MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012225	AGTA	2	8	216389	216396	50 %	25 %	25 %	0 %	225619143
5502	NC_012225	AT	3	6	216409	216414	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5503	NC_012225	CTC	2	6	216421	216426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619143
5504	NC_012225	TGTAAA	2	12	216509	216520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	225619143
5505	NC_012225	TAA	2	6	216530	216535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619143
5506	NC_012225	ATAA	2	8	216586	216593	75 %	25 %	0 %	0 %	225619143
5507	NC_012225	ATA	2	6	216611	216616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619143
5508	NC_012225	CTA	2	6	216652	216657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619143
5509	NC_012225	TTA	2	6	216672	216677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619143
5510	NC_012225	TTC	2	6	216715	216720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619143
5511	NC_012225	AT	3	6	216726	216731	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5512	NC_012225	TA	3	6	216773	216778	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5513	NC_012225	AT	3	6	216811	216816	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5514	NC_012225	AT	3	6	216836	216841	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5515	NC_012225	A	6	6	216847	216852	100 %	0 %	0 %	0 %	225619143
5516	NC_012225	TTC	2	6	216878	216883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619143
5517	NC_012225	CTA	2	6	216985	216990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619143
5518	NC_012225	AT	3	6	217047	217052	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5519	NC_012225	GTT	2	6	217074	217079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619143
5520	NC_012225	T	7	7	217095	217101	0 %	100 %	0 %	0 %	225619143
5521	NC_012225	AAAT	2	8	217172	217179	75 %	25 %	0 %	0 %	225619143
5522	NC_012225	AT	3	6	217178	217183	50 %	50 %	0 %	0 %	225619143
5523	NC_012225	ATT	2	6	217200	217205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619143
5524	NC_012225	AAT	2	6	217212	217217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619143
5525	NC_012225	TTC	2	6	217248	217253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619143
5526	NC_012225	TCT	2	6	217277	217282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619144
5527	NC_012225	TTC	2	6	217298	217303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619144
5528	NC_012225	T	6	6	217310	217315	0 %	100 %	0 %	0 %	225619144
5529	NC_012225	TCT	2	6	217320	217325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619144
5530	NC_012225	ATA	2	6	217342	217347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619144
5531	NC_012225	TTA	2	6	217423	217428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619144
5532	NC_012225	TCA	2	6	217482	217487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619144
5533	NC_012225	TAT	2	6	217507	217512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619144
5534	NC_012225	AT	3	6	217528	217533	50 %	50 %	0 %	0 %	225619144
5535	NC_012225	T	6	6	217533	217538	0 %	100 %	0 %	0 %	225619144
5536	NC_012225	TCT	2	6	217635	217640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619144
5537	NC_012225	ATT	2	6	217700	217705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619144
5538	NC_012225	T	6	6	217727	217732	0 %	100 %	0 %	0 %	225619144
5539	NC_012225	AAT	2	6	217755	217760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619144
5540	NC_012225	T	6	6	217763	217768	0 %	100 %	0 %	0 %	225619144
5541	NC_012225	CTT	2	6	217771	217776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619144
5542	NC_012225	CTA	2	6	217849	217854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619144
5543	NC_012225	ATTA	2	8	217856	217863	50 %	50 %	0 %	0 %	225619144
5544	NC_012225	TAT	2	6	217903	217908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619144
5545	NC_012225	CCAT	2	8	217932	217939	25 %	25 %	0 %	50 %	225619144
5546	NC_012225	TCA	2	6	217971	217976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619144
5547	NC_012225	TTCTTT	2	12	217996	218007	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	225619145
5548	NC_012225	ATCAT	2	10	218015	218024	40 %	40 %	0 %	20 %	225619145
5549	NC_012225	T	8	8	218028	218035	0 %	100 %	0 %	0 %	225619145
5550	NC_012225	T	7	7	218061	218067	0 %	100 %	0 %	0 %	225619145
5551	NC_012225	T	7	7	218116	218122	0 %	100 %	0 %	0 %	225619145
5552	NC_012225	TCT	2	6	218140	218145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619145
5553	NC_012225	CTT	2	6	218169	218174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619145
5554	NC_012225	T	7	7	218194	218200	0 %	100 %	0 %	0 %	225619145
5555	NC_012225	CT	3	6	218206	218211	0 %	50 %	0 %	50 %	225619145
5556	NC_012225	TCTT	2	8	218212	218219	0 %	75 %	0 %	25 %	225619145
5557	NC_012225	ACT	2	6	218234	218239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619145
5558	NC_012225	CCG	2	6	218252	218257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	225619145
5559	NC_012225	ACTA	2	8	218311	218318	50 %	25 %	0 %	25 %	225619145
5560	NC_012225	ATA	2	6	218342	218347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619145
