MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013714	CCG	2	6	158866	158871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455075
3002	NC_013714	ATC	2	6	158909	158914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455076
3003	NC_013714	GCC	2	6	158935	158940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455076
3004	NC_013714	CAG	2	6	158959	158964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455076
3005	NC_013714	ATG	2	6	158975	158980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455076
3006	NC_013714	CAG	2	6	158998	159003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455076
3007	NC_013714	CGA	2	6	159042	159047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455076
3008	NC_013714	TGC	2	6	159105	159110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455076
3009	NC_013714	CGAG	2	8	159183	159190	25 %	0 %	50 %	25 %	283455076
3010	NC_013714	CCG	2	6	159200	159205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455076
3011	NC_013714	GGC	2	6	159235	159240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455076
3012	NC_013714	GCG	2	6	159254	159259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455076
3013	NC_013714	CGT	2	6	159293	159298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455076
3014	NC_013714	CCT	2	6	159342	159347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455076
3015	NC_013714	GC	3	6	159355	159360	0 %	0 %	50 %	50 %	283455076
3016	NC_013714	GCG	2	6	159371	159376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455076
3017	NC_013714	CGA	2	6	159414	159419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455076
3018	NC_013714	CGAC	2	8	159426	159433	25 %	0 %	25 %	50 %	283455076
3019	NC_013714	TCA	2	6	159459	159464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455076
3020	NC_013714	GAAA	2	8	159489	159496	75 %	0 %	25 %	0 %	283455076
3021	NC_013714	GC	3	6	159645	159650	0 %	0 %	50 %	50 %	283455077
3022	NC_013714	TGCCGG	2	12	159726	159737	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283455077
3023	NC_013714	CGT	3	9	159750	159758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455077
3024	NC_013714	GCT	2	6	159864	159869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455077
3025	NC_013714	GAT	2	6	159889	159894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455077
3026	NC_013714	TGCT	2	8	159905	159912	0 %	50 %	25 %	25 %	283455077
3027	NC_013714	GTC	2	6	159964	159969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455077
3028	NC_013714	GAT	2	6	159970	159975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455077
3029	NC_013714	TGG	2	6	160029	160034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455077
3030	NC_013714	CGT	2	6	160041	160046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455077
3031	NC_013714	CGA	2	6	160047	160052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455077
3032	NC_013714	GCGT	2	8	160072	160079	0 %	25 %	50 %	25 %	283455077
3033	NC_013714	GAT	3	9	160120	160128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455077
3034	NC_013714	CTT	2	6	160177	160182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455077
3035	NC_013714	GT	3	6	160248	160253	0 %	50 %	50 %	0 %	283455077
3036	NC_013714	CCT	2	6	160260	160265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455077
3037	NC_013714	ATGCC	2	10	160293	160302	20 %	20 %	20 %	40 %	283455077
3038	NC_013714	TGT	2	6	160508	160513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455078
3039	NC_013714	CGT	2	6	160518	160523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3040	NC_013714	GGGGA	2	10	160582	160591	20 %	0 %	80 %	0 %	283455078
3041	NC_013714	CTG	2	6	160695	160700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3042	NC_013714	GCCG	2	8	160722	160729	0 %	0 %	50 %	50 %	283455078
3043	NC_013714	GGC	2	6	160752	160757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455078
3044	NC_013714	AAG	2	6	160893	160898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455078
3045	NC_013714	GGT	2	6	160899	160904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455078
3046	NC_013714	GCC	2	6	160959	160964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3047	NC_013714	CTGG	2	8	160979	160986	0 %	25 %	50 %	25 %	283455078
3048	NC_013714	AGC	2	6	161056	161061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3049	NC_013714	CCG	2	6	161068	161073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3050	NC_013714	GCC	2	6	161104	161109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3051	NC_013714	ACA	2	6	161233	161238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455078
