MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014150	AGA	2	6	55613	55618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125104
1502	NC_014150	AAT	2	6	55622	55627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125104
1503	NC_014150	AGA	2	6	55639	55644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125104
1504	NC_014150	ATT	2	6	55670	55675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125104
1505	NC_014150	AAT	2	6	55958	55963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125105
1506	NC_014150	TAA	2	6	55990	55995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125105
1507	NC_014150	TTAG	2	8	56000	56007	25 %	50 %	25 %	0 %	296125105
1508	NC_014150	ATC	2	6	56023	56028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125105
1509	NC_014150	TAT	2	6	56070	56075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1510	NC_014150	AAGA	2	8	56137	56144	75 %	0 %	25 %	0 %	296125105
1511	NC_014150	TTA	2	6	56161	56166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1512	NC_014150	TA	3	6	56194	56199	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1513	NC_014150	TAAG	2	8	56208	56215	50 %	25 %	25 %	0 %	296125105
1514	NC_014150	GAATAA	2	12	56221	56232	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296125105
1515	NC_014150	T	7	7	56243	56249	0 %	100 %	0 %	0 %	296125105
1516	NC_014150	ATT	2	6	56260	56265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1517	NC_014150	TAT	2	6	56278	56283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1518	NC_014150	CTG	2	6	56307	56312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125105
1519	NC_014150	CTT	2	6	56333	56338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125105
1520	NC_014150	T	6	6	56337	56342	0 %	100 %	0 %	0 %	296125105
1521	NC_014150	TCT	2	6	56350	56355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125105
1522	NC_014150	ATTA	2	8	56368	56375	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1523	NC_014150	TCT	2	6	56486	56491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125105
1524	NC_014150	TGA	2	6	56538	56543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125105
1525	NC_014150	A	6	6	56558	56563	100 %	0 %	0 %	0 %	296125105
1526	NC_014150	TAT	2	6	56567	56572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1527	NC_014150	AAAG	2	8	56575	56582	75 %	0 %	25 %	0 %	296125105
1528	NC_014150	TAG	2	6	56634	56639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125105
1529	NC_014150	AT	4	8	56673	56680	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1530	NC_014150	T	7	7	56680	56686	0 %	100 %	0 %	0 %	296125105
1531	NC_014150	ATT	2	6	56696	56701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1532	NC_014150	AAG	2	6	56743	56748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125105
1533	NC_014150	TAA	2	6	56755	56760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125105
1534	NC_014150	AT	3	6	56764	56769	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1535	NC_014150	AAG	2	6	56775	56780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125105
1536	NC_014150	AGA	2	6	56785	56790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125105
1537	NC_014150	TA	3	6	56796	56801	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1538	NC_014150	GCTT	2	8	56821	56828	0 %	50 %	25 %	25 %	296125105
1539	NC_014150	T	7	7	56866	56872	0 %	100 %	0 %	0 %	296125105
1540	NC_014150	TTA	2	6	56880	56885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1541	NC_014150	TA	3	6	56999	57004	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1542	NC_014150	TTC	2	6	57006	57011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125105
1543	NC_014150	ATT	2	6	57022	57027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125105
1544	NC_014150	TGA	2	6	57037	57042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125105
1545	NC_014150	TA	3	6	57047	57052	50 %	50 %	0 %	0 %	296125105
1546	NC_014150	TAG	2	6	57078	57083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125105
1547	NC_014150	TGT	2	6	57136	57141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125105
1548	NC_014150	TGC	2	6	57175	57180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125105
1549	NC_014150	TGCT	2	8	57195	57202	0 %	50 %	25 %	25 %	296125105
1550	NC_014150	ATG	2	6	57230	57235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125105
1551	NC_014150	ATA	2	6	57236	57241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125105
1552	NC_014150	TGCT	2	8	57258	57265	0 %	50 %	25 %	25 %	296125105
1553	NC_014150	A	7	7	57306	57312	100 %	0 %	0 %	0 %	296125105
1554	NC_014150	TTATA	2	10	57340	57349	40 %	60 %	0 %	0 %	296125106
1555	NC_014150	CTG	2	6	57387	57392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125106
1556	NC_014150	AAT	2	6	57449	57454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125106
1557	NC_014150	A	6	6	57478	57483	100 %	0 %	0 %	0 %	296125106
