MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 84016

< Previous12...678910111213141516...168169Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014150	GAA	2	6	185301	185306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125199
5003	NC_014150	GAA	2	6	185331	185336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125199
5004	NC_014150	GCTAT	2	10	185417	185426	20 %	40 %	20 %	20 %	296125200
5005	NC_014150	TTG	2	6	185439	185444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125200
5006	NC_014150	TAG	2	6	185496	185501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125200
5007	NC_014150	TTTAC	2	10	185516	185525	20 %	60 %	0 %	20 %	296125200
5008	NC_014150	TAA	2	6	185536	185541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5009	NC_014150	ATA	2	6	185544	185549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5010	NC_014150	TAA	2	6	185616	185621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5011	NC_014150	TAT	2	6	185635	185640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125200
5012	NC_014150	AT	3	6	185646	185651	50 %	50 %	0 %	0 %	296125200
5013	NC_014150	TGC	2	6	185665	185670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125200
5014	NC_014150	TAA	2	6	185691	185696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5015	NC_014150	AT	3	6	185733	185738	50 %	50 %	0 %	0 %	296125200
5016	NC_014150	A	7	7	185816	185822	100 %	0 %	0 %	0 %	296125200
5017	NC_014150	CTG	3	9	185907	185915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	296125200
5018	NC_014150	TAT	2	6	185953	185958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125200
5019	NC_014150	AT	3	6	186028	186033	50 %	50 %	0 %	0 %	296125200
5020	NC_014150	TAA	2	6	186078	186083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5021	NC_014150	AGG	2	6	186091	186096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	296125200
5022	NC_014150	GCC	2	6	186100	186105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	296125200
5023	NC_014150	TTA	2	6	186143	186148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125200
5024	NC_014150	TAT	2	6	186199	186204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125200
5025	NC_014150	A	6	6	186205	186210	100 %	0 %	0 %	0 %	296125200
5026	NC_014150	TATATT	2	12	186211	186222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125200
5027	NC_014150	ATT	2	6	186244	186249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125200
5028	NC_014150	CTT	2	6	186269	186274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125200
5029	NC_014150	AGA	2	6	186295	186300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125200
5030	NC_014150	AT	3	6	186429	186434	50 %	50 %	0 %	0 %	296125200
5031	NC_014150	ATA	2	6	186455	186460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5032	NC_014150	AAT	2	6	186490	186495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125200
5033	NC_014150	TGT	2	6	186517	186522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125200
5034	NC_014150	CTC	2	6	186543	186548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	296125200
5035	NC_014150	GTT	2	6	186659	186664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125200
5036	NC_014150	TAAAAG	2	12	186678	186689	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	296125200
5037	NC_014150	TCTT	2	8	186761	186768	0 %	75 %	0 %	25 %	296125200
5038	NC_014150	TTAAAA	2	12	186857	186868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125201
5039	NC_014150	TTA	2	6	186869	186874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125201
5040	NC_014150	TCT	2	6	186880	186885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125201
5041	NC_014150	TAAA	2	8	186962	186969	75 %	25 %	0 %	0 %	296125201
5042	NC_014150	CAGAAG	2	12	187035	187046	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	296125201
5043	NC_014150	A	6	6	187059	187064	100 %	0 %	0 %	0 %	296125201
5044	NC_014150	ATAG	2	8	187096	187103	50 %	25 %	25 %	0 %	296125201
5045	NC_014150	A	6	6	187208	187213	100 %	0 %	0 %	0 %	296125201
5046	NC_014150	GAA	2	6	187222	187227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	296125201
5047	NC_014150	CAA	2	6	187278	187283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	296125201
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5049	NC_014150	TAG	3	9	187462	187470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125202
5050	NC_014150	AAT	2	6	187485	187490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125202
5051	NC_014150	TTCA	2	8	187496	187503	25 %	50 %	0 %	25 %	296125202
5052	NC_014150	ATATA	2	10	187508	187517	60 %	40 %	0 %	0 %	296125202
5053	NC_014150	A	7	7	187610	187616	100 %	0 %	0 %	0 %	296125202
5054	NC_014150	TTA	2	6	187643	187648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125202
5055	NC_014150	CTA	2	6	187651	187656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125202
5056	NC_014150	TA	3	6	187709	187714	50 %	50 %	0 %	0 %	296125202
5057	NC_014150	ATC	2	6	187724	187729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125202
5058	NC_014150	TAT	2	6	187758	187763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125202
