MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira hyodysenteriae WA1 chromosome

Total Repeats: 78835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012225	GAA	2	6	196755	196760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619123
5002	NC_012225	GAA	2	6	196766	196771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619123
5003	NC_012225	TAAT	2	8	196814	196821	50 %	50 %	0 %	0 %	225619123
5004	NC_012225	ATTA	2	8	196915	196922	50 %	50 %	0 %	0 %	225619124
5005	NC_012225	T	7	7	197069	197075	0 %	100 %	0 %	0 %	225619124
5006	NC_012225	TCT	2	6	197091	197096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619124
5007	NC_012225	TA	3	6	197111	197116	50 %	50 %	0 %	0 %	225619124
5008	NC_012225	TTA	2	6	197140	197145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619124
5009	NC_012225	CTG	2	6	197173	197178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619124
5010	NC_012225	TTG	2	6	197224	197229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619124
5011	NC_012225	GAA	2	6	197240	197245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619124
5012	NC_012225	TATC	2	8	197266	197273	25 %	50 %	0 %	25 %	225619124
5013	NC_012225	TCT	3	9	197309	197317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619124
5014	NC_012225	TA	3	6	197397	197402	50 %	50 %	0 %	0 %	225619125
5015	NC_012225	TTC	2	6	197448	197453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619125
5016	NC_012225	CAT	2	6	197481	197486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619125
5017	NC_012225	AT	3	6	197485	197490	50 %	50 %	0 %	0 %	225619125
5018	NC_012225	TATG	2	8	197500	197507	25 %	50 %	25 %	0 %	225619125
5019	NC_012225	CAT	2	6	197514	197519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619125
5020	NC_012225	AGC	2	6	197578	197583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619125
5021	NC_012225	CTT	2	6	197622	197627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619125
5022	NC_012225	GTA	2	6	197681	197686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619125
5023	NC_012225	AACACC	2	12	197689	197700	50 %	0 %	0 %	50 %	225619125
5024	NC_012225	CAG	2	6	197796	197801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225619125
5025	NC_012225	AAC	2	6	197821	197826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619125
5026	NC_012225	GAA	2	6	197926	197931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619125
5027	NC_012225	AATG	2	8	197969	197976	50 %	25 %	25 %	0 %	225619125
5028	NC_012225	ATT	2	6	197986	197991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619125
5029	NC_012225	AGG	2	6	197998	198003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225619125
5030	NC_012225	CTT	2	6	198017	198022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619125
5031	NC_012225	TTA	2	6	198030	198035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619125
5032	NC_012225	TCT	2	6	198050	198055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225619125
5033	NC_012225	ATT	2	6	198098	198103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619125
5034	NC_012225	T	7	7	198236	198242	0 %	100 %	0 %	0 %	225619126
5035	NC_012225	ATT	2	6	198271	198276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619126
5036	NC_012225	TAT	2	6	198282	198287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619126
5037	NC_012225	TAG	2	6	198290	198295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619126
5038	NC_012225	GA	4	8	198334	198341	50 %	0 %	50 %	0 %	225619126
5039	NC_012225	A	6	6	198355	198360	100 %	0 %	0 %	0 %	225619126
5040	NC_012225	TAAAG	2	10	198411	198420	60 %	20 %	20 %	0 %	225619126
5041	NC_012225	TAT	2	6	198471	198476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619126
5042	NC_012225	AGAAA	2	10	198483	198492	80 %	0 %	20 %	0 %	225619126
5043	NC_012225	TAA	2	6	198668	198673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619127
5044	NC_012225	ATT	2	6	198702	198707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619127
5045	NC_012225	A	6	6	198749	198754	100 %	0 %	0 %	0 %	225619127
5046	NC_012225	GAA	2	6	198760	198765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619127
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5048	NC_012225	A	7	7	198808	198814	100 %	0 %	0 %	0 %	225619127
5049	NC_012225	TC	3	6	198860	198865	0 %	50 %	0 %	50 %	225619127
5050	NC_012225	AAG	2	6	198878	198883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619127
5051	NC_012225	ATGA	2	8	198901	198908	50 %	25 %	25 %	0 %	225619127
5052	NC_012225	CTG	2	6	198914	198919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619127
5053	NC_012225	GTT	2	6	198931	198936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225619127
5054	NC_012225	ATTA	2	8	198966	198973	50 %	50 %	0 %	0 %	225619127
5055	NC_012225	TGA	2	6	198975	198980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619127
5056	NC_012225	TGC	2	6	199003	199008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619127
