MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014150	AGT	2	6	36324	36329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125091
1002	NC_014150	A	6	6	36343	36348	100 %	0 %	0 %	0 %	296125091
1003	NC_014150	AGA	2	6	36391	36396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125091
1004	NC_014150	CAT	2	6	36402	36407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125091
1005	NC_014150	ATA	3	9	36457	36465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125091
1006	NC_014150	AT	3	6	36512	36517	50 %	50 %	0 %	0 %	296125091
1007	NC_014150	ATT	2	6	36585	36590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125091
1008	NC_014150	AGT	2	6	36598	36603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125091
1009	NC_014150	T	6	6	36636	36641	0 %	100 %	0 %	0 %	296125091
1010	NC_014150	TCT	3	9	36643	36651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125091
1011	NC_014150	T	7	7	36656	36662	0 %	100 %	0 %	0 %	296125091
1012	NC_014150	CT	3	6	36663	36668	0 %	50 %	0 %	50 %	296125091
1013	NC_014150	CAT	2	6	36689	36694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125091
1014	NC_014150	TAA	2	6	36752	36757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125091
1015	NC_014150	AAAT	2	8	36771	36778	75 %	25 %	0 %	0 %	296125091
1016	NC_014150	TATATT	2	12	36811	36822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125092
1017	NC_014150	TTTG	2	8	36864	36871	0 %	75 %	25 %	0 %	296125092
1018	NC_014150	AT	3	6	36877	36882	50 %	50 %	0 %	0 %	296125092
1019	NC_014150	AG	3	6	36904	36909	50 %	0 %	50 %	0 %	296125092
1020	NC_014150	TTA	2	6	36989	36994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125092
1021	NC_014150	TA	3	6	37095	37100	50 %	50 %	0 %	0 %	296125092
1022	NC_014150	AT	3	6	37119	37124	50 %	50 %	0 %	0 %	296125092
1023	NC_014150	TCC	2	6	37170	37175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125092
1024	NC_014150	AAC	2	6	37260	37265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125092
1025	NC_014150	AT	3	6	37287	37292	50 %	50 %	0 %	0 %	296125092
1026	NC_014150	ATA	2	6	37328	37333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125092
1027	NC_014150	ATT	2	6	37371	37376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125092
1028	NC_014150	TAAT	2	8	37379	37386	50 %	50 %	0 %	0 %	296125092
1029	NC_014150	TAT	2	6	37445	37450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125092
1030	NC_014150	ATA	2	6	37457	37462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125092
1031	NC_014150	T	6	6	37492	37497	0 %	100 %	0 %	0 %	296125092
1032	NC_014150	ATCA	2	8	37509	37516	50 %	25 %	0 %	25 %	296125093
1033	NC_014150	TAT	2	6	37595	37600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125093
1034	NC_014150	AGG	2	6	37628	37633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125093
1035	NC_014150	CTT	2	6	37654	37659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125093
1036	NC_014150	TCA	2	6	37720	37725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125093
1037	NC_014150	ATC	2	6	37736	37741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125093
1038	NC_014150	T	6	6	37763	37768	0 %	100 %	0 %	0 %	296125093
1039	NC_014150	TAA	2	6	37972	37977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125093
1040	NC_014150	TACA	2	8	38416	38423	50 %	25 %	0 %	25 %	296125094
1041	NC_014150	A	6	6	38472	38477	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1042	NC_014150	AAG	3	9	38481	38489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1043	NC_014150	AGA	2	6	38681	38686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1044	NC_014150	A	6	6	38686	38691	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1045	NC_014150	TTC	2	6	38707	38712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125094
1046	NC_014150	AAG	2	6	38725	38730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1047	NC_014150	TAT	2	6	38781	38786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125094
1048	NC_014150	ATA	2	6	38821	38826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1049	NC_014150	A	7	7	38882	38888	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1050	NC_014150	TA	3	6	38949	38954	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1051	NC_014150	ATA	2	6	38968	38973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1052	NC_014150	GAA	2	6	38979	38984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1053	NC_014150	TA	3	6	39004	39009	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1054	NC_014150	ATC	2	6	39019	39024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125094
1055	NC_014150	ATG	2	6	39049	39054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1056	NC_014150	AGA	2	6	39071	39076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1057	NC_014150	CTT	2	6	39096	39101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125094
1058	NC_014150	AAG	2	6	39134	39139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1059	NC_014150	AGA	2	6	39179	39184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1060	NC_014150	GAT	2	6	39185	39190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1061	NC_014150	TTA	2	6	39278	39283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125094
