MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium dentium Bd1 chromosome

Total Repeats: 48207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013714	TGAT	2	8	262791	262798	25 %	50 %	25 %	0 %	283455149
5002	NC_013714	TCG	2	6	262911	262916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5003	NC_013714	GAG	2	6	262979	262984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455149
5004	NC_013714	TGCG	2	8	263013	263020	0 %	25 %	50 %	25 %	283455149
5005	NC_013714	GCG	2	6	263153	263158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5006	NC_013714	TGC	2	6	263190	263195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5007	NC_013714	GCC	2	6	263231	263236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455149
5008	NC_013714	GCG	2	6	263273	263278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5009	NC_013714	CGA	2	6	263359	263364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5010	NC_013714	ATGCCG	2	12	263421	263432	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5011	NC_013714	GTC	2	6	263441	263446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5012	NC_013714	ATG	2	6	263460	263465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455149
5013	NC_013714	TGC	2	6	263502	263507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5014	NC_013714	TGC	2	6	263511	263516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5015	NC_013714	GCG	2	6	263543	263548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5016	NC_013714	GAAG	2	8	263572	263579	50 %	0 %	50 %	0 %	283455149
5017	NC_013714	GGC	2	6	263609	263614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455149
5018	NC_013714	TCG	2	6	263691	263696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455149
5019	NC_013714	CGC	2	6	263704	263709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455149
5020	NC_013714	TGA	2	6	263754	263759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455149
5021	NC_013714	CAT	2	6	263803	263808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455149
5022	NC_013714	CG	3	6	263851	263856	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5023	NC_013714	GCCG	2	8	264083	264090	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5024	NC_013714	AGG	2	6	264120	264125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455149
5025	NC_013714	GC	3	6	264130	264135	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5026	NC_013714	CG	3	6	264178	264183	0 %	0 %	50 %	50 %	283455149
5027	NC_013714	ACCG	2	8	264351	264358	25 %	0 %	25 %	50 %	283455150
5028	NC_013714	GTGA	2	8	264373	264380	25 %	25 %	50 %	0 %	283455150
5029	NC_013714	AAC	2	6	264383	264388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455150
5030	NC_013714	GTC	2	6	264406	264411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5031	NC_013714	ATGG	2	8	264441	264448	25 %	25 %	50 %	0 %	283455150
5032	NC_013714	GTG	2	6	264469	264474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455150
5033	NC_013714	GCT	2	6	264495	264500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5034	NC_013714	GTC	2	6	264523	264528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5035	NC_013714	CCA	2	6	264539	264544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455150
5036	NC_013714	TCG	2	6	264554	264559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5037	NC_013714	CGT	2	6	264619	264624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5038	NC_013714	ATC	2	6	264634	264639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5039	NC_013714	GGT	2	6	264640	264645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455150
5040	NC_013714	CGG	2	6	264659	264664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455150
5041	NC_013714	ATG	2	6	264667	264672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5042	NC_013714	ACCGT	2	10	264691	264700	20 %	20 %	20 %	40 %	283455150
5043	NC_013714	TCG	2	6	264746	264751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5044	NC_013714	ACCG	2	8	264772	264779	25 %	0 %	25 %	50 %	283455150
5045	NC_013714	GGT	2	6	264847	264852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455150
5046	NC_013714	GAT	2	6	264855	264860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5047	NC_013714	CGC	2	6	264936	264941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455150
5048	NC_013714	CGA	2	6	265025	265030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5049	NC_013714	ACT	2	6	265043	265048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5050	NC_013714	TCG	2	6	265076	265081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5051	NC_013714	ATG	2	6	265132	265137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5052	NC_013714	ATG	2	6	265186	265191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5053	NC_013714	CGCCAT	2	12	265197	265208	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	283455150
5054	NC_013714	CAT	2	6	265296	265301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5055	NC_013714	TTC	2	6	265306	265311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283455150
