MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis DSM 10140 chromosome

Total Repeats: 38253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012815	GCG	2	6	25325	25330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
502	NC_012815	GC	3	6	25338	25343	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
503	NC_012815	GCG	2	6	25350	25355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
504	NC_012815	GGCG	2	8	25373	25380	0 %	0 %	75 %	25 %	241195492
505	NC_012815	ACA	2	6	25390	25395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195492
506	NC_012815	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	241195492
507	NC_012815	GAA	2	6	25538	25543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195492
508	NC_012815	GCG	2	6	25625	25630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
509	NC_012815	GCG	2	6	25711	25716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
510	NC_012815	CG	3	6	25752	25757	0 %	0 %	50 %	50 %	241195492
511	NC_012815	TGTTCG	2	12	25771	25782	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	241195492
512	NC_012815	CGA	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195492
513	NC_012815	ATC	2	6	25914	25919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195492
514	NC_012815	GGC	3	9	25932	25940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
515	NC_012815	CGG	2	6	25946	25951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195492
516	NC_012815	TCG	2	6	25957	25962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195492
517	NC_012815	GAGT	2	8	26034	26041	25 %	25 %	50 %	0 %	241195492
518	NC_012815	GCA	2	6	26496	26501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
519	NC_012815	GCG	3	9	26594	26602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195493
520	NC_012815	GCA	2	6	26604	26609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
521	NC_012815	GCCGTT	2	12	26742	26753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195493
522	NC_012815	GGC	2	6	26869	26874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195493
523	NC_012815	GAG	2	6	26908	26913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195493
524	NC_012815	ACG	2	6	26951	26956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
525	NC_012815	GCT	3	9	26970	26978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195493
526	NC_012815	CGA	2	6	26979	26984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
527	NC_012815	CGA	2	6	27015	27020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195493
528	NC_012815	CGG	2	6	27027	27032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195493
529	NC_012815	GC	4	8	27057	27064	0 %	0 %	50 %	50 %	241195493
530	NC_012815	GGGGA	2	10	27082	27091	20 %	0 %	80 %	0 %	241195493
531	NC_012815	ATC	2	6	27304	27309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195494
532	NC_012815	TCT	2	6	27338	27343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195494
533	NC_012815	CATT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	241195494
534	NC_012815	GCC	2	6	27478	27483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195494
535	NC_012815	GTG	2	6	27502	27507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
536	NC_012815	GAT	2	6	27522	27527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195494
537	NC_012815	ATT	2	6	27574	27579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241195494
538	NC_012815	TGG	2	6	27656	27661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
539	NC_012815	TGG	2	6	27665	27670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
540	NC_012815	GTG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195494
541	NC_012815	CCG	2	6	27701	27706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241195494
542	NC_012815	GACG	2	8	27804	27811	25 %	0 %	50 %	25 %	241195494
543	NC_012815	TGA	2	6	27815	27820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195494
544	NC_012815	CT	3	6	27916	27921	0 %	50 %	0 %	50 %	241195494
545	NC_012815	CGA	2	6	27924	27929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195494
546	NC_012815	CTG	2	6	27931	27936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195494
547	NC_012815	GTC	3	9	27946	27954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195494
548	NC_012815	CG	3	6	28039	28044	0 %	0 %	50 %	50 %	241195494
549	NC_012815	ACG	2	6	28476	28481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195495
550	NC_012815	TGA	2	6	28500	28505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195495
551	NC_012815	TCG	2	6	28506	28511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195495
552	NC_012815	CAA	2	6	28534	28539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241195495
553	NC_012815	CG	3	6	28577	28582	0 %	0 %	50 %	50 %	241195495
554	NC_012815	GTCG	2	8	28651	28658	0 %	25 %	50 %	25 %	241195495
555	NC_012815	GC	3	6	28664	28669	0 %	0 %	50 %	50 %	241195495
556	NC_012815	GAA	2	6	28741	28746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195495
557	NC_012815	TGA	2	6	28809	28814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195495
558	NC_012815	GCG	2	6	28821	28826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195495
559	NC_012815	GCCGAG	2	12	29024	29035	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	241195495
560	NC_012815	TA	5	10	29303	29312	50 %	50 %	0 %	0 %	241195496
561	NC_012815	GGCGAT	2	12	29390	29401	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241195496
562	NC_012815	GCAG	2	8	29438	29445	25 %	0 %	50 %	25 %	241195496
563	NC_012815	CAT	2	6	29523	29528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195496
564	NC_012815	TTC	2	6	29530	29535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195496
565	NC_012815	AATC	2	8	29572	29579	50 %	25 %	0 %	25 %	241195496
566	NC_012815	AGC	2	6	29788	29793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195496
567	NC_012815	AGC	2	6	29859	29864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195496
568	NC_012815	CGA	2	6	29918	29923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195496
569	NC_012815	CGT	2	6	29939	29944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195496
570	NC_012815	GACT	2	8	29949	29956	25 %	25 %	25 %	25 %	241195496
571	NC_012815	CGG	2	6	30727	30732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195497
572	NC_012815	GGT	2	6	30734	30739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195497
