MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_4p

Total Repeats: 2414

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012725	GCA	2	6	47158	47163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029021
1002	NC_012725	AGC	2	6	47255	47260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029021
1003	NC_012725	TGC	2	6	47285	47290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029021
1004	NC_012725	GATG	2	8	47387	47394	25 %	25 %	50 %	0 %	238029021
1005	NC_012725	GCC	2	6	47407	47412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029021
1006	NC_012725	C	6	6	47411	47416	0 %	0 %	0 %	100 %	238029021
1007	NC_012725	CCGACG	2	12	47555	47566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	238029021
1008	NC_012725	TGC	2	6	47570	47575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029021
1009	NC_012725	GCG	2	6	47584	47589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029021
1010	NC_012725	CGA	2	6	47594	47599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029021
1011	NC_012725	CGA	2	6	47603	47608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029021
1012	NC_012725	CCA	2	6	47615	47620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238029021
1013	NC_012725	GCC	2	6	48695	48700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029022
1014	NC_012725	TCG	2	6	48759	48764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029022
1015	NC_012725	CGCCA	2	10	48776	48785	20 %	0 %	20 %	60 %	238029022
1016	NC_012725	CCA	2	6	48788	48793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238029022
1017	NC_012725	A	6	6	48821	48826	100 %	0 %	0 %	0 %	238029022
1018	NC_012725	CTT	2	6	48877	48882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238029022
1019	NC_012725	AGT	2	6	49023	49028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238029022
1020	NC_012725	CGA	2	6	49083	49088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029022
1021	NC_012725	TGC	2	6	49757	49762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1022	NC_012725	CG	3	6	49802	49807	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
1023	NC_012725	GGC	2	6	49913	49918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029023
1024	NC_012725	TGCG	2	8	49982	49989	0 %	25 %	50 %	25 %	238029023
1025	NC_012725	TCG	2	6	50026	50031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1026	NC_012725	GC	3	6	50037	50042	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
1027	NC_012725	GGGC	2	8	50048	50055	0 %	0 %	75 %	25 %	238029023
1028	NC_012725	CG	4	8	50082	50089	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
1029	NC_012725	CAC	2	6	50103	50108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238029023
1030	NC_012725	ACG	2	6	50167	50172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1031	NC_012725	TGC	2	6	50182	50187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1032	NC_012725	CGT	2	6	50249	50254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1033	NC_012725	TCG	2	6	50288	50293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1034	NC_012725	CG	3	6	50292	50297	0 %	0 %	50 %	50 %	238029023
1035	NC_012725	GCT	2	6	50473	50478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029023
1036	NC_012725	ACG	2	6	51580	51585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029024
1037	NC_012725	TCG	2	6	51608	51613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029024
1038	NC_012725	CCG	3	9	51638	51646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029024
1039	NC_012725	AGA	2	6	51682	51687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238029024
1040	NC_012725	CGCT	2	8	51739	51746	0 %	25 %	25 %	50 %	238029024
1041	NC_012725	TTA	2	6	51953	51958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238029024
1042	NC_012725	ATG	2	6	52012	52017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238029024
1043	NC_012725	CCGTA	2	10	52172	52181	20 %	20 %	20 %	40 %	238029024
1044	NC_012725	GCA	2	6	52232	52237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029024
1045	NC_012725	TGG	2	6	52363	52368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238029024
1046	NC_012725	T	6	6	52423	52428	0 %	100 %	0 %	0 %	238029024
1047	NC_012725	CGA	2	6	52662	52667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1048	NC_012725	CG	3	6	52767	52772	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1049	NC_012725	CG	3	6	52828	52833	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1050	NC_012725	GCT	2	6	52962	52967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1051	NC_012725	GAA	2	6	52983	52988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238029025
1052	NC_012725	CAT	2	6	53034	53039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238029025
1053	NC_012725	TCG	2	6	53048	53053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1054	NC_012725	GC	3	6	53065	53070	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1055	NC_012725	GCC	3	9	53134	53142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029025
1056	NC_012725	TGA	2	6	53159	53164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238029025
1057	NC_012725	CGG	2	6	53192	53197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029025
1058	NC_012725	GGCC	2	8	53232	53239	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1059	NC_012725	GC	3	6	53303	53308	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1060	NC_012725	ACG	2	6	53315	53320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1061	NC_012725	GGT	2	6	53328	53333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238029025
1062	NC_012725	GGAA	2	8	53336	53343	50 %	0 %	50 %	0 %	238029025
1063	NC_012725	CGG	2	6	53425	53430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029025
1064	NC_012725	GCCG	2	8	53436	53443	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1065	NC_012725	GGCT	2	8	53491	53498	0 %	25 %	50 %	25 %	238029025
1066	NC_012725	GAG	2	6	53593	53598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238029025
1067	NC_012725	CCGA	2	8	53614	53621	25 %	0 %	25 %	50 %	238029025
