MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM700

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014023	AAAAG	2	10	6146	6155	80 %	0 %	20 %	0 %	294508922
2	NC_014023	GGAAG	2	10	6593	6602	40 %	0 %	60 %	0 %	294508923
3	NC_014023	GAAAA	2	10	6651	6660	80 %	0 %	20 %	0 %	294508923
4	NC_014023	TTCTG	2	10	6693	6702	0 %	60 %	20 %	20 %	294508923
5	NC_014023	TATAC	2	10	6821	6830	40 %	40 %	0 %	20 %	294508923
6	NC_014023	CTCAT	2	10	7517	7526	20 %	40 %	0 %	40 %	294508924
7	NC_014023	TCTTT	2	10	9266	9275	0 %	80 %	0 %	20 %	294508926
8	NC_014023	GGTTA	2	10	9605	9614	20 %	40 %	40 %	0 %	294508926
9	NC_014023	TTGTA	2	10	10012	10021	20 %	60 %	20 %	0 %	294508927
10	NC_014023	GGGTA	2	10	10327	10336	20 %	20 %	60 %	0 %	294508928
11	NC_014023	ATTTT	2	10	10794	10803	20 %	80 %	0 %	0 %	294508930
12	NC_014023	AGAGA	2	10	12019	12028	60 %	0 %	40 %	0 %	294508932
13	NC_014023	GCAGC	2	10	13120	13129	20 %	0 %	40 %	40 %	294508934
14	NC_014023	TACTT	2	10	13429	13438	20 %	60 %	0 %	20 %	294508934
15	NC_014023	CTCTT	2	10	14284	14293	0 %	60 %	0 %	40 %	294508935
16	NC_014023	AGAAA	2	10	18091	18100	80 %	0 %	20 %	0 %	294508938
17	NC_014023	ATTTT	2	10	18323	18332	20 %	80 %	0 %	0 %	294508938
18	NC_014023	CTAAA	2	10	19280	19289	60 %	20 %	0 %	20 %	294508940
19	NC_014023	GAAGT	2	10	24577	24586	40 %	20 %	40 %	0 %	294508945
20	NC_014023	TATGA	2	10	25960	25969	40 %	40 %	20 %	0 %	294508947
21	NC_014023	ATTCA	2	10	26063	26072	40 %	40 %	0 %	20 %	294508947
22	NC_014023	GATTC	2	10	26163	26172	20 %	40 %	20 %	20 %	294508947
23	NC_014023	AAGAA	2	10	26421	26430	80 %	0 %	20 %	0 %	294508948
24	NC_014023	ATTTA	2	10	26675	26684	40 %	60 %	0 %	0 %	294508948
25	NC_014023	TATTT	2	10	30687	30696	20 %	80 %	0 %	0 %	294508953
26	NC_014023	CATAT	2	10	32334	32343	40 %	40 %	0 %	20 %	294508954
27	NC_014023	TCCAA	2	10	33808	33817	40 %	20 %	0 %	40 %	294508955
28	NC_014023	AGAAA	2	10	34099	34108	80 %	0 %	20 %	0 %	294508955
29	NC_014023	TCGCT	2	10	36155	36164	0 %	40 %	20 %	40 %	294508957
30	NC_014023	AAATA	2	10	41220	41229	80 %	20 %	0 %	0 %	294508962
31	NC_014023	CTTAC	2	10	43493	43502	20 %	40 %	0 %	40 %	294508966
32	NC_014023	TTTCT	2	10	44277	44286	0 %	80 %	0 %	20 %	294508967
33	NC_014023	CAATA	2	10	46311	46320	60 %	20 %	0 %	20 %	294508968
34	NC_014023	TGCCA	2	10	48695	48704	20 %	20 %	20 %	40 %	294508970
35	NC_014023	AAAAT	2	10	48856	48865	80 %	20 %	0 %	0 %	294508970
36	NC_014023	TTTTA	2	10	53882	53891	20 %	80 %	0 %	0 %	294508975
