MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012225	ATC	2	6	40185	40190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618994
1002	NC_012225	TGC	2	6	40202	40207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618994
1003	NC_012225	AT	3	6	40310	40315	50 %	50 %	0 %	0 %	225618994
1004	NC_012225	AAG	2	6	40395	40400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618994
1005	NC_012225	TAT	2	6	40436	40441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618994
1006	NC_012225	ATT	2	6	40447	40452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618994
1007	NC_012225	AT	3	6	40532	40537	50 %	50 %	0 %	0 %	225618994
1008	NC_012225	GCT	2	6	40540	40545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618994
1009	NC_012225	T	6	6	40555	40560	0 %	100 %	0 %	0 %	225618994
1010	NC_012225	ATC	2	6	40603	40608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618994
1011	NC_012225	TAATA	2	10	40664	40673	60 %	40 %	0 %	0 %	225618994
1012	NC_012225	TGC	2	6	40680	40685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618994
1013	NC_012225	TCT	2	6	40693	40698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618994
1014	NC_012225	GAA	2	6	40705	40710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618994
1015	NC_012225	TTC	2	6	40728	40733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618994
1016	NC_012225	TAT	3	9	40742	40750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618994
1017	NC_012225	CTGT	2	8	40779	40786	0 %	50 %	25 %	25 %	225618994
1018	NC_012225	CTT	2	6	40811	40816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618994
1019	NC_012225	TGTT	2	8	40827	40834	0 %	75 %	25 %	0 %	225618994
1020	NC_012225	ATT	2	6	40980	40985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618994
1021	NC_012225	AAT	2	6	40994	40999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618994
1022	NC_012225	TTG	3	9	41006	41014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225618994
1023	NC_012225	CTG	2	6	41018	41023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618994
1024	NC_012225	TAT	3	9	41024	41032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618994
1025	NC_012225	ATT	2	6	41110	41115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618994
1026	NC_012225	GCTT	2	8	41233	41240	0 %	50 %	25 %	25 %	225618995
1027	NC_012225	ATT	2	6	41291	41296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1028	NC_012225	TAG	2	6	41320	41325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618995
1029	NC_012225	TA	3	6	41354	41359	50 %	50 %	0 %	0 %	225618995
1030	NC_012225	TCT	2	6	41394	41399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618995
1031	NC_012225	TAT	2	6	41423	41428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1032	NC_012225	CAT	2	6	41440	41445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618995
1033	NC_012225	TAA	2	6	41456	41461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618995
1034	NC_012225	CAG	2	6	41488	41493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618995
1035	NC_012225	GTAA	2	8	41514	41521	50 %	25 %	25 %	0 %	225618995
1036	NC_012225	TAT	2	6	41536	41541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1037	NC_012225	T	6	6	41549	41554	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1038	NC_012225	CAG	2	6	41578	41583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618995
1039	NC_012225	AAGT	2	8	41596	41603	50 %	25 %	25 %	0 %	225618995
1040	NC_012225	TTA	2	6	41620	41625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1041	NC_012225	GAG	2	6	41629	41634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225618995
1042	NC_012225	T	6	6	41701	41706	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1043	NC_012225	TTA	2	6	41754	41759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1044	NC_012225	ATG	2	6	41783	41788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618995
1045	NC_012225	AGTATT	2	12	41885	41896	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	225618995
1046	NC_012225	T	6	6	41895	41900	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1047	NC_012225	AAT	2	6	41967	41972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618995
1048	NC_012225	ATC	2	6	41987	41992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618995
1049	NC_012225	TGC	2	6	42041	42046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618995
1050	NC_012225	ATC	2	6	42068	42073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618995
1051	NC_012225	TGCTT	2	10	42083	42092	0 %	60 %	20 %	20 %	225618995
1052	NC_012225	ATC	2	6	42132	42137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618995
1053	NC_012225	T	6	6	42143	42148	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1054	NC_012225	TCT	2	6	42252	42257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618995
1055	NC_012225	TC	3	6	42276	42281	0 %	50 %	0 %	50 %	225618995
1056	NC_012225	TAT	2	6	42299	42304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1057	NC_012225	TAT	2	6	42335	42340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1058	NC_012225	ATC	2	6	42341	42346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618995
