MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-3

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012185	TG	3	6	5506	5511	0 %	50 %	50 %	0 %	224984644
2	NC_012185	AT	3	6	7741	7746	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
3	NC_012185	TA	3	6	7824	7829	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
4	NC_012185	TA	3	6	7955	7960	50 %	50 %	0 %	0 %	224984646
5	NC_012185	TA	3	6	8281	8286	50 %	50 %	0 %	0 %	224984647
6	NC_012185	TA	3	6	8632	8637	50 %	50 %	0 %	0 %	224984647
7	NC_012185	TA	3	6	9098	9103	50 %	50 %	0 %	0 %	224984648
8	NC_012185	TA	3	6	9459	9464	50 %	50 %	0 %	0 %	224984649
9	NC_012185	AT	3	6	10528	10533	50 %	50 %	0 %	0 %	224984651
10	NC_012185	GT	3	6	10552	10557	0 %	50 %	50 %	0 %	224984651
11	NC_012185	CT	4	8	12462	12469	0 %	50 %	0 %	50 %	224984653
12	NC_012185	TA	3	6	13022	13027	50 %	50 %	0 %	0 %	224984654
13	NC_012185	AT	3	6	15578	15583	50 %	50 %	0 %	0 %	224984659
14	NC_012185	AT	3	6	15822	15827	50 %	50 %	0 %	0 %	224984659
15	NC_012185	AG	3	6	16668	16673	50 %	0 %	50 %	0 %	224984661
16	NC_012185	TA	3	6	17795	17800	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
17	NC_012185	AT	3	6	17997	18002	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
18	NC_012185	AT	3	6	18226	18231	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
19	NC_012185	AT	4	8	18671	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	224984662
20	NC_012185	CA	3	6	20306	20311	50 %	0 %	0 %	50 %	224984666
21	NC_012185	AT	3	6	22124	22129	50 %	50 %	0 %	0 %	224984669
22	NC_012185	TC	3	6	22202	22207	0 %	50 %	0 %	50 %	224984669
23	NC_012185	AT	3	6	22644	22649	50 %	50 %	0 %	0 %	224984670
24	NC_012185	TA	3	6	23542	23547	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
25	NC_012185	TA	3	6	23697	23702	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
26	NC_012185	AT	3	6	23710	23715	50 %	50 %	0 %	0 %	224984671
27	NC_012185	AT	3	6	24882	24887	50 %	50 %	0 %	0 %	224984673
28	NC_012185	TA	3	6	25505	25510	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
29	NC_012185	TA	3	6	25726	25731	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
30	NC_012185	AT	3	6	25749	25754	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
31	NC_012185	TA	3	6	25868	25873	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
32	NC_012185	AT	3	6	25922	25927	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
33	NC_012185	AT	3	6	25990	25995	50 %	50 %	0 %	0 %	224984674
34	NC_012185	AG	3	6	26004	26009	50 %	0 %	50 %	0 %	224984674
35	NC_012185	CT	3	6	30240	30245	0 %	50 %	0 %	50 %	224984683
36	NC_012185	AT	3	6	30784	30789	50 %	50 %	0 %	0 %	224984685
37	NC_012185	AT	3	6	30845	30850	50 %	50 %	0 %	0 %	224984685
38	NC_012185	GT	3	6	31022	31027	0 %	50 %	50 %	0 %	224984685
39	NC_012185	TA	3	6	32595	32600	50 %	50 %	0 %	0 %	224984687
40	NC_012185	CT	3	6	33926	33931	0 %	50 %	0 %	50 %	224984690
41	NC_012185	AT	3	6	33966	33971	50 %	50 %	0 %	0 %	224984690
42	NC_012185	AT	3	6	34257	34262	50 %	50 %	0 %	0 %	224984691
43	NC_012185	TC	3	6	34867	34872	0 %	50 %	0 %	50 %	224984692
44	NC_012185	TA	3	6	35692	35697	50 %	50 %	0 %	0 %	224984694
45	NC_012185	TA	3	6	36185	36190	50 %	50 %	0 %	0 %	224984696
46	NC_012185	TA	3	6	36505	36510	50 %	50 %	0 %	0 %	224984697
47	NC_012185	AT	3	6	37270	37275	50 %	50 %	0 %	0 %	224984700
