MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012225	ATG	2	6	59430	59435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619007
1502	NC_012225	AAT	2	6	59449	59454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619007
1503	NC_012225	CTTTT	2	10	59477	59486	0 %	80 %	0 %	20 %	225619007
1504	NC_012225	TAA	2	6	59496	59501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619007
1505	NC_012225	GAT	2	6	59542	59547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619007
1506	NC_012225	CTT	2	6	59553	59558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619007
1507	NC_012225	CTA	2	6	59652	59657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619007
1508	NC_012225	AGG	2	6	59749	59754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619007
1509	NC_012225	TAT	2	6	59761	59766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619007
1510	NC_012225	ATA	2	6	59864	59869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619007
1511	NC_012225	CTA	2	6	59874	59879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619007
1512	NC_012225	T	7	7	59889	59895	0 %	100 %	0 %	0 %	225619007
1513	NC_012225	ATT	2	6	59914	59919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619007
1514	NC_012225	TTC	2	6	59980	59985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619007
1515	NC_012225	TCA	2	6	60046	60051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619007
1516	NC_012225	TGT	2	6	60064	60069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619007
1517	NC_012225	TAT	2	6	60082	60087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619007
1518	NC_012225	GCT	2	6	60088	60093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619007
1519	NC_012225	TAA	2	6	60151	60156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619007
1520	NC_012225	TTC	2	6	60216	60221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619007
1521	NC_012225	ATTT	2	8	60241	60248	25 %	75 %	0 %	0 %	225619007
1522	NC_012225	A	6	6	60294	60299	100 %	0 %	0 %	0 %	225619007
1523	NC_012225	CAG	2	6	60336	60341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619007
1524	NC_012225	GTT	2	6	60389	60394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619007
1525	NC_012225	GGC	2	6	60434	60439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225619007
1526	NC_012225	ACT	3	9	60449	60457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619007
1527	NC_012225	TAA	2	6	60480	60485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619007
1528	NC_012225	AT	3	6	60505	60510	50 %	50 %	0 %	0 %	225619007
1529	NC_012225	GAT	2	6	60536	60541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619007
1530	NC_012225	TAA	2	6	60547	60552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619007
1531	NC_012225	TA	3	6	60614	60619	50 %	50 %	0 %	0 %	225619007
1532	NC_012225	ATG	2	6	60635	60640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619007
1533	NC_012225	GGTAG	2	10	60752	60761	20 %	20 %	60 %	0 %	225619007
1534	NC_012225	ATT	3	9	60865	60873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1535	NC_012225	TA	3	6	60901	60906	50 %	50 %	0 %	0 %	225619008
1536	NC_012225	AGA	2	6	60918	60923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619008
1537	NC_012225	TAA	2	6	60924	60929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619008
1538	NC_012225	A	6	6	60934	60939	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1539	NC_012225	ACT	2	6	60955	60960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619008
1540	NC_012225	AAT	2	6	60997	61002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619008
1541	NC_012225	TGATAA	2	12	61011	61022	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225619008
1542	NC_012225	TAT	2	6	61023	61028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1543	NC_012225	ATG	2	6	61046	61051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619008
1544	NC_012225	A	8	8	61052	61059	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1545	NC_012225	TTA	3	9	61217	61225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1546	NC_012225	GAA	2	6	61244	61249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619008
1547	NC_012225	GTTT	2	8	61261	61268	0 %	75 %	25 %	0 %	225619008
1548	NC_012225	ATTA	2	8	61324	61331	50 %	50 %	0 %	0 %	225619008
1549	NC_012225	TA	3	6	61330	61335	50 %	50 %	0 %	0 %	225619008
1550	NC_012225	ATATT	2	10	61344	61353	40 %	60 %	0 %	0 %	225619008
1551	NC_012225	A	7	7	61429	61435	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1552	NC_012225	TAT	2	6	61443	61448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1553	NC_012225	AATT	2	8	61487	61494	50 %	50 %	0 %	0 %	225619008
1554	NC_012225	ATA	2	6	61514	61519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619008
1555	NC_012225	ATT	2	6	61524	61529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1556	NC_012225	A	6	6	61532	61537	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1557	NC_012225	ATT	2	6	61566	61571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1558	NC_012225	AGA	2	6	61575	61580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619008
