MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 plasmid pBHWA1

Total Repeats: 1103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012226	A	7	7	16328	16334	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
502	NC_012226	A	8	8	16389	16396	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
503	NC_012226	ATA	2	6	16427	16432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
504	NC_012226	A	7	7	16467	16473	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
505	NC_012226	ATC	2	6	16502	16507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350713
506	NC_012226	CTT	2	6	16510	16515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350713
507	NC_012226	TCATT	2	10	16518	16527	20 %	60 %	0 %	20 %	225350713
508	NC_012226	AAATA	2	10	16605	16614	80 %	20 %	0 %	0 %	225350713
509	NC_012226	ATTTAA	2	12	16736	16747	50 %	50 %	0 %	0 %	225350713
510	NC_012226	A	7	7	16746	16752	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
511	NC_012226	AAT	2	6	16756	16761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
512	NC_012226	T	6	6	16765	16770	0 %	100 %	0 %	0 %	225350713
513	NC_012226	TA	4	8	16778	16785	50 %	50 %	0 %	0 %	225350713
514	NC_012226	TAA	2	6	16812	16817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
515	NC_012226	TAA	2	6	16833	16838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
516	NC_012226	ATA	2	6	16850	16855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
517	NC_012226	AGA	2	6	16896	16901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350713
518	NC_012226	TAA	2	6	16926	16931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
519	NC_012226	AGA	2	6	16953	16958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350713
520	NC_012226	AAG	2	6	17042	17047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350713
521	NC_012226	CTG	2	6	17054	17059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225350713
522	NC_012226	TGT	2	6	17070	17075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225350713
523	NC_012226	TAA	2	6	17106	17111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
524	NC_012226	TTA	2	6	17185	17190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350713
525	NC_012226	A	6	6	17211	17216	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
526	NC_012226	AGAA	2	8	17241	17248	75 %	0 %	25 %	0 %	225350713
527	NC_012226	A	6	6	17294	17299	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
528	NC_012226	A	6	6	17305	17310	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
529	NC_012226	ATA	2	6	17321	17326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350713
530	NC_012226	AT	3	6	17345	17350	50 %	50 %	0 %	0 %	225350713
531	NC_012226	T	6	6	17350	17355	0 %	100 %	0 %	0 %	225350713
532	NC_012226	A	7	7	17374	17380	100 %	0 %	0 %	0 %	225350713
533	NC_012226	AAAG	2	8	17406	17413	75 %	0 %	25 %	0 %	225350713
534	NC_012226	TGA	2	6	17478	17483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350713
535	NC_012226	TTTAA	2	10	17507	17516	40 %	60 %	0 %	0 %	225350713
536	NC_012226	GTA	2	6	17542	17547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350714
537	NC_012226	AAT	2	6	17595	17600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
538	NC_012226	TTC	2	6	17607	17612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350714
539	NC_012226	T	7	7	17622	17628	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
540	NC_012226	TAA	2	6	17634	17639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
541	NC_012226	T	6	6	17655	17660	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
542	NC_012226	TTC	2	6	17679	17684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350714
543	NC_012226	ATA	2	6	17716	17721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
544	NC_012226	AAT	2	6	17739	17744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
545	NC_012226	AT	3	6	17777	17782	50 %	50 %	0 %	0 %	225350714
546	NC_012226	T	7	7	17787	17793	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
547	NC_012226	AAT	2	6	17801	17806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
548	NC_012226	T	6	6	17817	17822	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
549	NC_012226	TCT	2	6	17824	17829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350714
550	NC_012226	TAA	2	6	17840	17845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
551	NC_012226	CAA	2	6	17905	17910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225350714
552	NC_012226	TAT	2	6	17918	17923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350714
553	NC_012226	AAT	2	6	17957	17962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
554	NC_012226	AT	3	6	17976	17981	50 %	50 %	0 %	0 %	225350714
555	NC_012226	TGT	2	6	17982	17987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225350714
556	NC_012226	TCA	2	6	17998	18003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350714
557	NC_012226	T	8	8	18062	18069	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
558	NC_012226	ATA	2	6	18113	18118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
559	NC_012226	T	6	6	18150	18155	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
560	NC_012226	AAT	2	6	18245	18250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350714
561	NC_012226	T	8	8	18254	18261	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
562	NC_012226	TTC	2	6	18300	18305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350714