3052	NC_013714	GCC	2	6	161240	161245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3053	NC_013714	GCC	2	6	161301	161306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3054	NC_013714	ACG	2	6	161467	161472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3055	NC_013714	CGC	2	6	161501	161506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3056	NC_013714	CGA	2	6	161534	161539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3057	NC_013714	GAC	2	6	161562	161567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3058	NC_013714	GGT	2	6	161588	161593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455078
3059	NC_013714	CGC	2	6	161735	161740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3060	NC_013714	TCG	2	6	161848	161853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3061	NC_013714	CGA	2	6	161966	161971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3062	NC_013714	AAG	2	6	161976	161981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455078
3063	NC_013714	GCT	2	6	162007	162012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3064	NC_013714	CGG	2	6	162017	162022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455078
3065	NC_013714	GCA	2	6	162047	162052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3066	NC_013714	CG	3	6	162088	162093	0 %	0 %	50 %	50 %	283455078
3067	NC_013714	TCG	2	6	162124	162129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3068	NC_013714	GCC	2	6	162131	162136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3069	NC_013714	GC	3	6	162148	162153	0 %	0 %	50 %	50 %	283455078
3070	NC_013714	GC	3	6	162185	162190	0 %	0 %	50 %	50 %	283455078
3071	NC_013714	GCT	2	6	162229	162234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3072	NC_013714	CGA	2	6	162266	162271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3073	NC_013714	GCGTG	2	10	162317	162326	0 %	20 %	60 %	20 %	283455078
3074	NC_013714	CGTGG	2	10	162381	162390	0 %	20 %	60 %	20 %	283455078
3075	NC_013714	GTGG	2	8	162416	162423	0 %	25 %	75 %	0 %	283455078
3076	NC_013714	ACGT	2	8	162491	162498	25 %	25 %	25 %	25 %	283455078
3077	NC_013714	TGA	2	6	162515	162520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455078
3078	NC_013714	GGC	2	6	162579	162584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455078
3079	NC_013714	GCT	2	6	162602	162607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455078
3080	NC_013714	GCC	2	6	162629	162634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455078
3081	NC_013714	CGG	2	6	162823	162828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3082	NC_013714	TG	3	6	162843	162848	0 %	50 %	50 %	0 %	283455079
3083	NC_013714	GGC	2	6	162857	162862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3084	NC_013714	GAT	2	6	162881	162886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3085	NC_013714	GCGAT	2	10	162900	162909	20 %	20 %	40 %	20 %	283455079
3086	NC_013714	CAC	2	6	162932	162937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455079
3087	NC_013714	CCT	2	6	163015	163020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455079
3088	NC_013714	GGCCG	2	10	163043	163052	0 %	0 %	60 %	40 %	283455079
3089	NC_013714	CGG	2	6	163071	163076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3090	NC_013714	TGATCA	2	12	163090	163101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283455079
3091	NC_013714	GGC	2	6	163115	163120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3092	NC_013714	TGG	2	6	163126	163131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455079
3093	NC_013714	ACC	3	9	163176	163184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455079
3094	NC_013714	GGCGAT	2	12	163187	163198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	283455079
3095	NC_013714	GAT	3	9	163196	163204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3096	NC_013714	CGC	2	6	163219	163224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455079
3097	NC_013714	TTGCC	2	10	163272	163281	0 %	40 %	20 %	40 %	283455079
3098	NC_013714	CGG	2	6	163342	163347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3099	NC_013714	CGG	2	6	163372	163377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3100	NC_013714	CAC	2	6	163448	163453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455079
3101	NC_013714	GAT	2	6	163502	163507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3102	NC_013714	TGG	2	6	163528	163533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455079
3103	NC_013714	GCC	2	6	163580	163585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455079
3104	NC_013714	CAC	2	6	163598	163603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455079
3105	NC_013714	CAT	2	6	163613	163618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455079
3106	NC_013714	TCA	2	6	163651	163656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455079
3107	NC_013714	GGA	2	6	163666	163671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455079
3108	NC_013714	ATG	2	6	163702	163707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3109	NC_013714	ATG	2	6	163740	163745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3110	NC_013714	GCC	2	6	163754	163759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455079
