MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012225	GA	3	6	139722	139727	50 %	0 %	50 %	0 %	225619074
3502	NC_012225	AGG	2	6	139762	139767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619074
3503	NC_012225	CAGA	2	8	139776	139783	50 %	0 %	25 %	25 %	225619074
3504	NC_012225	ATG	2	6	139809	139814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619074
3505	NC_012225	ATT	2	6	139818	139823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619074
3506	NC_012225	ATG	2	6	139935	139940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619074
3507	NC_012225	ATA	2	6	139946	139951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619074
3508	NC_012225	ATT	2	6	139956	139961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619074
3509	NC_012225	ATTT	2	8	140049	140056	25 %	75 %	0 %	0 %	225619074
3510	NC_012225	A	6	6	140123	140128	100 %	0 %	0 %	0 %	225619074
3511	NC_012225	ATA	2	6	140138	140143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619074
3512	NC_012225	ATA	2	6	140220	140225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619074
3513	NC_012225	AGA	2	6	140300	140305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619074
3514	NC_012225	GGT	2	6	140360	140365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225619074
3515	NC_012225	GAG	2	6	140450	140455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619074
3516	NC_012225	AT	3	6	140456	140461	50 %	50 %	0 %	0 %	225619074
3517	NC_012225	ATT	2	6	140512	140517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619074
3518	NC_012225	CAG	2	6	140557	140562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619074
3519	NC_012225	AAGAA	2	10	140570	140579	80 %	0 %	20 %	0 %	225619074
3520	NC_012225	AG	3	6	140582	140587	50 %	0 %	50 %	0 %	225619074
3521	NC_012225	A	6	6	140677	140682	100 %	0 %	0 %	0 %	225619074
3522	NC_012225	CAT	2	6	140685	140690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619074
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3525	NC_012225	TA	3	6	140740	140745	50 %	50 %	0 %	0 %	225619074
3526	NC_012225	TA	3	6	140873	140878	50 %	50 %	0 %	0 %	225619075
3527	NC_012225	ATC	2	6	140954	140959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619075
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3529	NC_012225	ATC	2	6	141026	141031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619075
3530	NC_012225	ATC	2	6	141056	141061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619075
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3532	NC_012225	AGG	2	6	141149	141154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619075
3533	NC_012225	AAT	2	6	141168	141173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619075
3534	NC_012225	TAA	2	6	141204	141209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619075
3535	NC_012225	TTA	3	9	141210	141218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619075
3536	NC_012225	A	7	7	141218	141224	100 %	0 %	0 %	0 %	225619075
3537	NC_012225	TCT	2	6	141225	141230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619075
3538	NC_012225	T	7	7	141353	141359	0 %	100 %	0 %	0 %	225619075
3539	NC_012225	AT	3	6	141368	141373	50 %	50 %	0 %	0 %	225619075
3540	NC_012225	TGT	2	6	141469	141474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619075
3541	NC_012225	ATT	2	6	141482	141487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619075
3542	NC_012225	ATC	2	6	141506	141511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619075
3543	NC_012225	TAT	2	6	141524	141529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619075
3544	NC_012225	GAAA	2	8	141533	141540	75 %	0 %	25 %	0 %	225619075
3545	NC_012225	A	6	6	141549	141554	100 %	0 %	0 %	0 %	225619075
3546	NC_012225	AAT	2	6	141567	141572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619075
3547	NC_012225	ATC	2	6	141584	141589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619075
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3549	NC_012225	TGAAA	2	10	141711	141720	60 %	20 %	20 %	0 %	225619075
3550	NC_012225	GAA	2	6	141745	141750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619075
3551	NC_012225	TAT	2	6	141758	141763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619075
3552	NC_012225	TA	3	6	141827	141832	50 %	50 %	0 %	0 %	225619075
3553	NC_012225	GAT	3	9	141864	141872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619075
3554	NC_012225	ATT	2	6	141893	141898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619075
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3556	NC_012225	ATT	2	6	142132	142137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619076
3557	NC_012225	AAG	2	6	142159	142164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619076
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3560	NC_012225	TAG	2	6	142333	142338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619076
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3563	NC_012225	TAA	2	6	142516	142521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619076
3564	NC_012225	TACT	2	8	142543	142550	25 %	50 %	0 %	25 %	225619076
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3569	NC_012225	GGA	2	6	142670	142675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619076
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3571	NC_012225	A	8	8	142695	142702	100 %	0 %	0 %	0 %	225619076
3572	NC_012225	AAG	2	6	142714	142719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619076
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3593	NC_012225	A	7	7	143469	143475	100 %	0 %	0 %	0 %	225619077
3594	NC_012225	A	6	6	143487	143492	100 %	0 %	0 %	0 %	225619077
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3607	NC_012225	TTA	2	6	143675	143680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619077
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3613	NC_012225	ATTT	2	8	143887	143894	25 %	75 %	0 %	0 %	225619077
3614	NC_012225	GAA	3	9	143938	143946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619077
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3616	NC_012225	TTAA	2	8	143983	143990	50 %	50 %	0 %	0 %	225619077
3617	NC_012225	AGAA	2	8	143996	144003	75 %	0 %	25 %	0 %	225619077
3618	NC_012225	GAA	3	9	144028	144036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619077
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3623	NC_012225	AATA	2	8	144502	144509	75 %	25 %	0 %	0 %	225619078
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3749	NC_012225	TGT	2	6	149979	149984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619083
3750	NC_012225	AT	3	6	149985	149990	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
3751	NC_012225	AAT	2	6	150059	150064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619083
3752	NC_012225	AT	3	6	150071	150076	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
3753	NC_012225	T	6	6	150088	150093	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
3754	NC_012225	TTG	2	6	150140	150145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619083
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3756	NC_012225	AAT	2	6	150197	150202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619083
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3765	NC_012225	TGTTAT	2	12	150513	150524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	225619083
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3768	NC_012225	T	7	7	150594	150600	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
3769	NC_012225	ACAT	2	8	150612	150619	50 %	25 %	0 %	25 %	225619083
3770	NC_012225	AT	4	8	150621	150628	50 %	50 %	0 %	0 %	225619083
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3772	NC_012225	T	7	7	150686	150692	0 %	100 %	0 %	0 %	225619083
3773	NC_012225	AATTAT	2	12	151014	151025	50 %	50 %	0 %	0 %	225619084
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3783	NC_012225	AT	3	6	151430	151435	50 %	50 %	0 %	0 %	225619084
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3869	NC_012225	CAG	2	6	155175	155180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619086
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3997	NC_012225	TA	3	6	160530	160535	50 %	50 %	0 %	0 %	225619092
3998	NC_012225	TGA	2	6	160561	160566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619092
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