MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JDM301 chromosome

Total Repeats: 47510

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014169	GTG	2	6	151444	151449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453295
3002	NC_014169	TTC	2	6	151465	151470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453295
3003	NC_014169	GTGCTG	2	12	151537	151548	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	296453295
3004	NC_014169	CAT	2	6	151563	151568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453295
3005	NC_014169	TGA	2	6	151682	151687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453295
3006	NC_014169	TGA	2	6	151719	151724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453295
3007	NC_014169	GCC	2	6	151726	151731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453295
3008	NC_014169	TCA	2	6	151763	151768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453295
3009	NC_014169	ATC	3	9	151771	151779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453295
3010	NC_014169	CGCA	2	8	151867	151874	25 %	0 %	25 %	50 %	296453295
3011	NC_014169	CGC	4	12	151950	151961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453295
3012	NC_014169	ATC	2	6	151966	151971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453295
3013	NC_014169	CAG	2	6	152201	152206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3014	NC_014169	TGCCC	2	10	152253	152262	0 %	20 %	20 %	60 %	296453296
3015	NC_014169	GAC	2	6	152285	152290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3016	NC_014169	CAC	2	6	152317	152322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453296
3017	NC_014169	TGGC	2	8	152444	152451	0 %	25 %	50 %	25 %	296453296
3018	NC_014169	GC	3	6	152450	152455	0 %	0 %	50 %	50 %	296453296
3019	NC_014169	CTA	2	6	152479	152484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453296
3020	NC_014169	ACCGC	2	10	152520	152529	20 %	0 %	20 %	60 %	296453296
3021	NC_014169	CGGC	2	8	152560	152567	0 %	0 %	50 %	50 %	296453296
3022	NC_014169	GCA	2	6	152568	152573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3023	NC_014169	CCG	2	6	152620	152625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453296
3024	NC_014169	ACG	2	6	152685	152690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3025	NC_014169	CACC	2	8	152737	152744	25 %	0 %	0 %	75 %	296453296
3026	NC_014169	AAG	2	6	152798	152803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453296
3027	NC_014169	ACG	2	6	152955	152960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3028	NC_014169	GAT	2	6	152989	152994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453296
3029	NC_014169	GCC	2	6	153008	153013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453296
3030	NC_014169	GCC	2	6	153102	153107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453296
3031	NC_014169	ACG	2	6	153147	153152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3032	NC_014169	ATG	2	6	153170	153175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453296
3033	NC_014169	TCG	2	6	153186	153191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3034	NC_014169	GC	3	6	153209	153214	0 %	0 %	50 %	50 %	296453296
3035	NC_014169	GGC	2	6	153308	153313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453296
3036	NC_014169	GGC	2	6	153343	153348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453296
3037	NC_014169	GCC	2	6	153503	153508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453296
3038	NC_014169	GAC	2	6	153518	153523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3039	NC_014169	ACG	2	6	153606	153611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3040	NC_014169	AGGCG	2	10	153682	153691	20 %	0 %	60 %	20 %	296453296
3041	NC_014169	GC	3	6	153706	153711	0 %	0 %	50 %	50 %	296453296
3042	NC_014169	GGC	2	6	153721	153726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453296
3043	NC_014169	CCG	2	6	153744	153749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453296
3044	NC_014169	CAG	2	6	153814	153819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3045	NC_014169	CGC	2	6	153886	153891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453296
3046	NC_014169	GCG	2	6	153904	153909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453296
3047	NC_014169	CGG	2	6	153928	153933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453296
3048	NC_014169	CG	3	6	153951	153956	0 %	0 %	50 %	50 %	296453296
3049	NC_014169	ACG	2	6	153957	153962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3050	NC_014169	GTG	2	6	153968	153973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453296
3051	NC_014169	CGA	2	6	153985	153990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3052	NC_014169	CAC	2	6	154033	154038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296453296
3053	NC_014169	CTG	2	6	154148	154153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453296
3054	NC_014169	TGA	2	6	154256	154261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453297
3055	NC_014169	CTCC	2	8	154287	154294	0 %	25 %	0 %	75 %	296453297
3056	NC_014169	TTC	2	6	154369	154374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453297
3057	NC_014169	TGG	2	6	154391	154396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453297
3058	NC_014169	GGC	3	9	154413	154421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453297
3059	NC_014169	CGC	2	6	154422	154427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453297
3060	NC_014169	GTG	2	6	154460	154465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453297
3061	NC_014169	CGG	2	6	154492	154497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453297
3062	NC_014169	GCC	2	6	154531	154536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453297
3063	NC_014169	GTC	2	6	154537	154542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453297
3064	NC_014169	TGC	2	6	154571	154576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453297
3065	NC_014169	GAC	2	6	154612	154617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453297
3066	NC_014169	CTG	2	6	154666	154671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453297
3067	NC_014169	GC	3	6	154685	154690	0 %	0 %	50 %	50 %	296453297
3068	NC_014169	CTG	2	6	154696	154701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453297
3069	NC_014169	ACG	2	6	154916	154921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453297
3070	NC_014169	CGG	2	6	154949	154954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453297
3071	NC_014169	CGCC	2	8	154988	154995	0 %	0 %	25 %	75 %	296453297
3072	NC_014169	GGCC	2	8	155034	155041	0 %	0 %	50 %	50 %	296453297
3073	NC_014169	CGCGG	2	10	155210	155219	0 %	0 %	60 %	40 %	296453298
3074	NC_014169	AGC	2	6	155222	155227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453298
3075	NC_014169	CTGC	2	8	155311	155318	0 %	25 %	25 %	50 %	296453298
3076	NC_014169	TGG	2	6	155321	155326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453298
3077	NC_014169	GCG	2	6	155374	155379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453298
