MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Bacillus anthracis str. CDC 684 plasmid pX01

Total Repeats: 411

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012579	ACAA	2	8	463	470	75 %	0 %	0 %	25 %	227811428
2	NC_012579	AATG	2	8	566	573	50 %	25 %	25 %	0 %	227811428
3	NC_012579	TAAG	2	8	629	636	50 %	25 %	25 %	0 %	227811428
4	NC_012579	TTTC	2	8	1673	1680	0 %	75 %	0 %	25 %	227811431
5	NC_012579	AATT	2	8	1964	1971	50 %	50 %	0 %	0 %	227811431
6	NC_012579	TTTG	2	8	3454	3461	0 %	75 %	25 %	0 %	227811434
7	NC_012579	GAAA	2	8	3672	3679	75 %	0 %	25 %	0 %	227811434
8	NC_012579	TAAT	2	8	4075	4082	50 %	50 %	0 %	0 %	227811435
9	NC_012579	TGAT	2	8	4180	4187	25 %	50 %	25 %	0 %	227811435
10	NC_012579	TTCG	2	8	4218	4225	0 %	50 %	25 %	25 %	227811435
11	NC_012579	TTAC	2	8	4919	4926	25 %	50 %	0 %	25 %	227811436
12	NC_012579	AAAT	2	8	6085	6092	75 %	25 %	0 %	0 %	227811438
13	NC_012579	CTTT	2	8	6135	6142	0 %	75 %	0 %	25 %	227811438
14	NC_012579	AATT	2	8	6643	6650	50 %	50 %	0 %	0 %	227811438
15	NC_012579	TGGA	2	8	7404	7411	25 %	25 %	50 %	0 %	227811439
16	NC_012579	TTAT	2	8	7420	7427	25 %	75 %	0 %	0 %	227811439
17	NC_012579	TTGG	2	8	7650	7657	0 %	50 %	50 %	0 %	227811439
18	NC_012579	CATA	2	8	7808	7815	50 %	25 %	0 %	25 %	227811439
19	NC_012579	TTGA	2	8	8490	8497	25 %	50 %	25 %	0 %	227811439
20	NC_012579	TTCC	2	8	8640	8647	0 %	50 %	0 %	50 %	227811439
21	NC_012579	TATT	2	8	9309	9316	25 %	75 %	0 %	0 %	227811440
22	NC_012579	GCTT	2	8	9820	9827	0 %	50 %	25 %	25 %	227811440
23	NC_012579	TTGC	2	8	10424	10431	0 %	50 %	25 %	25 %	227811440
24	NC_012579	ATTT	2	8	10436	10443	25 %	75 %	0 %	0 %	227811440
25	NC_012579	CTTC	2	8	10697	10704	0 %	50 %	0 %	50 %	227811440
26	NC_012579	GGTT	2	8	10794	10801	0 %	50 %	50 %	0 %	227811440
27	NC_012579	TGTA	2	8	11126	11133	25 %	50 %	25 %	0 %	227811440
28	NC_012579	ATAG	2	8	11359	11366	50 %	25 %	25 %	0 %	227811440
29	NC_012579	ATTC	2	8	11375	11382	25 %	50 %	0 %	25 %	227811440
30	NC_012579	CTTT	2	8	11576	11583	0 %	75 %	0 %	25 %	227811440
31	NC_012579	CAAT	2	8	12163	12170	50 %	25 %	0 %	25 %	227811441
32	NC_012579	AAGT	2	8	12473	12480	50 %	25 %	25 %	0 %	227811442
33	NC_012579	GTTT	2	8	12583	12590	0 %	75 %	25 %	0 %	227811442
34	NC_012579	TAAA	2	8	12908	12915	75 %	25 %	0 %	0 %	227811442
35	NC_012579	AGCA	2	8	13198	13205	50 %	0 %	25 %	25 %	227811442
36	NC_012579	GCTC	2	8	13209	13216	0 %	25 %	25 %	50 %	227811442
37	NC_012579	GTTT	2	8	13490	13497	0 %	75 %	25 %	0 %	227811443
38	NC_012579	CTTA	2	8	15018	15025	25 %	50 %	0 %	25 %	227811445
39	NC_012579	AAAT	2	8	15417	15424	75 %	25 %	0 %	0 %	227811446
40	NC_012579	TCAC	2	8	15568	15575	25 %	25 %	0 %	50 %	227811446
41	NC_012579	TTAA	2	8	15697	15704	50 %	50 %	0 %	0 %	227811446
42	NC_012579	TATT	2	8	15811	15818	25 %	75 %	0 %	0 %	227811446
43	NC_012579	TTCC	2	8	15825	15832	0 %	50 %	0 %	50 %	227811446
44	NC_012579	ATTT	2	8	16295	16302	25 %	75 %	0 %	0 %	227811446
45	NC_012579	TTTA	2	8	16317	16324	25 %	75 %	0 %	0 %	227811446
46	NC_012579	CGAA	2	8	16909	16916	50 %	0 %	25 %	25 %	227811446