48	NC_012185	AT	3	6	37586	37591	50 %	50 %	0 %	0 %	224984701
49	NC_012185	AT	3	6	39384	39389	50 %	50 %	0 %	0 %	224984706
50	NC_012185	AG	3	6	39863	39868	50 %	0 %	50 %	0 %	224984709
51	NC_012185	AT	4	8	43513	43520	50 %	50 %	0 %	0 %	224984718
52	NC_012185	AT	3	6	45093	45098	50 %	50 %	0 %	0 %	224984722
53	NC_012185	TA	3	6	45718	45723	50 %	50 %	0 %	0 %	224984724
54	NC_012185	TC	3	6	45758	45763	0 %	50 %	0 %	50 %	224984724
55	NC_012185	CT	3	6	46283	46288	0 %	50 %	0 %	50 %	224984725
56	NC_012185	GT	3	6	47207	47212	0 %	50 %	50 %	0 %	224984728
57	NC_012185	TA	3	6	47574	47579	50 %	50 %	0 %	0 %	224984729
58	NC_012185	TA	3	6	48446	48451	50 %	50 %	0 %	0 %	224984730
59	NC_012185	TA	3	6	48904	48909	50 %	50 %	0 %	0 %	224984731
60	NC_012185	AT	4	8	49040	49047	50 %	50 %	0 %	0 %	224984731
61	NC_012185	TA	3	6	50689	50694	50 %	50 %	0 %	0 %	224984733
62	NC_012185	TA	3	6	51072	51077	50 %	50 %	0 %	0 %	224984734
63	NC_012185	AT	3	6	51596	51601	50 %	50 %	0 %	0 %	224984735
64	NC_012185	AT	3	6	53196	53201	50 %	50 %	0 %	0 %	224984738
65	NC_012185	AT	3	6	53929	53934	50 %	50 %	0 %	0 %	224984739
66	NC_012185	AT	3	6	54764	54769	50 %	50 %	0 %	0 %	224984739
67	NC_012185	TA	5	10	55312	55321	50 %	50 %	0 %	0 %	224984740
68	NC_012185	AT	4	8	55803	55810	50 %	50 %	0 %	0 %	224984740
69	NC_012185	AT	3	6	55860	55865	50 %	50 %	0 %	0 %	224984740
70	NC_012185	TG	3	6	56270	56275	0 %	50 %	50 %	0 %	224984741
71	NC_012185	AG	3	6	57359	57364	50 %	0 %	50 %	0 %	224984742
72	NC_012185	GA	3	6	58127	58132	50 %	0 %	50 %	0 %	224984743
73	NC_012185	AT	3	6	58368	58373	50 %	50 %	0 %	0 %	224984743
74	NC_012185	CT	3	6	59584	59589	0 %	50 %	0 %	50 %	224984744
75	NC_012185	AT	3	6	59724	59729	50 %	50 %	0 %	0 %	224984744
76	NC_012185	AT	4	8	60547	60554	50 %	50 %	0 %	0 %	224984745
77	NC_012185	AT	3	6	61548	61553	50 %	50 %	0 %	0 %	224984746
78	NC_012185	AT	3	6	65477	65482	50 %	50 %	0 %	0 %	224984753
79	NC_012185	TA	3	6	65659	65664	50 %	50 %	0 %	0 %	224984753
80	NC_012185	AT	3	6	67850	67855	50 %	50 %	0 %	0 %	224984756
81	NC_012185	AT	4	8	68163	68170	50 %	50 %	0 %	0 %	224984756
82	NC_012185	TA	3	6	68473	68478	50 %	50 %	0 %	0 %	224984757
83	NC_012185	AT	3	6	68726	68731	50 %	50 %	0 %	0 %	224984758
84	NC_012185	AG	3	6	68803	68808	50 %	0 %	50 %	0 %	224984758
85	NC_012185	AT	3	6	70728	70733	50 %	50 %	0 %	0 %	224984761
86	NC_012185	AT	3	6	72310	72315	50 %	50 %	0 %	0 %	224984765
87	NC_012185	AG	3	6	72363	72368	50 %	0 %	50 %	0 %	224984765
88	NC_012185	AT	4	8	74419	74426	50 %	50 %	0 %	0 %	224984768
89	NC_012185	AG	3	6	74634	74639	50 %	0 %	50 %	0 %	224984768
90	NC_012185	AT	3	6	75135	75140	50 %	50 %	0 %	0 %	224984768
91	NC_012185	CT	3	6	75228	75233	0 %	50 %	0 %	50 %	224984768
92	NC_012185	AT	3	6	76211	76216	50 %	50 %	0 %	0 %	224984770
93	NC_012185	TA	3	6	76221	76226	50 %	50 %	0 %	0 %	224984770
94	NC_012185	AT	3	6	76261	76266	50 %	50 %	0 %	0 %	224984770
95	NC_012185	AT	3	6	76341	76346	50 %	50 %	0 %	0 %	224984770
96	NC_012185	TA	3	6	76368	76373	50 %	50 %	0 %	0 %	224984770
97	NC_012185	AT	3	6	76652	76657	50 %	50 %	0 %	0 %	224984771
98	NC_012185	AT	3	6	77083	77088	50 %	50 %	0 %	0 %	224984773
99	NC_012185	CT	3	6	81433	81438	0 %	50 %	0 %	50 %	224984780
100	NC_012185	AT	3	6	81449	81454	50 %	50 %	0 %	0 %	224984780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.