5059	NC_014150	AT	5	10	187837	187846	50 %	50 %	0 %	0 %	296125202
5060	NC_014150	GGAA	2	8	187847	187854	50 %	0 %	50 %	0 %	296125202
5061	NC_014150	TAA	2	6	187870	187875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	296125202
5062	NC_014150	ATG	2	6	187920	187925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125202
5063	NC_014150	GAT	2	6	187947	187952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125202
5064	NC_014150	TTG	2	6	187954	187959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	296125202
5065	NC_014150	TAT	2	6	188049	188054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125202
5066	NC_014150	ATT	2	6	188101	188106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125202
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5068	NC_014150	AT	3	6	188125	188130	50 %	50 %	0 %	0 %	296125202
5069	NC_014150	TTA	2	6	188135	188140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125202
5070	NC_014150	A	7	7	188148	188154	100 %	0 %	0 %	0 %	296125203
5071	NC_014150	TAT	2	6	188165	188170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125203
5072	NC_014150	T	7	7	188179	188185	0 %	100 %	0 %	0 %	296125203
5073	NC_014150	TAG	2	6	188218	188223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125203
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5075	NC_014150	TA	4	8	188275	188282	50 %	50 %	0 %	0 %	296125203
5076	NC_014150	AT	3	6	188328	188333	50 %	50 %	0 %	0 %	296125203
5077	NC_014150	A	6	6	188375	188380	100 %	0 %	0 %	0 %	296125203
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5080	NC_014150	TAT	2	6	188478	188483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125203
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5082	NC_014150	A	6	6	188523	188528	100 %	0 %	0 %	0 %	296125203
5083	NC_014150	TA	3	6	188529	188534	50 %	50 %	0 %	0 %	296125203
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5093	NC_014150	TAT	2	6	189307	189312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125204
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5095	NC_014150	T	6	6	189322	189327	0 %	100 %	0 %	0 %	296125204
5096	NC_014150	T	6	6	189352	189357	0 %	100 %	0 %	0 %	296125204
5097	NC_014150	AT	3	6	189386	189391	50 %	50 %	0 %	0 %	296125204
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5100	NC_014150	TCA	2	6	189527	189532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125204
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5102	NC_014150	TC	4	8	189608	189615	0 %	50 %	0 %	50 %	296125204
5103	NC_014150	TTCT	2	8	189641	189648	0 %	75 %	0 %	25 %	296125204
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5106	NC_014150	CAT	2	6	189744	189749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125204
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5109	NC_014150	TC	3	6	189888	189893	0 %	50 %	0 %	50 %	296125204
5110	NC_014150	TCTTTT	2	12	189944	189955	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	296125204
5111	NC_014150	T	6	6	189952	189957	0 %	100 %	0 %	0 %	296125204
5112	NC_014150	AT	3	6	189978	189983	50 %	50 %	0 %	0 %	296125204
5113	NC_014150	ATG	2	6	189985	189990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	296125204
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5115	NC_014150	ATTTA	2	10	190069	190078	40 %	60 %	0 %	0 %	296125204
5116	NC_014150	CAT	2	6	190191	190196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125204
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5118	NC_014150	AGC	2	6	190249	190254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	296125204
5119	NC_014150	TCT	2	6	190277	190282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125204
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5123	NC_014150	ATT	2	6	190466	190471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125204
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5352	NC_014150	TTTC	2	8	198543	198550	0 %	75 %	0 %	25 %	296125204
5353	NC_014150	AAAT	2	8	198559	198566	75 %	25 %	0 %	0 %	296125204
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5363	NC_014150	ATC	2	6	198805	198810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125204
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5491	NC_014150	TC	3	6	202987	202992	0 %	50 %	0 %	50 %	296125204
5492	NC_014150	ATC	2	6	203020	203025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	296125204
5493	NC_014150	TTC	2	6	203062	203067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125204
5494	NC_014150	CTT	2	6	203112	203117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	296125204
5495	NC_014150	TA	3	6	203139	203144	50 %	50 %	0 %	0 %	296125204
5496	NC_014150	CTAT	2	8	203258	203265	25 %	50 %	0 %	25 %	296125204
5497	NC_014150	TTCA	2	8	203302	203309	25 %	50 %	0 %	25 %	296125204
5498	NC_014150	TATCA	2	10	203341	203350	40 %	40 %	0 %	20 %	296125204
5499	NC_014150	ATT	2	6	203401	203406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	296125204
5500	NC_014150	ATCT	2	8	203409	203416	25 %	50 %	0 %	25 %	296125204

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