37	NC_014023	AATAA	2	10	56103	56112	80 %	20 %	0 %	0 %	294508977
38	NC_014023	ATGGA	2	10	57299	57308	40 %	20 %	40 %	0 %	294508978
39	NC_014023	TAAAA	2	10	57531	57540	80 %	20 %	0 %	0 %	294508978
40	NC_014023	GGGAT	2	10	59092	59101	20 %	20 %	60 %	0 %	294508980
41	NC_014023	GAAAA	2	10	60843	60852	80 %	0 %	20 %	0 %	294508984
42	NC_014023	GTAAC	2	10	62365	62374	40 %	20 %	20 %	20 %	294508986
43	NC_014023	GGAAT	2	10	64746	64755	40 %	20 %	40 %	0 %	294508987
44	NC_014023	CTTTA	2	10	65149	65158	20 %	60 %	0 %	20 %	294508988
45	NC_014023	GCTTG	2	10	66306	66315	0 %	40 %	40 %	20 %	294508989
46	NC_014023	TTTAT	2	10	66463	66472	20 %	80 %	0 %	0 %	294508989
47	NC_014023	ATTAA	2	10	68829	68838	60 %	40 %	0 %	0 %	294508992
48	NC_014023	TCAAT	2	10	69971	69980	40 %	40 %	0 %	20 %	294508993
49	NC_014023	ACATA	2	10	72268	72277	60 %	20 %	0 %	20 %	294508995
50	NC_014023	GTAAC	2	10	74957	74966	40 %	20 %	20 %	20 %	294508998
51	NC_014023	ACTTT	2	10	76276	76285	20 %	60 %	0 %	20 %	294509000
52	NC_014023	AATAG	2	10	77762	77771	60 %	20 %	20 %	0 %	294509000
53	NC_014023	AGATT	2	10	79894	79903	40 %	40 %	20 %	0 %	294509003
54	NC_014023	GATTT	2	10	80907	80916	20 %	60 %	20 %	0 %	294509004
55	NC_014023	ACTTC	2	10	81789	81798	20 %	40 %	0 %	40 %	294509006
56	NC_014023	CCATT	2	10	83143	83152	20 %	40 %	0 %	40 %	294509006
57	NC_014023	ATAAA	2	10	83401	83410	80 %	20 %	0 %	0 %	294509007
58	NC_014023	TTCAT	2	10	83414	83423	20 %	60 %	0 %	20 %	294509007
59	NC_014023	TATTG	2	10	84022	84031	20 %	60 %	20 %	0 %	294509008
60	NC_014023	GCTTT	2	10	86910	86919	0 %	60 %	20 %	20 %	294509011
61	NC_014023	GGTTA	2	10	86959	86968	20 %	40 %	40 %	0 %	294509011
62	NC_014023	AAAGA	2	10	87001	87010	80 %	0 %	20 %	0 %	294509011
63	NC_014023	TATAC	2	10	90168	90177	40 %	40 %	0 %	20 %	294509016
64	NC_014023	ATATC	2	10	93042	93051	40 %	40 %	0 %	20 %	294509020
65	NC_014023	AATTG	2	10	93815	93824	40 %	40 %	20 %	0 %	294509021
66	NC_014023	AATAC	2	10	95339	95348	60 %	20 %	0 %	20 %	294509023
67	NC_014023	CTAAT	2	10	97507	97516	40 %	40 %	0 %	20 %	294509026
68	NC_014023	GCTAT	2	10	99026	99035	20 %	40 %	20 %	20 %	294509028
69	NC_014023	AAAGA	2	10	99271	99280	80 %	0 %	20 %	0 %	294509028
70	NC_014023	AATAA	2	10	99924	99933	80 %	20 %	0 %	0 %	294509029
71	NC_014023	AAAGA	2	10	100220	100229	80 %	0 %	20 %	0 %	294509029
72	NC_014023	TCATT	2	10	101422	101431	20 %	60 %	0 %	20 %	294509030
73	NC_014023	TAGGA	2	10	101434	101443	40 %	20 %	40 %	0 %	294509030
74	NC_014023	CAAAA	2	10	101618	101627	80 %	0 %	0 %	20 %	294509031