47	NC_012579	ATTA	2	8	17301	17308	50 %	50 %	0 %	0 %	227811446
48	NC_012579	TAAA	3	12	17354	17365	75 %	25 %	0 %	0 %	227811446
49	NC_012579	AGAA	2	8	18077	18084	75 %	0 %	25 %	0 %	227811446
50	NC_012579	CACT	2	8	18422	18429	25 %	25 %	0 %	50 %	227811446
51	NC_012579	ATAA	2	8	18670	18677	75 %	25 %	0 %	0 %	227811446
52	NC_012579	TAAC	2	8	18779	18786	50 %	25 %	0 %	25 %	227811446
53	NC_012579	ATTT	2	8	18905	18912	25 %	75 %	0 %	0 %	227811446
54	NC_012579	CATT	2	8	19013	19020	25 %	50 %	0 %	25 %	227811446
55	NC_012579	TTTC	2	8	19547	19554	0 %	75 %	0 %	25 %	227811447
56	NC_012579	ATGA	2	8	19988	19995	50 %	25 %	25 %	0 %	227811447
57	NC_012579	ATAA	2	8	20325	20332	75 %	25 %	0 %	0 %	227811447
58	NC_012579	ATTT	2	8	21026	21033	25 %	75 %	0 %	0 %	227811447
59	NC_012579	TAGC	2	8	21748	21755	25 %	25 %	25 %	25 %	227811449
60	NC_012579	ATAC	2	8	22677	22684	50 %	25 %	0 %	25 %	227811450
61	NC_012579	ACTC	2	8	23053	23060	25 %	25 %	0 %	50 %	227811450
62	NC_012579	CTTT	2	8	23130	23137	0 %	75 %	0 %	25 %	227811450
63	NC_012579	TTCA	2	8	23573	23580	25 %	50 %	0 %	25 %	227811450
64	NC_012579	TGCA	2	8	23874	23881	25 %	25 %	25 %	25 %	227811450
65	NC_012579	TGAA	2	8	25535	25542	50 %	25 %	25 %	0 %	227811451
66	NC_012579	GAAT	2	8	25644	25651	50 %	25 %	25 %	0 %	227811451
67	NC_012579	ATCA	2	8	25811	25818	50 %	25 %	0 %	25 %	227811451
68	NC_012579	TCTA	2	8	25875	25882	25 %	50 %	0 %	25 %	227811451
69	NC_012579	TAAT	2	8	25946	25953	50 %	50 %	0 %	0 %	227811451
70	NC_012579	AAAT	2	8	26049	26056	75 %	25 %	0 %	0 %	227811451
71	NC_012579	ATCT	2	8	26528	26535	25 %	50 %	0 %	25 %	227811452
72	NC_012579	CTGA	2	8	26555	26562	25 %	25 %	25 %	25 %	227811452
73	NC_012579	CAAT	2	8	26822	26829	50 %	25 %	0 %	25 %	227811453
74	NC_012579	AAAG	2	8	27036	27043	75 %	0 %	25 %	0 %	227811454
75	NC_012579	AATT	2	8	27065	27072	50 %	50 %	0 %	0 %	227811454
76	NC_012579	GAAA	2	8	27249	27256	75 %	0 %	25 %	0 %	227811454
77	NC_012579	ATAG	2	8	27355	27362	50 %	25 %	25 %	0 %	227811454
78	NC_012579	ATTT	2	8	27560	27567	25 %	75 %	0 %	0 %	227811454
79	NC_012579	TGGG	2	8	27662	27669	0 %	25 %	75 %	0 %	227811454
80	NC_012579	ATCA	2	8	28201	28208	50 %	25 %	0 %	25 %	227811454
81	NC_012579	AAAC	2	8	28399	28406	75 %	0 %	0 %	25 %	227811454
82	NC_012579	ATAA	2	8	28518	28525	75 %	25 %	0 %	0 %	227811454
83	NC_012579	TTTC	2	8	29230	29237	0 %	75 %	0 %	25 %	227811456
84	NC_012579	GGAA	2	8	29368	29375	50 %	0 %	50 %	0 %	227811456
85	NC_012579	TTTC	2	8	30354	30361	0 %	75 %	0 %	25 %	227811456
86	NC_012579	GCAC	2	8	31001	31008	25 %	0 %	25 %	50 %	227811458
87	NC_012579	TATT	2	8	31250	31257	25 %	75 %	0 %	0 %	227811458
88	NC_012579	AATG	2	8	31641	31648	50 %	25 %	25 %	0 %	227811459
89	NC_012579	GCTT	2	8	31850	31857	0 %	50 %	25 %	25 %	227811459
90	NC_012579	CTTT	2	8	32292	32299	0 %	75 %	0 %	25 %	227811459
91	NC_012579	TTTA	2	8	32860	32867	25 %	75 %	0 %	0 %	227811459
92	NC_012579	TTCA	2	8	33100	33107	25 %	50 %	0 %	25 %	227811459
93	NC_012579	TTTC	2	8	34303	34310	0 %	75 %	0 %	25 %	227811461
94	NC_012579	AATG	2	8	34992	34999	50 %	25 %	25 %	0 %	227811463
