MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 plasmid pBMB171

Total Repeats: 5479

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014172	TTAGA	2	10	56084	56093	40 %	40 %	20 %	0 %	296506445
1002	NC_014172	TTC	2	6	56097	56102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506445
1003	NC_014172	CATC	2	8	56108	56115	25 %	25 %	0 %	50 %	296506445
1004	NC_014172	AT	3	6	56129	56134	50 %	50 %	0 %	0 %	296506445
1005	NC_014172	TAAT	2	8	56162	56169	50 %	50 %	0 %	0 %	296506446
1006	NC_014172	TA	3	6	56181	56186	50 %	50 %	0 %	0 %	296506446
1007	NC_014172	CAT	2	6	56213	56218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506446
1008	NC_014172	TTA	2	6	56267	56272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506446
1009	NC_014172	AT	3	6	56288	56293	50 %	50 %	0 %	0 %	296506446
1010	NC_014172	T	6	6	56302	56307	0 %	100 %	0 %	0 %	296506446
1011	NC_014172	TAA	2	6	56331	56336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506446
1012	NC_014172	TCT	2	6	56386	56391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506446
1013	NC_014172	AAAT	2	8	56397	56404	75 %	25 %	0 %	0 %	296506446
1014	NC_014172	CTT	2	6	56408	56413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506446
1015	NC_014172	TGC	2	6	56430	56435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506446
1016	NC_014172	TCA	2	6	56449	56454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506446
1017	NC_014172	ATC	2	6	56544	56549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506446
1018	NC_014172	AAATA	2	10	56585	56594	80 %	20 %	0 %	0 %	296506446
1019	NC_014172	A	7	7	56604	56610	100 %	0 %	0 %	0 %	296506446
1020	NC_014172	TA	3	6	56626	56631	50 %	50 %	0 %	0 %	296506446
1021	NC_014172	AGT	2	6	56634	56639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506446
1022	NC_014172	CAA	2	6	56648	56653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296506446
1023	NC_014172	A	6	6	56652	56657	100 %	0 %	0 %	0 %	296506446
1024	NC_014172	A	7	7	56703	56709	100 %	0 %	0 %	0 %	296506447
1025	NC_014172	TGT	2	6	56725	56730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506447
1026	NC_014172	AAT	2	6	56783	56788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506447
1027	NC_014172	GAAT	2	8	56863	56870	50 %	25 %	25 %	0 %	296506447
1028	NC_014172	ATC	2	6	56920	56925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506447
1029	NC_014172	ATT	2	6	56941	56946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506447
1030	NC_014172	T	7	7	56995	57001	0 %	100 %	0 %	0 %	296506447
1031	NC_014172	ATT	2	6	57002	57007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506447
1032	NC_014172	AAC	2	6	57103	57108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296506448
1033	NC_014172	A	6	6	57209	57214	100 %	0 %	0 %	0 %	296506448
1034	NC_014172	CTT	2	6	57222	57227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506448
1035	NC_014172	ATA	2	6	57272	57277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506448
1036	NC_014172	T	7	7	57292	57298	0 %	100 %	0 %	0 %	296506449
1037	NC_014172	T	7	7	57396	57402	0 %	100 %	0 %	0 %	296506449
1038	NC_014172	TTC	2	6	57423	57428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506449
1039	NC_014172	AT	4	8	57497	57504	50 %	50 %	0 %	0 %	296506449
1040	NC_014172	GTT	2	6	57523	57528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506449
1041	NC_014172	T	6	6	57558	57563	0 %	100 %	0 %	0 %	296506449
1042	NC_014172	ATC	2	6	57600	57605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506449
1043	NC_014172	CAAA	2	8	57665	57672	75 %	0 %	0 %	25 %	296506449
1044	NC_014172	TCT	2	6	57700	57705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506449
1045	NC_014172	A	6	6	57761	57766	100 %	0 %	0 %	0 %	296506449
1046	NC_014172	CAT	2	6	57771	57776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506449
1047	NC_014172	AAT	2	6	57799	57804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506449
1048	NC_014172	TAA	2	6	58234	58239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506450
1049	NC_014172	TAAT	2	8	58251	58258	50 %	50 %	0 %	0 %	296506450
1050	NC_014172	AGA	2	6	58276	58281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506450
1051	NC_014172	GTT	3	9	58301	58309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506450
1052	NC_014172	TAA	3	9	58333	58341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506450
1053	NC_014172	CAG	2	6	58397	58402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506450
1054	NC_014172	TA	3	6	58406	58411	50 %	50 %	0 %	0 %	296506450
1055	NC_014172	AAT	2	6	58580	58585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506450
1056	NC_014172	GGT	2	6	58597	58602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506450
1057	NC_014172	AGCT	2	8	58935	58942	25 %	25 %	25 %	25 %	296506451
1058	NC_014172	TAT	2	6	58971	58976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506451
1059	NC_014172	TCT	2	6	58981	58986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506451
1060	NC_014172	AAT	2	6	58997	59002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506451
1061	NC_014172	CTT	2	6	59009	59014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506451
1062	NC_014172	TCCT	2	8	59020	59027	0 %	50 %	0 %	50 %	296506451
1063	NC_014172	CTT	2	6	59108	59113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506451
1064	NC_014172	TTAA	2	8	59164	59171	50 %	50 %	0 %	0 %	296506451
1065	NC_014172	TCTT	2	8	59176	59183	0 %	75 %	0 %	25 %	296506451
1066	NC_014172	T	7	7	59269	59275	0 %	100 %	0 %	0 %	296506451
1067	NC_014172	CAT	2	6	59619	59624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1068	NC_014172	GCAA	2	8	59636	59643	50 %	0 %	25 %	25 %	296506452
