MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 chromosome

Total Repeats: 4899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014169	CGGT	2	8	637	644	0 %	25 %	50 %	25 %	296453188
2	NC_014169	ACGA	2	8	903	910	50 %	0 %	25 %	25 %	296453188
3	NC_014169	GGCG	2	8	1584	1591	0 %	0 %	75 %	25 %	296453188
4	NC_014169	ATGC	2	8	1608	1615	25 %	25 %	25 %	25 %	296453188
5	NC_014169	GCCG	2	8	3132	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	296453189
6	NC_014169	ATGG	2	8	3375	3382	25 %	25 %	50 %	0 %	296453189
7	NC_014169	GATG	2	8	4133	4140	25 %	25 %	50 %	0 %	296453190
8	NC_014169	CCCG	2	8	4449	4456	0 %	0 %	25 %	75 %	296453190
9	NC_014169	CGTG	2	8	4523	4530	0 %	25 %	50 %	25 %	296453190
10	NC_014169	CGCC	2	8	4849	4856	0 %	0 %	25 %	75 %	296453191
11	NC_014169	GCCG	2	8	4882	4889	0 %	0 %	50 %	50 %	296453191
12	NC_014169	GCCA	2	8	5102	5109	25 %	0 %	25 %	50 %	296453191
13	NC_014169	ACGG	2	8	5129	5136	25 %	0 %	50 %	25 %	296453191
14	NC_014169	ACCT	2	8	5183	5190	25 %	25 %	0 %	50 %	296453191
15	NC_014169	GGAA	2	8	5473	5480	50 %	0 %	50 %	0 %	296453192
16	NC_014169	GCCA	2	8	5744	5751	25 %	0 %	25 %	50 %	296453192
17	NC_014169	CGTG	2	8	6595	6602	0 %	25 %	50 %	25 %	296453192
18	NC_014169	CGCC	2	8	8834	8841	0 %	0 %	25 %	75 %	296453193
19	NC_014169	ATGT	2	8	12668	12675	25 %	50 %	25 %	0 %	296453195
20	NC_014169	TCGA	2	8	12953	12960	25 %	25 %	25 %	25 %	296453195
21	NC_014169	ATTC	2	8	12996	13003	25 %	50 %	0 %	25 %	296453195
22	NC_014169	CAGG	2	8	13061	13068	25 %	0 %	50 %	25 %	296453195
23	NC_014169	GTGA	2	8	13103	13110	25 %	25 %	50 %	0 %	296453195
24	NC_014169	AGAC	2	8	13699	13706	50 %	0 %	25 %	25 %	296453196
25	NC_014169	GGTC	2	8	15674	15681	0 %	25 %	50 %	25 %	296453197
26	NC_014169	ACTT	2	8	16248	16255	25 %	50 %	0 %	25 %	296453198
27	NC_014169	ATCG	2	8	16674	16681	25 %	25 %	25 %	25 %	296453198
28	NC_014169	CTGG	2	8	16867	16874	0 %	25 %	50 %	25 %	296453198
29	NC_014169	TTGC	2	8	17863	17870	0 %	50 %	25 %	25 %	296453199
30	NC_014169	CAGC	2	8	18492	18499	25 %	0 %	25 %	50 %	296453199
31	NC_014169	TCAG	2	8	18866	18873	25 %	25 %	25 %	25 %	296453199
32	NC_014169	ACGT	2	8	20134	20141	25 %	25 %	25 %	25 %	296453200
33	NC_014169	TGGC	2	8	20158	20165	0 %	25 %	50 %	25 %	296453200
34	NC_014169	CGGC	2	8	20205	20212	0 %	0 %	50 %	50 %	296453200
35	NC_014169	TCGC	2	8	20598	20605	0 %	25 %	25 %	50 %	296453201
36	NC_014169	CGCC	2	8	21008	21015	0 %	0 %	25 %	75 %	296453201
37	NC_014169	ACAA	2	8	21112	21119	75 %	0 %	0 %	25 %	296453201
38	NC_014169	CATC	2	8	22758	22765	25 %	25 %	0 %	50 %	296453203
39	NC_014169	GCCG	2	8	23026	23033	0 %	0 %	50 %	50 %	296453203
40	NC_014169	CGGC	2	8	23214	23221	0 %	0 %	50 %	50 %	296453203
41	NC_014169	CCTA	2	8	23411	23418	25 %	25 %	0 %	50 %	296453203
42	NC_014169	CAGG	2	8	24211	24218	25 %	0 %	50 %	25 %	296453205
43	NC_014169	ACGA	2	8	24882	24889	50 %	0 %	25 %	25 %	296453205
44	NC_014169	GGCA	2	8	24899	24906	25 %	0 %	50 %	25 %	296453205
45	NC_014169	GTGC	2	8	26089	26096	0 %	25 %	50 %	25 %	296453206
