MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1_lp54

Total Repeats: 1103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013129	AATTA	2	10	23081	23090	60 %	40 %	0 %	0 %	256041978
502	NC_013129	TTCCAA	2	12	23137	23148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041978
503	NC_013129	ATC	2	6	23162	23167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041978
504	NC_013129	T	8	8	23230	23237	0 %	100 %	0 %	0 %	256041978
505	NC_013129	TTG	2	6	23854	23859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041979
506	NC_013129	GAA	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041979
507	NC_013129	AGA	2	6	23975	23980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041979
508	NC_013129	T	6	6	24018	24023	0 %	100 %	0 %	0 %	256041979
509	NC_013129	GCAA	2	8	24111	24118	50 %	0 %	25 %	25 %	256041979
510	NC_013129	CAA	2	6	24138	24143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041979
511	NC_013129	A	6	6	24252	24257	100 %	0 %	0 %	0 %	256041979
512	NC_013129	ATG	2	6	24262	24267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041979
513	NC_013129	A	6	6	24318	24323	100 %	0 %	0 %	0 %	256041979
514	NC_013129	AAC	2	6	24345	24350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041979
515	NC_013129	TAT	2	6	24465	24470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041980
516	NC_013129	TAA	2	6	24516	24521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041980
517	NC_013129	AAT	2	6	24607	24612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041980
518	NC_013129	ATG	2	6	24617	24622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041980
519	NC_013129	ATCAAA	2	12	24642	24653	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	256041980
520	NC_013129	ATC	2	6	24692	24697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041980
521	NC_013129	TTG	2	6	24752	24757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041980
522	NC_013129	CA	3	6	24805	24810	50 %	0 %	0 %	50 %	256041980
523	NC_013129	GATT	2	8	24843	24850	25 %	50 %	25 %	0 %	256041980
524	NC_013129	T	6	6	24849	24854	0 %	100 %	0 %	0 %	256041980
525	NC_013129	GAA	2	6	24865	24870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041980
526	NC_013129	GAA	2	6	24886	24891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041980
527	NC_013129	ACT	2	6	24939	24944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041980
528	NC_013129	TTA	2	6	24950	24955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041980
529	NC_013129	CAGA	2	8	24971	24978	50 %	0 %	25 %	25 %	256041980
530	NC_013129	TAA	2	6	24983	24988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041980
531	NC_013129	AAG	2	6	25048	25053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041980
532	NC_013129	ATT	2	6	25056	25061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041980
533	NC_013129	TTTTTA	2	12	25062	25073	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	256041980
534	NC_013129	A	7	7	25433	25439	100 %	0 %	0 %	0 %	256041981
535	NC_013129	A	6	6	25465	25470	100 %	0 %	0 %	0 %	256041981
536	NC_013129	AATC	2	8	25483	25490	50 %	25 %	0 %	25 %	256041981
537	NC_013129	T	8	8	25515	25522	0 %	100 %	0 %	0 %	256041981
538	NC_013129	AGA	2	6	25546	25551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041981
539	NC_013129	AATT	2	8	25567	25574	50 %	50 %	0 %	0 %	256041981
540	NC_013129	CTTG	2	8	25593	25600	0 %	50 %	25 %	25 %	256041981
541	NC_013129	AAAG	2	8	25601	25608	75 %	0 %	25 %	0 %	256041981
542	NC_013129	CTT	2	6	25652	25657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041981
543	NC_013129	TGAAGA	2	12	25717	25728	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	256041981
544	NC_013129	A	6	6	25785	25790	100 %	0 %	0 %	0 %	256041981
545	NC_013129	TTA	2	6	25791	25796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041981
546	NC_013129	GAT	2	6	25847	25852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041981
547	NC_013129	GA	3	6	25856	25861	50 %	0 %	50 %	0 %	256041981
548	NC_013129	TAA	2	6	25893	25898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041981
549	NC_013129	ATTATG	2	12	25908	25919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	256041981
550	NC_013129	TGC	2	6	25956	25961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041981
551	NC_013129	ATTT	2	8	25985	25992	25 %	75 %	0 %	0 %	256041981
552	NC_013129	A	6	6	26001	26006	100 %	0 %	0 %	0 %	256041981
553	NC_013129	T	6	6	26023	26028	0 %	100 %	0 %	0 %	256041981
554	NC_013129	TGG	2	6	26049	26054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041981
555	NC_013129	TTG	2	6	26058	26063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041981
556	NC_013129	AGA	2	6	26083	26088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041981
557	NC_013129	T	6	6	26132	26137	0 %	100 %	0 %	0 %	256041981
558	NC_013129	CAAA	2	8	26151	26158	75 %	0 %	0 %	25 %	256041981
559	NC_013129	AG	3	6	26198	26203	50 %	0 %	50 %	0 %	256041981
560	NC_013129	ATG	2	6	26232	26237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041981
561	NC_013129	T	6	6	26241	26246	0 %	100 %	0 %	0 %	256041981
562	NC_013129	TAA	2	6	26277	26282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041981
563	NC_013129	GCA	2	6	26394	26399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041981
564	NC_013129	ATT	2	6	26421	26426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041981