1068	NC_012725	TGC	2	6	53665	53670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1069	NC_012725	CCA	2	6	53699	53704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238029025
1070	NC_012725	CGA	2	6	53736	53741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1071	NC_012725	T	6	6	53812	53817	0 %	100 %	0 %	0 %	238029025
1072	NC_012725	ACG	2	6	53825	53830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1073	NC_012725	CGA	2	6	53891	53896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1074	NC_012725	ACG	2	6	53909	53914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1075	NC_012725	CTG	2	6	53941	53946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1076	NC_012725	GCG	2	6	53954	53959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029025
1077	NC_012725	ACG	2	6	53963	53968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1078	NC_012725	CTG	2	6	53989	53994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1079	NC_012725	CGA	2	6	54000	54005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1080	NC_012725	TCA	2	6	54083	54088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238029025
1081	NC_012725	ACG	2	6	54182	54187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1082	NC_012725	CG	4	8	54186	54193	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1083	NC_012725	TCG	2	6	54200	54205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1084	NC_012725	ACG	2	6	54218	54223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1085	NC_012725	CAC	2	6	54331	54336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238029025
1086	NC_012725	CTG	2	6	54337	54342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1087	NC_012725	ACCG	2	8	54352	54359	25 %	0 %	25 %	50 %	238029025
1088	NC_012725	GGGAC	2	10	54386	54395	20 %	0 %	60 %	20 %	238029025
1089	NC_012725	GC	3	6	54406	54411	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1090	NC_012725	TGCG	2	8	54412	54419	0 %	25 %	50 %	25 %	238029025
1091	NC_012725	GAC	2	6	54430	54435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1092	NC_012725	CGA	2	6	54441	54446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1093	NC_012725	ACT	2	6	54518	54523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238029025
1094	NC_012725	CGG	2	6	54627	54632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029025
1095	NC_012725	TTC	2	6	54640	54645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238029025
1096	NC_012725	ACG	2	6	54650	54655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1097	NC_012725	TCA	2	6	54675	54680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238029025
1098	NC_012725	GGT	2	6	54696	54701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238029025
1099	NC_012725	CGAT	2	8	54740	54747	25 %	25 %	25 %	25 %	238029025
1100	NC_012725	ACG	2	6	54776	54781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1101	NC_012725	CCG	2	6	54782	54787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029025
1102	NC_012725	CGT	2	6	54792	54797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1103	NC_012725	GA	3	6	54804	54809	50 %	0 %	50 %	0 %	238029025
1104	NC_012725	GAA	2	6	54885	54890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238029025
1105	NC_012725	ACG	2	6	54902	54907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1106	NC_012725	GCC	2	6	54914	54919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029025
1107	NC_012725	GAC	2	6	54948	54953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1108	NC_012725	CGGC	3	12	54971	54982	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1109	NC_012725	CGGC	2	8	55001	55008	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1110	NC_012725	GGA	2	6	55047	55052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238029025
1111	NC_012725	GCCG	2	8	55062	55069	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1112	NC_012725	ACG	2	6	55088	55093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1113	NC_012725	ACG	2	6	55151	55156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029025
1114	NC_012725	CGGG	2	8	55157	55164	0 %	0 %	75 %	25 %	238029025
1115	NC_012725	TCA	2	6	55169	55174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238029025
1116	NC_012725	GCC	2	6	55258	55263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029025
1117	NC_012725	CCGG	2	8	55282	55289	0 %	0 %	50 %	50 %	238029025
1118	NC_012725	GAG	2	6	55300	55305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238029025
1119	NC_012725	GCC	2	6	55355	55360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238029025
1120	NC_012725	TCGA	2	8	55366	55373	25 %	25 %	25 %	25 %	238029025
1121	NC_012725	GGAC	2	8	55381	55388	25 %	0 %	50 %	25 %	238029025
1122	NC_012725	GCG	2	6	55436	55441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238029025
1123	NC_012725	AAG	2	6	55442	55447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238029025
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1125	NC_012725	CTT	2	6	55518	55523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238029025
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1252	NC_012725	GCA	2	6	60690	60695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029029
1253	NC_012725	CCTG	2	8	60708	60715	0 %	25 %	25 %	50 %	238029029
1254	NC_012725	GCT	2	6	60717	60722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238029029
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1293	NC_012725	CGA	2	6	62364	62369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238029030
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1367	NC_012725	CGGCA	2	10	68083	68092	20 %	0 %	40 %	40 %	238029033
1368	NC_012725	TGG	2	6	68145	68150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238029033
1369	NC_012725	TGCGG	2	10	68210	68219	0 %	20 %	60 %	20 %	339717963
1370	NC_012725	CGGC	2	8	68221	68228	0 %	0 %	50 %	50 %	339717963
1371	NC_012725	TCG	3	9	68260	68268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339717963
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