MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 5492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013714	CCGC	2	8	89	96	0 %	0 %	25 %	75 %	283454960
2	NC_013714	GCTG	2	8	104	111	0 %	25 %	50 %	25 %	283454960
3	NC_013714	AACC	2	8	202	209	50 %	0 %	0 %	50 %	283454960
4	NC_013714	ACCA	2	8	721	728	50 %	0 %	0 %	50 %	283454960
5	NC_013714	CAAC	2	8	1137	1144	50 %	0 %	0 %	50 %	283454960
6	NC_013714	CATG	2	8	1395	1402	25 %	25 %	25 %	25 %	283454960
7	NC_013714	GGCA	2	8	2067	2074	25 %	0 %	50 %	25 %	283454961
8	NC_013714	CCTA	2	8	2234	2241	25 %	25 %	0 %	50 %	283454961
9	NC_013714	ACCG	2	8	2482	2489	25 %	0 %	25 %	50 %	283454961
10	NC_013714	CCAT	2	8	3181	3188	25 %	25 %	0 %	50 %	283454962
11	NC_013714	CGGG	2	8	4523	4530	0 %	0 %	75 %	25 %	283454963
12	NC_013714	AGGA	2	8	5080	5087	50 %	0 %	50 %	0 %	283454964
13	NC_013714	TCCG	2	8	5260	5267	0 %	25 %	25 %	50 %	283454964
14	NC_013714	GGCG	2	8	5840	5847	0 %	0 %	75 %	25 %	283454964
15	NC_013714	CGGC	2	8	6466	6473	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
16	NC_013714	GCCG	2	8	6951	6958	0 %	0 %	50 %	50 %	283454964
17	NC_013714	AGCC	2	8	7917	7924	25 %	0 %	25 %	50 %	283454965
18	NC_013714	TGCG	2	8	8048	8055	0 %	25 %	50 %	25 %	283454965
19	NC_013714	ATCC	2	8	8142	8149	25 %	25 %	0 %	50 %	283454965
20	NC_013714	AGCC	2	8	9791	9798	25 %	0 %	25 %	50 %	283454965
21	NC_013714	AGCC	2	8	10050	10057	25 %	0 %	25 %	50 %	283454966
22	NC_013714	GTGC	2	8	10077	10084	0 %	25 %	50 %	25 %	283454966
23	NC_013714	GCCG	2	8	10859	10866	0 %	0 %	50 %	50 %	283454967
24	NC_013714	GTGC	2	8	11538	11545	0 %	25 %	50 %	25 %	283454967
25	NC_013714	GCCT	2	8	12014	12021	0 %	25 %	25 %	50 %	283454967
26	NC_013714	CGGC	2	8	12473	12480	0 %	0 %	50 %	50 %	283454968
27	NC_013714	GAGC	2	8	12757	12764	25 %	0 %	50 %	25 %	283454968
28	NC_013714	CGGT	2	8	12815	12822	0 %	25 %	50 %	25 %	283454968
29	NC_013714	TGGT	2	8	12835	12842	0 %	50 %	50 %	0 %	283454968
30	NC_013714	TCAT	2	8	13666	13673	25 %	50 %	0 %	25 %	283454969
31	NC_013714	TCAA	2	8	15773	15780	50 %	25 %	0 %	25 %	283454970
32	NC_013714	ATTT	2	8	16156	16163	25 %	75 %	0 %	0 %	283454971
33	NC_013714	TGAT	2	8	16382	16389	25 %	50 %	25 %	0 %	283454971
34	NC_013714	GCTG	2	8	16401	16408	0 %	25 %	50 %	25 %	283454971
35	NC_013714	ATCG	2	8	16901	16908	25 %	25 %	25 %	25 %	283454972
36	NC_013714	GTGC	2	8	17321	17328	0 %	25 %	50 %	25 %	283454972
37	NC_013714	AGGA	2	8	17486	17493	50 %	0 %	50 %	0 %	283454972
38	NC_013714	GGGA	2	8	17630	17637	25 %	0 %	75 %	0 %	283454973
39	NC_013714	GTCC	2	8	17720	17727	0 %	25 %	25 %	50 %	283454973
40	NC_013714	TCCA	2	8	17920	17927	25 %	25 %	0 %	50 %	283454973
41	NC_013714	GGCA	2	8	19429	19436	25 %	0 %	50 %	25 %	283454975
42	NC_013714	CGAA	2	8	19657	19664	50 %	0 %	25 %	25 %	283454975
43	NC_013714	GATC	2	8	20551	20558	25 %	25 %	25 %	25 %	283454976
44	NC_013714	AATG	2	8	20702	20709	50 %	25 %	25 %	0 %	283454976
45	NC_013714	GATG	2	8	21216	21223	25 %	25 %	50 %	0 %	283454977
46	NC_013714	ATGG	2	8	21703	21710	25 %	25 %	50 %	0 %	283454977