1558	NC_014150	ATA	2	6	57489	57494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125106
1559	NC_014150	ATG	2	6	57498	57503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125106
1560	NC_014150	GA	3	6	57587	57592	50 %	0 %	50 %	0 %	296125106
1561	NC_014150	A	8	8	57641	57648	100 %	0 %	0 %	0 %	296125106
1562	NC_014150	ATA	2	6	57713	57718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125106
1563	NC_014150	AGG	2	6	57727	57732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125106
1564	NC_014150	AT	3	6	57751	57756	50 %	50 %	0 %	0 %	296125106
1565	NC_014150	AGA	2	6	57781	57786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125106
1566	NC_014150	A	6	6	57822	57827	100 %	0 %	0 %	0 %	296125106
1567	NC_014150	ATT	3	9	57844	57852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125106
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1569	NC_014150	TGA	2	6	57934	57939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125106
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1572	NC_014150	TAT	2	6	58004	58009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125106
1573	NC_014150	TAT	2	6	58044	58049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125106
1574	NC_014150	ATA	2	6	58065	58070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125106
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1577	NC_014150	ATA	2	6	58267	58272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125107
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1582	NC_014150	A	6	6	58541	58546	100 %	0 %	0 %	0 %	296125107
1583	NC_014150	TAA	2	6	58561	58566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125107
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1585	NC_014150	TGT	2	6	58691	58696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125107
1586	NC_014150	TAT	2	6	58741	58746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125107
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1591	NC_014150	TGA	2	6	58940	58945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125107
1592	NC_014150	AAT	2	6	58990	58995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125107
1593	NC_014150	TGC	2	6	59153	59158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125108
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1595	NC_014150	AAG	2	6	59245	59250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125108
1596	NC_014150	AAT	2	6	59319	59324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125108
1597	NC_014150	TAA	2	6	59330	59335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125108
1598	NC_014150	AAGT	2	8	59342	59349	50 %	25 %	25 %	0 %	296125108
1599	NC_014150	GAA	2	6	59365	59370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125108
1600	NC_014150	ACT	2	6	59373	59378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125108
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1602	NC_014150	CTA	2	6	59437	59442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125108
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1604	NC_014150	ATTT	2	8	59512	59519	25 %	75 %	0 %	0 %	296125108
1605	NC_014150	A	6	6	59523	59528	100 %	0 %	0 %	0 %	296125108
1606	NC_014150	AAC	2	6	59549	59554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125108
1607	NC_014150	AGTA	2	8	59618	59625	50 %	25 %	25 %	0 %	296125108
1608	NC_014150	TTG	2	6	59650	59655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125108
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1610	NC_014150	ACC	2	6	59726	59731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	296125108
1611	NC_014150	GGAG	2	8	59772	59779	25 %	0 %	75 %	0 %	296125108
1612	NC_014150	ATT	2	6	59817	59822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125108
1613	NC_014150	A	6	6	59975	59980	100 %	0 %	0 %	0 %	296125108
1614	NC_014150	CAG	2	6	59989	59994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125108
1615	NC_014150	CTA	2	6	59995	60000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125108
1616	NC_014150	T	7	7	60061	60067	0 %	100 %	0 %	0 %	296125108
1617	NC_014150	TATTT	2	10	60087	60096	20 %	80 %	0 %	0 %	296125109
1618	NC_014150	TAT	2	6	60108	60113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125109
1619	NC_014150	TCA	2	6	60185	60190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125109
1620	NC_014150	ATCTTC	2	12	60223	60234	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	296125109
1621	NC_014150	ATT	2	6	60244	60249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125109
1622	NC_014150	TTA	2	6	60290	60295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125109
1623	NC_014150	ATC	2	6	60307	60312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125109
1624	NC_014150	AAG	2	6	60340	60345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125109
1625	NC_014150	T	7	7	60406	60412	0 %	100 %	0 %	0 %	296125109
1626	NC_014150	TATAT	2	10	60476	60485	40 %	60 %	0 %	0 %	296125109
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