 %	20 %	296506550
124	NC_014172	ATGCA	2	10	180592	180601	40 %	20 %	20 %	20 %	296506550
125	NC_014172	AGAAA	2	10	181638	181647	80 %	0 %	20 %	0 %	296506550
126	NC_014172	GAAGA	2	10	184450	184459	60 %	0 %	40 %	0 %	296506550
127	NC_014172	GAAAT	2	10	184759	184768	60 %	20 %	20 %	0 %	296506550
128	NC_014172	CATAA	2	10	187633	187642	60 %	20 %	0 %	20 %	296506551
129	NC_014172	AGAAA	2	10	187905	187914	80 %	0 %	20 %	0 %	296506551
130	NC_014172	CATCA	2	10	188530	188539	40 %	20 %	0 %	40 %	296506551
131	NC_014172	ATGTG	2	10	189069	189078	20 %	40 %	40 %	0 %	296506551
132	NC_014172	ATTTG	2	10	192294	192303	20 %	60 %	20 %	0 %	296506551
133	NC_014172	AAATC	2	10	194226	194235	60 %	20 %	0 %	20 %	296506551
134	NC_014172	ATAGG	2	10	195426	195435	40 %	20 %	40 %	0 %	296506551
135	NC_014172	AAAAT	2	10	196467	196476	80 %	20 %	0 %	0 %	296506552
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.