MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013129	ATTT	2	8	788	795	25 %	75 %	0 %	0 %	256041952
2	NC_013129	AGCA	2	8	951	958	50 %	0 %	25 %	25 %	256041952
3	NC_013129	TTAA	2	8	2034	2041	50 %	50 %	0 %	0 %	256041954
4	NC_013129	CAAA	2	8	2533	2540	75 %	0 %	0 %	25 %	256041954
5	NC_013129	ATTT	2	8	2641	2648	25 %	75 %	0 %	0 %	256041954
6	NC_013129	CAAT	2	8	3605	3612	50 %	25 %	0 %	25 %	256041955
7	NC_013129	CCAC	2	8	3738	3745	25 %	0 %	0 %	75 %	256041955
8	NC_013129	AACA	2	8	4194	4201	75 %	0 %	0 %	25 %	256041955
9	NC_013129	CTTT	2	8	4826	4833	0 %	75 %	0 %	25 %	256041956
10	NC_013129	ACAA	2	8	5785	5792	75 %	0 %	0 %	25 %	256041958
11	NC_013129	GCAA	2	8	6053	6060	50 %	0 %	25 %	25 %	256041958
12	NC_013129	ACAA	2	8	6471	6478	75 %	0 %	0 %	25 %	256041958
13	NC_013129	CAAA	2	8	7573	7580	75 %	0 %	0 %	25 %	256041960
14	NC_013129	TTGA	2	8	7635	7642	25 %	50 %	25 %	0 %	256041960
15	NC_013129	AAAT	2	8	7675	7682	75 %	25 %	0 %	0 %	256041960
16	NC_013129	ATTT	2	8	8004	8011	25 %	75 %	0 %	0 %	256041960
17	NC_013129	TAAA	2	8	8408	8415	75 %	25 %	0 %	0 %	256041961
18	NC_013129	TCAA	2	8	8736	8743	50 %	25 %	0 %	25 %	256041962
19	NC_013129	ATCA	2	8	9108	9115	50 %	25 %	0 %	25 %	256041963
20	NC_013129	TATT	2	8	9451	9458	25 %	75 %	0 %	0 %	256041964
21	NC_013129	GAAG	2	8	10849	10856	50 %	0 %	50 %	0 %	256041965
22	NC_013129	TTTA	2	8	11889	11896	25 %	75 %	0 %	0 %	256041966
23	NC_013129	TAAA	2	8	11898	11905	75 %	25 %	0 %	0 %	256041966
24	NC_013129	GAAA	2	8	11912	11919	75 %	0 %	25 %	0 %	256041966
25	NC_013129	AAAT	2	8	12153	12160	75 %	25 %	0 %	0 %	256041966
26	NC_013129	GAAA	2	8	13332	13339	75 %	0 %	25 %	0 %	256041967
27	NC_013129	TCAA	2	8	13641	13648	50 %	25 %	0 %	25 %	256041968
28	NC_013129	ATTT	2	8	14038	14045	25 %	75 %	0 %	0 %	256041968
29	NC_013129	TAAT	2	8	14089	14096	50 %	50 %	0 %	0 %	256041968
30	NC_013129	TAAA	2	8	14275	14282	75 %	25 %	0 %	0 %	256041968
31	NC_013129	AAAG	2	8	14673	14680	75 %	0 %	25 %	0 %	256041969
32	NC_013129	CTTT	2	8	14786	14793	0 %	75 %	0 %	25 %	256041969
33	NC_013129	GAAA	2	8	15745	15752	75 %	0 %	25 %	0 %	256041971
34	NC_013129	TAGT	2	8	16543	16550	25 %	50 %	25 %	0 %	256041972
35	NC_013129	ATTT	2	8	16709	16716	25 %	75 %	0 %	0 %	256041973
36	NC_013129	GCAA	2	8	16814	16821	50 %	0 %	25 %	25 %	256041973
37	NC_013129	TTCT	2	8	17190	17197	0 %	75 %	0 %	25 %	256041973
38	NC_013129	AAAT	2	8	18256	18263	75 %	25 %	0 %	0 %	256041974
39	NC_013129	ACCA	2	8	18832	18839	50 %	0 %	0 %	50 %	256041975
40	NC_013129	AAAT	2	8	18862	18869	75 %	25 %	0 %	0 %	256041975
41	NC_013129	TCAA	2	8	19551	19558	50 %	25 %	0 %	25 %	256041975
42	NC_013129	GTGG	2	8	19607	19614	0 %	25 %	75 %	0 %	256041975
43	NC_013129	TGCT	2	8	19707	19714	0 %	50 %	25 %	25 %	256041975
44	NC_013129	TTTG	2	8	19903	19910	0 %	75 %	25 %	0 %	256041975
45	NC_013129	GAAA	2	8	21132	21139	75 %	0 %	25 %	0 %	256041977
46	NC_013129	CTTT	2	8	21175	21182	0 %	75 %	0 %	25 %	256041977
47	NC_013129	TGAC	2	8	21233	21240	25 %	25 %	25 %	25 %	256041977
48	NC_013129	TAAG	2	8	21389	21396	50 %	25 %	25 %	0 %	256041977
49	NC_013129	TTGT	2	8	21702	21709	0 %	75 %	25 %	0 %	256041978
50	NC_013129	TGCT	2	8	22918	22925	0 %	50 %	25 %	25 %	256041978
51	NC_013129	GCAA	2	8	24111	24118	50 %	0 %	25 %	25 %	256041979
52	NC_013129	GATT	2	8	24843	24850	25 %	50 %	25 %	0 %	256041980
53	NC_013129	CAGA	2	8	24971	24978	50 %	0 %	25 %	25 %	256041980
