MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1002 plasmid pBC201

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014120	TGACT	2	10	1448	1457	20 %	40 %	20 %	20 %	295701109
2	NC_014120	CAGGC	2	10	3004	3013	20 %	0 %	40 %	40 %	295701113
3	NC_014120	TCGCC	2	10	3290	3299	0 %	20 %	20 %	60 %	295701113
4	NC_014120	CAGGA	2	10	4597	4606	40 %	0 %	40 %	20 %	295701115
5	NC_014120	CGTTT	2	10	4998	5007	0 %	60 %	20 %	20 %	295701115
6	NC_014120	AGGCG	2	10	6740	6749	20 %	0 %	60 %	20 %	295701118
7	NC_014120	ACAGA	2	10	7525	7534	60 %	0 %	20 %	20 %	295701119
8	NC_014120	CGGGC	2	10	7930	7939	0 %	0 %	60 %	40 %	295701119
9	NC_014120	CGACC	2	10	8094	8103	20 %	0 %	20 %	60 %	295701120
10	NC_014120	CATTC	2	10	10618	10627	20 %	40 %	0 %	40 %	295701122
11	NC_014120	ACCGC	2	10	13560	13569	20 %	0 %	20 %	60 %	295701126
12	NC_014120	CGTCG	2	10	13693	13702	0 %	20 %	40 %	40 %	295701126
13	NC_014120	CAGCG	2	10	14240	14249	20 %	0 %	40 %	40 %	295701126
14	NC_014120	CATCG	2	10	14498	14507	20 %	20 %	20 %	40 %	295701127
15	NC_014120	AGCGC	2	10	15290	15299	20 %	0 %	40 %	40 %	295701128
16	NC_014120	GTCAT	2	10	16192	16201	20 %	40 %	20 %	20 %	295701129
17	NC_014120	GCGCC	2	10	16246	16255	0 %	0 %	40 %	60 %	295701129
18	NC_014120	TCACG	2	10	16469	16478	20 %	20 %	20 %	40 %	295701129
19	NC_014120	TCGTC	2	10	18173	18182	0 %	40 %	20 %	40 %	295701129
20	NC_014120	AGGAA	2	10	18339	18348	60 %	0 %	40 %	0 %	295701130
21	NC_014120	CCCTT	2	10	20079	20088	0 %	40 %	0 %	60 %	295701131
22	NC_014120	CCAGT	2	10	20278	20287	20 %	20 %	20 %	40 %	295701131
23	NC_014120	CGATG	2	10	21848	21857	20 %	20 %	40 %	20 %	295701132
24	NC_014120	GCCGT	2	10	23170	23179	0 %	20 %	40 %	40 %	295701135
25	NC_014120	GCGAA	2	10	24517	24526	40 %	0 %	40 %	20 %	295701136
26	NC_014120	GCCCT	2	10	24644	24653	0 %	20 %	20 %	60 %	295701136
27	NC_014120	CGGCA	2	10	26595	26604	20 %	0 %	40 %	40 %	295701138
28	NC_014120	GGCTT	2	10	28818	28827	0 %	40 %	40 %	20 %	295701140
29	NC_014120	TGAGC	2	10	29665	29674	20 %	20 %	40 %	20 %	295701141
30	NC_014120	GCATT	2	10	38329	38338	20 %	40 %	20 %	20 %	295701144
31	NC_014120	GCGCC	2	10	39139	39148	0 %	0 %	40 %	60 %	295701145
32	NC_014120	GCGCA	2	10	39595	39604	20 %	0 %	40 %	40 %	295701146
33	NC_014120	CCGAT	2	10	41755	41764	20 %	20 %	20 %	40 %	295701148
34	NC_014120	GTCGC	2	10	45977	45986	0 %	20 %	40 %	40 %	295701151
35	NC_014120	GCCTG	2	10	46845	46854	0 %	20 %	40 %	40 %	295701152
36	NC_014120	AGGTC	2	10	50782	50791	20 %	20 %	40 %	20 %	295701156
