MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus cereus 03BB102 plasmid p03BB102_179

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012473	TTTCC	2	10	737	746	0 %	60 %	0 %	40 %	225871491
2	NC_012473	TAAAA	2	10	896	905	80 %	20 %	0 %	0 %	225871492
3	NC_012473	CGGAA	2	10	1545	1554	40 %	0 %	40 %	20 %	225871493
4	NC_012473	AAGAA	2	10	1949	1958	80 %	0 %	20 %	0 %	225871494
5	NC_012473	CATAC	2	10	1967	1976	40 %	20 %	0 %	40 %	225871494
6	NC_012473	TTTAA	2	10	3256	3265	40 %	60 %	0 %	0 %	225871496
7	NC_012473	GCATT	2	10	5415	5424	20 %	40 %	20 %	20 %	225871498
8	NC_012473	ACCAA	2	10	5958	5967	60 %	0 %	0 %	40 %	225871498
9	NC_012473	TTCGG	2	10	9952	9961	0 %	40 %	40 %	20 %	225871502
10	NC_012473	CTATT	2	10	10762	10771	20 %	60 %	0 %	20 %	225871504
11	NC_012473	CTCTT	2	10	13548	13557	0 %	60 %	0 %	40 %	225871507
12	NC_012473	TGTCC	2	10	14700	14709	0 %	40 %	20 %	40 %	225871508
13	NC_012473	AGCCA	2	10	16741	16750	40 %	0 %	20 %	40 %	225871511
14	NC_012473	TCCGT	2	10	17286	17295	0 %	40 %	20 %	40 %	225871511
15	NC_012473	AATTA	2	10	20658	20667	60 %	40 %	0 %	0 %	225871514
16	NC_012473	CTCTT	2	10	23216	23225	0 %	60 %	0 %	40 %	225871517
17	NC_012473	ATCTA	2	10	25932	25941	40 %	40 %	0 %	20 %	225871520
18	NC_012473	ATAAG	2	10	27538	27547	60 %	20 %	20 %	0 %	225871523
19	NC_012473	TTTCC	2	10	28564	28573	0 %	60 %	0 %	40 %	225871525
20	NC_012473	TGATT	2	10	28935	28944	20 %	60 %	20 %	0 %	225871526
21	NC_012473	TTAAA	2	10	29182	29191	60 %	40 %	0 %	0 %	225871527
22	NC_012473	AAATT	2	10	30579	30588	60 %	40 %	0 %	0 %	225871529
23	NC_012473	AGTAA	2	10	30892	30901	60 %	20 %	20 %	0 %	225871529
24	NC_012473	TATAT	2	10	34478	34487	40 %	60 %	0 %	0 %	225871533
25	NC_012473	TTGCA	2	10	39721	39730	20 %	40 %	20 %	20 %	225871537
26	NC_012473	CTCTT	2	10	41604	41613	0 %	60 %	0 %	40 %	225871538
27	NC_012473	TTGAT	2	10	41691	41700	20 %	60 %	20 %	0 %	225871538
28	NC_012473	TTATT	2	10	45472	45481	20 %	80 %	0 %	0 %	225871543
29	NC_012473	ATCAA	2	10	45766	45775	60 %	20 %	0 %	20 %	225871543
30	NC_012473	GTGAT	2	10	49661	49670	20 %	40 %	40 %	0 %	225871546
31	NC_012473	AAAAG	2	10	51014	51023	80 %	0 %	20 %	0 %	225871546
32	NC_012473	GAAAA	2	10	51498	51507	80 %	0 %	20 %	0 %	225871547
33	NC_012473	GAAAC	2	10	52841	52850	60 %	0 %	20 %	20 %	225871549
34	NC_012473	GAAAC	2	10	52877	52886	60 %	0 %	20 %	20 %	225871549
35	NC_012473	GAAAA	2	10	55128	55137	80 %	0 %	20 %	0 %	225871550
36	NC_012473	AATGA	2	10	55773	55782	60 %	20 %	20 %	0 %	225871550
37	NC_012473	AGAAA	2	10	57552	57561	80 %	0 %	20 %	0 %	225871553
38	NC_012473	AAGAA	2	10	58072	58081	80 %	0 %	20 %	0 %	225871554
39	NC_012473	AAAGA	2	10	58914	58923	80 %	0 %	20 %	0 %	225871555
40	NC_012473	GAAAG	2	10	59492	59501	60 %	0 %	40 %	0 %	225871555
41	NC_012473	AGAAA	2	10	59879	59888	80 %	0 %	20 %	0 %	225871555
42	NC_012473	ATCAT	2	10	60031	60040	40 %	40 %	0 %	20 %	225871555
43	NC_012473	AAAGA	2	10	61465	61474	80 %	0 %	20 %	0 %	225871557
44	NC_012473	ATTGC	2	10	61715	61724	20 %	40 %	20 %	20 %	225871557
45	NC_012473	AAATC	2	10	63110	63119	60 %	20 %	0 %	20 %	225871561
46	NC_012473	AACAG	2	10	67299	67308	60 %	0 %	20 %	20 %	225871565
47	NC_012473	TATGG	2	10	70412	70421	20 %	40 %	40 %	0 %	225871568
48	NC_012473	AAAGA	2	10	71129	71138	80 %	0 %	20 %	0 %	225871568
49	NC_012473	ATTTA	2	10	76284	76293	40 %	60 %	0 %	0 %	225871575
50	NC_012473	TGAAG	2	10	77961	77970	40 %	20 %	40 %	0 %	225871576
51	NC_012473	AACAA	2	10	78500	78509	80 %	0 %	0 %	20 %	225871576
52	NC_012473	AAAAT	2	10	87469	87478	80 %	20 %	0 %	0 %	225871581
