MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 48336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	ATT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
2	NC_014150	GAT	2	6	183	188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
3	NC_014150	TTG	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125059
4	NC_014150	ATA	2	6	241	246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
5	NC_014150	GCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125059
6	NC_014150	TGC	2	6	275	280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125059
7	NC_014150	ATA	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
8	NC_014150	GAA	3	9	402	410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125059
9	NC_014150	ATA	2	6	436	441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
10	NC_014150	TAA	3	9	479	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
11	NC_014150	ATT	2	6	502	507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
12	NC_014150	AAT	2	6	534	539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
13	NC_014150	AGC	2	6	557	562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125059
14	NC_014150	GAT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
15	NC_014150	CTT	2	6	816	821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125059
16	NC_014150	ATT	2	6	848	853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
17	NC_014150	GCA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125059
18	NC_014150	CCT	2	6	912	917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125059
19	NC_014150	CCT	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125059
20	NC_014150	TAT	2	6	1013	1018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
21	NC_014150	ATT	2	6	1028	1033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
22	NC_014150	TAC	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125059
23	NC_014150	TGA	2	6	1147	1152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125059
24	NC_014150	ATT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
25	NC_014150	ATT	2	6	1267	1272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125059
26	NC_014150	TCT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125059
27	NC_014150	ATA	2	6	1419	1424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125059
28	NC_014150	AAG	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125059
29	NC_014150	GAA	3	9	2054	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
30	NC_014150	TAA	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
31	NC_014150	AAT	2	6	2111	2116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
32	NC_014150	GAA	2	6	2117	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
33	NC_014150	ATA	2	6	2130	2135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125060
34	NC_014150	GAA	2	6	2162	2167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125060
35	NC_014150	GCT	2	6	2168	2173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125060
36	NC_014150	ATG	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
37	NC_014150	GCA	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125060
38	NC_014150	ATT	3	9	2332	2340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125060
39	NC_014150	GTT	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125060
40	NC_014150	ATG	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
41	NC_014150	GTA	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125060
42	NC_014150	CCT	2	6	2648	2653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125060
43	NC_014150	TTA	2	6	2719	2724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125061
44	NC_014150	TTC	2	6	2772	2777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125061
45	NC_014150	AAG	2	6	2817	2822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125061
46	NC_014150	TAC	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125061
47	NC_014150	TGT	2	6	2875	2880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125061
48	NC_014150	AAT	2	6	3000	3005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
49	NC_014150	AAC	2	6	3021	3026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
50	NC_014150	GTA	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
51	NC_014150	AAC	2	6	3093	3098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
52	NC_014150	TAG	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
53	NC_014150	TAG	2	6	3137	3142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
54	NC_014150	AGA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
55	NC_014150	AGA	2	6	3267	3272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
56	NC_014150	CTC	2	6	3314	3319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125062
57	NC_014150	AGA	2	6	3363	3368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
58	NC_014150	TAT	2	6	3396	3401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
59	NC_014150	CTA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125062
60	NC_014150	AAT	2	6	3483	3488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
61	NC_014150	CAG	3	9	3500	3508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
62	NC_014150	GGT	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296125062
63	NC_014150	TGA	2	6	3654	3659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
64	NC_014150	AAT	2	6	3724	3729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
65	NC_014150	AAG	2	6	3755	3760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
66	NC_014150	CAG	2	6	3827	3832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
67	NC_014150	AGG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125062
68	NC_014150	TAA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
69	NC_014150	AGC	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
70	NC_014150	TAT	2	6	4107	4112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
71	NC_014150	CTT	3	9	4135	4143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125062
72	NC_014150	ACT	2	6	4213	4218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125062
73	NC_014150	CAG	3	9	4250	4258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
74	NC_014150	ACA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
75	NC_014150	GAA	2	6	4537	4542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
76	NC_014150	GAA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125062
77	NC_014150	ATT	2	6	4611	4616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125062
78	NC_014150	CAG	2	6	4688	4693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
79	NC_014150	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
80	NC_014150	ATA	2	6	4712	4717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
81	NC_014150	AGC	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125062