1559	NC_012225	A	6	6	61590	61595	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1560	NC_012225	ATG	2	6	61628	61633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619008
1561	NC_012225	ATA	2	6	61636	61641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619008
1562	NC_012225	A	6	6	61645	61650	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1563	NC_012225	ATT	2	6	61664	61669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1564	NC_012225	ATTAAA	2	12	61737	61748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619008
1565	NC_012225	T	7	7	61764	61770	0 %	100 %	0 %	0 %	225619008
1566	NC_012225	AT	3	6	61802	61807	50 %	50 %	0 %	0 %	225619008
1567	NC_012225	TAT	2	6	61828	61833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1568	NC_012225	T	6	6	61889	61894	0 %	100 %	0 %	0 %	225619008
1569	NC_012225	ATG	2	6	61931	61936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619008
1570	NC_012225	A	6	6	61956	61961	100 %	0 %	0 %	0 %	225619008
1571	NC_012225	AGA	2	6	61968	61973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619008
1572	NC_012225	T	8	8	61977	61984	0 %	100 %	0 %	0 %	225619008
1573	NC_012225	AAAT	2	8	61998	62005	75 %	25 %	0 %	0 %	225619008
1574	NC_012225	AGA	2	6	62025	62030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619008
1575	NC_012225	TAT	2	6	62033	62038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619008
1576	NC_012225	ATT	2	6	62135	62140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619009
1577	NC_012225	T	6	6	62139	62144	0 %	100 %	0 %	0 %	225619009
1578	NC_012225	GAA	2	6	62159	62164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619009
1579	NC_012225	AAC	2	6	62199	62204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619009
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1581	NC_012225	CTC	2	6	62390	62395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619009
1582	NC_012225	AAG	2	6	62405	62410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619009
1583	NC_012225	GTA	2	6	62416	62421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619009
1584	NC_012225	AGC	2	6	62469	62474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619009
1585	NC_012225	TAA	2	6	62495	62500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619009
1586	NC_012225	TAG	2	6	62504	62509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619009
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1589	NC_012225	AACAT	2	10	62567	62576	60 %	20 %	0 %	20 %	225619009
1590	NC_012225	TTC	2	6	62630	62635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619009
1591	NC_012225	AGT	2	6	62652	62657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619009
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1593	NC_012225	AAC	2	6	62784	62789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619009
1594	NC_012225	AGA	2	6	62813	62818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619009
1595	NC_012225	AGC	2	6	62820	62825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619009
1596	NC_012225	TA	3	6	62826	62831	50 %	50 %	0 %	0 %	225619009
1597	NC_012225	CTA	2	6	62834	62839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619009
1598	NC_012225	AAT	2	6	62848	62853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619009
1599	NC_012225	GAA	2	6	62892	62897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619009
1600	NC_012225	AAC	2	6	62955	62960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619009
1601	NC_012225	ATTT	2	8	62967	62974	25 %	75 %	0 %	0 %	225619009
1602	NC_012225	GCCA	2	8	62991	62998	25 %	0 %	25 %	50 %	225619009
1603	NC_012225	ACT	2	6	63043	63048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619009
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1605	NC_012225	ATT	2	6	63145	63150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619009
1606	NC_012225	T	6	6	63268	63273	0 %	100 %	0 %	0 %	225619009
1607	NC_012225	ATA	3	9	63295	63303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619009
1608	NC_012225	AGC	2	6	63312	63317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619009
1609	NC_012225	GAT	2	6	63328	63333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619009
1610	NC_012225	CAG	3	9	63374	63382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619009
1611	NC_012225	CAAC	2	8	63409	63416	50 %	0 %	0 %	50 %	225619009
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1613	NC_012225	A	6	6	63567	63572	100 %	0 %	0 %	0 %	225619010
1614	NC_012225	TA	3	6	63604	63609	50 %	50 %	0 %	0 %	225619010
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1621	NC_012225	TACT	2	8	63934	63941	25 %	50 %	0 %	25 %	225619010
1622	NC_012225	TAA	2	6	63946	63951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619010
1623	NC_012225	GAAG	2	8	64023	64030	50 %	0 %	50 %	0 %	225619010
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1625	NC_012225	GAG	2	6	64132	64137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619010
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