95	NC_012579	TCCT	2	8	35019	35026	0 %	50 %	0 %	50 %	227811463
96	NC_012579	GTAT	2	8	35077	35084	25 %	50 %	25 %	0 %	227811463
97	NC_012579	AAAG	2	8	35313	35320	75 %	0 %	25 %	0 %	227811464
98	NC_012579	TAAT	2	8	37157	37164	50 %	50 %	0 %	0 %	227811469
99	NC_012579	ATCT	2	8	37523	37530	25 %	50 %	0 %	25 %	227811469
100	NC_012579	AATT	2	8	37550	37557	50 %	50 %	0 %	0 %	227811469
101	NC_012579	ATTA	2	8	37692	37699	50 %	50 %	0 %	0 %	227811469
102	NC_012579	ATCT	2	8	38099	38106	25 %	50 %	0 %	25 %	227811470
103	NC_012579	AATT	2	8	38218	38225	50 %	50 %	0 %	0 %	227811470
104	NC_012579	ATTT	2	8	38401	38408	25 %	75 %	0 %	0 %	227811470
105	NC_012579	ATGC	2	8	38659	38666	25 %	25 %	25 %	25 %	227811471
106	NC_012579	AATA	2	8	39285	39292	75 %	25 %	0 %	0 %	227811471
107	NC_012579	AGTA	2	8	39335	39342	50 %	25 %	25 %	0 %	227811471
108	NC_012579	GTTT	2	8	39790	39797	0 %	75 %	25 %	0 %	227811472
109	NC_012579	CGAA	2	8	39930	39937	50 %	0 %	25 %	25 %	227811472
110	NC_012579	GATA	2	8	40109	40116	50 %	25 %	25 %	0 %	227811472
111	NC_012579	TCCT	2	8	40130	40137	0 %	50 %	0 %	50 %	227811472
112	NC_012579	GTTT	2	8	40418	40425	0 %	75 %	25 %	0 %	227811472
113	NC_012579	CTTT	2	8	41310	41317	0 %	75 %	0 %	25 %	227811473
114	NC_012579	ATAA	2	8	41762	41769	75 %	25 %	0 %	0 %	227811474
115	NC_012579	TGCC	2	8	42126	42133	0 %	25 %	25 %	50 %	227811474
116	NC_012579	AATT	2	8	43647	43654	50 %	50 %	0 %	0 %	227811475
117	NC_012579	TACA	2	8	44778	44785	50 %	25 %	0 %	25 %	227811476
118	NC_012579	AACA	2	8	45802	45809	75 %	0 %	0 %	25 %	227811477
119	NC_012579	GAGG	2	8	46938	46945	25 %	0 %	75 %	0 %	227811478
120	NC_012579	AGAA	2	8	47350	47357	75 %	0 %	25 %	0 %	227811479
121	NC_012579	GAAA	3	12	48049	48060	75 %	0 %	25 %	0 %	227811480
122	NC_012579	AATT	2	8	49285	49292	50 %	50 %	0 %	0 %	227811482
123	NC_012579	AAAC	2	8	51825	51832	75 %	0 %	0 %	25 %	227811486
124	NC_012579	TTAC	2	8	51880	51887	25 %	50 %	0 %	25 %	227811486
125	NC_012579	GAAT	2	8	52830	52837	50 %	25 %	25 %	0 %	227811487
126	NC_012579	ATGA	2	8	53086	53093	50 %	25 %	25 %	0 %	227811487
127	NC_012579	TTGG	2	8	54771	54778	0 %	50 %	50 %	0 %	227811487
128	NC_012579	TTAT	2	8	54942	54949	25 %	75 %	0 %	0 %	227811487
129	NC_012579	TAAA	2	8	55237	55244	75 %	25 %	0 %	0 %	227811487
130	NC_012579	AGTG	2	8	55280	55287	25 %	25 %	50 %	0 %	227811487
131	NC_012579	GTTT	2	8	55820	55827	0 %	75 %	25 %	0 %	227811488
132	NC_012579	GTAC	2	8	56343	56350	25 %	25 %	25 %	25 %	227811489
133	NC_012579	CGTA	2	8	56868	56875	25 %	25 %	25 %	25 %	227811489
134	NC_012579	CATA	2	8	56914	56921	50 %	25 %	0 %	25 %	227811489
135	NC_012579	TCAC	2	8	58222	58229	25 %	25 %	0 %	50 %	227811490
136	NC_012579	CTCG	2	8	58402	58409	0 %	25 %	25 %	50 %	227811490
137	NC_012579	ATTA	2	8	58593	58600	50 %	50 %	0 %	0 %	227811490
138	NC_012579	TGCC	2	8	59315	59322	0 %	25 %	25 %	50 %	227811490
139	NC_012579	TTAA	2	8	59386	59393	50 %	50 %	0 %	0 %	227811491
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411	NC_012579	TGAT	2	8	181506	181513	25 %	50 %	25 %	0 %	227811633

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.