MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1

Total Repeats: 1103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012226	TTA	2	6	32515	32520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350727
1002	NC_012226	TAT	2	6	32573	32578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350727
1003	NC_012226	AGCA	2	8	32607	32614	50 %	0 %	25 %	25 %	225350727
1004	NC_012226	ATT	2	6	32647	32652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350728
1005	NC_012226	TCCAA	2	10	32654	32663	40 %	20 %	0 %	40 %	225350728
1006	NC_012226	T	6	6	32684	32689	0 %	100 %	0 %	0 %	225350728
1007	NC_012226	TA	3	6	32782	32787	50 %	50 %	0 %	0 %	225350728
1008	NC_012226	ACC	2	6	32792	32797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225350728
1009	NC_012226	CTT	2	6	32800	32805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350728
1010	NC_012226	TCT	2	6	32910	32915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350728
1011	NC_012226	TAA	2	6	32918	32923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350728
1012	NC_012226	ATA	2	6	32930	32935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350728
1013	NC_012226	T	6	6	33026	33031	0 %	100 %	0 %	0 %	225350728
1014	NC_012226	T	6	6	33057	33062	0 %	100 %	0 %	0 %	225350728
1015	NC_012226	GATT	2	8	33072	33079	25 %	50 %	25 %	0 %	225350728
1016	NC_012226	A	7	7	33113	33119	100 %	0 %	0 %	0 %	225350728
1017	NC_012226	T	6	6	33206	33211	0 %	100 %	0 %	0 %	225350728
1018	NC_012226	ATA	2	6	33225	33230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350728
1019	NC_012226	TAA	2	6	33245	33250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1020	NC_012226	TCA	2	6	33277	33282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350729
1021	NC_012226	T	6	6	33286	33291	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1022	NC_012226	TATT	2	8	33319	33326	25 %	75 %	0 %	0 %	225350729
1023	NC_012226	A	6	6	33329	33334	100 %	0 %	0 %	0 %	225350729
1024	NC_012226	ATT	2	6	33336	33341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1025	NC_012226	T	6	6	33348	33353	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1026	NC_012226	TCA	2	6	33358	33363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350729
1027	NC_012226	TAT	2	6	33380	33385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1028	NC_012226	TA	3	6	33390	33395	50 %	50 %	0 %	0 %	225350729
1029	NC_012226	ATC	2	6	33408	33413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350729
1030	NC_012226	T	6	6	33460	33465	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1031	NC_012226	TAAA	2	8	33483	33490	75 %	25 %	0 %	0 %	225350729
1032	NC_012226	ATC	2	6	33495	33500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350729
1033	NC_012226	ATT	2	6	33553	33558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1034	NC_012226	TAT	2	6	33560	33565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1035	NC_012226	GAG	2	6	33566	33571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225350729
1036	NC_012226	TCAT	2	8	33592	33599	25 %	50 %	0 %	25 %	225350729
1037	NC_012226	TTA	2	6	33607	33612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1038	NC_012226	TAT	3	9	33686	33694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1039	NC_012226	ATA	2	6	33758	33763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1040	NC_012226	ATC	2	6	33771	33776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350729
1041	NC_012226	ATA	2	6	33782	33787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1042	NC_012226	TCA	2	6	33793	33798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350729
1043	NC_012226	ATTT	2	8	33857	33864	25 %	75 %	0 %	0 %	225350729
1044	NC_012226	T	6	6	33870	33875	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1045	NC_012226	TATTT	2	10	33894	33903	20 %	80 %	0 %	0 %	225350729
1046	NC_012226	TAA	3	9	33906	33914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1047	NC_012226	TTTA	2	8	33915	33922	25 %	75 %	0 %	0 %	225350729
1048	NC_012226	TAT	2	6	33923	33928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1049	NC_012226	TAA	2	6	33960	33965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1050	NC_012226	TAA	2	6	33978	33983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1051	NC_012226	AAAT	2	8	33994	34001	75 %	25 %	0 %	0 %	225350729
1052	NC_012226	ATA	2	6	34023	34028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1053	NC_012226	TATTT	2	10	34033	34042	20 %	80 %	0 %	0 %	225350729
1054	NC_012226	TAA	2	6	34060	34065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350729
1055	NC_012226	TAT	2	6	34097	34102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1056	NC_012226	T	6	6	34154	34159	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1057	NC_012226	T	8	8	34167	34174	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1058	NC_012226	T	6	6	34180	34185	0 %	100 %	0 %	0 %	225350729
1059	NC_012226	TCT	2	6	34192	34197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350729
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1061	NC_012226	AT	3	6	34373	34378	50 %	50 %	0 %	0 %	225350729
1062	NC_012226	TTTA	2	8	34431	34438	25 %	75 %	0 %	0 %	225350729
1063	NC_012226	ATT	2	6	34450	34455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350729
1064	NC_012226	ATT	2	6	34642	34647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
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1066	NC_012226	AT	3	6	34738	34743	50 %	50 %	0 %	0 %	225350730
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1068	NC_012226	TCT	2	6	34797	34802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350730
1069	NC_012226	TAT	2	6	34816	34821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
1070	NC_012226	TCT	3	9	34824	34832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350730
1071	NC_012226	ATT	2	6	34865	34870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
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1077	NC_012226	A	6	6	35043	35048	100 %	0 %	0 %	0 %	225350730
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1083	NC_012226	T	7	7	35111	35117	0 %	100 %	0 %	0 %	225350730
1084	NC_012226	TTA	2	6	35139	35144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
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1086	NC_012226	T	6	6	35174	35179	0 %	100 %	0 %	0 %	225350730
1087	NC_012226	TAT	2	6	35188	35193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
1088	NC_012226	ATA	2	6	35197	35202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350730
1089	NC_012226	ATT	2	6	35210	35215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
1090	NC_012226	TAAA	2	8	35224	35231	75 %	25 %	0 %	0 %	225350730
1091	NC_012226	AT	4	8	35246	35253	50 %	50 %	0 %	0 %	225350730
1092	NC_012226	TA	3	6	35306	35311	50 %	50 %	0 %	0 %	225350730
1093	NC_012226	AAT	4	12	35362	35373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350730
1094	NC_012226	T	6	6	35409	35414	0 %	100 %	0 %	0 %	225350730
1095	NC_012226	TCT	2	6	35418	35423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350730
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1098	NC_012226	AT	3	6	35583	35588	50 %	50 %	0 %	0 %	225350730
1099	NC_012226	ATA	2	6	35636	35641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350730
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1101	NC_012226	ATT	2	6	35730	35735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350730
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1103	NC_012226	TCT	2	6	35757	35762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350730

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