54	NC_013129	AATC	2	8	25483	25490	50 %	25 %	0 %	25 %	256041981
55	NC_013129	AATT	2	8	25567	25574	50 %	50 %	0 %	0 %	256041981
56	NC_013129	CTTG	2	8	25593	25600	0 %	50 %	25 %	25 %	256041981
57	NC_013129	AAAG	2	8	25601	25608	75 %	0 %	25 %	0 %	256041981
58	NC_013129	ATTT	2	8	25985	25992	25 %	75 %	0 %	0 %	256041981
59	NC_013129	CAAA	2	8	26151	26158	75 %	0 %	0 %	25 %	256041981
60	NC_013129	ATAA	2	8	26860	26867	75 %	25 %	0 %	0 %	256041982
61	NC_013129	GAAT	2	8	27234	27241	50 %	25 %	25 %	0 %	256041982
62	NC_013129	TACT	2	8	28247	28254	25 %	50 %	0 %	25 %	256041984
63	NC_013129	AATT	2	8	28532	28539	50 %	50 %	0 %	0 %	256041984
64	NC_013129	TGTT	2	8	29122	29129	0 %	75 %	25 %	0 %	256041985
65	NC_013129	TTAA	2	8	29510	29517	50 %	50 %	0 %	0 %	256041986
66	NC_013129	CAAA	2	8	29855	29862	75 %	0 %	0 %	25 %	256041987
67	NC_013129	GCAA	2	8	31166	31173	50 %	0 %	25 %	25 %	256041989
68	NC_013129	CAAG	2	8	31210	31217	50 %	0 %	25 %	25 %	256041989
69	NC_013129	AGCA	2	8	31835	31842	50 %	0 %	25 %	25 %	256041990
70	NC_013129	CAAT	2	8	32122	32129	50 %	25 %	0 %	25 %	256041990
71	NC_013129	ACAT	2	8	32250	32257	50 %	25 %	0 %	25 %	256041991
72	NC_013129	GGTT	2	8	32525	32532	0 %	50 %	50 %	0 %	256041991
73	NC_013129	TACA	2	8	32791	32798	50 %	25 %	0 %	25 %	256041992
74	NC_013129	AGCA	2	8	34395	34402	50 %	0 %	25 %	25 %	256041994
75	NC_013129	GTAT	2	8	35058	35065	25 %	50 %	25 %	0 %	256041995
76	NC_013129	TTTA	2	8	35776	35783	25 %	75 %	0 %	0 %	256041995
77	NC_013129	AATT	2	8	35912	35919	50 %	50 %	0 %	0 %	256041996
78	NC_013129	TAAT	2	8	36077	36084	50 %	50 %	0 %	0 %	256041996
79	NC_013129	ATGA	2	8	37056	37063	50 %	25 %	25 %	0 %	256041998
80	NC_013129	ATTT	2	8	37202	37209	25 %	75 %	0 %	0 %	256041998
81	NC_013129	TTTG	2	8	37268	37275	0 %	75 %	25 %	0 %	256041998
82	NC_013129	AGAC	2	8	37379	37386	50 %	0 %	25 %	25 %	256041998
83	NC_013129	GTTG	2	8	38199	38206	0 %	50 %	50 %	0 %	256042000
84	NC_013129	AGTG	2	8	38711	38718	25 %	25 %	50 %	0 %	256042000
85	NC_013129	AATA	2	8	40022	40029	75 %	25 %	0 %	0 %	256042001
86	NC_013129	AAAT	2	8	40039	40046	75 %	25 %	0 %	0 %	256042001
87	NC_013129	GCTT	2	8	40743	40750	0 %	50 %	25 %	25 %	256042002
88	NC_013129	TTTA	2	8	40928	40935	25 %	75 %	0 %	0 %	256042002
89	NC_013129	ATTT	2	8	40995	41002	25 %	75 %	0 %	0 %	256042002
90	NC_013129	ACTT	2	8	41413	41420	25 %	50 %	0 %	25 %	256042003
91	NC_013129	TTGC	2	8	42264	42271	0 %	50 %	25 %	25 %	256042004
92	NC_013129	GTTT	2	8	42814	42821	0 %	75 %	25 %	0 %	256042005
93	NC_013129	AATT	2	8	43463	43470	50 %	50 %	0 %	0 %	256042005
94	NC_013129	GTTT	2	8	44022	44029	0 %	75 %	25 %	0 %	256042006
95	NC_013129	TTTG	2	8	44305	44312	0 %	75 %	25 %	0 %	256042006
96	NC_013129	ATTT	2	8	44951	44958	25 %	75 %	0 %	0 %	256042007
97	NC_013129	GAAA	2	8	44975	44982	75 %	0 %	25 %	0 %	256042007
98	NC_013129	ATTT	2	8	45112	45119	25 %	75 %	0 %	0 %	256042007
99	NC_013129	TTTG	2	8	45372	45379	0 %	75 %	25 %	0 %	256042007
100	NC_013129	AATC	2	8	46703	46710	50 %	25 %	0 %	25 %	256042008
101	NC_013129	GATT	2	8	48136	48143	25 %	50 %	25 %	0 %	256042009
102	NC_013129	CTTT	2	8	49237	49244	0 %	75 %	0 %	25 %	256042011
103	NC_013129	TATT	2	8	50082	50089	25 %	75 %	0 %	0 %	256042012
104	NC_013129	TAAA	2	8	51471	51478	75 %	25 %	0 %	0 %	256042013
105	NC_013129	ATTG	2	8	52752	52759	25 %	50 %	25 %	0 %	256042014

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.