MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 2763

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	TATGG	2	10	3517	3526	20 %	40 %	40 %	0 %	296125062
2	NC_014150	AGAAT	2	10	4465	4474	60 %	20 %	20 %	0 %	296125062
3	NC_014150	TTTAT	2	10	5785	5794	20 %	80 %	0 %	0 %	296125064
4	NC_014150	ATGTT	2	10	5914	5923	20 %	60 %	20 %	0 %	296125064
5	NC_014150	GGTTT	2	10	8865	8874	0 %	60 %	40 %	0 %	296125068
6	NC_014150	ATAAA	2	10	9778	9787	80 %	20 %	0 %	0 %	296125068
7	NC_014150	AGCTG	2	10	12125	12134	20 %	20 %	40 %	20 %	296125069
8	NC_014150	ATTTT	2	10	12392	12401	20 %	80 %	0 %	0 %	296125070
9	NC_014150	CCCAA	2	10	16960	16969	40 %	0 %	0 %	60 %	296125074
10	NC_014150	ATTTA	2	10	20694	20703	40 %	60 %	0 %	0 %	296125076
11	NC_014150	TAATA	2	10	20792	20801	60 %	40 %	0 %	0 %	296125077
12	NC_014150	GTAAA	2	10	26398	26407	60 %	20 %	20 %	0 %	296125081
13	NC_014150	AAGTC	2	10	29079	29088	40 %	20 %	20 %	20 %	296125082
14	NC_014150	AATAA	2	10	30274	30283	80 %	20 %	0 %	0 %	296125083
15	NC_014150	ATTAT	2	10	30586	30595	40 %	60 %	0 %	0 %	296125083
16	NC_014150	GAATA	2	10	31648	31657	60 %	20 %	20 %	0 %	296125084
17	NC_014150	TGATA	2	10	32133	32142	40 %	40 %	20 %	0 %	296125084
18	NC_014150	ATATT	2	10	33002	33011	40 %	60 %	0 %	0 %	296125087
19	NC_014150	TAATA	2	10	33084	33093	60 %	40 %	0 %	0 %	296125087
20	NC_014150	TATAA	2	10	33145	33154	60 %	40 %	0 %	0 %	296125087
21	NC_014150	TAATA	2	10	33504	33513	60 %	40 %	0 %	0 %	296125088
22	NC_014150	ATAAA	2	10	33572	33581	80 %	20 %	0 %	0 %	296125088
23	NC_014150	ATTAT	2	10	33870	33879	40 %	60 %	0 %	0 %	296125088
24	NC_014150	ACTTT	2	10	34740	34749	20 %	60 %	0 %	20 %	296125090
25	NC_014150	ATAGT	2	10	35313	35322	40 %	40 %	20 %	0 %	296125090
26	NC_014150	AAAAG	2	10	40389	40398	80 %	0 %	20 %	0 %	296125094
27	NC_014150	TGCTT	2	10	41090	41099	0 %	60 %	20 %	20 %	296125094
28	NC_014150	ATTCT	2	10	43961	43970	20 %	60 %	0 %	20 %	296125096
29	NC_014150	ATTTT	2	10	44209	44218	20 %	80 %	0 %	0 %	296125096
30	NC_014150	AAGTA	2	10	45368	45377	60 %	20 %	20 %	0 %	296125098
31	NC_014150	ATCTT	2	10	45438	45447	20 %	60 %	0 %	20 %	296125098
32	NC_014150	TTAAT	2	10	46663	46672	40 %	60 %	0 %	0 %	296125098
33	NC_014150	TAAAA	2	10	46735	46744	80 %	20 %	0 %	0 %	296125098
34	NC_014150	ATTTT	2	10	46845	46854	20 %	80 %	0 %	0 %	296125098
35	NC_014150	TCAAA	2	10	48232	48241	60 %	20 %	0 %	20 %	296125099
36	NC_014150	TAATA	2	10	48734	48743	60 %	40 %	0 %	0 %	296125099
37	NC_014150	ATTTT	2	10	49201	49210	20 %	80 %	0 %	0 %	296125099
38	NC_014150	CTATA	2	10	50288	50297	40 %	40 %	0 %	20 %	296125100