5056	NC_013714	GAT	3	9	265326	265334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455150
5057	NC_013714	CCG	2	6	265424	265429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455150
5058	NC_013714	GCC	2	6	265492	265497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455150
5059	NC_013714	GCT	2	6	265554	265559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455150
5060	NC_013714	GC	3	6	265562	265567	0 %	0 %	50 %	50 %	283455150
5061	NC_013714	TCA	2	6	265580	265585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455150
5062	NC_013714	GCG	2	6	265891	265896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455151
5063	NC_013714	CGC	2	6	265916	265921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455151
5064	NC_013714	CCG	2	6	265975	265980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455151
5065	NC_013714	AGCC	2	8	265999	266006	25 %	0 %	25 %	50 %	283455151
5066	NC_013714	GCG	2	6	266041	266046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455151
5067	NC_013714	GTG	3	9	266080	266088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455151
5068	NC_013714	GGC	2	6	266127	266132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455151
5069	NC_013714	GTGC	2	8	266169	266176	0 %	25 %	50 %	25 %	283455151
5070	NC_013714	TGG	2	6	266177	266182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455151
5071	NC_013714	TGC	2	6	266213	266218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455151
5072	NC_013714	TGG	2	6	266368	266373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455151
5073	NC_013714	TCG	2	6	266423	266428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455151
5074	NC_013714	GCGG	2	8	266805	266812	0 %	0 %	75 %	25 %	283455151
5075	NC_013714	GGC	2	6	266903	266908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455152
5076	NC_013714	GCC	2	6	266997	267002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455152
5077	NC_013714	CGA	2	6	267007	267012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5078	NC_013714	GCGTGC	2	12	267048	267059	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283455152
5079	NC_013714	CAC	2	6	267149	267154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455152
5080	NC_013714	TGGCT	2	10	267168	267177	0 %	40 %	40 %	20 %	283455152
5081	NC_013714	CGA	2	6	267210	267215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5082	NC_013714	ACC	2	6	267248	267253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455152
5083	NC_013714	CCG	2	6	267281	267286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455152
5084	NC_013714	CAT	2	6	267295	267300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455152
5085	NC_013714	CAT	2	6	267335	267340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455152
5086	NC_013714	AG	3	6	267365	267370	50 %	0 %	50 %	0 %	283455152
5087	NC_013714	GTG	2	6	267513	267518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455152
5088	NC_013714	ACC	2	6	267524	267529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455152
5089	NC_013714	TGG	2	6	267567	267572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455152
5090	NC_013714	GCT	2	6	267580	267585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5091	NC_013714	CCG	2	6	267609	267614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455152
5092	NC_013714	TGC	2	6	267642	267647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455152
5093	NC_013714	GAAC	2	8	267653	267660	50 %	0 %	25 %	25 %	283455152
5094	NC_013714	CGAA	2	8	267758	267765	50 %	0 %	25 %	25 %	283455152
5095	NC_013714	GCG	2	6	267787	267792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455152
5096	NC_013714	AC	3	6	267847	267852	50 %	0 %	0 %	50 %	283455153
5097	NC_013714	TGA	2	6	267863	267868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283455153
5098	NC_013714	GTGGCT	2	12	267912	267923	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283455153
5099	NC_013714	GCC	2	6	267926	267931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455153
5100	NC_013714	GGCAG	2	10	268011	268020	20 %	0 %	60 %	20 %	283455153
5101	NC_013714	GC	3	6	268085	268090	0 %	0 %	50 %	50 %	283455153
5102	NC_013714	TG	3	6	268117	268122	0 %	50 %	50 %	0 %	283455153
5103	NC_013714	CGTA	2	8	268140	268147	25 %	25 %	25 %	25 %	283455153
5104	NC_013714	GCG	2	6	268148	268153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455153
5105	NC_013714	GAA	2	6	268174	268179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455153
5106	NC_013714	ACTC	2	8	268209	268216	25 %	25 %	0 %	50 %	283455153
5107	NC_013714	GCCC	2	8	268250	268257	0 %	0 %	25 %	75 %	283455153
5108	NC_013714	GAA	2	6	268258	268263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455153
5109	NC_013714	CTG	2	6	268441	268446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455153
5110	NC_013714	GCCC	2	8	268492	268499	0 %	0 %	25 %	75 %	283455153
5111	NC_013714	GCT	2	6	268530	268535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455153