1069	NC_014172	TGT	2	6	59665	59670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506452
1070	NC_014172	CTG	2	6	59673	59678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296506452
1071	NC_014172	TTCTG	2	10	59717	59726	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
1072	NC_014172	TTCTG	2	10	59741	59750	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
1073	NC_014172	TTCTG	2	10	59765	59774	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
1074	NC_014172	TTCTG	2	10	59789	59798	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
1075	NC_014172	TTCTG	2	10	59813	59822	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
1076	NC_014172	TTCTG	2	10	59837	59846	0 %	60 %	20 %	20 %	296506452
1077	NC_014172	TTTC	2	8	59886	59893	0 %	75 %	0 %	25 %	296506452
1078	NC_014172	TCCT	2	8	59932	59939	0 %	50 %	0 %	50 %	296506452
1079	NC_014172	TAC	2	6	60004	60009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1080	NC_014172	TAT	2	6	60024	60029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1081	NC_014172	TTA	2	6	60099	60104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1082	NC_014172	CTTCT	2	10	60121	60130	0 %	60 %	0 %	40 %	296506452
1083	NC_014172	CTA	2	6	60138	60143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1084	NC_014172	TAC	2	6	60247	60252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1085	NC_014172	TAT	2	6	60267	60272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1086	NC_014172	CTA	2	6	60282	60287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1087	NC_014172	TTA	2	6	60342	60347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1088	NC_014172	TCT	3	9	60368	60376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506452
1089	NC_014172	CTA	2	6	60381	60386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1090	NC_014172	TGT	2	6	60400	60405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506452
1091	NC_014172	GTTACT	2	12	60437	60448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296506452
1092	NC_014172	TAC	2	6	60490	60495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1093	NC_014172	TAT	2	6	60510	60515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1094	NC_014172	CTA	2	6	60525	60530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1095	NC_014172	TGT	2	6	60619	60624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296506452
1096	NC_014172	ACC	2	6	60625	60630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506452
1097	NC_014172	TGG	2	6	60652	60657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506452
1098	NC_014172	CCA	2	6	60671	60676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506452
1099	NC_014172	TGG	2	6	60697	60702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296506452
1100	NC_014172	ACC	2	6	60709	60714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506452
1101	NC_014172	ATT	2	6	60718	60723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1102	NC_014172	CAC	2	6	60729	60734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506452
1103	NC_014172	ATT	2	6	60793	60798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1104	NC_014172	CAT	2	6	60834	60839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1105	NC_014172	CCA	2	6	60854	60859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296506452
1106	NC_014172	TTA	2	6	60881	60886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1107	NC_014172	TTGT	2	8	60902	60909	0 %	75 %	25 %	0 %	296506452
1108	NC_014172	ATT	2	6	60946	60951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506452
1109	NC_014172	TCA	2	6	61028	61033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1110	NC_014172	TCA	2	6	61112	61117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506452
1111	NC_014172	TCT	2	6	61160	61165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506452
1112	NC_014172	T	6	6	61165	61170	0 %	100 %	0 %	0 %	296506452
1113	NC_014172	T	6	6	61177	61182	0 %	100 %	0 %	0 %	296506452
1114	NC_014172	CTTTT	2	10	61183	61192	0 %	80 %	0 %	20 %	296506452
1115	NC_014172	CTTTTT	2	12	61201	61212	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296506452
1116	NC_014172	CTT	2	6	61237	61242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296506452
1117	NC_014172	AGA	2	6	61246	61251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296506452
1118	NC_014172	AGC	2	6	61260	61265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506452
1119	NC_014172	AGT	2	6	61297	61302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296506452
1120	NC_014172	GTAA	2	8	61304	61311	50 %	25 %	25 %	0 %	296506452
1121	NC_014172	CTTT	2	8	61314	61321	0 %	75 %	0 %	25 %	296506452
1122	NC_014172	AAT	2	6	61332	61337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506452
1123	NC_014172	CAAT	2	8	61347	61354	50 %	25 %	0 %	25 %	296506452
1124	NC_014172	ATT	2	6	61419	61424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296506453
1125	NC_014172	T	6	6	61427	61432	0 %	100 %	0 %	0 %	296506453
1126	NC_014172	ATTT	2	8	61484	61491	25 %	75 %	0 %	0 %	296506453
1127	NC_014172	AAT	2	6	61512	61517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296506453
1128	NC_014172	CTTCT	2	10	61520	61529	0 %	60 %	0 %	40 %	296506453
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1251	NC_014172	TCTA	2	8	65374	65381	25 %	50 %	0 %	25 %	296506456
1252	NC_014172	TCA	2	6	65427	65432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296506456
1253	NC_014172	AGC	2	6	65479	65484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296506456
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