46	NC_014169	CCGT	2	8	26694	26701	0 %	25 %	25 %	50 %	296453207
47	NC_014169	GATG	2	8	26731	26738	25 %	25 %	50 %	0 %	296453207
48	NC_014169	GCTG	2	8	27687	27694	0 %	25 %	50 %	25 %	296453208
49	NC_014169	TCGC	2	8	29195	29202	0 %	25 %	25 %	50 %	296453209
50	NC_014169	GAGC	2	8	29654	29661	25 %	0 %	50 %	25 %	296453209
51	NC_014169	CGGC	2	8	29725	29732	0 %	0 %	50 %	50 %	296453209
52	NC_014169	CCGT	2	8	30112	30119	0 %	25 %	25 %	50 %	296453209
53	NC_014169	CAGG	2	8	30507	30514	25 %	0 %	50 %	25 %	296453209
54	NC_014169	GTTG	2	8	30799	30806	0 %	50 %	50 %	0 %	296453209
55	NC_014169	TACG	2	8	31158	31165	25 %	25 %	25 %	25 %	296453209
56	NC_014169	CTGA	2	8	32033	32040	25 %	25 %	25 %	25 %	296453210
57	NC_014169	CGGC	2	8	33115	33122	0 %	0 %	50 %	50 %	296453212
58	NC_014169	CGCT	2	8	33137	33144	0 %	25 %	25 %	50 %	296453212
59	NC_014169	GCCG	2	8	33438	33445	0 %	0 %	50 %	50 %	296453212
60	NC_014169	CACG	2	8	33854	33861	25 %	0 %	25 %	50 %	296453212
61	NC_014169	CGGC	2	8	33895	33902	0 %	0 %	50 %	50 %	296453212
62	NC_014169	CCCG	2	8	34219	34226	0 %	0 %	25 %	75 %	296453212
63	NC_014169	CGCT	2	8	34231	34238	0 %	25 %	25 %	50 %	296453212
64	NC_014169	CGCC	2	8	34502	34509	0 %	0 %	25 %	75 %	296453212
65	NC_014169	TCGT	2	8	34629	34636	0 %	50 %	25 %	25 %	296453212
66	NC_014169	TGCT	2	8	34771	34778	0 %	50 %	25 %	25 %	296453212
67	NC_014169	ACGA	2	8	35235	35242	50 %	0 %	25 %	25 %	296453213
68	NC_014169	CGTG	2	8	35296	35303	0 %	25 %	50 %	25 %	296453213
69	NC_014169	GCCG	2	8	35798	35805	0 %	0 %	50 %	50 %	296453213
70	NC_014169	CCTT	2	8	37115	37122	0 %	50 %	0 %	50 %	296453215
71	NC_014169	AAAG	2	8	38153	38160	75 %	0 %	25 %	0 %	296453216
72	NC_014169	TGTT	2	8	38511	38518	0 %	75 %	25 %	0 %	296453216
73	NC_014169	ATCG	2	8	38781	38788	25 %	25 %	25 %	25 %	296453216
74	NC_014169	TCGA	2	8	38964	38971	25 %	25 %	25 %	25 %	296453216
75	NC_014169	TCGT	2	8	39523	39530	0 %	50 %	25 %	25 %	296453216
76	NC_014169	TTTG	2	8	39679	39686	0 %	75 %	25 %	0 %	296453216
77	NC_014169	AGAT	2	8	43469	43476	50 %	25 %	25 %	0 %	296453217
78	NC_014169	CCTG	2	8	43481	43488	0 %	25 %	25 %	50 %	296453217
79	NC_014169	CGGG	2	8	43963	43970	0 %	0 %	75 %	25 %	296453217
80	NC_014169	ACCG	2	8	44266	44273	25 %	0 %	25 %	50 %	296453217
81	NC_014169	CGAC	2	8	44312	44319	25 %	0 %	25 %	50 %	296453217
82	NC_014169	CGCT	2	8	45101	45108	0 %	25 %	25 %	50 %	296453217
83	NC_014169	CGTG	2	8	46671	46678	0 %	25 %	50 %	25 %	296453218
84	NC_014169	TGGC	2	8	48105	48112	0 %	25 %	50 %	25 %	296453218
85	NC_014169	TCTG	2	8	48269	48276	0 %	50 %	25 %	25 %	296453218
86	NC_014169	GCGG	2	8	48691	48698	0 %	0 %	75 %	25 %	296453219
87	NC_014169	GGCT	2	8	48754	48761	0 %	25 %	50 %	25 %	296453219
88	NC_014169	TTCA	2	8	49147	49154	25 %	50 %	0 %	25 %	296453219
89	NC_014169	GCGG	2	8	49210	49217	0 %	0 %	75 %	25 %	296453219
90	NC_014169	CCAG	2	8	50778	50785	25 %	0 %	25 %	50 %	296453220
91	NC_014169	CGGC	2	8	52577	52584	0 %	0 %	50 %	50 %	296453221
92	NC_014169	CGGA	2	8	52718	52725	25 %	0 %	50 %	25 %	296453221
