MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012225	ATC	3	9	19536	19544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618970
502	NC_012225	ATC	2	6	19611	19616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618970
503	NC_012225	TTCC	2	8	19640	19647	0 %	50 %	0 %	50 %	225618970
504	NC_012225	TCA	2	6	19672	19677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618970
505	NC_012225	ATC	2	6	19722	19727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618970
506	NC_012225	TAT	2	6	19840	19845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618971
507	NC_012225	AAT	2	6	19850	19855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618971
508	NC_012225	TAA	2	6	19872	19877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618971
509	NC_012225	TTC	2	6	19938	19943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618971
510	NC_012225	CTT	2	6	19976	19981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618971
511	NC_012225	AGA	2	6	20040	20045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618971
512	NC_012225	CTAT	2	8	20083	20090	25 %	50 %	0 %	25 %	225618971
513	NC_012225	GCTTC	2	10	20101	20110	0 %	40 %	20 %	40 %	225618971
514	NC_012225	CAT	3	9	20123	20131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618971
515	NC_012225	AGCAT	2	10	20134	20143	40 %	20 %	20 %	20 %	225618971
516	NC_012225	TAAA	2	8	20148	20155	75 %	25 %	0 %	0 %	225618971
517	NC_012225	TTA	2	6	20218	20223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618971
518	NC_012225	CCG	2	6	20266	20271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225618971
519	NC_012225	GAG	2	6	20297	20302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225618971
520	NC_012225	CAT	2	6	20375	20380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618971
521	NC_012225	ATC	2	6	20436	20441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618971
522	NC_012225	ATA	2	6	20446	20451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618971
523	NC_012225	CAG	2	6	20462	20467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618971
524	NC_012225	ATT	2	6	20497	20502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618971
525	NC_012225	AT	3	6	20601	20606	50 %	50 %	0 %	0 %	225618971
526	NC_012225	TCA	2	6	20638	20643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618971
527	NC_012225	AT	3	6	20693	20698	50 %	50 %	0 %	0 %	225618971
528	NC_012225	AT	3	6	20723	20728	50 %	50 %	0 %	0 %	225618971
529	NC_012225	TC	3	6	20736	20741	0 %	50 %	0 %	50 %	225618971
530	NC_012225	TCT	2	6	20749	20754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618971
531	NC_012225	TTTTC	2	10	20881	20890	0 %	80 %	0 %	20 %	225618971
532	NC_012225	AT	3	6	20943	20948	50 %	50 %	0 %	0 %	225618971
533	NC_012225	T	6	6	21095	21100	0 %	100 %	0 %	0 %	225618971
534	NC_012225	T	6	6	21173	21178	0 %	100 %	0 %	0 %	225618972
535	NC_012225	TAT	2	6	21184	21189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618972
536	NC_012225	TAA	2	6	21190	21195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618972
537	NC_012225	A	6	6	21208	21213	100 %	0 %	0 %	0 %	225618972
538	NC_012225	AAAT	2	8	21221	21228	75 %	25 %	0 %	0 %	225618972
539	NC_012225	TAT	2	6	21263	21268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618972
540	NC_012225	TAA	2	6	21269	21274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618972
541	NC_012225	A	6	6	21287	21292	100 %	0 %	0 %	0 %	225618972
542	NC_012225	AAAT	2	8	21300	21307	75 %	25 %	0 %	0 %	225618972
543	NC_012225	TAT	2	6	21337	21342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618972
544	NC_012225	CGCCTA	2	12	21352	21363	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	225618972
545	NC_012225	AAAT	3	12	21372	21383	75 %	25 %	0 %	0 %	225618972
546	NC_012225	AAG	2	6	21584	21589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618973
547	NC_012225	T	7	7	21627	21633	0 %	100 %	0 %	0 %	225618973
548	NC_012225	GTT	2	6	21652	21657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225618973
549	NC_012225	A	7	7	21665	21671	100 %	0 %	0 %	0 %	225618973
550	NC_012225	GAT	2	6	21778	21783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618973
551	NC_012225	ATA	3	9	21830	21838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618973
552	NC_012225	AAATA	2	10	21870	21879	80 %	20 %	0 %	0 %	225618973
553	NC_012225	TAA	2	6	21899	21904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618973
554	NC_012225	A	6	6	22113	22118	100 %	0 %	0 %	0 %	225618974
555	NC_012225	ATT	2	6	22162	22167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618974
556	NC_012225	ATA	2	6	22186	22191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618974
557	NC_012225	TAT	2	6	22202	22207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618974
558	NC_012225	TA	3	6	22230	22235	50 %	50 %	0 %	0 %	225618974
559	NC_012225	GTAA	2	8	22252	22259	50 %	25 %	25 %	0 %	225618974
