MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012725	CGAT	2	8	830	837	25 %	25 %	25 %	25 %	238028979
2	NC_012725	AGCG	2	8	1156	1163	25 %	0 %	50 %	25 %	238028979
3	NC_012725	CGAT	2	8	1219	1226	25 %	25 %	25 %	25 %	238028979
4	NC_012725	GCTG	2	8	1748	1755	0 %	25 %	50 %	25 %	238028979
5	NC_012725	CCGA	2	8	2999	3006	25 %	0 %	25 %	50 %	238028980
6	NC_012725	ACCA	2	8	3210	3217	50 %	0 %	0 %	50 %	238028980
7	NC_012725	CAGG	2	8	3540	3547	25 %	0 %	50 %	25 %	238028980
8	NC_012725	CGAT	2	8	3658	3665	25 %	25 %	25 %	25 %	238028980
9	NC_012725	CGGT	2	8	4087	4094	0 %	25 %	50 %	25 %	238028981
10	NC_012725	CCAC	2	8	4423	4430	25 %	0 %	0 %	75 %	238028981
11	NC_012725	CCGG	2	8	5193	5200	0 %	0 %	50 %	50 %	238028982
12	NC_012725	GCTG	2	8	6737	6744	0 %	25 %	50 %	25 %	238028983
13	NC_012725	TTTC	2	8	6788	6795	0 %	75 %	0 %	25 %	238028983
14	NC_012725	CGGC	2	8	7128	7135	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
15	NC_012725	GGCC	2	8	7196	7203	0 %	0 %	50 %	50 %	238028983
16	NC_012725	GCAC	2	8	7297	7304	25 %	0 %	25 %	50 %	238028983
17	NC_012725	CGGC	2	8	8295	8302	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
18	NC_012725	GGTC	2	8	8823	8830	0 %	25 %	50 %	25 %	238028984
19	NC_012725	GCCG	2	8	8854	8861	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
20	NC_012725	TGCC	2	8	8904	8911	0 %	25 %	25 %	50 %	238028984
21	NC_012725	AGGC	2	8	8933	8940	25 %	0 %	50 %	25 %	238028984
22	NC_012725	CGGC	2	8	9303	9310	0 %	0 %	50 %	50 %	238028984
23	NC_012725	GCGA	2	8	9541	9548	25 %	0 %	50 %	25 %	238028985
24	NC_012725	GTTG	2	8	9779	9786	0 %	50 %	50 %	0 %	238028985
25	NC_012725	CTGC	2	8	10151	10158	0 %	25 %	25 %	50 %	238028986
26	NC_012725	GCCG	2	8	10514	10521	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
27	NC_012725	GGGC	2	8	10654	10661	0 %	0 %	75 %	25 %	238028987
28	NC_012725	GAGG	2	8	10666	10673	25 %	0 %	75 %	0 %	238028987
29	NC_012725	GCTC	2	8	10986	10993	0 %	25 %	25 %	50 %	238028987
30	NC_012725	TGGT	2	8	11193	11200	0 %	50 %	50 %	0 %	238028987
31	NC_012725	GCCG	2	8	11237	11244	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
32	NC_012725	GCCG	2	8	11549	11556	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
33	NC_012725	GGCC	2	8	11563	11570	0 %	0 %	50 %	50 %	238028987
34	NC_012725	TGGT	2	8	11586	11593	0 %	50 %	50 %	0 %	238028987
35	NC_012725	CGCT	2	8	11911	11918	0 %	25 %	25 %	50 %	238028987
36	NC_012725	GGCG	2	8	13468	13475	0 %	0 %	75 %	25 %	238028987
37	NC_012725	TGGC	2	8	13867	13874	0 %	25 %	50 %	25 %	238028987
38	NC_012725	GCGA	2	8	14685	14692	25 %	0 %	50 %	25 %	238028987
39	NC_012725	TGCC	2	8	15662	15669	0 %	25 %	25 %	50 %	238028988
40	NC_012725	AGGT	2	8	16161	16168	25 %	25 %	50 %	0 %	238028989
41	NC_012725	TCGA	2	8	18213	18220	25 %	25 %	25 %	25 %	238028993
42	NC_012725	CAGA	2	8	18559	18566	50 %	0 %	25 %	25 %	238028993
43	NC_012725	CCGC	2	8	18568	18575	0 %	0 %	25 %	75 %	238028993
44	NC_012725	CCGG	2	8	18727	18734	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
45	NC_012725	ACCG	2	8	19020	19027	25 %	0 %	25 %	50 %	238028993