573	NC_012815	GGT	2	6	30833	30838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195497
574	NC_012815	CGACAT	2	12	30851	30862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241195497
575	NC_012815	GGC	2	6	31122	31127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195498
576	NC_012815	ATC	2	6	31150	31155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195498
577	NC_012815	TGG	2	6	31160	31165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195498
578	NC_012815	GCG	2	6	31248	31253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195498
579	NC_012815	ATC	2	6	31574	31579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195499
580	NC_012815	GC	3	6	31612	31617	0 %	0 %	50 %	50 %	241195499
581	NC_012815	GGT	2	6	31698	31703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195499
582	NC_012815	ACG	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195499
583	NC_012815	GA	3	6	31808	31813	50 %	0 %	50 %	0 %	241195499
584	NC_012815	TAG	2	6	31822	31827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195499
585	NC_012815	GCTT	2	8	31989	31996	0 %	50 %	25 %	25 %	241195500
586	NC_012815	TGC	2	6	32030	32035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195500
587	NC_012815	GAT	2	6	32037	32042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195500
588	NC_012815	TCG	2	6	32044	32049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195500
589	NC_012815	ATC	2	6	32089	32094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241195500
590	NC_012815	CTC	2	6	32106	32111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195500
591	NC_012815	TCG	2	6	32143	32148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195500
592	NC_012815	AGC	2	6	32167	32172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195500
593	NC_012815	TTG	2	6	32223	32228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195500
594	NC_012815	TGG	2	6	32251	32256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195500
595	NC_012815	AGTATG	2	12	32319	32330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195501
596	NC_012815	CGT	2	6	32338	32343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195501
597	NC_012815	GCA	2	6	32347	32352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195501
598	NC_012815	GAG	2	6	32394	32399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241195501
599	NC_012815	CTG	2	6	32443	32448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195501
600	NC_012815	GGT	2	6	32453	32458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195501
601	NC_012815	AG	3	6	32472	32477	50 %	0 %	50 %	0 %	241195501
602	NC_012815	GCA	2	6	32603	32608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195501
603	NC_012815	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	241195502
604	NC_012815	GGC	2	6	32741	32746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241195502
605	NC_012815	CTT	2	6	32754	32759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195502
606	NC_012815	A	7	7	32816	32822	100 %	0 %	0 %	0 %	241195502
607	NC_012815	ATT	2	6	32830	32835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241195502
608	NC_012815	TA	3	6	32848	32853	50 %	50 %	0 %	0 %	241195502
609	NC_012815	TGC	2	6	32899	32904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195502
610	NC_012815	TTTC	2	8	32914	32921	0 %	75 %	0 %	25 %	241195502
611	NC_012815	TGT	3	9	32948	32956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241195502
612	NC_012815	GGGAA	2	10	32962	32971	40 %	0 %	60 %	0 %	241195502
613	NC_012815	TG	4	8	33004	33011	0 %	50 %	50 %	0 %	241195502
614	NC_012815	ATT	2	6	33102	33107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241195502
615	NC_012815	TAT	2	6	33111	33116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241195502
616	NC_012815	A	7	7	33145	33151	100 %	0 %	0 %	0 %	241195502
617	NC_012815	ATTT	2	8	33195	33202	25 %	75 %	0 %	0 %	241195502
618	NC_012815	ACGA	2	8	33211	33218	50 %	0 %	25 %	25 %	241195502
619	NC_012815	CGA	2	6	33334	33339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241195502
620	NC_012815	CTTG	2	8	33368	33375	0 %	50 %	25 %	25 %	241195502
621	NC_012815	TTTA	2	8	33384	33391	25 %	75 %	0 %	0 %	241195502
622	NC_012815	A	6	6	33416	33421	100 %	0 %	0 %	0 %	241195502
623	NC_012815	GAA	2	6	33423	33428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241195502
624	NC_012815	CTT	2	6	33447	33452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241195502
625	NC_012815	ATA	2	6	33511	33516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241195502
626	NC_012815	T	6	6	33537	33542	0 %	100 %	0 %	0 %	241195502
627	NC_012815	CGT	2	6	33630	33635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195502
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753	NC_012815	GAT	2	6	42326	42331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195508
754	NC_012815	CCA	2	6	42468	42473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241195508
755	NC_012815	GAT	2	6	42531	42536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195508
756	NC_012815	CGT	2	6	42987	42992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241195509
757	NC_012815	GAT	2	6	43000	43005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195509
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771	NC_012815	TTTG	2	8	44880	44887	0 %	75 %	25 %	0 %	241195512
772	NC_012815	CCT	2	6	44934	44939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241195512
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776	NC_012815	GC	3	6	45366	45371	0 %	0 %	50 %	50 %	241195514
777	NC_012815	GAT	2	6	45436	45441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195514
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780	NC_012815	ATG	2	6	45567	45572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241195515
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782	NC_012815	TGG	2	6	45682	45687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241195515
783	NC_012815	GGAT	2	8	45700	45707	25 %	25 %	50 %	0 %	241195515
784	NC_012815	TC	3	6	45739	45744	0 %	50 %	0 %	50 %	241195515
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877	NC_012815	GCCCG	2	10	49960	49969	0 %	0 %	40 %	60 %	241195519
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1000	NC_012815	CTCG	2	8	58032	58039	0 %	25 %	25 %	50 %	241195524

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