MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_012225	TAT	2	6	235170	235175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6003	NC_012225	TTA	2	6	235194	235199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6004	NC_012225	AT	4	8	235231	235238	50 %	50 %	0 %	0 %	225619156
6005	NC_012225	TTA	2	6	235241	235246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6006	NC_012225	CTT	2	6	235298	235303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619156
6007	NC_012225	TTTC	2	8	235308	235315	0 %	75 %	0 %	25 %	225619156
6008	NC_012225	TAA	2	6	235348	235353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619156
6009	NC_012225	TA	3	6	235417	235422	50 %	50 %	0 %	0 %	225619156
6010	NC_012225	TAT	3	9	235425	235433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6011	NC_012225	TAT	2	6	235446	235451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6012	NC_012225	ATT	2	6	235516	235521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6013	NC_012225	CAG	2	6	235524	235529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619156
6014	NC_012225	ATA	2	6	235587	235592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619156
6015	NC_012225	ATTTT	2	10	235637	235646	20 %	80 %	0 %	0 %	225619156
6016	NC_012225	TAA	2	6	235671	235676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619156
6017	NC_012225	AAT	2	6	235685	235690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619156
6018	NC_012225	TTA	3	9	235692	235700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6019	NC_012225	T	7	7	235704	235710	0 %	100 %	0 %	0 %	225619156
6020	NC_012225	ATT	2	6	235924	235929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619157
6021	NC_012225	A	6	6	235931	235936	100 %	0 %	0 %	0 %	225619157
6022	NC_012225	ATG	2	6	235941	235946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619157
6023	NC_012225	CATT	2	8	235949	235956	25 %	50 %	0 %	25 %	225619157
6024	NC_012225	GCAT	2	8	235963	235970	25 %	25 %	25 %	25 %	225619157
6025	NC_012225	A	6	6	236005	236010	100 %	0 %	0 %	0 %	225619157
6026	NC_012225	TGAAGA	2	12	236014	236025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225619157
6027	NC_012225	TGA	2	6	236077	236082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619157
6028	NC_012225	TTAAAG	2	12	236091	236102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225619157
6029	NC_012225	A	6	6	236202	236207	100 %	0 %	0 %	0 %	225619157
6030	NC_012225	TGA	2	6	236221	236226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619157
6031	NC_012225	TTA	2	6	236238	236243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619157
6032	NC_012225	TTAG	2	8	236255	236262	25 %	50 %	25 %	0 %	225619157
6033	NC_012225	GAT	2	6	236279	236284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619157
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6035	NC_012225	GCC	2	6	236330	236335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225619157
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6037	NC_012225	TAA	2	6	236397	236402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619157
6038	NC_012225	AG	3	6	236434	236439	50 %	0 %	50 %	0 %	225619157
6039	NC_012225	AATATT	2	12	236464	236475	50 %	50 %	0 %	0 %	225619157
6040	NC_012225	TAG	2	6	236515	236520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619158
6041	NC_012225	TGC	2	6	236567	236572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619158
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6044	NC_012225	AT	3	6	236659	236664	50 %	50 %	0 %	0 %	225619158
6045	NC_012225	AGAA	2	8	236805	236812	75 %	0 %	25 %	0 %	225619158
6046	NC_012225	TA	4	8	236820	236827	50 %	50 %	0 %	0 %	225619158
6047	NC_012225	TGA	3	9	236849	236857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619158
6048	NC_012225	TGC	2	6	236900	236905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619158
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6051	NC_012225	CTG	2	6	236986	236991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619158
6052	NC_012225	TA	3	6	237085	237090	50 %	50 %	0 %	0 %	225619158
6053	NC_012225	CTT	2	6	237091	237096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619158
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6059	NC_012225	ATC	2	6	237271	237276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619159
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6062	NC_012225	AGCA	2	8	237303	237310	50 %	0 %	25 %	25 %	225619159
6063	NC_012225	A	7	7	237310	237316	100 %	0 %	0 %	0 %	225619159
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6110	NC_012225	AT	3	6	239205	239210	50 %	50 %	0 %	0 %	225619163
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6493	NC_012225	TTC	2	6	253917	253922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619174
6494	NC_012225	ACTA	2	8	253998	254005	50 %	25 %	0 %	25 %	225619174
6495	NC_012225	GAG	2	6	254006	254011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619174
6496	NC_012225	ATT	3	9	254106	254114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619174
6497	NC_012225	ATT	2	6	254120	254125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619175
6498	NC_012225	ATCT	2	8	254213	254220	25 %	50 %	0 %	25 %	225619175
6499	NC_012225	TCT	2	6	254227	254232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619175
6500	NC_012225	T	7	7	254246	254252	0 %	100 %	0 %	0 %	225619175

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