MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	TCTA	2	8	1910	1917	25 %	50 %	0 %	25 %	224985711
2	NC_012204	AGCA	2	8	2557	2564	50 %	0 %	25 %	25 %	224985712
3	NC_012204	GTTA	2	8	2764	2771	25 %	50 %	25 %	0 %	224985712
4	NC_012204	CTTA	2	8	3493	3500	25 %	50 %	0 %	25 %	224985713
5	NC_012204	TCTA	2	8	4277	4284	25 %	50 %	0 %	25 %	224985715
6	NC_012204	AGCA	2	8	4912	4919	50 %	0 %	25 %	25 %	224985715
7	NC_012204	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	224985715
8	NC_012204	GCTT	2	8	5846	5853	0 %	50 %	25 %	25 %	224985717
9	NC_012204	TAAA	2	8	6228	6235	75 %	25 %	0 %	0 %	224985718
10	NC_012204	ATGA	2	8	7152	7159	50 %	25 %	25 %	0 %	224985719
11	NC_012204	TAAA	2	8	7267	7274	75 %	25 %	0 %	0 %	224985719
12	NC_012204	CTAT	2	8	9262	9269	25 %	50 %	0 %	25 %	224985722
13	NC_012204	AAAC	2	8	9294	9301	75 %	0 %	0 %	25 %	224985722
14	NC_012204	TTAT	2	8	10243	10250	25 %	75 %	0 %	0 %	224985724
15	NC_012204	TAAT	2	8	10428	10435	50 %	50 %	0 %	0 %	224985725
16	NC_012204	GAAA	2	8	11479	11486	75 %	0 %	25 %	0 %	224985727
17	NC_012204	CAAA	2	8	11556	11563	75 %	0 %	0 %	25 %	224985727
18	NC_012204	AAAC	2	8	11866	11873	75 %	0 %	0 %	25 %	224985727
19	NC_012204	GAAA	2	8	11945	11952	75 %	0 %	25 %	0 %	224985727
20	NC_012204	ACGA	2	8	11976	11983	50 %	0 %	25 %	25 %	224985727
21	NC_012204	AAAT	2	8	11988	11995	75 %	25 %	0 %	0 %	224985727
22	NC_012204	TAAA	2	8	12072	12079	75 %	25 %	0 %	0 %	224985727
23	NC_012204	GCAA	2	8	12176	12183	50 %	0 %	25 %	25 %	224985727
24	NC_012204	GATG	2	8	12257	12264	25 %	25 %	50 %	0 %	224985728
25	NC_012204	AATT	2	8	15420	15427	50 %	50 %	0 %	0 %	224985731
26	NC_012204	AAAC	2	8	15626	15633	75 %	0 %	0 %	25 %	224985731
27	NC_012204	ATAA	2	8	15793	15800	75 %	25 %	0 %	0 %	224985732
28	NC_012204	AAGA	2	8	15809	15816	75 %	0 %	25 %	0 %	224985732
29	NC_012204	ATTT	2	8	15822	15829	25 %	75 %	0 %	0 %	224985732
30	NC_012204	ATTT	2	8	17053	17060	25 %	75 %	0 %	0 %	224985735
31	NC_012204	ATTT	2	8	17253	17260	25 %	75 %	0 %	0 %	224985735
32	NC_012204	ATTT	2	8	18362	18369	25 %	75 %	0 %	0 %	224985736
33	NC_012204	AAAG	2	8	18446	18453	75 %	0 %	25 %	0 %	224985736
34	NC_012204	ATTG	2	8	18607	18614	25 %	50 %	25 %	0 %	224985736
35	NC_012204	TCAA	2	8	18830	18837	50 %	25 %	0 %	25 %	224985736
36	NC_012204	ACTT	2	8	19292	19299	25 %	50 %	0 %	25 %	224985737
37	NC_012204	TAAA	2	8	19639	19646	75 %	25 %	0 %	0 %	224985737
38	NC_012204	ATTT	2	8	19897	19904	25 %	75 %	0 %	0 %	224985738
39	NC_012204	TTCC	2	8	19911	19918	0 %	50 %	0 %	50 %	224985738
40	NC_012204	GAAA	2	8	20344	20351	75 %	0 %	25 %	0 %	224985738
41	NC_012204	TTTC	2	8	21377	21384	0 %	75 %	0 %	25 %	224985739
42	NC_012204	TTCT	2	8	22164	22171	0 %	75 %	0 %	25 %	224985742
43	NC_012204	TCAT	2	8	22659	22666	25 %	50 %	0 %	25 %	224985743
44	NC_012204	ATTT	2	8	22769	22776	25 %	75 %	0 %	0 %	224985743
45	NC_012204	AAAT	2	8	23622	23629	75 %	25 %	0 %	0 %	224985745

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.