MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Burkholderia glumae BGR1 plasmid bglu_1p

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012723	GC	3	6	361	366	0 %	0 %	50 %	50 %	238025582
2	NC_012723	AG	3	6	628	633	50 %	0 %	50 %	0 %	238025582
3	NC_012723	GA	3	6	1119	1124	50 %	0 %	50 %	0 %	238025583
4	NC_012723	CT	4	8	1424	1431	0 %	50 %	0 %	50 %	238025583
5	NC_012723	CG	3	6	1590	1595	0 %	0 %	50 %	50 %	238025583
6	NC_012723	CG	3	6	2624	2629	0 %	0 %	50 %	50 %	238025584
7	NC_012723	GT	3	6	2827	2832	0 %	50 %	50 %	0 %	238025584
8	NC_012723	CG	3	6	3225	3230	0 %	0 %	50 %	50 %	238025584
9	NC_012723	CG	4	8	4147	4154	0 %	0 %	50 %	50 %	238025585
10	NC_012723	GC	3	6	4240	4245	0 %	0 %	50 %	50 %	238025585
11	NC_012723	CG	3	6	4252	4257	0 %	0 %	50 %	50 %	238025585
12	NC_012723	AG	3	6	5383	5388	50 %	0 %	50 %	0 %	238025586
13	NC_012723	CG	3	6	5409	5414	0 %	0 %	50 %	50 %	238025586
14	NC_012723	CG	3	6	5596	5601	0 %	0 %	50 %	50 %	238025586
15	NC_012723	GC	4	8	5732	5739	0 %	0 %	50 %	50 %	238025586
16	NC_012723	GC	3	6	6296	6301	0 %	0 %	50 %	50 %	238025587
17	NC_012723	GC	3	6	7716	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	238025589
18	NC_012723	CG	4	8	9164	9171	0 %	0 %	50 %	50 %	238025590
19	NC_012723	GC	3	6	9734	9739	0 %	0 %	50 %	50 %	238025590
20	NC_012723	GC	3	6	9923	9928	0 %	0 %	50 %	50 %	238025591
21	NC_012723	GC	3	6	10415	10420	0 %	0 %	50 %	50 %	238025592
22	NC_012723	AC	3	6	11948	11953	50 %	0 %	0 %	50 %	238025593
23	NC_012723	CG	3	6	12005	12010	0 %	0 %	50 %	50 %	238025594
24	NC_012723	CG	3	6	12165	12170	0 %	0 %	50 %	50 %	238025594
25	NC_012723	CG	3	6	12354	12359	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
26	NC_012723	CG	3	6	12483	12488	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
27	NC_012723	CG	4	8	12611	12618	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
28	NC_012723	GC	3	6	12737	12742	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
29	NC_012723	CG	3	6	12872	12877	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
30	NC_012723	CG	3	6	12926	12931	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
31	NC_012723	GC	3	6	12952	12957	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
32	NC_012723	GC	6	12	13047	13058	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
33	NC_012723	GC	3	6	13065	13070	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
34	NC_012723	GC	3	6	13156	13161	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
35	NC_012723	CG	3	6	13211	13216	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
36	NC_012723	GC	4	8	13281	13288	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
37	NC_012723	CG	3	6	13491	13496	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
38	NC_012723	GC	3	6	13508	13513	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
39	NC_012723	GC	3	6	13726	13731	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
40	NC_012723	GC	4	8	13733	13740	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
41	NC_012723	GC	3	6	13810	13815	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
42	NC_012723	CG	5	10	13886	13895	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
43	NC_012723	CG	3	6	14007	14012	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
