MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bartonella grahamii as4aup plasmid pBGR3

Total Repeats: 319

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012847	GGT	2	6	334	339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851421
2	NC_012847	GAA	2	6	430	435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851421
3	NC_012847	GAT	2	6	522	527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851422
4	NC_012847	AGA	2	6	644	649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851422
5	NC_012847	TGG	2	6	740	745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851422
6	NC_012847	GGT	2	6	789	794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851422
7	NC_012847	TCA	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851423
8	NC_012847	GAC	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851423
9	NC_012847	GCT	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851423
10	NC_012847	AGA	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851423
11	NC_012847	CAC	2	6	1555	1560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240851423
12	NC_012847	TTC	2	6	1625	1630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851423
13	NC_012847	GTG	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851423
14	NC_012847	AGT	2	6	1922	1927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851424
15	NC_012847	CAA	2	6	1967	1972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851424
16	NC_012847	ACA	2	6	2096	2101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851424
17	NC_012847	CAG	2	6	2156	2161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851424
18	NC_012847	TAG	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851424
19	NC_012847	ATC	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851424
20	NC_012847	ATT	2	6	2346	2351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851424
21	NC_012847	ATT	3	9	3065	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851425
22	NC_012847	TCT	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851425
23	NC_012847	TCC	2	6	3286	3291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240851425
24	NC_012847	ATG	2	6	3329	3334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851425
25	NC_012847	CGG	2	6	3477	3482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240851425
26	NC_012847	TAC	2	6	3531	3536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851425
27	NC_012847	TAT	2	6	3687	3692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851425
28	NC_012847	CGA	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851425
29	NC_012847	AAC	2	6	3928	3933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851425
30	NC_012847	ATG	2	6	3940	3945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851425
31	NC_012847	TAA	2	6	4246	4251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851425
32	NC_012847	CTA	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851425
33	NC_012847	TAT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851425
34	NC_012847	TTC	2	6	4386	4391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851425
35	NC_012847	AAT	2	6	5281	5286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851426
36	NC_012847	ACT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851426
37	NC_012847	TGC	2	6	5403	5408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851426
38	NC_012847	GGC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240851426
39	NC_012847	CAC	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240851426
40	NC_012847	AGA	2	6	5661	5666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851427
41	NC_012847	GAT	2	6	5748	5753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851427
42	NC_012847	TTC	2	6	5855	5860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851427
43	NC_012847	AGC	2	6	5989	5994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851428
44	NC_012847	CAA	2	6	6026	6031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851428
45	NC_012847	CAT	2	6	6035	6040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851428
46	NC_012847	ATT	2	6	6069	6074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851428
47	NC_012847	ATT	2	6	6108	6113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851428
48	NC_012847	CAA	2	6	6140	6145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851428
49	NC_012847	GAT	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
50	NC_012847	GCA	2	6	6524	6529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851428
51	NC_012847	CCA	2	6	6542	6547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240851428
52	NC_012847	TGG	2	6	6550	6555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851428
53	NC_012847	GTC	2	6	6559	6564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851428
54	NC_012847	TGA	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
55	NC_012847	TGA	2	6	6887	6892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
56	NC_012847	CAT	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851428
57	NC_012847	CGC	2	6	6955	6960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240851428
58	NC_012847	TGG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851428
59	NC_012847	GCG	2	6	7044	7049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240851428
60	NC_012847	TGG	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851428
61	NC_012847	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
62	NC_012847	CTG	2	6	7207	7212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851428
63	NC_012847	GGC	2	6	7392	7397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240851428
64	NC_012847	CAG	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851428
65	NC_012847	CGG	2	6	7558	7563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240851428
66	NC_012847	AGC	2	6	7570	7575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851428
67	NC_012847	TTG	2	6	7581	7586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851428
68	NC_012847	AAC	2	6	7594	7599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851428
69	NC_012847	TGA	2	6	7712	7717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
70	NC_012847	ATG	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
71	NC_012847	ATG	2	6	7797	7802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
72	NC_012847	CGT	2	6	7839	7844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851428
73	NC_012847	GAT	2	6	7884	7889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851428
74	NC_012847	TGT	2	6	7948	7953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851428
75	NC_012847	TCA	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851428
76	NC_012847	CAC	2	6	8222	8227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240851428
77	NC_012847	AAT	2	6	8419	8424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851429
78	NC_012847	CAA	2	6	8477	8482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851429
79	NC_012847	ACA	2	6	8488	8493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851429
80	NC_012847	CAA	2	6	8587	8592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851429
81	NC_012847	AAT	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851429
82	NC_012847	GCT	2	6	8606	8611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851429
83	NC_012847	TGG	3	9	8656	8664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851429
84	NC_012847	GGT	2	6	8717	8722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851429
85	NC_012847	AAG	2	6	8733	8738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851429
86	NC_012847	AGC	2	6	8797	8802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851429
87	NC_012847	ATT	2	6	8858	8863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851429
88	NC_012847	GCT	2	6	8888	8893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851429
89	NC_012847	AGC	2	6	8920	8925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851429
90	NC_012847	CAA	2	6	8981	8986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851429
91	NC_012847	AGA	2	6	9019	9024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851429
92	NC_012847	ATC	2	6	9104	9109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851430
93	NC_012847	AAC	2	6	9112	9117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851430
94	NC_012847	TCA	2	6	9138	9143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851430
95	NC_012847	AGA	2	6	9172	9177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851430
96	NC_012847	ATC	2	6	9270	9275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851430
97	NC_012847	GAA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851430
98	NC_012847	GAA	2	6	9308	9313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851430
99	NC_012847	AGA	2	6	9328	9333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851430
100	NC_012847	CAA	2	6	9347	9352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851430
101	NC_012847	GAA	3	9	9353	9361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851430
102	NC_012847	CAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851430