47	NC_013714	GTCG	2	8	22231	22238	0 %	25 %	50 %	25 %	283454978
48	NC_013714	GTGC	2	8	22290	22297	0 %	25 %	50 %	25 %	283454978
49	NC_013714	GCCT	2	8	22762	22769	0 %	25 %	25 %	50 %	283454978
50	NC_013714	GTGA	2	8	23559	23566	25 %	25 %	50 %	0 %	283454979
51	NC_013714	CTTG	2	8	23881	23888	0 %	50 %	25 %	25 %	283454980
52	NC_013714	CGAC	2	8	24675	24682	25 %	0 %	25 %	50 %	283454980
53	NC_013714	TCGG	2	8	25986	25993	0 %	25 %	50 %	25 %	283454980
54	NC_013714	CATG	2	8	26230	26237	25 %	25 %	25 %	25 %	283454980
55	NC_013714	GTTG	2	8	26525	26532	0 %	50 %	50 %	0 %	283454980
56	NC_013714	TCGC	2	8	27407	27414	0 %	25 %	25 %	50 %	283454981
57	NC_013714	CAGG	2	8	27584	27591	25 %	0 %	50 %	25 %	283454981
58	NC_013714	GATG	2	8	28050	28057	25 %	25 %	50 %	0 %	283454981
59	NC_013714	CTGC	2	8	28123	28130	0 %	25 %	25 %	50 %	283454981
60	NC_013714	TTGC	2	8	28298	28305	0 %	50 %	25 %	25 %	283454981
61	NC_013714	CTGC	2	8	28510	28517	0 %	25 %	25 %	50 %	283454981
62	NC_013714	GGCT	2	8	28872	28879	0 %	25 %	50 %	25 %	283454982
63	NC_013714	GCTG	2	8	29294	29301	0 %	25 %	50 %	25 %	283454982
64	NC_013714	GGCC	2	8	29978	29985	0 %	0 %	50 %	50 %	283454982
65	NC_013714	TTCG	2	8	30555	30562	0 %	50 %	25 %	25 %	283454983
66	NC_013714	GCGG	2	8	30776	30783	0 %	0 %	75 %	25 %	283454983
67	NC_013714	CGGC	2	8	30947	30954	0 %	0 %	50 %	50 %	283454983
68	NC_013714	CGTT	2	8	30985	30992	0 %	50 %	25 %	25 %	283454983
69	NC_013714	CGGT	2	8	31336	31343	0 %	25 %	50 %	25 %	283454983
70	NC_013714	CGGT	3	12	31448	31459	0 %	25 %	50 %	25 %	283454983
71	NC_013714	GACT	2	8	32099	32106	25 %	25 %	25 %	25 %	283454984
72	NC_013714	CGGC	2	8	32254	32261	0 %	0 %	50 %	50 %	283454985
73	NC_013714	TCCA	2	8	32370	32377	25 %	25 %	0 %	50 %	283454985
74	NC_013714	TCAA	2	8	32939	32946	50 %	25 %	0 %	25 %	283454986
75	NC_013714	GCCG	2	8	33053	33060	0 %	0 %	50 %	50 %	283454986
76	NC_013714	GCAA	2	8	33187	33194	50 %	0 %	25 %	25 %	283454986
77	NC_013714	TCCA	2	8	33822	33829	25 %	25 %	0 %	50 %	283454986
78	NC_013714	ACCC	2	8	33915	33922	25 %	0 %	0 %	75 %	283454986
79	NC_013714	TCGA	2	8	35340	35347	25 %	25 %	25 %	25 %	283454986
80	NC_013714	AGTG	2	8	35386	35393	25 %	25 %	50 %	0 %	283454986
81	NC_013714	TGCC	2	8	36429	36436	0 %	25 %	25 %	50 %	283454987
82	NC_013714	GGCG	2	8	36604	36611	0 %	0 %	75 %	25 %	283454987
83	NC_013714	CTGA	2	8	36997	37004	25 %	25 %	25 %	25 %	283454987
84	NC_013714	ACGT	2	8	38120	38127	25 %	25 %	25 %	25 %	283454988
85	NC_013714	GTGA	2	8	38259	38266	25 %	25 %	50 %	0 %	283454988
86	NC_013714	ACGT	2	8	38353	38360	25 %	25 %	25 %	25 %	283454988
87	NC_013714	GATT	2	8	38396	38403	25 %	50 %	25 %	0 %	283454988
88	NC_013714	CAGT	2	8	40872	40879	25 %	25 %	25 %	25 %	283454991
89	NC_013714	CGCA	2	8	41062	41069	25 %	0 %	25 %	50 %	283454991
90	NC_013714	CCGA	2	8	41116	41123	25 %	0 %	25 %	50 %	283454991
91	NC_013714	CGCA	2	8	41740	41747	25 %	0 %	25 %	50 %	283454992
92	NC_013714	CGAT	2	8	41841	41848	25 %	25 %	25 %	25 %	283454992
93	NC_013714	GCTG	2	8	42591	42598	0 %	25 %	50 %	25 %	283454993