1062	NC_014150	TAA	2	6	39356	39361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1063	NC_014150	AAT	2	6	39372	39377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1064	NC_014150	TCA	2	6	39469	39474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125094
1065	NC_014150	ATG	2	6	39490	39495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1066	NC_014150	GAAA	2	8	39612	39619	75 %	0 %	25 %	0 %	296125094
1067	NC_014150	GAT	2	6	39651	39656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1068	NC_014150	TAA	2	6	39667	39672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1069	NC_014150	GGA	2	6	39738	39743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125094
1070	NC_014150	ATG	2	6	39823	39828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1071	NC_014150	AGT	2	6	39836	39841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1072	NC_014150	AT	4	8	39844	39851	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1073	NC_014150	AGC	2	6	39891	39896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125094
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1075	NC_014150	TATG	2	8	39911	39918	25 %	50 %	25 %	0 %	296125094
1076	NC_014150	TTA	2	6	39976	39981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125094
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1078	NC_014150	GAT	2	6	40194	40199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
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1081	NC_014150	TTA	2	6	40279	40284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125094
1082	NC_014150	TGA	2	6	40304	40309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
1083	NC_014150	A	6	6	40382	40387	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1084	NC_014150	AAAAG	2	10	40389	40398	80 %	0 %	20 %	0 %	296125094
1085	NC_014150	TA	3	6	40405	40410	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1086	NC_014150	AAAG	2	8	40437	40444	75 %	0 %	25 %	0 %	296125094
1087	NC_014150	AT	3	6	40458	40463	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
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1093	NC_014150	TTA	2	6	40623	40628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125094
1094	NC_014150	TTAT	2	8	40631	40638	25 %	75 %	0 %	0 %	296125094
1095	NC_014150	AT	3	6	40721	40726	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1096	NC_014150	CTT	2	6	40761	40766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125094
1097	NC_014150	A	7	7	40822	40828	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1098	NC_014150	ATT	2	6	40868	40873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125094
1099	NC_014150	TGC	2	6	40934	40939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125094
1100	NC_014150	GAA	2	6	40950	40955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1101	NC_014150	GA	5	10	40956	40965	50 %	0 %	50 %	0 %	296125094
1102	NC_014150	AGA	2	6	40988	40993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1103	NC_014150	ATTA	2	8	41045	41052	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1104	NC_014150	TGCTT	2	10	41090	41099	0 %	60 %	20 %	20 %	296125094
1105	NC_014150	CTT	2	6	41206	41211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125094
1106	NC_014150	ATC	2	6	41293	41298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125094
1107	NC_014150	AT	3	6	41309	41314	50 %	50 %	0 %	0 %	296125094
1108	NC_014150	TAA	2	6	41339	41344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1109	NC_014150	AAAGAT	2	12	41367	41378	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296125094
1110	NC_014150	ATTT	2	8	41464	41471	25 %	75 %	0 %	0 %	296125094
1111	NC_014150	GTAT	2	8	41477	41484	25 %	50 %	25 %	0 %	296125094
1112	NC_014150	A	6	6	41498	41503	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1113	NC_014150	AGAT	2	8	41506	41513	50 %	25 %	25 %	0 %	296125094
1114	NC_014150	TAA	2	6	41551	41556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1115	NC_014150	A	7	7	41569	41575	100 %	0 %	0 %	0 %	296125094
1116	NC_014150	AAT	2	6	41598	41603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
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1118	NC_014150	AAG	2	6	41659	41664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125094
1119	NC_014150	ATA	2	6	41674	41679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1120	NC_014150	TAG	2	6	41714	41719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
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1122	NC_014150	TAA	2	6	41777	41782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1123	NC_014150	TGT	2	6	41810	41815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125094
1124	NC_014150	GCA	2	6	41823	41828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125094
1125	NC_014150	TAA	2	6	41843	41848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
1126	NC_014150	TAA	2	6	41903	41908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125094
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1128	NC_014150	TGA	2	6	41918	41923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125094
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