82	NC_014150	GGA	2	6	4810	4815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125062
83	NC_014150	CAA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125062
84	NC_014150	TGA	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125062
85	NC_014150	TAA	2	6	4899	4904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
86	NC_014150	ATA	2	6	4905	4910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125062
87	NC_014150	AGT	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125063
88	NC_014150	TTA	2	6	5165	5170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125063
89	NC_014150	ATA	2	6	5421	5426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125063
90	NC_014150	TAA	2	6	5433	5438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125063
91	NC_014150	ATA	2	6	5517	5522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
92	NC_014150	ATA	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
93	NC_014150	GTT	2	6	5732	5737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125064
94	NC_014150	TAA	2	6	5839	5844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
95	NC_014150	TAA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
96	NC_014150	ATA	2	6	5940	5945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
97	NC_014150	ATG	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125064
98	NC_014150	GAA	2	6	6025	6030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125064
99	NC_014150	AGA	2	6	6085	6090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125064
100	NC_014150	AGA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125064
101	NC_014150	TGA	2	6	6175	6180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125064
102	NC_014150	TAA	2	6	6187	6192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
103	NC_014150	GAA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125064
104	NC_014150	TAA	2	6	6357	6362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125064
105	NC_014150	GAA	2	6	6386	6391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125064
106	NC_014150	ATT	2	6	6770	6775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125065
107	NC_014150	TAT	2	6	6795	6800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125065
108	NC_014150	TTA	2	6	6869	6874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125065
109	NC_014150	GGC	2	6	6882	6887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296125065
110	NC_014150	GCT	2	6	6967	6972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125065
111	NC_014150	TAA	2	6	6987	6992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125065
112	NC_014150	TAT	2	6	7208	7213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125065
113	NC_014150	TTG	2	6	7217	7222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125065
114	NC_014150	TTA	2	6	7269	7274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125066
115	NC_014150	ATT	2	6	7284	7289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125066
116	NC_014150	TAA	2	6	7489	7494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125066
117	NC_014150	TGT	2	6	7498	7503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125066
118	NC_014150	GCA	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125066
119	NC_014150	AGA	2	6	7550	7555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125066
120	NC_014150	ATT	2	6	7620	7625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125067
121	NC_014150	CTA	2	6	7653	7658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125067
122	NC_014150	ATG	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125067
123	NC_014150	AAG	2	6	7749	7754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125067
124	NC_014150	TGA	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125067
125	NC_014150	GGT	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	296125067
126	NC_014150	CGG	2	6	7894	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	296125067
127	NC_014150	GAT	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125067
128	NC_014150	GGA	3	9	7937	7945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125067
129	NC_014150	AGA	2	6	7973	7978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125067
130	NC_014150	GGA	2	6	8014	8019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125067
131	NC_014150	GGA	2	6	8132	8137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125067
132	NC_014150	AAG	2	6	8176	8181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125067
133	NC_014150	ACT	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125067
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145	NC_014150	TAT	2	6	8855	8860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125068
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255	NC_014150	AGA	2	6	17207	17212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125074
256	NC_014150	ATA	2	6	17280	17285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125074
257	NC_014150	ATT	2	6	17325	17330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125074
258	NC_014150	TAT	2	6	17350	17355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125074
259	NC_014150	CAT	2	6	17407	17412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125074
260	NC_014150	CTT	2	6	17449	17454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125074
261	NC_014150	TCT	2	6	17487	17492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125074
262	NC_014150	ATT	2	6	17952	17957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125075
263	NC_014150	CTT	2	6	17990	17995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125075
264	NC_014150	TAT	2	6	18156	18161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125075
265	NC_014150	AGA	2	6	18205	18210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125075
266	NC_014150	ATC	2	6	18420	18425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125075
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269	NC_014150	TAA	2	6	18603	18608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
270	NC_014150	TAA	2	6	18624	18629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
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277	NC_014150	TGA	2	6	19401	19406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125075
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288	NC_014150	ATT	3	9	19746	19754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125075
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382	NC_014150	CTT	2	6	25390	25395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125081
383	NC_014150	CTG	2	6	25426	25431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125081
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