MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014150	TAA	2	6	152905	152910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125179
4002	NC_014150	CAG	2	6	152937	152942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125179
4003	NC_014150	TA	3	6	152943	152948	50 %	50 %	0 %	0 %	296125179
4004	NC_014150	ATT	3	9	152978	152986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125179
4005	NC_014150	TAA	2	6	153012	153017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125179
4006	NC_014150	ATTTAA	2	12	153040	153051	50 %	50 %	0 %	0 %	296125179
4007	NC_014150	CAA	2	6	153060	153065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125179
4008	NC_014150	TTC	2	6	153115	153120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125179
4009	NC_014150	T	7	7	153126	153132	0 %	100 %	0 %	0 %	296125179
4010	NC_014150	ATA	2	6	153163	153168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125179
4011	NC_014150	TTC	2	6	153172	153177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125179
4012	NC_014150	ACA	2	6	153231	153236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125179
4013	NC_014150	T	6	6	153238	153243	0 %	100 %	0 %	0 %	296125179
4014	NC_014150	TATT	2	8	153264	153271	25 %	75 %	0 %	0 %	296125179
4015	NC_014150	TTTTCT	2	12	153317	153328	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296125179
4016	NC_014150	AGC	2	6	153346	153351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125179
4017	NC_014150	A	6	6	153452	153457	100 %	0 %	0 %	0 %	296125179
4018	NC_014150	TA	3	6	153508	153513	50 %	50 %	0 %	0 %	296125179
4019	NC_014150	A	6	6	153518	153523	100 %	0 %	0 %	0 %	296125179
4020	NC_014150	TAAT	2	8	153561	153568	50 %	50 %	0 %	0 %	296125179
4021	NC_014150	ATC	2	6	153577	153582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125179
4022	NC_014150	ATATT	2	10	153642	153651	40 %	60 %	0 %	0 %	296125179
4023	NC_014150	ATT	2	6	153659	153664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125179
4024	NC_014150	TGC	2	6	153713	153718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125180
4025	NC_014150	CTC	2	6	153719	153724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125180
4026	NC_014150	TAA	2	6	153729	153734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4027	NC_014150	GCTCT	8	40	153745	153784	0 %	40 %	20 %	40 %	296125180
4028	NC_014150	CAT	2	6	153814	153819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125180
4029	NC_014150	TAA	2	6	153821	153826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4030	NC_014150	TAA	2	6	153835	153840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4031	NC_014150	TTA	2	6	153862	153867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125180
4032	NC_014150	TTA	2	6	153915	153920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125180
4033	NC_014150	AAT	2	6	153932	153937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4034	NC_014150	TAT	2	6	153968	153973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125180
4035	NC_014150	T	6	6	154001	154006	0 %	100 %	0 %	0 %	296125180
4036	NC_014150	TAA	2	6	154010	154015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4037	NC_014150	TTC	2	6	154018	154023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125180
4038	NC_014150	A	6	6	154026	154031	100 %	0 %	0 %	0 %	296125180
4039	NC_014150	CAA	2	6	154044	154049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125180
4040	NC_014150	TAT	2	6	154063	154068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125180
4041	NC_014150	TAT	2	6	154072	154077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125180
4042	NC_014150	TAAT	2	8	154107	154114	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4043	NC_014150	AT	3	6	154113	154118	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4044	NC_014150	T	8	8	154126	154133	0 %	100 %	0 %	0 %	296125180
4045	NC_014150	ATTT	2	8	154153	154160	25 %	75 %	0 %	0 %	296125180
4046	NC_014150	AT	3	6	154193	154198	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4047	NC_014150	TA	3	6	154199	154204	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4048	NC_014150	AAAAT	2	10	154229	154238	80 %	20 %	0 %	0 %	296125180
4049	NC_014150	CTA	2	6	154249	154254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125180
4050	NC_014150	AAAT	2	8	154268	154275	75 %	25 %	0 %	0 %	296125180
4051	NC_014150	TAAT	2	8	154285	154292	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4052	NC_014150	ATA	3	9	154322	154330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4053	NC_014150	TGC	2	6	154331	154336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125180
4054	NC_014150	T	6	6	154344	154349	0 %	100 %	0 %	0 %	296125180