5057	NC_012225	CCA	2	6	199110	199115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225619127
5058	NC_012225	TATG	2	8	199137	199144	25 %	50 %	25 %	0 %	225619127
5059	NC_012225	CGT	2	6	199180	199185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619127
5060	NC_012225	TAAC	2	8	199238	199245	50 %	25 %	0 %	25 %	225619127
5061	NC_012225	CTAATG	2	12	199250	199261	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	225619127
5062	NC_012225	CTG	2	6	199391	199396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619127
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5064	NC_012225	TAAA	2	8	199454	199461	75 %	25 %	0 %	0 %	225619127
5065	NC_012225	A	7	7	199459	199465	100 %	0 %	0 %	0 %	225619127
5066	NC_012225	GAA	2	6	199513	199518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619127
5067	NC_012225	GCT	2	6	199519	199524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619127
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5069	NC_012225	TA	3	6	199582	199587	50 %	50 %	0 %	0 %	225619127
5070	NC_012225	GCT	2	6	199600	199605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619127
5071	NC_012225	GAA	2	6	199670	199675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619127
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5073	NC_012225	TGA	2	6	199794	199799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619127
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5080	NC_012225	TGAA	2	8	200074	200081	50 %	25 %	25 %	0 %	225619128
5081	NC_012225	CTA	2	6	200122	200127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225619128
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5083	NC_012225	ACA	2	6	200157	200162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225619128
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5088	NC_012225	CAATA	2	10	200246	200255	60 %	20 %	0 %	20 %	225619128
5089	NC_012225	TA	3	6	200254	200259	50 %	50 %	0 %	0 %	225619128
5090	NC_012225	A	6	6	200390	200395	100 %	0 %	0 %	0 %	225619128
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5093	NC_012225	GAT	2	6	200454	200459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619128
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5096	NC_012225	GTCA	2	8	200550	200557	25 %	25 %	25 %	25 %	225619128
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5105	NC_012225	AT	3	6	200836	200841	50 %	50 %	0 %	0 %	225619128
5106	NC_012225	ATA	2	6	200863	200868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619128
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5109	NC_012225	AAT	2	6	200940	200945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619128
5110	NC_012225	GA	3	6	200959	200964	50 %	0 %	50 %	0 %	225619128
5111	NC_012225	CTG	3	9	200968	200976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619128
5112	NC_012225	TATAA	2	10	200988	200997	60 %	40 %	0 %	0 %	225619128
5113	NC_012225	TAG	2	6	201008	201013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225619128
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5120	NC_012225	ATA	2	6	201316	201321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225619128
5121	NC_012225	CTG	2	6	201325	201330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619128
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5123	NC_012225	CAGA	2	8	201436	201443	50 %	0 %	25 %	25 %	225619128
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5125	NC_012225	ATGA	2	8	201477	201484	50 %	25 %	25 %	0 %	225619128
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5128	NC_012225	TAT	3	9	201504	201512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225619128
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5132	NC_012225	TA	4	8	201569	201576	50 %	50 %	0 %	0 %	225619128
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5243	NC_012225	TGC	2	6	206114	206119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225619134
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5245	NC_012225	GAA	2	6	206205	206210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619134
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5248	NC_012225	AAG	2	6	206272	206277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225619134
5249	NC_012225	TGATGT	2	12	206369	206380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	225619134
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5252	NC_012225	AG	3	6	206481	206486	50 %	0 %	50 %	0 %	225619134
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5486	NC_012225	A	6	6	215662	215667	100 %	0 %	0 %	0 %	225619142
5487	NC_012225	TA	3	6	215700	215705	50 %	50 %	0 %	0 %	225619142
5488	NC_012225	AG	3	6	215748	215753	50 %	0 %	50 %	0 %	225619142
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5491	NC_012225	ATGG	2	8	215915	215922	25 %	25 %	50 %	0 %	225619142
5492	NC_012225	AT	3	6	215982	215987	50 %	50 %	0 %	0 %	225619142
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