39	NC_014150	GTTAT	2	10	50416	50425	20 %	60 %	20 %	0 %	296125100
40	NC_014150	AGAGC	2	10	52319	52328	40 %	0 %	40 %	20 %	296125102
41	NC_014150	AAGAA	2	10	53223	53232	80 %	0 %	20 %	0 %	296125102
42	NC_014150	TCTGT	2	10	54151	54160	0 %	60 %	20 %	20 %	296125103
43	NC_014150	TATCA	2	10	54180	54189	40 %	40 %	0 %	20 %	296125103
44	NC_014150	TGAAA	2	10	54367	54376	60 %	20 %	20 %	0 %	296125103
45	NC_014150	GAGAA	2	10	54984	54993	60 %	0 %	40 %	0 %	296125104
46	NC_014150	AAATA	2	10	55163	55172	80 %	20 %	0 %	0 %	296125104
47	NC_014150	TTATA	2	10	57340	57349	40 %	60 %	0 %	0 %	296125106
48	NC_014150	TATTT	2	10	60087	60096	20 %	80 %	0 %	0 %	296125109
49	NC_014150	TATAT	2	10	60476	60485	40 %	60 %	0 %	0 %	296125109
50	NC_014150	ATATC	2	10	60915	60924	40 %	40 %	0 %	20 %	296125109
51	NC_014150	ATAGA	2	10	63093	63102	60 %	20 %	20 %	0 %	296125110
52	NC_014150	ATATT	2	10	67786	67795	40 %	60 %	0 %	0 %	296125113
53	NC_014150	GTTAT	2	10	69034	69043	20 %	60 %	20 %	0 %	296125114
54	NC_014150	ACAAT	2	10	69235	69244	60 %	20 %	0 %	20 %	296125114
55	NC_014150	TTTCT	2	10	71396	71405	0 %	80 %	0 %	20 %	296125116
56	NC_014150	CTTAT	2	10	74769	74778	20 %	60 %	0 %	20 %	296125118
57	NC_014150	TCAAA	2	10	75002	75011	60 %	20 %	0 %	20 %	296125118
58	NC_014150	TAATG	2	10	77383	77392	40 %	40 %	20 %	0 %	296125121
59	NC_014150	ACTAT	2	10	77952	77961	40 %	40 %	0 %	20 %	296125121
60	NC_014150	TAAAT	2	10	78476	78485	60 %	40 %	0 %	0 %	296125122
61	NC_014150	TGAAA	2	10	79100	79109	60 %	20 %	20 %	0 %	296125122
62	NC_014150	AGAAA	2	10	80092	80101	80 %	0 %	20 %	0 %	296125123
63	NC_014150	TCATT	2	10	80916	80925	20 %	60 %	0 %	20 %	296125124
64	NC_014150	TATTT	2	10	81124	81133	20 %	80 %	0 %	0 %	296125124
65	NC_014150	AATAC	2	10	81218	81227	60 %	20 %	0 %	20 %	296125124
66	NC_014150	TTATA	2	10	82196	82205	40 %	60 %	0 %	0 %	296125124
67	NC_014150	AACAT	2	10	82485	82494	60 %	20 %	0 %	20 %	296125125
68	NC_014150	TTTTA	2	10	83088	83097	20 %	80 %	0 %	0 %	296125125
69	NC_014150	ATTTA	2	10	85786	85795	40 %	60 %	0 %	0 %	296125128
70	NC_014150	TTTCT	2	10	87459	87468	0 %	80 %	0 %	20 %	296125130
71	NC_014150	TTTTC	2	10	87507	87516	0 %	80 %	0 %	20 %	296125130
72	NC_014150	TTCTA	2	10	88316	88325	20 %	60 %	0 %	20 %	296125130
73	NC_014150	AATAC	2	10	88632	88641	60 %	20 %	0 %	20 %	296125130
74	NC_014150	TCAAC	2	10	89580	89589	40 %	20 %	0 %	40 %	296125131
75	NC_014150	ATATT	2	10	91272	91281	40 %	60 %	0 %	0 %	296125131
76	NC_014150	TAAGA	2	10	92364	92373	60 %	20 %	20 %	0 %	296125131
77	NC_014150	ATTTC	2	10	93895	93904	20 %	60 %	0 %	20 %	296125132