53	NC_012473	ACGTA	2	10	88977	88986	40 %	20 %	20 %	20 %	225871583
54	NC_012473	CCATA	2	10	93158	93167	40 %	20 %	0 %	40 %	225871587
55	NC_012473	AAGTG	2	10	93171	93180	40 %	20 %	40 %	0 %	225871587
56	NC_012473	TAAAG	2	10	93937	93946	60 %	20 %	20 %	0 %	225871588
57	NC_012473	TTTCC	2	10	94538	94547	0 %	60 %	0 %	40 %	225871589
58	NC_012473	ACAGT	2	10	97701	97710	40 %	20 %	20 %	20 %	225871594
59	NC_012473	GTACT	2	10	97718	97727	20 %	40 %	20 %	20 %	225871594
60	NC_012473	TATTT	2	10	99766	99775	20 %	80 %	0 %	0 %	225871596
61	NC_012473	TGAAT	2	10	100405	100414	40 %	40 %	20 %	0 %	225871596
62	NC_012473	CTAAA	2	10	101649	101658	60 %	20 %	0 %	20 %	225871596
63	NC_012473	AAAAG	2	10	102093	102102	80 %	0 %	20 %	0 %	225871597
64	NC_012473	GTGAT	2	10	102382	102391	20 %	40 %	40 %	0 %	225871597
65	NC_012473	TTGGT	2	10	103522	103531	0 %	60 %	40 %	0 %	225871599
66	NC_012473	ATTAT	2	10	103905	103914	40 %	60 %	0 %	0 %	225871600
67	NC_012473	AAAAT	3	15	104116	104130	80 %	20 %	0 %	0 %	225871601
68	NC_012473	TAATA	2	10	108468	108477	60 %	40 %	0 %	0 %	225871604
69	NC_012473	AAAAG	2	10	109492	109501	80 %	0 %	20 %	0 %	225871606
70	NC_012473	CCTTG	2	10	111668	111677	0 %	40 %	20 %	40 %	225871610
71	NC_012473	ATGAA	2	10	113082	113091	60 %	20 %	20 %	0 %	225871612
72	NC_012473	GAAAA	2	10	115943	115952	80 %	0 %	20 %	0 %	225871617
73	NC_012473	TACAA	2	10	116871	116880	60 %	20 %	0 %	20 %	225871617
74	NC_012473	CTTTT	2	10	119576	119585	0 %	80 %	0 %	20 %	225871623
75	NC_012473	ATGTA	2	10	121340	121349	40 %	40 %	20 %	0 %	225871624
76	NC_012473	ATTTA	2	10	122823	122832	40 %	60 %	0 %	0 %	225871626
77	NC_012473	ATTAG	2	10	128747	128756	40 %	40 %	20 %	0 %	225871633
78	NC_012473	GGATT	2	10	128816	128825	20 %	40 %	40 %	0 %	225871633
79	NC_012473	AAATG	2	10	134606	134615	60 %	20 %	20 %	0 %	225871636
80	NC_012473	TAAAA	2	10	135350	135359	80 %	20 %	0 %	0 %	225871636
81	NC_012473	GGATT	2	10	137248	137257	20 %	40 %	40 %	0 %	225871637
82	NC_012473	GATAT	2	10	138839	138848	40 %	40 %	20 %	0 %	225871637
83	NC_012473	ATAAA	2	10	140804	140813	80 %	20 %	0 %	0 %	225871639
84	NC_012473	ATTCC	2	10	142975	142984	20 %	40 %	0 %	40 %	225871643
85	NC_012473	CAATG	2	10	145659	145668	40 %	20 %	20 %	20 %	225871645
86	NC_012473	GAAGC	2	10	153552	153561	40 %	0 %	40 %	20 %	225871663
87	NC_012473	AGGGA	2	10	154034	154043	40 %	0 %	60 %	0 %	225871663
88	NC_012473	TTAAA	2	10	154339	154348	60 %	40 %	0 %	0 %	225871663
89	NC_012473	TTGGA	2	10	154640	154649	20 %	40 %	40 %	0 %	225871664
90	NC_012473	ATGGT	2	10	160265	160274	20 %	40 %	40 %	0 %	225871675
91	NC_012473	GTAAT	2	10	161322	161331	40 %	40 %	20 %	0 %	225871676
92	NC_012473	ATTTC	2	10	162144	162153	20 %	60 %	0 %	20 %	225871677
93	NC_012473	TTAAA	2	10	167098	167107	60 %	40 %	0 %	0 %	225871681
94	NC_012473	CAATT	2	10	170634	170643	40 %	40 %	0 %	20 %	225871685
95	NC_012473	TTCAA	2	10	170749	170758	40 %	40 %	0 %	20 %	225871685
96	NC_012473	TAATT	2	10	170791	170800	40 %	60 %	0 %	0 %	225871685
97	NC_012473	AAGTT	2	10	171832	171841	40 %	40 %	20 %	0 %	225871686
98	NC_012473	TCATA	2	10	172326	172335	40 %	40 %	0 %	20 %	225871687
99	NC_012473	TTACA	2	10	173089	173098	40 %	40 %	0 %	20 %	225871689
100	NC_012473	TTTTC	2	10	173982	173991	0 %	80 %	0 %	20 %	225871691
101	NC_012473	AATCG	2	10	175791	175800	40 %	20 %	20 %	20 %	225871695
102	NC_012473	AAAAT	2	10	177974	177983	80 %	20 %	0 %	0 %	225871698
103	NC_012473	AAAAT	2	10	178852	178861	80 %	20 %	0 %	0 %	225871698
104	NC_012473	ATGGA	2	10	179271	179280	40 %	20 %	40 %	0 %	225871698

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.