560	NC_012225	TAT	2	6	22268	22273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618975
561	NC_012225	AT	3	6	22305	22310	50 %	50 %	0 %	0 %	225618975
562	NC_012225	TCTTTT	2	12	22327	22338	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	225618975
563	NC_012225	T	6	6	22335	22340	0 %	100 %	0 %	0 %	225618975
564	NC_012225	TAT	2	6	22342	22347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618975
565	NC_012225	ATA	2	6	22360	22365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618975
566	NC_012225	CTGT	2	8	22382	22389	0 %	50 %	25 %	25 %	225618975
567	NC_012225	ATC	2	6	22408	22413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618975
568	NC_012225	TTC	2	6	22414	22419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618975
569	NC_012225	T	6	6	22454	22459	0 %	100 %	0 %	0 %	225618975
570	NC_012225	TATG	2	8	22468	22475	25 %	50 %	25 %	0 %	225618975
571	NC_012225	ATAA	2	8	22536	22543	75 %	25 %	0 %	0 %	225618975
572	NC_012225	CAT	2	6	22548	22553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618975
573	NC_012225	AGT	2	6	22582	22587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618975
574	NC_012225	ATTC	2	8	22597	22604	25 %	50 %	0 %	25 %	225618975
575	NC_012225	CCG	2	6	22610	22615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225618975
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577	NC_012225	TAT	2	6	22704	22709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618975
578	NC_012225	TCTA	2	8	22738	22745	25 %	50 %	0 %	25 %	225618975
579	NC_012225	AT	4	8	22750	22757	50 %	50 %	0 %	0 %	225618975
580	NC_012225	CCG	2	6	22814	22819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225618975
581	NC_012225	CAT	2	6	22837	22842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618975
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583	NC_012225	A	7	7	22891	22897	100 %	0 %	0 %	0 %	225618975
584	NC_012225	TAT	2	6	22926	22931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618975
585	NC_012225	TTTA	2	8	22975	22982	25 %	75 %	0 %	0 %	225618975
586	NC_012225	TAA	2	6	22995	23000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618975
587	NC_012225	T	9	9	23008	23016	0 %	100 %	0 %	0 %	225618975
588	NC_012225	TCT	2	6	23018	23023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618975
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591	NC_012225	T	6	6	23098	23103	0 %	100 %	0 %	0 %	225618975
592	NC_012225	T	7	7	23348	23354	0 %	100 %	0 %	0 %	225618976
593	NC_012225	AATT	2	8	23365	23372	50 %	50 %	0 %	0 %	225618976
594	NC_012225	AT	3	6	23396	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	225618976
595	NC_012225	TGC	2	6	23413	23418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618976
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597	NC_012225	GCA	2	6	23440	23445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618976
598	NC_012225	TTTCA	2	10	23455	23464	20 %	60 %	0 %	20 %	225618976
599	NC_012225	A	7	7	23550	23556	100 %	0 %	0 %	0 %	225618977
600	NC_012225	TGA	3	9	23569	23577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225618977
601	NC_012225	TGC	2	6	23603	23608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225618977
602	NC_012225	CAAAA	2	10	23713	23722	80 %	0 %	0 %	20 %	225618977
603	NC_012225	AAG	2	6	23782	23787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618977
604	NC_012225	A	6	6	23859	23864	100 %	0 %	0 %	0 %	225618977
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609	NC_012225	TCA	2	6	24033	24038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225618977
610	NC_012225	AT	3	6	24074	24079	50 %	50 %	0 %	0 %	225618977
611	NC_012225	ATT	2	6	24094	24099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225618977
612	NC_012225	TTC	2	6	24105	24110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618977
613	NC_012225	ATA	2	6	24115	24120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618977
614	NC_012225	TTAA	2	8	24266	24273	50 %	50 %	0 %	0 %	225618977
615	NC_012225	A	7	7	24455	24461	100 %	0 %	0 %	0 %	225618978
616	NC_012225	TATT	2	8	24471	24478	25 %	75 %	0 %	0 %	225618978
617	NC_012225	GCA	2	6	24509	24514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225618978
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620	NC_012225	A	6	6	24613	24618	100 %	0 %	0 %	0 %	225618978
621	NC_012225	AAG	2	6	24693	24698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225618978
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625	NC_012225	TCT	2	6	24814	24819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225618978
626	NC_012225	GGA	2	6	24857	24862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225618978
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628	NC_012225	A	7	7	24941	24947	100 %	0 %	0 %	0 %	225618978
629	NC_012225	ATA	2	6	24954	24959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225618978
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