5561	NC_012225	TCCA	2	8	218422	218429	25 %	25 %	0 %	50 %	225619145
5562	NC_012225	TATT	2	8	219096	219103	25 %	75 %	0 %	0 %	225619146
5563	NC_012225	AAG	2	6	219124	219129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619146
5564	NC_012225	ATAAAA	2	12	219178	219189	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	225619146
5565	NC_012225	ATA	2	6	219229	219234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619146
5566	NC_012225	CTTAT	2	10	219269	219278	20 %	60 %	0 %	20 %	225619146
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5568	NC_012225	TAA	2	6	219407	219412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619146
5569	NC_012225	AAATG	2	10	219434	219443	60 %	20 %	20 %	0 %	225619146
5570	NC_012225	CTT	2	6	219477	219482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619146
5571	NC_012225	AAG	2	6	219493	219498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619146
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5573	NC_012225	A	9	9	219518	219526	100 %	0 %	0 %	0 %	225619146
5574	NC_012225	ATT	2	6	219562	219567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619146
5575	NC_012225	A	6	6	219575	219580	100 %	0 %	0 %	0 %	225619146
5576	NC_012225	TA	3	6	219594	219599	50 %	50 %	0 %	0 %	225619146
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5580	NC_012225	TAA	2	6	219893	219898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619146
5581	NC_012225	AAT	2	6	219911	219916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619146
5582	NC_012225	ATA	2	6	219961	219966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619146
5583	NC_012225	GCT	2	6	220005	220010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619146
5584	NC_012225	ATT	2	6	220018	220023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619146
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5588	NC_012225	GCT	2	6	220339	220344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619147
5589	NC_012225	AGA	2	6	220390	220395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619147
5590	NC_012225	AAAG	2	8	220398	220405	75 %	0 %	25 %	0 %	225619147
5591	NC_012225	GAA	2	6	220414	220419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619147
5592	NC_012225	AGG	2	6	220500	220505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619147
5593	NC_012225	A	6	6	220510	220515	100 %	0 %	0 %	0 %	225619147
5594	NC_012225	AGCTAT	2	12	220533	220544	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225619147
5595	NC_012225	ATG	2	6	220565	220570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619147
5596	NC_012225	ACA	2	6	220576	220581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619147
5597	NC_012225	GAT	2	6	220612	220617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619147
5598	NC_012225	TTA	2	6	220661	220666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619147
5599	NC_012225	GTT	2	6	220705	220710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619147
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5602	NC_012225	CAGAAA	2	12	220760	220771	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	225619147
5603	NC_012225	A	6	6	220810	220815	100 %	0 %	0 %	0 %	225619147
5604	NC_012225	AAAAT	2	10	220914	220923	80 %	20 %	0 %	0 %	225619148
5605	NC_012225	T	6	6	220937	220942	0 %	100 %	0 %	0 %	225619148
5606	NC_012225	TAT	2	6	220977	220982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619148
5607	NC_012225	AT	3	6	221018	221023	50 %	50 %	0 %	0 %	225619148
5608	NC_012225	AGG	2	6	221077	221082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619148
5609	NC_012225	A	6	6	221106	221111	100 %	0 %	0 %	0 %	225619148
5610	NC_012225	TTTA	2	8	221146	221153	25 %	75 %	0 %	0 %	225619148
5611	NC_012225	ACAG	2	8	221200	221207	50 %	0 %	25 %	25 %	225619148
5612	NC_012225	AT	3	6	221230	221235	50 %	50 %	0 %	0 %	225619148
5613	NC_012225	TCC	2	6	221245	221250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225619148
5614	NC_012225	TAC	2	6	221260	221265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619148
5615	NC_012225	ACA	2	6	221327	221332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619148
5616	NC_012225	GTAA	2	8	221390	221397	50 %	25 %	25 %	0 %	225619148
5617	NC_012225	TAGT	2	8	221433	221440	25 %	50 %	25 %	0 %	225619148
5618	NC_012225	TAA	2	6	221455	221460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619148
5619	NC_012225	AT	3	6	221491	221496	50 %	50 %	0 %	0 %	225619148
5620	NC_012225	ATA	2	6	221499	221504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619148
5621	NC_012225	ATG	2	6	221532	221537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619148
5622	NC_012225	TTG	2	6	221607	221612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619148
5623	NC_012225	A	6	6	221634	221639	100 %	0 %	0 %	0 %	225619148
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5998	NC_012225	T	6	6	234935	234940	0 %	100 %	0 %	0 %	225619156
5999	NC_012225	ATT	2	6	234979	234984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619156
6000	NC_012225	ATG	2	6	235002	235007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619156

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