4055	NC_014150	AT	3	6	154377	154382	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4056	NC_014150	AT	3	6	154402	154407	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4057	NC_014150	AT	3	6	154414	154419	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4058	NC_014150	T	6	6	154428	154433	0 %	100 %	0 %	0 %	296125180
4059	NC_014150	AT	4	8	154439	154446	50 %	50 %	0 %	0 %	296125180
4060	NC_014150	ACA	2	6	154470	154475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125180
4061	NC_014150	T	6	6	154481	154486	0 %	100 %	0 %	0 %	296125180
4062	NC_014150	T	6	6	154494	154499	0 %	100 %	0 %	0 %	296125180
4063	NC_014150	TCC	2	6	154523	154528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125180
4064	NC_014150	TATAT	2	10	154529	154538	40 %	60 %	0 %	0 %	296125180
4065	NC_014150	AGA	2	6	154565	154570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125180
4066	NC_014150	TCC	2	6	154622	154627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125180
4067	NC_014150	TGC	2	6	154651	154656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125180
4068	NC_014150	TAA	2	6	154666	154671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
4069	NC_014150	TCTAT	2	10	154677	154686	20 %	60 %	0 %	20 %	296125180
4070	NC_014150	TATCT	3	15	154701	154715	20 %	60 %	0 %	20 %	296125180
4071	NC_014150	TCC	2	6	154727	154732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125180
4072	NC_014150	GTA	2	6	154764	154769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125180
4073	NC_014150	AAT	2	6	154774	154779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125180
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4076	NC_014150	ATT	2	6	154832	154837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125180
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4078	NC_014150	TTTAGC	2	12	154877	154888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	296125180
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4082	NC_014150	TTC	2	6	154992	154997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125181
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4094	NC_014150	ATC	2	6	155571	155576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125181
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4096	NC_014150	ATA	2	6	155610	155615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125181
4097	NC_014150	CAT	2	6	155624	155629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125181
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4099	NC_014150	T	6	6	155668	155673	0 %	100 %	0 %	0 %	296125181
4100	NC_014150	TC	3	6	155689	155694	0 %	50 %	0 %	50 %	296125181
4101	NC_014150	TTTA	2	8	155706	155713	25 %	75 %	0 %	0 %	296125181
4102	NC_014150	TAA	2	6	155747	155752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125181
4103	NC_014150	CAT	2	6	155762	155767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125181
4104	NC_014150	TAG	2	6	155792	155797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125181
4105	NC_014150	TTA	2	6	155800	155805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125181
4106	NC_014150	TATCTA	2	12	155816	155827	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	296125181
4107	NC_014150	TAT	2	6	155888	155893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125181
4108	NC_014150	ACA	2	6	155914	155919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125181
4109	NC_014150	TAT	2	6	155987	155992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125181
4110	NC_014150	ATA	2	6	156026	156031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125181
4111	NC_014150	TAA	2	6	156107	156112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125181
4112	NC_014150	AT	3	6	156134	156139	50 %	50 %	0 %	0 %	296125181
4113	NC_014150	TCA	2	6	156148	156153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125181
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4115	NC_014150	ATT	2	6	156207	156212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125181
4116	NC_014150	TCA	2	6	156214	156219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125181
4117	NC_014150	CCAA	2	8	156251	156258	50 %	0 %	0 %	50 %	296125181
4118	NC_014150	TTC	2	6	156269	156274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125181
4119	NC_014150	ATTT	2	8	156378	156385	25 %	75 %	0 %	0 %	296125181
4120	NC_014150	AT	3	6	156460	156465	50 %	50 %	0 %	0 %	296125181
4121	NC_014150	TCC	2	6	156519	156524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125181
4122	NC_014150	AGT	2	6	156531	156536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125181
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4498	NC_014150	TAA	3	9	168232	168240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125190
4499	NC_014150	ACAA	2	8	168245	168252	75 %	0 %	0 %	25 %	296125190
4500	NC_014150	ATT	2	6	168255	168260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125190

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