37	NC_014120	CTGAA	2	10	56209	56218	40 %	20 %	20 %	20 %	295701159
38	NC_014120	GTGGA	2	10	59092	59101	20 %	20 %	60 %	0 %	295701159
39	NC_014120	GATGG	2	10	60321	60330	20 %	20 %	60 %	0 %	295701159
40	NC_014120	AATGG	2	10	61910	61919	40 %	20 %	40 %	0 %	295701160
41	NC_014120	AGGTA	2	10	62383	62392	40 %	20 %	40 %	0 %	295701161
42	NC_014120	TGCCG	2	10	65073	65082	0 %	20 %	40 %	40 %	295701162
43	NC_014120	GAGTG	2	10	65141	65150	20 %	20 %	60 %	0 %	295701162
44	NC_014120	CGAAT	2	10	65374	65383	40 %	20 %	20 %	20 %	295701162
45	NC_014120	ACGCC	2	10	72031	72040	20 %	0 %	20 %	60 %	295701165
46	NC_014120	GATGC	2	10	73745	73754	20 %	20 %	40 %	20 %	295701169
47	NC_014120	CCGGT	2	10	73835	73844	0 %	20 %	40 %	40 %	295701169
48	NC_014120	CAAGC	2	10	75798	75807	40 %	0 %	20 %	40 %	295701171
49	NC_014120	CGCTG	2	10	76214	76223	0 %	20 %	40 %	40 %	295701171
50	NC_014120	CGCCT	2	10	83380	83389	0 %	20 %	20 %	60 %	295701177
51	NC_014120	TGCCG	2	10	84543	84552	0 %	20 %	40 %	40 %	295701178
52	NC_014120	TGCCG	2	10	90017	90026	0 %	20 %	40 %	40 %	295701181
53	NC_014120	GAGTG	2	10	90085	90094	20 %	20 %	60 %	0 %	295701181
54	NC_014120	CGAAT	2	10	90318	90327	40 %	20 %	20 %	20 %	295701181
55	NC_014120	TGAAC	2	10	96477	96486	40 %	20 %	20 %	20 %	295701184
56	NC_014120	CAACA	2	10	104640	104649	60 %	0 %	0 %	40 %	295701187
57	NC_014120	GCGAG	2	10	106777	106786	20 %	0 %	60 %	20 %	295701188
58	NC_014120	GCACG	2	10	106909	106918	20 %	0 %	40 %	40 %	295701188
59	NC_014120	CTGTC	2	10	107250	107259	0 %	40 %	20 %	40 %	295701189
60	NC_014120	CACGC	2	10	107459	107468	20 %	0 %	20 %	60 %	295701189
61	NC_014120	CGTGC	2	10	108233	108242	0 %	20 %	40 %	40 %	295701189
62	NC_014120	GGCTG	2	10	108311	108320	0 %	20 %	60 %	20 %	295701189
63	NC_014120	CTGCC	2	10	110346	110355	0 %	20 %	20 %	60 %	295701191
64	NC_014120	TGCAC	2	10	111656	111665	20 %	20 %	20 %	40 %	295701192
65	NC_014120	CGCCC	2	10	112029	112038	0 %	0 %	20 %	80 %	295701192
66	NC_014120	AACGA	2	10	113488	113497	60 %	0 %	20 %	20 %	295701194
67	NC_014120	TGAGT	2	10	114406	114415	20 %	40 %	40 %	0 %	295701195
68	NC_014120	TCGCT	2	10	116343	116352	0 %	40 %	20 %	40 %	295701197
69	NC_014120	CCGAG	2	10	119901	119910	20 %	0 %	40 %	40 %	295701200
70	NC_014120	AAGGA	2	10	127272	127281	60 %	0 %	40 %	0 %	295701204
71	NC_014120	CGAAC	2	10	128495	128504	40 %	0 %	20 %	40 %	295701205
72	NC_014120	GCAGC	2	10	128567	128576	20 %	0 %	40 %	40 %	295701205
73	NC_014120	AGGCG	2	10	132665	132674	20 %	0 %	60 %	20 %	295701210
74	NC_014120	CGGCG	2	10	134478	134487	0 %	0 %	60 %	40 %	295701211