565	NC_013129	ATT	2	6	26430	26435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041981
566	NC_013129	CTT	2	6	26564	26569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041981
567	NC_013129	A	6	6	26681	26686	100 %	0 %	0 %	0 %	256041982
568	NC_013129	AAG	2	6	26711	26716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041982
569	NC_013129	TAA	2	6	26808	26813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041982
570	NC_013129	ATT	2	6	26825	26830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041982
571	NC_013129	ATAA	2	8	26860	26867	75 %	25 %	0 %	0 %	256041982
572	NC_013129	TTA	2	6	26966	26971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041982
573	NC_013129	TAA	2	6	27056	27061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041982
574	NC_013129	A	7	7	27146	27152	100 %	0 %	0 %	0 %	256041982
575	NC_013129	T	7	7	27174	27180	0 %	100 %	0 %	0 %	256041982
576	NC_013129	GAAT	2	8	27234	27241	50 %	25 %	25 %	0 %	256041982
577	NC_013129	TAA	2	6	27249	27254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041982
578	NC_013129	A	6	6	27451	27456	100 %	0 %	0 %	0 %	256041983
579	NC_013129	CTG	2	6	27571	27576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256041983
580	NC_013129	GGT	2	6	27669	27674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256041983
581	NC_013129	GTT	2	6	27729	27734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041983
582	NC_013129	AGA	2	6	27791	27796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041983
583	NC_013129	TAA	3	9	27802	27810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041983
584	NC_013129	AGA	2	6	27897	27902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041983
585	NC_013129	T	7	7	27925	27931	0 %	100 %	0 %	0 %	256041983
586	NC_013129	CGA	2	6	27998	28003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041984
587	NC_013129	ATT	2	6	28119	28124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041984
588	NC_013129	CAA	2	6	28186	28191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041984
589	NC_013129	TACT	2	8	28247	28254	25 %	50 %	0 %	25 %	256041984
590	NC_013129	GA	3	6	28304	28309	50 %	0 %	50 %	0 %	256041984
591	NC_013129	AAT	2	6	28325	28330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041984
592	NC_013129	CTT	2	6	28404	28409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256041984
593	NC_013129	TGA	2	6	28412	28417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041984
594	NC_013129	CAAAT	2	10	28456	28465	60 %	20 %	0 %	20 %	256041984
595	NC_013129	ATG	2	6	28516	28521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041984
596	NC_013129	AATT	2	8	28532	28539	50 %	50 %	0 %	0 %	256041984
597	NC_013129	GA	3	6	28548	28553	50 %	0 %	50 %	0 %	256041984
598	NC_013129	GCC	2	6	28594	28599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256041984
599	NC_013129	ACA	2	6	28618	28623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041984
600	NC_013129	ATT	2	6	28624	28629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041984
601	NC_013129	TAA	2	6	28667	28672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256041984
602	NC_013129	GAT	2	6	28710	28715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041984
603	NC_013129	AT	3	6	28725	28730	50 %	50 %	0 %	0 %	256041984
604	NC_013129	AAG	2	6	28733	28738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041984
605	NC_013129	ACT	2	6	28745	28750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041984
606	NC_013129	TCA	2	6	28766	28771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256041984
607	NC_013129	CAA	2	6	28855	28860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256041984
608	NC_013129	A	6	6	28859	28864	100 %	0 %	0 %	0 %	256041984
609	NC_013129	A	6	6	28891	28896	100 %	0 %	0 %	0 %	256041984
610	NC_013129	T	8	8	29043	29050	0 %	100 %	0 %	0 %	256041985
611	NC_013129	TGTT	2	8	29122	29129	0 %	75 %	25 %	0 %	256041985
612	NC_013129	TAT	2	6	29136	29141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256041985
613	NC_013129	TTTAA	2	10	29184	29193	40 %	60 %	0 %	0 %	256041985
614	NC_013129	AGC	2	6	29259	29264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256041985
615	NC_013129	GAT	2	6	29292	29297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041985
616	NC_013129	CT	3	6	29324	29329	0 %	50 %	0 %	50 %	256041985
617	NC_013129	AGT	2	6	29336	29341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041985
618	NC_013129	GAT	2	6	29359	29364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041986
619	NC_013129	TA	3	6	29392	29397	50 %	50 %	0 %	0 %	256041986
620	NC_013129	T	7	7	29409	29415	0 %	100 %	0 %	0 %	256041986
621	NC_013129	TGT	2	6	29485	29490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041986
622	NC_013129	TTAA	2	8	29510	29517	50 %	50 %	0 %	0 %	256041986
623	NC_013129	AGA	2	6	29521	29526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041986
624	NC_013129	AGT	2	6	29527	29532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041986
625	NC_013129	TGA	2	6	29632	29637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256041986
626	NC_013129	A	6	6	29661	29666	100 %	0 %	0 %	0 %	256041986
627	NC_013129	AAG	2	6	29673	29678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256041986
628	NC_013129	TTG	2	6	29713	29718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256041986
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