46	NC_012725	CACG	2	8	19504	19511	25 %	0 %	25 %	50 %	238028993
47	NC_012725	CTTC	2	8	19861	19868	0 %	50 %	0 %	50 %	238028993
48	NC_012725	GCCC	2	8	20009	20016	0 %	0 %	25 %	75 %	238028993
49	NC_012725	GCCG	2	8	20021	20028	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
50	NC_012725	GGCC	2	8	20041	20048	0 %	0 %	50 %	50 %	238028993
51	NC_012725	GCTG	2	8	20074	20081	0 %	25 %	50 %	25 %	238028993
52	NC_012725	GGCA	2	8	20535	20542	25 %	0 %	50 %	25 %	238028994
53	NC_012725	GACG	2	8	21135	21142	25 %	0 %	50 %	25 %	238028995
54	NC_012725	CTTT	2	8	21510	21517	0 %	75 %	0 %	25 %	238028996
55	NC_012725	CGGC	2	8	21578	21585	0 %	0 %	50 %	50 %	238028996
56	NC_012725	AGCG	2	8	21628	21635	25 %	0 %	50 %	25 %	238028996
57	NC_012725	GCCG	2	8	22234	22241	0 %	0 %	50 %	50 %	238028997
58	NC_012725	GCCT	2	8	24166	24173	0 %	25 %	25 %	50 %	238028997
59	NC_012725	CGGG	2	8	24485	24492	0 %	0 %	75 %	25 %	238028997
60	NC_012725	GTTG	2	8	24778	24785	0 %	50 %	50 %	0 %	238028997
61	NC_012725	CAGG	2	8	25775	25782	25 %	0 %	50 %	25 %	238028998
62	NC_012725	CAGC	2	8	25820	25827	25 %	0 %	25 %	50 %	238028998
63	NC_012725	CGTC	2	8	26267	26274	0 %	25 %	25 %	50 %	238028998
64	NC_012725	GCCA	2	8	27454	27461	25 %	0 %	25 %	50 %	238028999
65	NC_012725	GATA	2	8	27640	27647	50 %	25 %	25 %	0 %	238028999
66	NC_012725	CGTG	2	8	27809	27816	0 %	25 %	50 %	25 %	238028999
67	NC_012725	CAGC	2	8	27829	27836	25 %	0 %	25 %	50 %	238028999
68	NC_012725	TCGG	2	8	28391	28398	0 %	25 %	50 %	25 %	238029000
69	NC_012725	GCGA	2	8	29612	29619	25 %	0 %	50 %	25 %	238029001
70	NC_012725	GCCG	2	8	30834	30841	0 %	0 %	50 %	50 %	238029002
71	NC_012725	TGAT	2	8	31029	31036	25 %	50 %	25 %	0 %	238029003
72	NC_012725	GCCA	2	8	31298	31305	25 %	0 %	25 %	50 %	238029003
73	NC_012725	GCAC	2	8	32178	32185	25 %	0 %	25 %	50 %	238029003
74	NC_012725	CGCC	2	8	32911	32918	0 %	0 %	25 %	75 %	238029004
75	NC_012725	GCAG	2	8	34638	34645	25 %	0 %	50 %	25 %	238029006
76	NC_012725	CGGC	2	8	35095	35102	0 %	0 %	50 %	50 %	238029007
77	NC_012725	GTTG	2	8	35119	35126	0 %	50 %	50 %	0 %	238029007
78	NC_012725	GCTG	2	8	35131	35138	0 %	25 %	50 %	25 %	238029007
79	NC_012725	CGGC	2	8	35491	35498	0 %	0 %	50 %	50 %	238029007
80	NC_012725	ACCG	2	8	35701	35708	25 %	0 %	25 %	50 %	238029007
81	NC_012725	GTGC	2	8	35709	35716	0 %	25 %	50 %	25 %	238029007
82	NC_012725	TCGG	2	8	35863	35870	0 %	25 %	50 %	25 %	238029008
83	NC_012725	GCCA	2	8	35883	35890	25 %	0 %	25 %	50 %	238029008
84	NC_012725	GCAC	2	8	36059	36066	25 %	0 %	25 %	50 %	238029008
85	NC_012725	GTCC	2	8	37229	37236	0 %	25 %	25 %	50 %	238029010
86	NC_012725	TCGG	2	8	37473	37480	0 %	25 %	50 %	25 %	238029010
87	NC_012725	TAGT	2	8	37727	37734	25 %	50 %	25 %	0 %	238029010
88	NC_012725	ACCA	2	8	38611	38618	50 %	0 %	0 %	50 %	238029010
89	NC_012725	CGGT	2	8	39090	39097	0 %	25 %	50 %	25 %	238029010
90	NC_012725	CCAC	2	8	39174	39181	25 %	0 %	0 %	75 %	238029010
91	NC_012725	GATC	2	8	39187	39194	25 %	25 %	25 %	25 %	238029010
92	NC_012725	GGCG	2	8	39302	39309	0 %	0 %	75 %	25 %	238029011
93	NC_012725	GCGG	2	8	40088	40095	0 %	0 %	75 %	25 %	238029012