75	NC_014120	ATGCG	2	10	143980	143989	20 %	20 %	40 %	20 %	295701216
76	NC_014120	TGCCA	2	10	147814	147823	20 %	20 %	20 %	40 %	295701219
77	NC_014120	AGTTG	2	10	147982	147991	20 %	40 %	40 %	0 %	295701219
78	NC_014120	CGAAG	2	10	149869	149878	40 %	0 %	40 %	20 %	295701221
79	NC_014120	GTGTC	2	10	151949	151958	0 %	40 %	40 %	20 %	295701223
80	NC_014120	GCGTC	2	10	155722	155731	0 %	20 %	40 %	40 %	295701228
81	NC_014120	ATCAG	2	10	155767	155776	40 %	20 %	20 %	20 %	295701229
82	NC_014120	TGCGC	2	10	156210	156219	0 %	20 %	40 %	40 %	295701230
83	NC_014120	GCGAA	2	10	157492	157501	40 %	0 %	40 %	20 %	295701231
84	NC_014120	GTTGA	2	10	159323	159332	20 %	40 %	40 %	0 %	295701233
85	NC_014120	CAGAT	2	10	165514	165523	40 %	20 %	20 %	20 %	295701239
86	NC_014120	CTGCA	2	10	166935	166944	20 %	20 %	20 %	40 %	295701240
87	NC_014120	GGTGT	2	10	169363	169372	0 %	40 %	60 %	0 %	295701242
88	NC_014120	ATGGG	2	10	169689	169698	20 %	20 %	60 %	0 %	295701242
89	NC_014120	CGCAG	2	10	170479	170488	20 %	0 %	40 %	40 %	295701243
90	NC_014120	GCCGC	2	10	171971	171980	0 %	0 %	40 %	60 %	295701245
91	NC_014120	TCATG	2	10	178648	178657	20 %	40 %	20 %	20 %	295701251
92	NC_014120	AGGAA	2	10	181640	181649	60 %	0 %	40 %	0 %	295701254
93	NC_014120	GATCG	2	10	186205	186214	20 %	20 %	40 %	20 %	295701257
94	NC_014120	TTCGG	2	10	188367	188376	0 %	40 %	40 %	20 %	295701258
95	NC_014120	ATTCG	2	10	194054	194063	20 %	40 %	20 %	20 %	295701262
96	NC_014120	CGCGC	2	10	194337	194346	0 %	0 %	40 %	60 %	295701262
97	NC_014120	CGCAC	2	10	199218	199227	20 %	0 %	20 %	60 %	295701264
98	NC_014120	CGACT	2	10	199341	199350	20 %	20 %	20 %	40 %	295701264
99	NC_014120	GCATC	2	10	202645	202654	20 %	20 %	20 %	40 %	295701266
100	NC_014120	AGCGA	2	10	209843	209852	40 %	0 %	40 %	20 %	295701272
101	NC_014120	AGCGC	2	10	218120	218129	20 %	0 %	40 %	40 %	295701278
102	NC_014120	GCATC	2	10	219699	219708	20 %	20 %	20 %	40 %	295701279
103	NC_014120	CGTGC	2	10	220362	220371	0 %	20 %	40 %	40 %	295701279
104	NC_014120	GCGAC	2	10	224289	224298	20 %	0 %	40 %	40 %	295701280
105	NC_014120	AAGGG	2	10	227238	227247	40 %	0 %	60 %	0 %	295701282
106	NC_014120	TTGGG	2	10	228269	228278	0 %	40 %	60 %	0 %	295701283
107	NC_014120	ACTGC	2	10	230835	230844	20 %	20 %	20 %	40 %	295701284
108	NC_014120	CGGCG	2	10	231079	231088	0 %	0 %	60 %	40 %	295701284
109	NC_014120	ATGCG	2	10	235927	235936	20 %	20 %	40 %	20 %	295701289
110	NC_014120	TCGCC	2	10	236121	236130	0 %	20 %	20 %	60 %	295701289