93	NC_014169	CACG	2	8	52917	52924	25 %	0 %	25 %	50 %	296453221
94	NC_014169	GATC	2	8	52931	52938	25 %	25 %	25 %	25 %	296453221
95	NC_014169	GCAC	2	8	52941	52948	25 %	0 %	25 %	50 %	296453221
96	NC_014169	CCGG	2	8	53062	53069	0 %	0 %	50 %	50 %	296453221
97	NC_014169	TGGC	2	8	53155	53162	0 %	25 %	50 %	25 %	296453221
98	NC_014169	CGTA	2	8	53398	53405	25 %	25 %	25 %	25 %	296453221
99	NC_014169	GCGG	2	8	54077	54084	0 %	0 %	75 %	25 %	296453222
100	NC_014169	TCGG	2	8	54118	54125	0 %	25 %	50 %	25 %	296453222
101	NC_014169	CAGA	2	8	54236	54243	50 %	0 %	25 %	25 %	296453222
102	NC_014169	CGGC	2	8	54524	54531	0 %	0 %	50 %	50 %	296453222
103	NC_014169	CGGT	2	8	54637	54644	0 %	25 %	50 %	25 %	296453222
104	NC_014169	GCCG	2	8	54743	54750	0 %	0 %	50 %	50 %	296453222
105	NC_014169	TGCC	2	8	54860	54867	0 %	25 %	25 %	50 %	296453222
106	NC_014169	GTGC	2	8	55677	55684	0 %	25 %	50 %	25 %	296453224
107	NC_014169	TGCG	2	8	56038	56045	0 %	25 %	50 %	25 %	296453224
108	NC_014169	CGGT	2	8	56717	56724	0 %	25 %	50 %	25 %	296453225
109	NC_014169	CGTG	2	8	57317	57324	0 %	25 %	50 %	25 %	296453225
110	NC_014169	CGGT	2	8	57571	57578	0 %	25 %	50 %	25 %	296453226
111	NC_014169	CAGC	2	8	58394	58401	25 %	0 %	25 %	50 %	296453226
112	NC_014169	GCTG	2	8	58523	58530	0 %	25 %	50 %	25 %	296453226
113	NC_014169	CCTG	2	8	58768	58775	0 %	25 %	25 %	50 %	296453226
114	NC_014169	GACC	2	8	59835	59842	25 %	0 %	25 %	50 %	296453228
115	NC_014169	CCTC	2	8	59966	59973	0 %	25 %	0 %	75 %	296453228
116	NC_014169	ACCC	2	8	60529	60536	25 %	0 %	0 %	75 %	296453228
117	NC_014169	GGCC	2	8	60671	60678	0 %	0 %	50 %	50 %	296453228
118	NC_014169	TCGG	2	8	62606	62613	0 %	25 %	50 %	25 %	296453230
119	NC_014169	TGCA	2	8	62667	62674	25 %	25 %	25 %	25 %	296453230
120	NC_014169	CGTG	2	8	62749	62756	0 %	25 %	50 %	25 %	296453230
121	NC_014169	GTGG	2	8	63246	63253	0 %	25 %	75 %	0 %	296453230
122	NC_014169	GGTG	2	8	63272	63279	0 %	25 %	75 %	0 %	296453230
123	NC_014169	GGCA	2	8	65418	65425	25 %	0 %	50 %	25 %	296453233
124	NC_014169	GGCA	2	8	65593	65600	25 %	0 %	50 %	25 %	296453233
125	NC_014169	GAGC	2	8	65691	65698	25 %	0 %	50 %	25 %	296453233
126	NC_014169	GTCG	2	8	67309	67316	0 %	25 %	50 %	25 %	296453234
127	NC_014169	CTCA	3	12	67530	67541	25 %	25 %	0 %	50 %	296453235
128	NC_014169	GACC	2	8	67997	68004	25 %	0 %	25 %	50 %	296453235
129	NC_014169	TGGG	2	8	68659	68666	0 %	25 %	75 %	0 %	296453235
130	NC_014169	GCTG	2	8	69278	69285	0 %	25 %	50 %	25 %	296453235
131	NC_014169	TCCC	2	8	69646	69653	0 %	25 %	0 %	75 %	296453236
132	NC_014169	GATG	2	8	71023	71030	25 %	25 %	50 %	0 %	296453237
133	NC_014169	CTGG	2	8	73512	73519	0 %	25 %	50 %	25 %	296453238
134	NC_014169	CTGG	2	8	73787	73794	0 %	25 %	50 %	25 %	296453239
135	NC_014169	CAGC	2	8	74151	74158	25 %	0 %	25 %	50 %	296453239
136	NC_014169	GACG	2	8	75684	75691	25 %	0 %	50 %	25 %	296453240
137	NC_014169	GCCA	2	8	75841	75848	25 %	0 %	25 %	50 %	296453240
138	NC_014169	ACGT	2	8	76044	76051	25 %	25 %	25 %	25 %	296453241
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