94	NC_012725	GGCC	2	8	40107	40114	0 %	0 %	50 %	50 %	238029012
95	NC_012725	GTGG	2	8	40236	40243	0 %	25 %	75 %	0 %	238029012
96	NC_012725	GGCG	2	8	40558	40565	0 %	0 %	75 %	25 %	238029012
97	NC_012725	GACG	2	8	41110	41117	25 %	0 %	50 %	25 %	238029013
98	NC_012725	GCCG	2	8	41223	41230	0 %	0 %	50 %	50 %	238029013
99	NC_012725	TCGA	2	8	41482	41489	25 %	25 %	25 %	25 %	238029013
100	NC_012725	GTCG	2	8	41988	41995	0 %	25 %	50 %	25 %	238029013
101	NC_012725	CGGT	2	8	42417	42424	0 %	25 %	50 %	25 %	238029014
102	NC_012725	CGTG	2	8	42511	42518	0 %	25 %	50 %	25 %	238029014
103	NC_012725	CGAA	2	8	42822	42829	50 %	0 %	25 %	25 %	238029014
104	NC_012725	CTCC	2	8	43564	43571	0 %	25 %	0 %	75 %	238029015
105	NC_012725	CGCT	2	8	43668	43675	0 %	25 %	25 %	50 %	238029015
106	NC_012725	CGGT	2	8	43804	43811	0 %	25 %	50 %	25 %	238029015
107	NC_012725	GCTT	2	8	43908	43915	0 %	50 %	25 %	25 %	238029015
108	NC_012725	GTCA	2	8	44504	44511	25 %	25 %	25 %	25 %	238029015
109	NC_012725	CTCG	2	8	44519	44526	0 %	25 %	25 %	50 %	238029016
110	NC_012725	GACG	2	8	44742	44749	25 %	0 %	50 %	25 %	238029016
111	NC_012725	GGCG	2	8	44853	44860	0 %	0 %	75 %	25 %	238029016
112	NC_012725	CGGC	2	8	44879	44886	0 %	0 %	50 %	50 %	238029016
113	NC_012725	CGGT	2	8	45032	45039	0 %	25 %	50 %	25 %	238029016
114	NC_012725	GCCG	2	8	45056	45063	0 %	0 %	50 %	50 %	238029016
115	NC_012725	CGGC	2	8	45694	45701	0 %	0 %	50 %	50 %	238029017
116	NC_012725	GCCG	2	8	45908	45915	0 %	0 %	50 %	50 %	238029018
117	NC_012725	CGAT	2	8	46058	46065	25 %	25 %	25 %	25 %	238029018
118	NC_012725	TGCG	2	8	46854	46861	0 %	25 %	50 %	25 %	238029020
119	NC_012725	GATG	2	8	47387	47394	25 %	25 %	50 %	0 %	238029021
120	NC_012725	TGCG	2	8	49982	49989	0 %	25 %	50 %	25 %	238029023
121	NC_012725	GGGC	2	8	50048	50055	0 %	0 %	75 %	25 %	238029023
122	NC_012725	CGCT	2	8	51739	51746	0 %	25 %	25 %	50 %	238029024
123	NC_012725	GGCC	2	8	53232	53239	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
124	NC_012725	GGAA	2	8	53336	53343	50 %	0 %	50 %	0 %	238029025
125	NC_012725	GCCG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
126	NC_012725	GGCT	2	8	53491	53498	0 %	25 %	50 %	25 %	238029025
127	NC_012725	CCGA	2	8	53614	53621	25 %	0 %	25 %	50 %	238029025
128	NC_012725	ACCG	2	8	54352	54359	25 %	0 %	25 %	50 %	238029025
129	NC_012725	TGCG	2	8	54412	54419	0 %	25 %	50 %	25 %	238029025
130	NC_012725	CGAT	2	8	54740	54747	25 %	25 %	25 %	25 %	238029025
131	NC_012725	CGGC	3	12	54971	54982	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
132	NC_012725	CGGC	2	8	55001	55008	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
133	NC_012725	GCCG	2	8	55062	55069	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
134	NC_012725	CGGG	2	8	55157	55164	0 %	0 %	75 %	25 %	238029025
135	NC_012725	CCGG	2	8	55282	55289	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
136	NC_012725	TCGA	2	8	55366	55373	25 %	25 %	25 %	25 %	238029025
137	NC_012725	GGAC	2	8	55381	55388	25 %	0 %	50 %	25 %	238029025
138	NC_012725	CCGG	2	8	55801	55808	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.