111	NC_014120	AGCGG	2	10	236357	236366	20 %	0 %	60 %	20 %	295701289
112	NC_014120	AACCC	2	10	237001	237010	40 %	0 %	0 %	60 %	295701290
113	NC_014120	GCATA	2	10	241471	241480	40 %	20 %	20 %	20 %	295701293
114	NC_014120	GCGCG	2	10	241800	241809	0 %	0 %	60 %	40 %	295701294
115	NC_014120	TCGAC	2	10	242672	242681	20 %	20 %	20 %	40 %	295701294
116	NC_014120	CGTCA	2	10	243705	243714	20 %	20 %	20 %	40 %	295701295
117	NC_014120	CGGCG	2	10	244809	244818	0 %	0 %	60 %	40 %	295701296
118	NC_014120	TGACC	2	10	245801	245810	20 %	20 %	20 %	40 %	295701296
119	NC_014120	TCGAA	2	10	248611	248620	40 %	20 %	20 %	20 %	295701299
120	NC_014120	CTGAT	2	10	249125	249134	20 %	40 %	20 %	20 %	295701300
121	NC_014120	CTGAT	2	10	249805	249814	20 %	40 %	20 %	20 %	295701301
122	NC_014120	CTTCT	2	10	253327	253336	0 %	60 %	0 %	40 %	295701302
123	NC_014120	ACCCT	2	10	256382	256391	20 %	20 %	0 %	60 %	295701304
124	NC_014120	CAACG	2	10	257712	257721	40 %	0 %	20 %	40 %	295701304
125	NC_014120	GGCGC	2	10	258026	258035	0 %	0 %	60 %	40 %	295701304
126	NC_014120	GAGCG	2	10	259863	259872	20 %	0 %	60 %	20 %	295701304
127	NC_014120	CGCCT	2	10	273423	273432	0 %	20 %	20 %	60 %	295701311
128	NC_014120	AAATG	2	10	276076	276085	60 %	20 %	20 %	0 %	295701312
129	NC_014120	GCCGA	2	10	283931	283940	20 %	0 %	40 %	40 %	295701317
130	NC_014120	CAGCG	2	10	288503	288512	20 %	0 %	40 %	40 %	295701320
131	NC_014120	GCGAT	2	10	295226	295235	20 %	20 %	40 %	20 %	295701322
132	NC_014120	CGGAG	2	10	295653	295662	20 %	0 %	60 %	20 %	295701322
133	NC_014120	GACCA	2	10	300455	300464	40 %	0 %	20 %	40 %	295701324
134	NC_014120	CGCGG	2	10	303788	303797	0 %	0 %	60 %	40 %	295701327
135	NC_014120	GACTC	2	10	305014	305023	20 %	20 %	20 %	40 %	295701328
136	NC_014120	GCGGT	2	10	306378	306387	0 %	20 %	60 %	20 %	295701329
137	NC_014120	TGCGC	2	10	306733	306742	0 %	20 %	40 %	40 %	295701329
138	NC_014120	TTCGC	2	10	307840	307849	0 %	40 %	20 %	40 %	295701329
139	NC_014120	GCGTC	2	10	308005	308014	0 %	20 %	40 %	40 %	295701329
140	NC_014120	AGGCC	2	10	309588	309597	20 %	0 %	40 %	40 %	295701331
141	NC_014120	TAACG	2	10	309616	309625	40 %	20 %	20 %	20 %	295701331
142	NC_014120	GCCTG	2	10	319616	319625	0 %	20 %	40 %	40 %	295701337
143	NC_014120	GACAT	2	10	322765	322774	40 %	20 %	20 %	20 %	295701338
144	NC_014120	GCCTG	2	10	324409	324418	0 %	20 %	40 %	40 %	295701340
145	NC_014120	CTGGG	2	10	326861	326870	0 %	20 %	60 %	20 %	295701342
146	NC_014120	CGACG	2	10	329088	329097	20 %	0 %	40 %	40 %	295701344
147	NC_014120	ATGTC	2	10	336183	336192	20 %	40 %	20 %	20 %	295701351
