MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014150	TTG	2	6	19496	19501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125075
502	NC_014150	TCC	2	6	19548	19553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125075
503	NC_014150	CTA	2	6	19574	19579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125075
504	NC_014150	ATA	2	6	19580	19585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
505	NC_014150	CTTT	2	8	19606	19613	0 %	75 %	0 %	25 %	296125075
506	NC_014150	AAT	2	6	19627	19632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
507	NC_014150	AT	3	6	19631	19636	50 %	50 %	0 %	0 %	296125075
508	NC_014150	AT	3	6	19638	19643	50 %	50 %	0 %	0 %	296125075
509	NC_014150	ATA	2	6	19652	19657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
510	NC_014150	ATT	2	6	19697	19702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125075
511	NC_014150	CTC	2	6	19703	19708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125075
512	NC_014150	AGGC	2	8	19709	19716	25 %	0 %	50 %	25 %	296125075
513	NC_014150	AAT	2	6	19729	19734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
514	NC_014150	ATT	3	9	19746	19754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125075
515	NC_014150	ATA	2	6	19769	19774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125075
516	NC_014150	TTTA	2	8	19797	19804	25 %	75 %	0 %	0 %	296125076
517	NC_014150	AAT	2	6	19807	19812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
518	NC_014150	AGG	2	6	19866	19871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125076
519	NC_014150	ATT	2	6	19883	19888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125076
520	NC_014150	GAC	2	6	19918	19923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125076
521	NC_014150	TGA	3	9	19950	19958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125076
522	NC_014150	AAT	2	6	19987	19992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
523	NC_014150	A	8	8	20066	20073	100 %	0 %	0 %	0 %	296125076
524	NC_014150	TAT	2	6	20085	20090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125076
525	NC_014150	ATA	2	6	20111	20116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
526	NC_014150	ATA	2	6	20123	20128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
527	NC_014150	ATTT	2	8	20162	20169	25 %	75 %	0 %	0 %	296125076
528	NC_014150	CT	3	6	20182	20187	0 %	50 %	0 %	50 %	296125076
529	NC_014150	TAC	2	6	20208	20213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125076
530	NC_014150	A	8	8	20217	20224	100 %	0 %	0 %	0 %	296125076
531	NC_014150	A	6	6	20274	20279	100 %	0 %	0 %	0 %	296125076
532	NC_014150	TTA	2	6	20280	20285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125076
533	NC_014150	A	6	6	20294	20299	100 %	0 %	0 %	0 %	296125076
534	NC_014150	AT	3	6	20324	20329	50 %	50 %	0 %	0 %	296125076
535	NC_014150	ATG	3	9	20339	20347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125076
536	NC_014150	TAA	2	6	20357	20362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
537	NC_014150	T	6	6	20369	20374	0 %	100 %	0 %	0 %	296125076
538	NC_014150	ATA	2	6	20393	20398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
539	NC_014150	TAA	2	6	20418	20423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
540	NC_014150	TA	3	6	20440	20445	50 %	50 %	0 %	0 %	296125076
541	NC_014150	TAA	2	6	20484	20489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125076
542	NC_014150	TA	3	6	20494	20499	50 %	50 %	0 %	0 %	296125076
543	NC_014150	GAG	2	6	20632	20637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125076
544	NC_014150	A	6	6	20677	20682	100 %	0 %	0 %	0 %	296125076
545	NC_014150	ATTTA	2	10	20694	20703	40 %	60 %	0 %	0 %	296125076
546	NC_014150	TTC	2	6	20716	20721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125077
547	NC_014150	TAA	2	6	20749	20754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125077
548	NC_014150	TAATA	2	10	20792	20801	60 %	40 %	0 %	0 %	296125077
549	NC_014150	ATC	2	6	20813	20818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125077
550	NC_014150	CTG	2	6	20825	20830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125077
551	NC_014150	ATT	2	6	20834	20839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125077
552	NC_014150	CAT	2	6	20843	20848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125077
553	NC_014150	TA	3	6	20855	20860	50 %	50 %	0 %	0 %	296125077
554	NC_014150	AT	3	6	20888	20893	50 %	50 %	0 %	0 %	296125077
555	NC_014150	TTA	2	6	20902	20907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125077
556	NC_014150	T	6	6	20921	20926	0 %	100 %	0 %	0 %	296125077
557	NC_014150	GAG	2	6	20929	20934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125077
558	NC_014150	TAT	2	6	20935	20940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125077
559	NC_014150	AT	3	6	20957	20962	50 %	50 %	0 %	0 %	296125077
560	NC_014150	T	6	6	20986	20991	0 %	100 %	0 %	0 %	296125077