3078	NC_014169	TGT	2	6	155414	155419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296453298
3079	NC_014169	TCG	2	6	155471	155476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453298
3080	NC_014169	TGG	2	6	155588	155593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453298
3081	NC_014169	CTGG	2	8	155595	155602	0 %	25 %	50 %	25 %	296453298
3082	NC_014169	TAC	2	6	155611	155616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453298
3083	NC_014169	CTG	2	6	155662	155667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453298
3084	NC_014169	TGC	3	9	155675	155683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453298
3085	NC_014169	TCGT	2	8	155731	155738	0 %	50 %	25 %	25 %	296453298
3086	NC_014169	ACGC	2	8	155759	155766	25 %	0 %	25 %	50 %	296453298
3087	NC_014169	GAT	2	6	155775	155780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453298
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3089	NC_014169	GCT	2	6	155793	155798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453298
3090	NC_014169	CGCC	2	8	155819	155826	0 %	0 %	25 %	75 %	296453298
3091	NC_014169	CTG	2	6	155917	155922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453298
3092	NC_014169	TGG	2	6	155936	155941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453298
3093	NC_014169	TGC	2	6	156023	156028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3094	NC_014169	GCC	2	6	156106	156111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453299
3095	NC_014169	GTC	2	6	156177	156182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3096	NC_014169	CGA	2	6	156188	156193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453299
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3098	NC_014169	CAT	2	6	156255	156260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453299
3099	NC_014169	GCA	2	6	156270	156275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3100	NC_014169	CAG	2	6	156303	156308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3101	NC_014169	GGCCG	2	10	156333	156342	0 %	0 %	60 %	40 %	296453299
3102	NC_014169	CG	3	6	156341	156346	0 %	0 %	50 %	50 %	296453299
3103	NC_014169	GGC	2	6	156377	156382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453299
3104	NC_014169	GC	4	8	156418	156425	0 %	0 %	50 %	50 %	296453299
3105	NC_014169	TCGA	2	8	156427	156434	25 %	25 %	25 %	25 %	296453299
3106	NC_014169	GCC	2	6	156448	156453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296453299
3107	NC_014169	TGA	2	6	156491	156496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453299
3108	NC_014169	TGC	2	6	156499	156504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3109	NC_014169	TCG	3	9	156526	156534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3110	NC_014169	TGG	2	6	156542	156547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296453299
3111	NC_014169	GAT	2	6	156582	156587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453299
3112	NC_014169	GCT	2	6	156608	156613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453299
3113	NC_014169	GAA	2	6	156687	156692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453299
3114	NC_014169	GCCG	2	8	156744	156751	0 %	0 %	50 %	50 %	296453299
3115	NC_014169	TCA	2	6	156815	156820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453299
3116	NC_014169	TCT	2	6	156920	156925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453299
3117	NC_014169	CG	4	8	156951	156958	0 %	0 %	50 %	50 %	296453299
3118	NC_014169	GCCG	2	8	156978	156985	0 %	0 %	50 %	50 %	296453299
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3120	NC_014169	GAA	2	6	157146	157151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453300
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3124	NC_014169	GT	3	6	157328	157333	0 %	50 %	50 %	0 %	296453300
3125	NC_014169	TGC	2	6	157552	157557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453301
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3241	NC_014169	AGA	2	6	162986	162991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453304
3242	NC_014169	CAG	2	6	163012	163017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453304
3243	NC_014169	GGCGCT	2	12	163063	163074	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	296453304
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3253	NC_014169	C	6	6	163408	163413	0 %	0 %	0 %	100 %	296453305
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3261	NC_014169	CGA	2	6	163568	163573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453305
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3358	NC_014169	TGC	3	9	167965	167973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453310
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3360	NC_014169	ACCT	2	8	168051	168058	25 %	25 %	0 %	50 %	296453310
3361	NC_014169	ATC	2	6	168066	168071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453310
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3363	NC_014169	ACT	2	6	168118	168123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453310
3364	NC_014169	ATC	2	6	168144	168149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453310
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3381	NC_014169	TGA	2	6	169071	169076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296453311
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3385	NC_014169	TCA	2	6	169236	169241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453311
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3472	NC_014169	GCT	2	6	174096	174101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453314
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3474	NC_014169	CTG	2	6	174166	174171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296453314
3475	NC_014169	TCGC	2	8	174175	174182	0 %	25 %	25 %	50 %	296453314
3476	NC_014169	CAT	2	6	174189	174194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296453314
3477	NC_014169	AAG	3	9	174220	174228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453314
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3479	NC_014169	GGC	2	6	174342	174347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453315
3480	NC_014169	TCCAG	2	10	174383	174392	20 %	20 %	20 %	40 %	296453315
3481	NC_014169	CTT	2	6	174396	174401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296453315
3482	NC_014169	GGC	2	6	174432	174437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296453315
3483	NC_014169	CTC	2	6	174453	174458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296453315
3484	NC_014169	CCCG	2	8	174479	174486	0 %	0 %	25 %	75 %	296453315
3485	NC_014169	GAA	2	6	174513	174518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296453315
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3492	NC_014169	GAC	2	6	174978	174983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453315
3493	NC_014169	GCA	2	6	175007	175012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296453315
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