78	NC_014150	ATAAA	2	10	94299	94308	80 %	20 %	0 %	0 %	296125133
79	NC_014150	TATGA	2	10	94847	94856	40 %	40 %	20 %	0 %	296125133
80	NC_014150	GAAAA	2	10	95209	95218	80 %	0 %	20 %	0 %	296125134
81	NC_014150	GTTTT	2	10	95254	95263	0 %	80 %	20 %	0 %	296125134
82	NC_014150	AAATA	2	10	97081	97090	80 %	20 %	0 %	0 %	296125134
83	NC_014150	AAAGA	2	10	97462	97471	80 %	0 %	20 %	0 %	296125135
84	NC_014150	AGAAA	2	10	97739	97748	80 %	0 %	20 %	0 %	296125135
85	NC_014150	ATTTT	2	10	98114	98123	20 %	80 %	0 %	0 %	296125135
86	NC_014150	TAATA	2	10	101099	101108	60 %	40 %	0 %	0 %	296125138
87	NC_014150	ACAGA	2	10	102217	102226	60 %	0 %	20 %	20 %	296125139
88	NC_014150	TAGAA	2	10	103587	103596	60 %	20 %	20 %	0 %	296125141
89	NC_014150	AGAAT	2	10	104012	104021	60 %	20 %	20 %	0 %	296125141
90	NC_014150	TAATA	2	10	104055	104064	60 %	40 %	0 %	0 %	296125141
91	NC_014150	AAGAT	2	10	104189	104198	60 %	20 %	20 %	0 %	296125141
92	NC_014150	ATATT	2	10	105230	105239	40 %	60 %	0 %	0 %	296125142
93	NC_014150	TTTTA	2	10	106777	106786	20 %	80 %	0 %	0 %	296125143
94	NC_014150	TTTCT	2	10	106803	106812	0 %	80 %	0 %	20 %	296125143
95	NC_014150	GTATA	2	10	109807	109816	40 %	40 %	20 %	0 %	296125146
96	NC_014150	ATTTT	2	10	110284	110293	20 %	80 %	0 %	0 %	296125147
97	NC_014150	CTAAT	2	10	110294	110303	40 %	40 %	0 %	20 %	296125147
98	NC_014150	AAACC	2	10	110476	110485	60 %	0 %	0 %	40 %	296125147
99	NC_014150	ATATT	2	10	114847	114856	40 %	60 %	0 %	0 %	296125151
100	NC_014150	AGGGT	2	10	117386	117395	20 %	20 %	60 %	0 %	296125152
101	NC_014150	TATTT	2	10	119447	119456	20 %	80 %	0 %	0 %	296125154
102	NC_014150	ATACA	2	10	119636	119645	60 %	20 %	0 %	20 %	296125155
103	NC_014150	AGAAT	2	10	122421	122430	60 %	20 %	20 %	0 %	296125157
104	NC_014150	TTTTG	2	10	122682	122691	0 %	80 %	20 %	0 %	296125157
105	NC_014150	TATTT	2	10	122705	122714	20 %	80 %	0 %	0 %	296125157
106	NC_014150	TAATA	2	10	123286	123295	60 %	40 %	0 %	0 %	296125157
107	NC_014150	ATATT	2	10	123330	123339	40 %	60 %	0 %	0 %	296125157
108	NC_014150	ATAAG	2	10	124246	124255	60 %	20 %	20 %	0 %	296125158
109	NC_014150	TATAA	2	10	124732	124741	60 %	40 %	0 %	0 %	296125158
110	NC_014150	TTAAA	2	10	124980	124989	60 %	40 %	0 %	0 %	296125158
111	NC_014150	TTCAT	2	10	127010	127019	20 %	60 %	0 %	20 %	296125160
112	NC_014150	AGAAA	2	10	128052	128061	80 %	0 %	20 %	0 %	296125160
113	NC_014150	TATAA	2	10	128260	128269	60 %	40 %	0 %	0 %	296125160
114	NC_014150	ATTTT	2	10	130125	130134	20 %	80 %	0 %	0 %	296125163
115	NC_014150	ATTAA	2	10	130481	130490	60 %	40 %	0 %	0 %	296125163