1059	NC_012225	ATT	2	6	42377	42382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1060	NC_012225	T	6	6	42396	42401	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1061	NC_012225	T	6	6	42403	42408	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1062	NC_012225	TAT	3	9	42416	42424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1063	NC_012225	ATT	2	6	42440	42445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618995
1064	NC_012225	T	6	6	42459	42464	0 %	100 %	0 %	0 %	225618995
1065	NC_012225	T	7	7	42536	42542	0 %	100 %	0 %	0 %	225618996
1066	NC_012225	T	6	6	42552	42557	0 %	100 %	0 %	0 %	225618996
1067	NC_012225	TAT	2	6	42583	42588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618996
1068	NC_012225	ACT	2	6	42597	42602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1069	NC_012225	CAA	2	6	42613	42618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225618996
1070	NC_012225	TTTCT	2	10	42631	42640	0 %	80 %	0 %	20 %	225618996
1071	NC_012225	CAT	2	6	42677	42682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1072	NC_012225	ATC	2	6	42740	42745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1073	NC_012225	TCA	2	6	42762	42767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1074	NC_012225	TAT	2	6	42788	42793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618996
1075	NC_012225	ATC	2	6	42797	42802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1076	NC_012225	CAA	2	6	42814	42819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225618996
1077	NC_012225	CTT	2	6	42853	42858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618996
1078	NC_012225	ATC	2	6	42872	42877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1079	NC_012225	AT	3	6	42903	42908	50 %	50 %	0 %	0 %	225618996
1080	NC_012225	CTT	2	6	42931	42936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618996
1081	NC_012225	T	6	6	42950	42955	0 %	100 %	0 %	0 %	225618996
1082	NC_012225	AT	3	6	42988	42993	50 %	50 %	0 %	0 %	225618996
1083	NC_012225	CAT	2	6	43046	43051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618996
1084	NC_012225	TTC	2	6	43078	43083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618996
1085	NC_012225	TTC	2	6	43136	43141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618996
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1087	NC_012225	TC	3	6	43308	43313	0 %	50 %	0 %	50 %	225618996
1088	NC_012225	T	7	7	43325	43331	0 %	100 %	0 %	0 %	225618996
1089	NC_012225	AGC	2	6	43385	43390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618996
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1092	NC_012225	CTTT	2	8	43470	43477	0 %	75 %	0 %	25 %	225618996
1093	NC_012225	GATA	2	8	43547	43554	50 %	25 %	25 %	0 %	225618996
1094	NC_012225	ATT	2	6	43566	43571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618996
1095	NC_012225	TATG	2	8	43893	43900	25 %	50 %	25 %	0 %	225618997
1096	NC_012225	A	6	6	43933	43938	100 %	0 %	0 %	0 %	225618997
1097	NC_012225	TAA	2	6	43989	43994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618997
1098	NC_012225	AGT	2	6	44038	44043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618997
1099	NC_012225	ATT	2	6	44064	44069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618997
1100	NC_012225	GAA	2	6	44142	44147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618997
1101	NC_012225	AGAAT	2	10	44201	44210	60 %	20 %	20 %	0 %	225618997
1102	NC_012225	GAA	2	6	44225	44230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618997
1103	NC_012225	CTT	2	6	44288	44293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618997
1104	NC_012225	TAT	2	6	44317	44322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618997
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1106	NC_012225	ATA	3	9	44393	44401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618997
1107	NC_012225	AAT	3	9	44408	44416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618997
1108	NC_012225	TAC	2	6	44464	44469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618997
1109	NC_012225	TAGTT	2	10	44479	44488	20 %	60 %	20 %	0 %	225618997
1110	NC_012225	TAGA	2	8	44559	44566	50 %	25 %	25 %	0 %	225618997
1111	NC_012225	TAA	2	6	44667	44672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618997
1112	NC_012225	GAA	2	6	44756	44761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618997
1113	NC_012225	A	6	6	44815	44820	100 %	0 %	0 %	0 %	225618997
1114	NC_012225	TCA	2	6	44828	44833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618997
1115	NC_012225	AGC	2	6	44872	44877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618997
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1117	NC_012225	TGT	2	6	44893	44898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225618997
1118	NC_012225	T	6	6	44966	44971	0 %	100 %	0 %	0 %	225618997
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1120	NC_012225	TTC	2	6	45063	45068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618997
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1122	NC_012225	GATA	2	8	45130	45137	50 %	25 %	25 %	0 %	225618997
1123	NC_012225	TCA	2	6	45169	45174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618997
1124	NC_012225	T	6	6	45193	45198	0 %	100 %	0 %	0 %	225618997
1125	NC_012225	A	6	6	45262	45267	100 %	0 %	0 %	0 %	225618997
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