561	NC_014150	CTT	2	6	20992	20997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125077
562	NC_014150	T	8	8	21017	21024	0 %	100 %	0 %	0 %	296125077
563	NC_014150	GTT	2	6	21039	21044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125077
564	NC_014150	TA	4	8	21052	21059	50 %	50 %	0 %	0 %	296125077
565	NC_014150	CTT	2	6	21082	21087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125077
566	NC_014150	TA	3	6	21110	21115	50 %	50 %	0 %	0 %	296125077
567	NC_014150	A	6	6	21115	21120	100 %	0 %	0 %	0 %	296125077
568	NC_014150	A	6	6	21216	21221	100 %	0 %	0 %	0 %	296125077
569	NC_014150	TTA	3	9	21235	21243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125077
570	NC_014150	AAAT	2	8	21252	21259	75 %	25 %	0 %	0 %	296125077
571	NC_014150	ATT	2	6	21292	21297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125078
572	NC_014150	AAT	2	6	21312	21317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125078
573	NC_014150	TAA	2	6	21319	21324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125078
574	NC_014150	AAT	2	6	21342	21347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125078
575	NC_014150	CTT	2	6	21355	21360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125078
576	NC_014150	ATT	2	6	21377	21382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125078
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578	NC_014150	CAT	2	6	21457	21462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125078
579	NC_014150	AAG	2	6	21529	21534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125078
580	NC_014150	TAT	2	6	21544	21549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125078
581	NC_014150	AAT	2	6	21550	21555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125078
582	NC_014150	TAT	2	6	21562	21567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125078
583	NC_014150	CTT	2	6	21604	21609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125078
584	NC_014150	TGC	2	6	21623	21628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125078
585	NC_014150	T	8	8	21639	21646	0 %	100 %	0 %	0 %	296125078
586	NC_014150	TAT	2	6	21667	21672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125078
587	NC_014150	ATTA	2	8	21677	21684	50 %	50 %	0 %	0 %	296125078
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592	NC_014150	T	8	8	21769	21776	0 %	100 %	0 %	0 %	296125078
593	NC_014150	AT	3	6	21817	21822	50 %	50 %	0 %	0 %	296125078
594	NC_014150	TTG	2	6	21871	21876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125078
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596	NC_014150	GTT	2	6	21930	21935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125078
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598	NC_014150	T	7	7	22115	22121	0 %	100 %	0 %	0 %	296125078
599	NC_014150	TAA	2	6	22148	22153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125078
600	NC_014150	CTT	2	6	22177	22182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125078
601	NC_014150	T	6	6	22202	22207	0 %	100 %	0 %	0 %	296125078
602	NC_014150	CTT	2	6	22255	22260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125078
603	NC_014150	TAT	2	6	22280	22285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125078
604	NC_014150	CAT	2	6	22291	22296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125078
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608	NC_014150	TAAGAA	2	12	22423	22434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296125078
609	NC_014150	TA	3	6	22451	22456	50 %	50 %	0 %	0 %	296125078
610	NC_014150	TTA	2	6	22489	22494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125079
611	NC_014150	GCA	2	6	22529	22534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125079
612	NC_014150	TCTT	2	8	22543	22550	0 %	75 %	0 %	25 %	296125079
613	NC_014150	TTC	2	6	22582	22587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125079
614	NC_014150	T	8	8	22592	22599	0 %	100 %	0 %	0 %	296125079
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616	NC_014150	TTC	2	6	22630	22635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125079
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618	NC_014150	AT	3	6	22653	22658	50 %	50 %	0 %	0 %	296125079
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620	NC_014150	TCT	2	6	22682	22687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125079
621	NC_014150	AT	3	6	22854	22859	50 %	50 %	0 %	0 %	296125079
622	NC_014150	ATT	2	6	22919	22924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125079
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626	NC_014150	ACA	2	6	23090	23095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125079
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628	NC_014150	T	6	6	23363	23368	0 %	100 %	0 %	0 %	296125080
629	NC_014150	ATTT	2	8	23400	23407	25 %	75 %	0 %	0 %	296125080
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