75	NC_014023	TTAAA	2	10	103638	103647	60 %	40 %	0 %	0 %	294509034
76	NC_014023	TGTCA	2	10	105175	105184	20 %	40 %	20 %	20 %	294509035
77	NC_014023	GAAGC	2	10	106845	106854	40 %	0 %	40 %	20 %	294509037
78	NC_014023	GATGT	2	10	107968	107977	20 %	40 %	40 %	0 %	294509038
79	NC_014023	ATCAT	2	10	110527	110536	40 %	40 %	0 %	20 %	294509039
80	NC_014023	GAAAA	2	10	111967	111976	80 %	0 %	20 %	0 %	294509040
81	NC_014023	TAAGC	2	10	113425	113434	40 %	20 %	20 %	20 %	294509044
82	NC_014023	CATGT	2	10	114846	114855	20 %	40 %	20 %	20 %	294509046
83	NC_014023	CTTTA	2	10	124978	124987	20 %	60 %	0 %	20 %	294509055
84	NC_014023	TATAA	2	10	126350	126359	60 %	40 %	0 %	0 %	294509056
85	NC_014023	AAATA	2	10	126705	126714	80 %	20 %	0 %	0 %	294509056
86	NC_014023	CTGTT	2	10	127020	127029	0 %	60 %	20 %	20 %	294509056
87	NC_014023	AAGAT	2	10	127194	127203	60 %	20 %	20 %	0 %	294509057
88	NC_014023	TTCAT	2	10	127244	127253	20 %	60 %	0 %	20 %	294509057
89	NC_014023	AAATA	2	10	128726	128735	80 %	20 %	0 %	0 %	294509059
90	NC_014023	CTGTG	2	10	128897	128906	0 %	40 %	40 %	20 %	294509059
91	NC_014023	TTTTC	2	10	129721	129730	0 %	80 %	0 %	20 %	294509060
92	NC_014023	CTTGC	2	10	133815	133824	0 %	40 %	20 %	40 %	294509063
93	NC_014023	AAATC	2	10	136519	136528	60 %	20 %	0 %	20 %	294509064
94	NC_014023	TATAA	2	10	137473	137482	60 %	40 %	0 %	0 %	294509064
95	NC_014023	CTAGA	2	10	144271	144280	40 %	20 %	20 %	20 %	294509072
96	NC_014023	CCACT	2	10	144713	144722	20 %	20 %	0 %	60 %	294509073
97	NC_014023	AAAAT	2	10	144859	144868	80 %	20 %	0 %	0 %	294509073
98	NC_014023	AAAAT	2	10	145202	145211	80 %	20 %	0 %	0 %	294509074
99	NC_014023	TCATT	2	10	146622	146631	20 %	60 %	0 %	20 %	294509074
100	NC_014023	TAATT	2	10	147678	147687	40 %	60 %	0 %	0 %	294509076
101	NC_014023	TAAAA	2	10	147980	147989	80 %	20 %	0 %	0 %	294509076
102	NC_014023	AATAA	2	10	148499	148508	80 %	20 %	0 %	0 %	294509076
103	NC_014023	TGTTA	2	10	148670	148679	20 %	60 %	20 %	0 %	294509076
104	NC_014023	TTTAT	2	10	150000	150009	20 %	80 %	0 %	0 %	294509077
105	NC_014023	ATATT	2	10	154659	154668	40 %	60 %	0 %	0 %	294509082
106	NC_014023	ATTAT	2	10	156847	156856	40 %	60 %	0 %	0 %	294509084
107	NC_014023	ATTTA	2	10	158284	158293	40 %	60 %	0 %	0 %	294509086
108	NC_014023	AGAAA	2	10	159412	159421	80 %	0 %	20 %	0 %	294509086
109	NC_014023	TTGTA	2	10	162842	162851	20 %	60 %	20 %	0 %	294509090

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.