94	NC_013714	GCTG	2	8	44237	44244	0 %	25 %	50 %	25 %	283454993
95	NC_013714	TTCC	2	8	44603	44610	0 %	50 %	0 %	50 %	283454994
96	NC_013714	CGAT	2	8	45975	45982	25 %	25 %	25 %	25 %	283454995
97	NC_013714	CGGG	2	8	46350	46357	0 %	0 %	75 %	25 %	283454995
98	NC_013714	TGGC	2	8	46445	46452	0 %	25 %	50 %	25 %	283454995
99	NC_013714	GCTG	2	8	46713	46720	0 %	25 %	50 %	25 %	283454995
100	NC_013714	ATTC	2	8	46996	47003	25 %	50 %	0 %	25 %	283454995
101	NC_013714	GTGC	2	8	47019	47026	0 %	25 %	50 %	25 %	283454996
102	NC_013714	AACG	2	8	50449	50456	50 %	0 %	25 %	25 %	283454998
103	NC_013714	TTCG	2	8	51092	51099	0 %	50 %	25 %	25 %	283454999
104	NC_013714	ATGA	2	8	51560	51567	50 %	25 %	25 %	0 %	283455000
105	NC_013714	TGGA	2	8	52836	52843	25 %	25 %	50 %	0 %	283455000
106	NC_013714	TGAC	2	8	52890	52897	25 %	25 %	25 %	25 %	283455000
107	NC_013714	GCGG	2	8	53572	53579	0 %	0 %	75 %	25 %	283455000
108	NC_013714	ACTG	2	8	53732	53739	25 %	25 %	25 %	25 %	283455000
109	NC_013714	CTCA	2	8	54900	54907	25 %	25 %	0 %	50 %	283455001
110	NC_013714	CAAA	2	8	55433	55440	75 %	0 %	0 %	25 %	283455001
111	NC_013714	CCGA	2	8	55807	55814	25 %	0 %	25 %	50 %	283455001
112	NC_013714	CAGT	2	8	56454	56461	25 %	25 %	25 %	25 %	283455001
113	NC_013714	CACC	2	8	57100	57107	25 %	0 %	0 %	75 %	283455002
114	NC_013714	CGGA	2	8	57736	57743	25 %	0 %	50 %	25 %	283455002
115	NC_013714	CGGC	2	8	58144	58151	0 %	0 %	50 %	50 %	283455002
116	NC_013714	TGGG	2	8	58350	58357	0 %	25 %	75 %	0 %	283455002
117	NC_013714	ATGC	2	8	58827	58834	25 %	25 %	25 %	25 %	283455002
118	NC_013714	GCCT	2	8	59150	59157	0 %	25 %	25 %	50 %	283455003
119	NC_013714	GGTC	2	8	60082	60089	0 %	25 %	50 %	25 %	283455003
120	NC_013714	CTTG	2	8	60765	60772	0 %	50 %	25 %	25 %	283455004
121	NC_013714	CTTC	2	8	61397	61404	0 %	50 %	0 %	50 %	283455004
122	NC_013714	GAAC	2	8	61645	61652	50 %	0 %	25 %	25 %	283455005
123	NC_013714	GTGG	2	8	61776	61783	0 %	25 %	75 %	0 %	283455005
124	NC_013714	TGCG	2	8	61786	61793	0 %	25 %	50 %	25 %	283455005
125	NC_013714	GTGC	2	8	62019	62026	0 %	25 %	50 %	25 %	283455005
126	NC_013714	TGGC	2	8	62316	62323	0 %	25 %	50 %	25 %	283455005
127	NC_013714	CGCC	2	8	62483	62490	0 %	0 %	25 %	75 %	283455005
128	NC_013714	GGTC	2	8	62496	62503	0 %	25 %	50 %	25 %	283455005
129	NC_013714	CTGC	2	8	63223	63230	0 %	25 %	25 %	50 %	283455006
130	NC_013714	TCGG	2	8	63888	63895	0 %	25 %	50 %	25 %	283455007
131	NC_013714	GTGC	2	8	64946	64953	0 %	25 %	50 %	25 %	283455008
132	NC_013714	ACGC	2	8	65106	65113	25 %	0 %	25 %	50 %	283455008
133	NC_013714	CCGA	2	8	66978	66985	25 %	0 %	25 %	50 %	283455009
134	NC_013714	TCCA	2	8	67213	67220	25 %	25 %	0 %	50 %	283455009
135	NC_013714	GGCG	2	8	67920	67927	0 %	0 %	75 %	25 %	283455009
136	NC_013714	CGTG	2	8	67986	67993	0 %	25 %	50 %	25 %	283455009
137	NC_013714	ATGC	2	8	69005	69012	25 %	25 %	25 %	25 %	283455010
138	NC_013714	CGGC	2	8	69464	69471	0 %	0 %	50 %	50 %	283455010
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