MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013714	TGGTG	2	10	108153	108162	0 %	40 %	60 %	0 %	283455038
2003	NC_013714	TTCGT	2	10	108203	108212	0 %	60 %	20 %	20 %	283455038
2004	NC_013714	TGG	2	6	108213	108218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455038
2005	NC_013714	CTG	2	6	108220	108225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455038
2006	NC_013714	GCG	2	6	108318	108323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455038
2007	NC_013714	CCG	2	6	108356	108361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455038
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2009	NC_013714	ATG	2	6	108409	108414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455038
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2011	NC_013714	CCG	2	6	108485	108490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455038
2012	NC_013714	TCG	2	6	108593	108598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455038
2013	NC_013714	CTTG	2	8	108630	108637	0 %	50 %	25 %	25 %	283455038
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2015	NC_013714	ATCGCG	2	12	108691	108702	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455038
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2023	NC_013714	GCAGTC	2	12	108939	108950	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455038
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2062	NC_013714	CGACG	2	10	110593	110602	20 %	0 %	40 %	40 %	283455039
2063	NC_013714	CGG	2	6	110603	110608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455039
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2106	NC_013714	GCTC	2	8	112646	112653	0 %	25 %	25 %	50 %	283455041
2107	NC_013714	GC	3	6	112682	112687	0 %	0 %	50 %	50 %	283455041
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2116	NC_013714	CAGG	2	8	112888	112895	25 %	0 %	50 %	25 %	283455042
2117	NC_013714	TGC	2	6	112901	112906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455042
2118	NC_013714	GCG	2	6	112969	112974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455042
2119	NC_013714	CTG	2	6	112999	113004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455042
2120	NC_013714	ATC	2	6	113071	113076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455042
2121	NC_013714	ATC	2	6	113080	113085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455042
2122	NC_013714	CGG	2	6	113115	113120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455042
2123	NC_013714	CCG	2	6	113123	113128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455042
2124	NC_013714	CTG	2	6	113200	113205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455042
2125	NC_013714	CAA	2	6	113217	113222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455042
2126	NC_013714	TGG	2	6	113236	113241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455042
2127	NC_013714	TGG	2	6	113264	113269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455042
2128	NC_013714	CGG	2	6	113406	113411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455042
2129	NC_013714	CAT	2	6	113433	113438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455042
2130	NC_013714	TGC	2	6	113444	113449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455042
2131	NC_013714	TG	3	6	113496	113501	0 %	50 %	50 %	0 %	283455042
2132	NC_013714	CTG	3	9	113509	113517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455042
2133	NC_013714	AGG	2	6	113588	113593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455042
2134	NC_013714	TCC	2	6	113626	113631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455042
2135	NC_013714	TCG	2	6	113660	113665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455042
2136	NC_013714	TTG	2	6	113707	113712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455042
2137	NC_013714	GTC	2	6	113773	113778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455043
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2139	NC_013714	CCGAT	2	10	113925	113934	20 %	20 %	20 %	40 %	283455043
2140	NC_013714	CGG	2	6	113965	113970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455043
2141	NC_013714	CCG	2	6	113976	113981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455043
2142	NC_013714	TTC	2	6	114059	114064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455043
2143	NC_013714	TGA	2	6	114069	114074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455043
2144	NC_013714	ACA	2	6	114216	114221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455043
2145	NC_013714	TGC	2	6	114222	114227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455043
2146	NC_013714	CTG	2	6	114341	114346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455043
2147	NC_013714	AAG	2	6	114350	114355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455043
2148	NC_013714	GC	3	6	114372	114377	0 %	0 %	50 %	50 %	283455043
2149	NC_013714	CTG	2	6	114398	114403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455043
2150	NC_013714	CGA	2	6	114448	114453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455043
2151	NC_013714	GCT	2	6	114490	114495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455043
2152	NC_013714	CAT	2	6	114502	114507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455043
2153	NC_013714	ACG	2	6	114527	114532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455043
2154	NC_013714	TGA	2	6	114636	114641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455043
2155	NC_013714	AGG	2	6	114723	114728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455043
2156	NC_013714	CTG	2	6	114864	114869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455044
2157	NC_013714	TCG	2	6	114952	114957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455044
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2159	NC_013714	TGT	2	6	115039	115044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283455044
2160	NC_013714	CGG	2	6	115268	115273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455044
2161	NC_013714	TGG	2	6	115285	115290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455044
2162	NC_013714	TGA	3	9	115306	115314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455044
2163	NC_013714	TCG	2	6	115426	115431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455044
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2171	NC_013714	GCC	2	6	116158	116163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455045
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2183	NC_013714	CCG	2	6	116672	116677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455045
2184	NC_013714	CCGA	2	8	116725	116732	25 %	0 %	25 %	50 %	283455045
2185	NC_013714	GACGC	2	10	116779	116788	20 %	0 %	40 %	40 %	283455045
2186	NC_013714	GCT	2	6	116817	116822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455045
2187	NC_013714	CCG	2	6	116837	116842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455045