44	NC_012723	GC	3	6	14114	14119	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
45	NC_012723	GC	3	6	14234	14239	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
46	NC_012723	GC	3	6	14469	14474	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
47	NC_012723	CG	3	6	14475	14480	0 %	0 %	50 %	50 %	238025595
48	NC_012723	GT	3	6	21168	21173	0 %	50 %	50 %	0 %	238025599
49	NC_012723	GT	3	6	21387	21392	0 %	50 %	50 %	0 %	238025599
50	NC_012723	GT	3	6	21606	21611	0 %	50 %	50 %	0 %	238025599
51	NC_012723	TG	3	6	22531	22536	0 %	50 %	50 %	0 %	238025599
52	NC_012723	CG	4	8	23770	23777	0 %	0 %	50 %	50 %	238025600
53	NC_012723	GA	3	6	25435	25440	50 %	0 %	50 %	0 %	238025600
54	NC_012723	GC	3	6	25462	25467	0 %	0 %	50 %	50 %	238025600
55	NC_012723	CG	3	6	25914	25919	0 %	0 %	50 %	50 %	238025601
56	NC_012723	GC	3	6	26332	26337	0 %	0 %	50 %	50 %	238025601
57	NC_012723	CG	3	6	26378	26383	0 %	0 %	50 %	50 %	238025601
58	NC_012723	TG	3	6	27309	27314	0 %	50 %	50 %	0 %	238025602
59	NC_012723	CG	5	10	27562	27571	0 %	0 %	50 %	50 %	238025602
60	NC_012723	TC	3	6	28209	28214	0 %	50 %	0 %	50 %	238025602
61	NC_012723	GC	3	6	28628	28633	0 %	0 %	50 %	50 %	238025602
62	NC_012723	GC	3	6	30675	30680	0 %	0 %	50 %	50 %	238025603
63	NC_012723	GC	3	6	30716	30721	0 %	0 %	50 %	50 %	238025603
64	NC_012723	CG	3	6	31297	31302	0 %	0 %	50 %	50 %	238025603
65	NC_012723	CG	3	6	31507	31512	0 %	0 %	50 %	50 %	238025603
66	NC_012723	CG	4	8	31588	31595	0 %	0 %	50 %	50 %	238025603
67	NC_012723	GC	3	6	31658	31663	0 %	0 %	50 %	50 %	238025603
68	NC_012723	CG	3	6	31867	31872	0 %	0 %	50 %	50 %	238025604
69	NC_012723	CG	3	6	32526	32531	0 %	0 %	50 %	50 %	238025605
70	NC_012723	GA	3	6	37983	37988	50 %	0 %	50 %	0 %	238025608
71	NC_012723	GC	3	6	38558	38563	0 %	0 %	50 %	50 %	238025609
72	NC_012723	CT	3	6	38573	38578	0 %	50 %	0 %	50 %	238025609
73	NC_012723	CG	3	6	39271	39276	0 %	0 %	50 %	50 %	238025610
74	NC_012723	CG	3	6	40079	40084	0 %	0 %	50 %	50 %	238025611
75	NC_012723	GA	3	6	40328	40333	50 %	0 %	50 %	0 %	238025611
76	NC_012723	GC	3	6	40810	40815	0 %	0 %	50 %	50 %	238025612
77	NC_012723	CG	3	6	41125	41130	0 %	0 %	50 %	50 %	238025613
78	NC_012723	GC	3	6	42371	42376	0 %	0 %	50 %	50 %	238025614
79	NC_012723	GT	3	6	42428	42433	0 %	50 %	50 %	0 %	238025615
80	NC_012723	GA	3	6	42999	43004	50 %	0 %	50 %	0 %	238025615
81	NC_012723	CG	3	6	44585	44590	0 %	0 %	50 %	50 %	238025616
82	NC_012723	GC	3	6	48465	48470	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
83	NC_012723	CG	5	10	48654	48663	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
84	NC_012723	GC	3	6	48680	48685	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
85	NC_012723	GC	6	12	48775	48786	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
86	NC_012723	GC	3	6	48793	48798	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
87	NC_012723	GC	3	6	48884	48889	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
88	NC_012723	CG	3	6	48939	48944	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
89	NC_012723	GC	4	8	49009	49016	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
90	NC_012723	GC	3	6	49236	49241	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
91	NC_012723	GC	3	6	49454	49459	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
92	NC_012723	GC	4	8	49461	49468	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