5112	NC_013714	CTG	2	6	268573	268578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455153
5113	NC_013714	ATC	2	6	268604	268609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455153
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5115	NC_013714	CGTC	2	8	268887	268894	0 %	25 %	25 %	50 %	283455154
5116	NC_013714	CGC	2	6	268975	268980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455154
5117	NC_013714	CGC	2	6	269001	269006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455154
5118	NC_013714	CCT	2	6	269160	269165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283455154
5119	NC_013714	TCAA	2	8	269343	269350	50 %	25 %	0 %	25 %	283455155
5120	NC_013714	GGGT	2	8	269380	269387	0 %	25 %	75 %	0 %	283455155
5121	NC_013714	CTGC	2	8	269429	269436	0 %	25 %	25 %	50 %	283455155
5122	NC_013714	CCG	2	6	269488	269493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455155
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5130	NC_013714	GTG	3	9	269739	269747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455156
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5214	NC_013714	CAT	2	6	274166	274171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455161
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5227	NC_013714	GCC	2	6	274741	274746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455161
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5230	NC_013714	AGGCCA	2	12	274864	274875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455161
5231	NC_013714	CCA	2	6	274906	274911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283455161
5232	NC_013714	GAA	2	6	275111	275116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455161
5233	NC_013714	CTA	2	6	275192	275197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283455161
5234	NC_013714	GTG	2	6	275319	275324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455161
5235	NC_013714	ACG	2	6	275352	275357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455161
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5237	NC_013714	GAA	2	6	275426	275431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455161
5238	NC_013714	AAG	2	6	275499	275504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283455161
5239	NC_013714	TCG	2	6	275647	275652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455161
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5241	NC_013714	CGA	2	6	275681	275686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455161
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5243	NC_013714	CCG	3	9	275749	275757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455161
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5343	NC_013714	TACG	2	8	280608	280615	25 %	25 %	25 %	25 %	283455164
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5348	NC_013714	GCCG	2	8	280854	280861	0 %	0 %	50 %	50 %	283455164
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5359	NC_013714	GT	3	6	281377	281382	0 %	50 %	50 %	0 %	283455165
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5365	NC_013714	GCAG	2	8	281479	281486	25 %	0 %	50 %	25 %	283455165
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5478	NC_013714	TCCGT	2	10	287013	287022	0 %	40 %	20 %	40 %	283455169
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5483	NC_013714	CCG	2	6	287204	287209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5484	NC_013714	GGCGA	2	10	287245	287254	20 %	0 %	60 %	20 %	283455169
5485	NC_013714	GTG	2	6	287296	287301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283455169
5486	NC_013714	GGA	2	6	287317	287322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455169
5487	NC_013714	TCG	2	6	287331	287336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5488	NC_013714	GGA	2	6	287343	287348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283455169
5489	NC_013714	GCTC	2	8	287352	287359	0 %	25 %	25 %	50 %	283455169
5490	NC_013714	CGA	2	6	287418	287423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5491	NC_013714	CCG	3	9	287426	287434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5492	NC_013714	GAC	2	6	287487	287492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283455169
5493	NC_013714	CGC	2	6	287543	287548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5494	NC_013714	GCT	2	6	287562	287567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283455169
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5496	NC_013714	CGG	2	6	287658	287663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455169
5497	NC_013714	CG	3	6	287667	287672	0 %	0 %	50 %	50 %	283455169
5498	NC_013714	CGC	2	6	287692	287697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283455169
5499	NC_013714	CAA	2	6	287749	287754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283455169
5500	NC_013714	CGG	2	6	287786	287791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283455169

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