103	NC_012847	ATA	2	6	9411	9416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851430
104	NC_012847	ACA	2	6	9639	9644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851431
105	NC_012847	TTC	2	6	9658	9663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851431
106	NC_012847	CAA	2	6	9687	9692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851431
107	NC_012847	CAT	2	6	9706	9711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851431
108	NC_012847	CAC	2	6	9721	9726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240851431
109	NC_012847	GCA	2	6	9872	9877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851431
110	NC_012847	ATT	2	6	9947	9952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851431
111	NC_012847	TCA	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851431
112	NC_012847	TGG	2	6	10231	10236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851431
113	NC_012847	GGA	2	6	10286	10291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240851431
114	NC_012847	TAG	2	6	10330	10335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851431
115	NC_012847	AGC	2	6	10336	10341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851431
116	NC_012847	GTG	2	6	10347	10352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851431
117	NC_012847	AGG	2	6	10411	10416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240851431
118	NC_012847	TAT	2	6	10596	10601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851432
119	NC_012847	ATC	2	6	10620	10625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851432
120	NC_012847	GAA	2	6	10675	10680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851432
121	NC_012847	CGC	2	6	10785	10790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240851433
122	NC_012847	ACC	2	6	10791	10796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240851433
123	NC_012847	AAT	2	6	10838	10843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851433
124	NC_012847	TCA	2	6	10858	10863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851433
125	NC_012847	AAG	2	6	10948	10953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851433
126	NC_012847	CAA	2	6	10957	10962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851433
127	NC_012847	CGA	2	6	10967	10972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851433
128	NC_012847	GCA	2	6	10992	10997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851433
129	NC_012847	TCG	2	6	11023	11028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851433
130	NC_012847	AGA	2	6	11030	11035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851433
131	NC_012847	GAA	2	6	11079	11084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851433
132	NC_012847	TAC	2	6	11214	11219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851433
133	NC_012847	AAC	2	6	11232	11237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851433
134	NC_012847	ACA	3	9	11239	11247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851433
135	NC_012847	TCA	2	6	11254	11259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851433
136	NC_012847	ATG	2	6	11511	11516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851434
137	NC_012847	ATT	2	6	11534	11539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851434
138	NC_012847	GAA	2	6	11582	11587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851434
139	NC_012847	GTC	2	6	11693	11698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851434
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142	NC_012847	ACA	2	6	11860	11865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851434
143	NC_012847	AAC	2	6	12196	12201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851434
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146	NC_012847	ATT	2	6	12356	12361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851435
147	NC_012847	TAA	2	6	12460	12465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851435
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151	NC_012847	TAA	2	6	12664	12669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851435
152	NC_012847	TAA	2	6	12685	12690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851435
153	NC_012847	ATC	2	6	12773	12778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851435
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158	NC_012847	ATT	2	6	13096	13101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851435
159	NC_012847	GTT	2	6	13109	13114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851435
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162	NC_012847	CCT	2	6	13247	13252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240851435
163	NC_012847	ATG	2	6	13475	13480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851436
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165	NC_012847	TTG	2	6	13523	13528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851436
166	NC_012847	GTT	2	6	13600	13605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851436
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170	NC_012847	CAA	2	6	13930	13935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851436
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243	NC_012847	AGC	2	6	20223	20228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851440
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245	NC_012847	GAA	2	6	20528	20533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851441
246	NC_012847	GAA	2	6	20546	20551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240851441
247	NC_012847	CTT	2	6	20564	20569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851441
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251	NC_012847	GAG	2	6	20681	20686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240851441
252	NC_012847	AAT	2	6	20724	20729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851441
253	NC_012847	TGA	2	6	20786	20791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851442
254	NC_012847	TGC	2	6	20897	20902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851442
255	NC_012847	ACA	2	6	20951	20956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851442
256	NC_012847	TAC	2	6	21096	21101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851443
257	NC_012847	TTC	2	6	21168	21173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240851443
258	NC_012847	CAT	2	6	21221	21226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851443
259	NC_012847	TGC	2	6	21246	21251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851443
260	NC_012847	CTA	2	6	21252	21257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851443
261	NC_012847	TAT	3	9	21369	21377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851443
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263	NC_012847	AAC	2	6	21473	21478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851443
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268	NC_012847	TGG	2	6	21666	21671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240851443
269	NC_012847	AAC	2	6	21678	21683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851443
270	NC_012847	CTC	2	6	21812	21817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240851443
271	NC_012847	CAA	2	6	21827	21832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851443
272	NC_012847	TTA	2	6	21856	21861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851443
273	NC_012847	CTC	2	6	21916	21921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240851443
274	NC_012847	TTA	2	6	21982	21987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240851443
275	NC_012847	ACT	2	6	21993	21998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851443
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280	NC_012847	TTG	2	6	22358	22363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851443
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284	NC_012847	ATA	3	9	22893	22901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851443
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286	NC_012847	AGC	2	6	23639	23644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240851444
287	NC_012847	ACT	2	6	24006	24011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851445
288	NC_012847	TAC	2	6	24014	24019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240851445
289	NC_012847	TTG	2	6	24196	24201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240851445
290	NC_012847	TGA	2	6	24261	24266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851446
291	NC_012847	GCT	2	6	24395	24400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240851446
292	NC_012847	AAC	2	6	24507	24512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240851446
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294	NC_012847	ATA	2	6	24808	24813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240851447
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296	NC_012847	TAG	2	6	24974	24979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240851447
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.