148	NC_014120	CCTGC	2	10	336498	336507	0 %	20 %	20 %	60 %	295701352
149	NC_014120	AGACG	2	10	337179	337188	40 %	0 %	40 %	20 %	295701352
150	NC_014120	GACAA	2	10	338676	338685	60 %	0 %	20 %	20 %	295701354
151	NC_014120	TCGAC	2	10	339281	339290	20 %	20 %	20 %	40 %	295701354
152	NC_014120	TCTGG	2	10	342346	342355	0 %	40 %	40 %	20 %	295701357
153	NC_014120	GCTCG	2	10	351324	351333	0 %	20 %	40 %	40 %	295701363
154	NC_014120	AACGC	2	10	351498	351507	40 %	0 %	20 %	40 %	295701363
155	NC_014120	CGCAG	2	10	354221	354230	20 %	0 %	40 %	40 %	295701366
156	NC_014120	CATCG	2	10	360489	360498	20 %	20 %	20 %	40 %	295701372
157	NC_014120	CAATC	2	10	360830	360839	40 %	20 %	0 %	40 %	295701372
158	NC_014120	TCGAG	2	10	366779	366788	20 %	20 %	40 %	20 %	295701376
159	NC_014120	CGCGC	2	10	367554	367563	0 %	0 %	40 %	60 %	295701377
160	NC_014120	CCCGC	2	10	367591	367600	0 %	0 %	20 %	80 %	295701377
161	NC_014120	CATGG	2	10	370075	370084	20 %	20 %	40 %	20 %	295701379
162	NC_014120	GAACT	2	10	372422	372431	40 %	20 %	20 %	20 %	295701383
163	NC_014120	CGGCG	2	10	376320	376329	0 %	0 %	60 %	40 %	295701386
164	NC_014120	GACTC	2	10	383949	383958	20 %	20 %	20 %	40 %	295701392
165	NC_014120	GGCCG	2	10	384766	384775	0 %	0 %	60 %	40 %	295701392
166	NC_014120	CCAAT	2	10	393646	393655	40 %	20 %	0 %	40 %	295701404
167	NC_014120	AGGCT	2	10	394190	394199	20 %	20 %	40 %	20 %	295701405
168	NC_014120	CCACG	2	10	394317	394326	20 %	0 %	20 %	60 %	295701405
169	NC_014120	CTTTG	2	10	396442	396451	0 %	60 %	20 %	20 %	295701409
170	NC_014120	ACGCA	2	10	396638	396647	40 %	0 %	20 %	40 %	295701410
171	NC_014120	ATGCG	2	10	402475	402484	20 %	20 %	40 %	20 %	295701420
172	NC_014120	CGTCA	2	10	403200	403209	20 %	20 %	20 %	40 %	295701421
173	NC_014120	TCGGT	2	10	405588	405597	0 %	40 %	40 %	20 %	295701423
174	NC_014120	GCGCC	2	10	405984	405993	0 %	0 %	40 %	60 %	295701423
175	NC_014120	GCGAA	2	10	406984	406993	40 %	0 %	40 %	20 %	295701424
176	NC_014120	GCGCG	2	10	408125	408134	0 %	0 %	60 %	40 %	295701425
177	NC_014120	GCAAC	2	10	410022	410031	40 %	0 %	20 %	40 %	295701426
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179	NC_014120	TCTCC	2	10	412690	412699	0 %	40 %	0 %	60 %	295701430
180	NC_014120	CAGCG	2	10	414118	414127	20 %	0 %	40 %	40 %	295701431
181	NC_014120	ATCGT	2	10	414131	414140	20 %	40 %	20 %	20 %	295701431
182	NC_014120	CGTCG	2	10	414653	414662	0 %	20 %	40 %	40 %	295701432
183	NC_014120	CGGTA	2	10	415586	415595	20 %	20 %	40 %	20 %	295701434
