MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012225	A	6	6	160616	160621	100 %	0 %	0 %	0 %	225619092
4002	NC_012225	ATA	2	6	160641	160646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619092
4003	NC_012225	AAAT	2	8	160701	160708	75 %	25 %	0 %	0 %	225619092
4004	NC_012225	CGG	2	6	160985	160990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225619093
4005	NC_012225	T	6	6	161020	161025	0 %	100 %	0 %	0 %	225619093
4006	NC_012225	AAAAT	2	10	161086	161095	80 %	20 %	0 %	0 %	225619093
4007	NC_012225	TAG	2	6	161141	161146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619093
4008	NC_012225	TAATA	2	10	161210	161219	60 %	40 %	0 %	0 %	225619093
4009	NC_012225	TAC	2	6	161237	161242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619093
4010	NC_012225	ATA	2	6	161256	161261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619093
4011	NC_012225	ACTTAT	2	12	161393	161404	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	225619093
4012	NC_012225	ATA	2	6	161526	161531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619093
4013	NC_012225	TAG	2	6	161537	161542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619093
4014	NC_012225	TGC	2	6	161543	161548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619093
4015	NC_012225	ACA	2	6	161634	161639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619093
4016	NC_012225	CTG	2	6	161644	161649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619093
4017	NC_012225	AGC	2	6	161687	161692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619093
4018	NC_012225	AT	3	6	161713	161718	50 %	50 %	0 %	0 %	225619093
4019	NC_012225	GTT	2	6	161724	161729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619093
4020	NC_012225	TTC	2	6	161736	161741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619093
4021	NC_012225	TA	3	6	161754	161759	50 %	50 %	0 %	0 %	225619093
4022	NC_012225	TTG	2	6	161776	161781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619093
4023	NC_012225	GTA	2	6	161811	161816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619093
4024	NC_012225	AATA	2	8	161820	161827	75 %	25 %	0 %	0 %	225619093
4025	NC_012225	AT	3	6	161833	161838	50 %	50 %	0 %	0 %	225619093
4026	NC_012225	TA	3	6	161844	161849	50 %	50 %	0 %	0 %	225619093
4027	NC_012225	CTT	2	6	161897	161902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619093
4028	NC_012225	AGT	2	6	161921	161926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619093
4029	NC_012225	ATT	2	6	161934	161939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4030	NC_012225	AGA	2	6	161948	161953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619093
4031	NC_012225	TTCT	2	8	161971	161978	0 %	75 %	0 %	25 %	225619093
4032	NC_012225	CTT	2	6	161985	161990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619093
4033	NC_012225	CTG	2	6	162004	162009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619093
4034	NC_012225	AAGAA	2	10	162020	162029	80 %	0 %	20 %	0 %	225619093
4035	NC_012225	AT	3	6	162035	162040	50 %	50 %	0 %	0 %	225619093
4036	NC_012225	AAG	2	6	162054	162059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619093
4037	NC_012225	CTT	2	6	162105	162110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619093
4038	NC_012225	A	6	6	162130	162135	100 %	0 %	0 %	0 %	225619093
4039	NC_012225	ATA	2	6	162142	162147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619093
4040	NC_012225	T	6	6	162167	162172	0 %	100 %	0 %	0 %	225619093
4041	NC_012225	ATT	2	6	162179	162184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4042	NC_012225	TAT	2	6	162240	162245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4043	NC_012225	TAT	2	6	162284	162289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4044	NC_012225	GAAAA	2	10	162300	162309	80 %	0 %	20 %	0 %	225619093
4045	NC_012225	ATT	2	6	162311	162316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4046	NC_012225	AGA	2	6	162332	162337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619093
4047	NC_012225	TAA	2	6	162340	162345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619093
4048	NC_012225	ATA	3	9	162355	162363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619093
4049	NC_012225	ATT	2	6	162376	162381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4050	NC_012225	ATT	2	6	162403	162408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4051	NC_012225	A	6	6	162421	162426	100 %	0 %	0 %	0 %	225619093
4052	NC_012225	ATG	2	6	162430	162435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619093
4053	NC_012225	ATC	2	6	162451	162456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619093
4054	NC_012225	TAT	2	6	162471	162476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619093
4055	NC_012225	TAG	2	6	162595	162600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619093
4056	NC_012225	ATAA	2	8	162619	162626	75 %	25 %	0 %	0 %	225619093
4057	NC_012225	GAA	2	6	162650	162655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619094
4058	NC_012225	TA	4	8	162658	162665	50 %	50 %	0 %	0 %	225619094
4059	NC_012225	ATA	3	9	162724	162732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619094
4060	NC_012225	AGA	2	6	162773	162778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619094
4061	NC_012225	CAG	2	6	162826	162831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619094
4062	NC_012225	AT	3	6	162846	162851	50 %	50 %	0 %	0 %	225619094
4063	NC_012225	AAT	2	6	162855	162860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619094
4064	NC_012225	T	6	6	162875	162880	0 %	100 %	0 %	0 %	225619094
4065	NC_012225	TA	3	6	162883	162888	50 %	50 %	0 %	0 %	225619094
4066	NC_012225	CAT	2	6	162908	162913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619094