93	NC_012723	GC	3	6	49538	49543	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
94	NC_012723	CG	5	10	49614	49623	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
95	NC_012723	CG	3	6	49735	49740	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
96	NC_012723	GC	3	6	49842	49847	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
97	NC_012723	GC	3	6	49962	49967	0 %	0 %	50 %	50 %	238025621
98	NC_012723	CT	3	6	51041	51046	0 %	50 %	0 %	50 %	238025623
99	NC_012723	GC	3	6	51229	51234	0 %	0 %	50 %	50 %	238025623
100	NC_012723	CG	3	6	51251	51256	0 %	0 %	50 %	50 %	238025623
101	NC_012723	AC	3	6	51958	51963	50 %	0 %	0 %	50 %	238025624
102	NC_012723	GC	3	6	52206	52211	0 %	0 %	50 %	50 %	238025624
103	NC_012723	CG	3	6	53095	53100	0 %	0 %	50 %	50 %	238025625
104	NC_012723	CG	3	6	53431	53436	0 %	0 %	50 %	50 %	238025625
105	NC_012723	CG	5	10	53817	53826	0 %	0 %	50 %	50 %	238025625
106	NC_012723	CG	3	6	55196	55201	0 %	0 %	50 %	50 %	238025626
107	NC_012723	CG	3	6	55989	55994	0 %	0 %	50 %	50 %	238025627
108	NC_012723	GC	3	6	56224	56229	0 %	0 %	50 %	50 %	238025627
109	NC_012723	GC	3	6	56270	56275	0 %	0 %	50 %	50 %	238025627
110	NC_012723	CG	3	6	56479	56484	0 %	0 %	50 %	50 %	238025627
111	NC_012723	GC	3	6	57149	57154	0 %	0 %	50 %	50 %	238025628
112	NC_012723	GC	3	6	57349	57354	0 %	0 %	50 %	50 %	238025628
113	NC_012723	CG	5	10	59546	59555	0 %	0 %	50 %	50 %	238025629
114	NC_012723	CG	3	6	60073	60078	0 %	0 %	50 %	50 %	238025629
115	NC_012723	GC	3	6	60283	60288	0 %	0 %	50 %	50 %	238025629
116	NC_012723	GA	3	6	61910	61915	50 %	0 %	50 %	0 %	238025630
117	NC_012723	GC	3	6	62355	62360	0 %	0 %	50 %	50 %	238025630
118	NC_012723	CT	3	6	62447	62452	0 %	50 %	0 %	50 %	238025630
119	NC_012723	GT	4	8	63519	63526	0 %	50 %	50 %	0 %	238025631
120	NC_012723	GC	3	6	63650	63655	0 %	0 %	50 %	50 %	238025631
121	NC_012723	CG	4	8	64604	64611	0 %	0 %	50 %	50 %	238025631
122	NC_012723	GC	5	10	65037	65046	0 %	0 %	50 %	50 %	238025631
123	NC_012723	GC	3	6	65131	65136	0 %	0 %	50 %	50 %	238025631
124	NC_012723	CG	3	6	66814	66819	0 %	0 %	50 %	50 %	238025632
125	NC_012723	GC	3	6	67049	67054	0 %	0 %	50 %	50 %	238025632
126	NC_012723	CG	4	8	67094	67101	0 %	0 %	50 %	50 %	238025632
127	NC_012723	CG	3	6	67304	67309	0 %	0 %	50 %	50 %	238025632
128	NC_012723	TC	3	6	68429	68434	0 %	50 %	0 %	50 %	238025633
129	NC_012723	CA	3	6	68509	68514	50 %	0 %	0 %	50 %	238025633
130	NC_012723	GC	3	6	69002	69007	0 %	0 %	50 %	50 %	238025633
131	NC_012723	GC	3	6	69349	69354	0 %	0 %	50 %	50 %	238025633
132	NC_012723	CG	3	6	69364	69369	0 %	0 %	50 %	50 %	238025633
133	NC_012723	CG	3	6	69516	69521	0 %	0 %	50 %	50 %	238025633
134	NC_012723	CG	3	6	69593	69598	0 %	0 %	50 %	50 %	238025633
135	NC_012723	CG	3	6	70931	70936	0 %	0 %	50 %	50 %	238025634
136	NC_012723	CG	3	6	71590	71595	0 %	0 %	50 %	50 %	238025635
137	NC_012723	GC	3	6	71799	71804	0 %	0 %	50 %	50 %	238025636
138	NC_012723	CG	4	8	71867	71874	0 %	0 %	50 %	50 %	238025636
139	NC_012723	CG	3	6	71950	71955	0 %	0 %	50 %	50 %	238025636
140	NC_012723	CG	3	6	72160	72165	0 %	0 %	50 %	50 %	238025636
141	NC_012723	GC	3	6	72741	72746	0 %	0 %	50 %	50 %	238025636
142	NC_012723	GC	3	6	72782	72787	0 %	0 %	50 %	50 %	238025636
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.