563	NC_012226	AT	4	8	18317	18324	50 %	50 %	0 %	0 %	225350714
564	NC_012226	T	6	6	18360	18365	0 %	100 %	0 %	0 %	225350714
565	NC_012226	TAAT	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	225350714
566	NC_012226	CAAT	2	8	18435	18442	50 %	25 %	0 %	25 %	225350715
567	NC_012226	A	7	7	18446	18452	100 %	0 %	0 %	0 %	225350715
568	NC_012226	AAG	2	6	18493	18498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225350715
569	NC_012226	CAA	2	6	18502	18507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225350715
570	NC_012226	AGG	2	6	18560	18565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225350715
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572	NC_012226	T	6	6	18740	18745	0 %	100 %	0 %	0 %	225350715
573	NC_012226	T	6	6	18794	18799	0 %	100 %	0 %	0 %	225350715
574	NC_012226	TCA	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350715
575	NC_012226	A	6	6	18814	18819	100 %	0 %	0 %	0 %	225350715
576	NC_012226	TCT	2	6	18843	18848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350715
577	NC_012226	ATT	2	6	18854	18859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350715
578	NC_012226	TAT	2	6	18863	18868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350715
579	NC_012226	AT	3	6	18867	18872	50 %	50 %	0 %	0 %	225350715
580	NC_012226	T	6	6	18889	18894	0 %	100 %	0 %	0 %	225350715
581	NC_012226	ATA	2	6	18903	18908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350715
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583	NC_012226	ATTT	2	8	18955	18962	25 %	75 %	0 %	0 %	225350716
584	NC_012226	ATT	2	6	18979	18984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350716
585	NC_012226	TCA	2	6	19022	19027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350716
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587	NC_012226	TAT	2	6	19032	19037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350716
588	NC_012226	T	6	6	19052	19057	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
589	NC_012226	ATC	2	6	19090	19095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350716
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592	NC_012226	ATTT	2	8	19212	19219	25 %	75 %	0 %	0 %	225350716
593	NC_012226	TTTAA	2	10	19253	19262	40 %	60 %	0 %	0 %	225350716
594	NC_012226	T	6	6	19270	19275	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
595	NC_012226	TTC	2	6	19282	19287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350716
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597	NC_012226	TA	3	6	19326	19331	50 %	50 %	0 %	0 %	225350716
598	NC_012226	TAA	2	6	19342	19347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350716
599	NC_012226	ATT	2	6	19348	19353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350716
600	NC_012226	CTT	2	6	19383	19388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350716
601	NC_012226	TTC	2	6	19429	19434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350716
602	NC_012226	T	6	6	19493	19498	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
603	NC_012226	CTTT	2	8	19499	19506	0 %	75 %	0 %	25 %	225350716
604	NC_012226	T	6	6	19523	19528	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
605	NC_012226	ATA	2	6	19604	19609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350716
606	NC_012226	T	6	6	19634	19639	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
607	NC_012226	ATT	2	6	19690	19695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350716
608	NC_012226	TAG	2	6	19731	19736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225350716
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610	NC_012226	T	8	8	19791	19798	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
611	NC_012226	AAT	2	6	19800	19805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350716
612	NC_012226	TAT	2	6	19918	19923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350716
613	NC_012226	T	6	6	19927	19932	0 %	100 %	0 %	0 %	225350716
614	NC_012226	TCT	2	6	19940	19945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350716
615	NC_012226	TTA	2	6	19946	19951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350716
616	NC_012226	TTAT	2	8	19961	19968	25 %	75 %	0 %	0 %	225350716
617	NC_012226	ATT	2	6	20043	20048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225350717
618	NC_012226	TCT	2	6	20087	20092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225350717
619	NC_012226	AATA	2	8	20093	20100	75 %	25 %	0 %	0 %	225350717
620	NC_012226	CAT	2	6	20136	20141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225350717
621	NC_012226	AAT	2	6	20220	20225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225350717
622	NC_012226	T	7	7	20232	20238	0 %	100 %	0 %	0 %	225350717
623	NC_012226	TAAAA	2	10	20242	20251	80 %	20 %	0 %	0 %	225350717
624	NC_012226	A	7	7	20248	20254	100 %	0 %	0 %	0 %	225350717
625	NC_012226	CCG	2	6	20255	20260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225350717
626	NC_012226	TATCA	2	10	20305	20314	40 %	40 %	0 %	20 %	225350717
627	NC_012226	GGA	2	6	20348	20353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225350717
628	NC_012226	T	6	6	20386	20391	0 %	100 %	0 %	0 %	225350717
629	NC_012226	AATTCT	2	12	20396	20407	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225350717
630	NC_012226	TAAG	2	8	20441	20448	50 %	25 %	25 %	0 %	225350717
631	NC_012226	A	7	7	20449	20455	100 %	0 %	0 %	0 %	225350717
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