4067	NC_012225	TA	3	6	162968	162973	50 %	50 %	0 %	0 %	225619094
4068	NC_012225	AGA	2	6	163001	163006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619094
4069	NC_012225	AG	3	6	163028	163033	50 %	0 %	50 %	0 %	225619094
4070	NC_012225	ATA	2	6	163102	163107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619094
4071	NC_012225	TA	3	6	163113	163118	50 %	50 %	0 %	0 %	225619094
4072	NC_012225	ATC	2	6	163159	163164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619094
4073	NC_012225	TTA	2	6	163192	163197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619094
4074	NC_012225	ATAA	2	8	163218	163225	75 %	25 %	0 %	0 %	225619094
4075	NC_012225	AAC	2	6	163235	163240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619094
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4079	NC_012225	A	7	7	163403	163409	100 %	0 %	0 %	0 %	225619094
4080	NC_012225	ATA	2	6	163431	163436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619094
4081	NC_012225	AATT	2	8	163490	163497	50 %	50 %	0 %	0 %	225619094
4082	NC_012225	ATAGA	2	10	163513	163522	60 %	20 %	20 %	0 %	225619094
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4085	NC_012225	GAA	2	6	163598	163603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619095
4086	NC_012225	ACAGG	2	10	163623	163632	40 %	0 %	40 %	20 %	225619095
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4090	NC_012225	ATC	2	6	163726	163731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619095
4091	NC_012225	ATG	2	6	163753	163758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619095
4092	NC_012225	TTC	2	6	163768	163773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619095
4093	NC_012225	TGA	2	6	163832	163837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619095
4094	NC_012225	AT	3	6	163839	163844	50 %	50 %	0 %	0 %	225619095
4095	NC_012225	CTG	2	6	163897	163902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619095
4096	NC_012225	ATT	2	6	163928	163933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619095
4097	NC_012225	CAGA	2	8	164019	164026	50 %	0 %	25 %	25 %	225619095
4098	NC_012225	A	6	6	164026	164031	100 %	0 %	0 %	0 %	225619095
4099	NC_012225	AGA	2	6	164157	164162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619095
4100	NC_012225	GA	3	6	164164	164169	50 %	0 %	50 %	0 %	225619095
4101	NC_012225	A	7	7	164181	164187	100 %	0 %	0 %	0 %	225619095
4102	NC_012225	TAAA	2	8	164212	164219	75 %	25 %	0 %	0 %	225619095
4103	NC_012225	CAG	2	6	164310	164315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619095
4104	NC_012225	TGA	2	6	164324	164329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619095
4105	NC_012225	GA	3	6	164347	164352	50 %	0 %	50 %	0 %	225619095
4106	NC_012225	TTG	2	6	164392	164397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619095
4107	NC_012225	A	6	6	164409	164414	100 %	0 %	0 %	0 %	225619095
4108	NC_012225	TTA	2	6	164463	164468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619095
4109	NC_012225	CAAAAG	2	12	164479	164490	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225619095
4110	NC_012225	AAT	2	6	164537	164542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619095
4111	NC_012225	ATTA	2	8	164593	164600	50 %	50 %	0 %	0 %	225619095
4112	NC_012225	AAT	2	6	164607	164612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619096
4113	NC_012225	ATT	2	6	164615	164620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619096
4114	NC_012225	A	9	9	164624	164632	100 %	0 %	0 %	0 %	225619096
4115	NC_012225	TTGA	2	8	164634	164641	25 %	50 %	25 %	0 %	225619096
4116	NC_012225	A	7	7	164667	164673	100 %	0 %	0 %	0 %	225619096
4117	NC_012225	AAAT	2	8	164725	164732	75 %	25 %	0 %	0 %	225619096
4118	NC_012225	ATA	2	6	164749	164754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619096
4119	NC_012225	AAATA	2	10	164759	164768	80 %	20 %	0 %	0 %	225619096
4120	NC_012225	T	7	7	164771	164777	0 %	100 %	0 %	0 %	225619096
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4122	NC_012225	TAA	2	6	164836	164841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619096
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4124	NC_012225	T	6	6	164892	164897	0 %	100 %	0 %	0 %	225619096
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4242	NC_012225	AT	3	6	169087	169092	50 %	50 %	0 %	0 %	225619099
4243	NC_012225	TAA	2	6	169093	169098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619099
4244	NC_012225	CAT	2	6	169186	169191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619099
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4247	NC_012225	TATAG	2	10	169320	169329	40 %	40 %	20 %	0 %	225619099
4248	NC_012225	ATTGC	2	10	169338	169347	20 %	40 %	20 %	20 %	225619099
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4251	NC_012225	ATAG	2	8	169487	169494	50 %	25 %	25 %	0 %	225619100
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4253	NC_012225	AGGT	2	8	169530	169537	25 %	25 %	50 %	0 %	225619100
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4368	NC_012225	T	6	6	174150	174155	0 %	100 %	0 %	0 %	225619103
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4495	NC_012225	ATG	2	6	179501	179506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619108
4496	NC_012225	AATA	2	8	179552	179559	75 %	25 %	0 %	0 %	225619108
4497	NC_012225	ATA	3	9	179557	179565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619108
4498	NC_012225	TAA	2	6	179584	179589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619108
4499	NC_012225	AT	3	6	179600	179605	50 %	50 %	0 %	0 %	225619108
4500	NC_012225	TAT	3	9	179617	179625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619108

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