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2192	NC_013714	CAC	3	9	117006	117014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455045
2193	NC_013714	TGC	2	6	117018	117023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455045
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2199	NC_013714	CTC	2	6	117169	117174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455045
2200	NC_013714	CAA	2	6	117225	117230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455045
2201	NC_013714	ACA	2	6	117281	117286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455045
2202	NC_013714	CCGA	2	8	117322	117329	25 %	0 %	25 %	50 %	283455045
2203	NC_013714	AAT	2	6	117515	117520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283455046
2204	NC_013714	GAA	2	6	117521	117526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455046
2205	NC_013714	GATTAC	2	12	117548	117559	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	283455046
2206	NC_013714	CGG	3	9	117562	117570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455046
2207	NC_013714	GAT	2	6	117581	117586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455046
2208	NC_013714	GGC	2	6	117665	117670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455046
2209	NC_013714	CGGCC	2	10	117707	117716	0 %	0 %	40 %	60 %	283455046
2210	NC_013714	CCA	2	6	117724	117729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455046
2211	NC_013714	CGG	2	6	117761	117766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455046
2212	NC_013714	CGT	2	6	117835	117840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455046
2213	NC_013714	CGTC	2	8	117868	117875	0 %	25 %	25 %	50 %	283455046
2214	NC_013714	CCG	2	6	117885	117890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455046
2215	NC_013714	GAT	2	6	117944	117949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455046
2216	NC_013714	ACT	2	6	117991	117996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455046
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2218	NC_013714	ATC	2	6	118047	118052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455046
2219	NC_013714	GAA	2	6	118067	118072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455046
2220	NC_013714	ACG	2	6	118093	118098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455046
2221	NC_013714	GTC	2	6	118125	118130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455046
2222	NC_013714	GGA	2	6	118139	118144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455046
2223	NC_013714	GTC	2	6	118158	118163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455046
2224	NC_013714	CCGA	2	8	118188	118195	25 %	0 %	25 %	50 %	283455046
2225	NC_013714	TGAC	2	8	118330	118337	25 %	25 %	25 %	25 %	283455046
2226	NC_013714	CTG	2	6	118377	118382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455046
2227	NC_013714	CCGA	2	8	118416	118423	25 %	0 %	25 %	50 %	283455046
2228	NC_013714	AGA	2	6	118432	118437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455046
2229	NC_013714	CCG	2	6	118480	118485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455046
2230	NC_013714	GGC	2	6	118508	118513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455046
2231	NC_013714	GCG	2	6	118531	118536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455046
2232	NC_013714	GACG	2	8	118538	118545	25 %	0 %	50 %	25 %	283455046
2233	NC_013714	AGA	2	6	118558	118563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455046
2234	NC_013714	CCA	2	6	118585	118590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455046
2235	NC_013714	GCT	2	6	118628	118633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455046
2236	NC_013714	ACA	2	6	118741	118746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455046
2237	NC_013714	GAA	2	6	119043	119048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455047
2238	NC_013714	TGG	2	6	119078	119083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455047
2239	NC_013714	CGA	2	6	119106	119111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455047
2240	NC_013714	CGAA	2	8	119159	119166	50 %	0 %	25 %	25 %	283455047
2241	NC_013714	GC	3	6	119170	119175	0 %	0 %	50 %	50 %	283455047
2242	NC_013714	CTT	2	6	119235	119240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455047
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2348	NC_013714	CGAC	2	8	124393	124400	25 %	0 %	25 %	50 %	283455051
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2350	NC_013714	CGG	2	6	124505	124510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455051
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2353	NC_013714	GCGA	2	8	124737	124744	25 %	0 %	50 %	25 %	283455051
2354	NC_013714	CGA	2	6	124774	124779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455051
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2356	NC_013714	AC	3	6	124939	124944	50 %	0 %	0 %	50 %	283455051
2357	NC_013714	CAT	2	6	125026	125031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455052
2358	NC_013714	CGA	2	6	125113	125118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455052
2359	NC_013714	A	6	6	125189	125194	100 %	0 %	0 %	0 %	283455052
2360	NC_013714	GCC	3	9	125264	125272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455052
2361	NC_013714	GGCAT	2	10	125273	125282	20 %	20 %	40 %	20 %	283455052
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2480	NC_013714	CGGT	2	8	131546	131553	0 %	25 %	50 %	25 %	283455056
2481	NC_013714	TGCGT	2	10	131557	131566	0 %	40 %	40 %	20 %	283455056
2482	NC_013714	TGC	2	6	131688	131693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455056
2483	NC_013714	GC	3	6	131698	131703	0 %	0 %	50 %	50 %	283455056
2484	NC_013714	GTA	2	6	131713	131718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455056
2485	NC_013714	CGT	2	6	131727	131732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455056
2486	NC_013714	CGT	2	6	131739	131744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455056
2487	NC_013714	ATTGC	2	10	131777	131786	20 %	40 %	20 %	20 %	283455056
2488	NC_013714	TGA	2	6	131817	131822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455056
2489	NC_013714	CCGTCG	2	12	131843	131854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	283455056
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2491	NC_013714	GAA	2	6	132269	132274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455057
2492	NC_013714	GCC	2	6	132282	132287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455057
2493	NC_013714	TCGCT	2	10	132292	132301	0 %	40 %	20 %	40 %	283455057
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2499	NC_013714	CT	3	6	132551	132556	0 %	50 %	0 %	50 %	283455057
2500	NC_013714	AAG	2	6	132696	132701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455057

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