3111	NC_013714	TGA	2	6	163789	163794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3112	NC_013714	GCG	2	6	163848	163853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455079
3113	NC_013714	CCG	2	6	163873	163878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455079
3114	NC_013714	AGT	2	6	163906	163911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3115	NC_013714	ACGA	2	8	163914	163921	50 %	0 %	25 %	25 %	283455079
3116	NC_013714	CCA	2	6	163939	163944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455079
3117	NC_013714	AGT	2	6	163969	163974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3118	NC_013714	GC	3	6	163995	164000	0 %	0 %	50 %	50 %	283455079
3119	NC_013714	GTA	2	6	164021	164026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455079
3120	NC_013714	TCT	2	6	164049	164054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455079
3121	NC_013714	GCAC	2	8	164073	164080	25 %	0 %	25 %	50 %	283455079
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3222	NC_013714	CAT	2	6	169714	169719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455083
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3225	NC_013714	GCAT	2	8	170098	170105	25 %	25 %	25 %	25 %	283455084
3226	NC_013714	GGCTG	2	10	170126	170135	0 %	20 %	60 %	20 %	283455084
3227	NC_013714	GCG	2	6	170224	170229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455084
3228	NC_013714	TCA	2	6	170338	170343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455084
3229	NC_013714	GTG	2	6	170484	170489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455084
3230	NC_013714	CGA	2	6	170554	170559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455084
3231	NC_013714	CAC	2	6	170600	170605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455084
3232	NC_013714	CTG	2	6	170622	170627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455084
3233	NC_013714	CGA	2	6	170657	170662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455084
3234	NC_013714	TCG	2	6	170677	170682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455084
3235	NC_013714	ACG	2	6	170735	170740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455084
3236	NC_013714	AGA	2	6	170764	170769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455084
3237	NC_013714	CGA	2	6	170774	170779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455084
3238	NC_013714	TCAAT	2	10	170843	170852	40 %	40 %	0 %	20 %	283455084
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3240	NC_013714	CAG	2	6	170954	170959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455084
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3360	NC_013714	GGC	2	6	177956	177961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455087
3361	NC_013714	GCA	2	6	177993	177998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455087
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3479	NC_013714	GCA	2	6	183942	183947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455091
3480	NC_013714	CG	3	6	184002	184007	0 %	0 %	50 %	50 %	283455091
3481	NC_013714	CCT	2	6	184029	184034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455091
3482	NC_013714	GC	4	8	184042	184049	0 %	0 %	50 %	50 %	283455091
3483	NC_013714	GCA	2	6	184062	184067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455091
3484	NC_013714	GTT	2	6	184099	184104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455091
3485	NC_013714	GGT	2	6	184108	184113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455091
3486	NC_013714	TGA	2	6	184173	184178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455091
3487	NC_013714	GAAT	2	8	184206	184213	50 %	25 %	25 %	0 %	283455091
3488	NC_013714	CCG	2	6	184232	184237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455091
3489	NC_013714	TCG	2	6	184271	184276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455091
3490	NC_013714	TGCG	2	8	184279	184286	0 %	25 %	50 %	25 %	283455091
3491	NC_013714	GTG	3	9	184316	184324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455091
3492	NC_013714	TCG	2	6	184334	184339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455091
3493	NC_013714	TCG	2	6	184404	184409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455091
3494	NC_013714	TCT	2	6	184442	184447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455092
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3496	NC_013714	TCGCCG	2	12	184544	184555	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283455092
3497	NC_013714	AGAAAT	2	12	184557	184568	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	283455092
3498	NC_013714	CGT	2	6	184580	184585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455092
3499	NC_013714	CTT	2	6	184639	184644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455092
3500	NC_013714	GAT	2	6	184714	184719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455092

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