184	NC_014120	AGTTC	2	10	415989	415998	20 %	40 %	20 %	20 %	295701434
185	NC_014120	CGATG	2	10	420521	420530	20 %	20 %	40 %	20 %	295701439
186	NC_014120	CGGCG	2	10	421515	421524	0 %	0 %	60 %	40 %	295701441
187	NC_014120	CTTCC	2	10	423135	423144	0 %	40 %	0 %	60 %	295701441
188	NC_014120	CACCC	2	10	423690	423699	20 %	0 %	0 %	80 %	295701441
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192	NC_014120	CCAGA	2	10	429778	429787	40 %	0 %	20 %	40 %	295701446
193	NC_014120	TGCAG	2	10	431127	431136	20 %	20 %	40 %	20 %	295701448
194	NC_014120	AATGG	2	10	431518	431527	40 %	20 %	40 %	0 %	295701449
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196	NC_014120	TGGCC	2	10	432944	432953	0 %	20 %	40 %	40 %	295701450
197	NC_014120	CGACG	2	10	435010	435019	20 %	0 %	40 %	40 %	295701451
198	NC_014120	GCCAG	2	10	435102	435111	20 %	0 %	40 %	40 %	295701451
199	NC_014120	ACCGT	2	10	437072	437081	20 %	20 %	20 %	40 %	295701453
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201	NC_014120	GCCGG	2	10	439102	439111	0 %	0 %	60 %	40 %	295701454
202	NC_014120	GCCCT	2	10	440980	440989	0 %	20 %	20 %	60 %	295701457
203	NC_014120	AGCGC	2	10	441033	441042	20 %	0 %	40 %	40 %	295701457
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205	NC_014120	GACCG	2	10	441209	441218	20 %	0 %	40 %	40 %	295701457
206	NC_014120	CGCAG	2	10	441386	441395	20 %	0 %	40 %	40 %	295701457
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213	NC_014120	CACTG	2	10	450191	450200	20 %	20 %	20 %	40 %	295701468
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221	NC_014120	GCGCG	2	10	473965	473974	0 %	0 %	60 %	40 %	295701498
222	NC_014120	CAGTC	2	10	476150	476159	20 %	20 %	20 %	40 %	295701500
223	NC_014120	CAGCG	2	10	476264	476273	20 %	0 %	40 %	40 %	295701500
224	NC_014120	GCACG	2	10	476664	476673	20 %	0 %	40 %	40 %	295701500
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228	NC_014120	CGCGG	2	10	481423	481432	0 %	0 %	60 %	40 %	295701504
229	NC_014120	CGTGA	2	10	481754	481763	20 %	20 %	40 %	20 %	295701504
230	NC_014120	CCCGG	2	10	481929	481938	0 %	0 %	40 %	60 %	295701505
231	NC_014120	GCGTG	2	10	482659	482668	0 %	20 %	60 %	20 %	295701505
232	NC_014120	CGCGC	2	10	482683	482692	0 %	0 %	40 %	60 %	295701505
233	NC_014120	GCGAC	2	10	482835	482844	20 %	0 %	40 %	40 %	295701505
234	NC_014120	GTCGG	2	10	484396	484405	0 %	20 %	60 %	20 %	295701508
235	NC_014120	ATCGC	2	10	486274	486283	20 %	20 %	20 %	40 %	295701510

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.