116	NC_014150	TATCA	2	10	132989	132998	40 %	40 %	0 %	20 %	296125165
117	NC_014150	TTTTC	2	10	133835	133844	0 %	80 %	0 %	20 %	296125166
118	NC_014150	TAATG	2	10	134370	134379	40 %	40 %	20 %	0 %	296125167
119	NC_014150	AAAAT	2	10	134501	134510	80 %	20 %	0 %	0 %	296125167
120	NC_014150	ATATT	2	10	134911	134920	40 %	60 %	0 %	0 %	296125167
121	NC_014150	AAAAG	2	10	136263	136272	80 %	0 %	20 %	0 %	296125168
122	NC_014150	TAAAT	2	10	138019	138028	60 %	40 %	0 %	0 %	296125170
123	NC_014150	TATTT	2	10	138376	138385	20 %	80 %	0 %	0 %	296125171
124	NC_014150	AAATT	2	10	139189	139198	60 %	40 %	0 %	0 %	296125172
125	NC_014150	GTTGG	2	10	144163	144172	0 %	40 %	60 %	0 %	296125173
126	NC_014150	TTCAG	2	10	144328	144337	20 %	40 %	20 %	20 %	296125173
127	NC_014150	TACTT	2	10	145158	145167	20 %	60 %	0 %	20 %	296125173
128	NC_014150	GAATG	2	10	145303	145312	40 %	20 %	40 %	0 %	296125173
129	NC_014150	GGTCT	8	40	145564	145603	0 %	40 %	40 %	20 %	296125174
130	NC_014150	TATAA	2	10	146020	146029	60 %	40 %	0 %	0 %	296125174
131	NC_014150	AAGAA	2	10	146536	146545	80 %	0 %	20 %	0 %	296125174
132	NC_014150	GGTCT	12	60	147673	147732	0 %	40 %	40 %	20 %	296125175
133	NC_014150	ATTTA	2	10	147819	147828	40 %	60 %	0 %	0 %	296125175
134	NC_014150	TATAT	2	10	147894	147903	40 %	60 %	0 %	0 %	296125175
135	NC_014150	ATATA	2	10	148202	148211	60 %	40 %	0 %	0 %	296125175
136	NC_014150	ATTTT	2	10	148348	148357	20 %	80 %	0 %	0 %	296125175
137	NC_014150	TTCTT	2	10	148779	148788	0 %	80 %	0 %	20 %	296125175
138	NC_014150	ATATT	2	10	148963	148972	40 %	60 %	0 %	0 %	296125175
139	NC_014150	GGTCT	9	45	150263	150307	0 %	40 %	40 %	20 %	296125177
140	NC_014150	ATTTT	2	10	151738	151747	20 %	80 %	0 %	0 %	296125178
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154	NC_014150	AATCT	2	10	159052	159061	40 %	40 %	0 %	20 %	296125184
155	NC_014150	TCATA	2	10	160518	160527	40 %	40 %	0 %	20 %	296125185
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168	NC_014150	AAATT	2	10	171212	171221	60 %	40 %	0 %	0 %	296125193
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172	NC_014150	AAAAT	2	10	173358	173367	80 %	20 %	0 %	0 %	296125194
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176	NC_014150	TTTTG	2	10	175971	175980	0 %	80 %	20 %	0 %	296125196
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263	NC_014150	ATTTA	2	10	269299	269308	40 %	60 %	0 %	0 %	296125252
264	NC_014150	TATTT	2	10	269752	269761	20 %	80 %	0 %	0 %	296125252
265	NC_014150	GTATT	2	10	269916	269925	20 %	60 %	20 %	0 %	296125252
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